Análisis de las frecuencias de todas las combinaciones genotípicas de 4 polimorfismos de genes implicados en el ciclo del folato en la población española / Analysis of the frequencies of genotype combinations of 4 polymorphisms of genes acting on the folate cycle in the Spanish population

RESUMEN

Fundamento y objetivo: Distintas poblaciones muestran diferencias en cuanto a las frecuencias de polimorfismos de genes del ciclo del folato. El objetivo de este estudio ha sido analizar las frecuencias genotípicas de 4 polimorfismos, uno de los cuales -1561C-T del gen de la glutamato carboxipeptidasa II (GCPII)- se analiza por primera vez en España, así como realizar un metaanálisis de los datos publicados. Sujetos y método: Utilizando la Red del Estudio Colaborativo Español de Malformaciones Congénitas (ECEMC) se obtuvieron, en 15 comunidades autónomas, muestras de sangre de 190 parejas madres-recién nacidos sin defectos. Se analizaron los polimorfismos 677C-T y 1298A-C del gen de la metilentetrahidrofolato reductasa (MTHFR); 66A-G del gen de la metionina sintasa reductasa (MTRR), y 1561C-T del gen de la GCPII. Los valores poblaciones se calcularon por los intervalos de confianza del 99%. Resultados: Las frecuencias en nuestro país difieren de las de otras poblaciones, excepto las del área mediterránea europea. La frecuencia del polimorfismo 1561C-T (gen GCPII) en España es del 5,11%, igual que en Francia (5%) e Italia (6%). Las de MTHFR, CTCC y TTAC en España son muy bajas y no se observó ninguna madrehijo con TTCC. El metaanálisis (23.612 individuos) mostró que, con un 99% de probabilidad, las frecuencias poblacionales de CTCC, TTAC y TTCC serían de 0,10-0,24; 0,20-0,36, y 0,003-0,05, respectivamente. Conclusiones: Estos resultados son importantes para estudios sobre la relación de dichos polimorfismos con problemas de salud y susceptibilidad individuales, así como para investigar sus implicaciones biológicas. Tras los últimos hallazgos estructurales y funcionales en la MTHFR pueden entenderse las diferencias, porque los genotipos infrecuentes podrían relacionarse con la viabilidad fetal, las concentraciones de homocisteína materno/ fetal y los estilos de vida

ABSTRACT

Background and objective: Studies on different populations have shown a great variability of the frequencies of different polymorphisms in genes acting in the folate cycle. The present study was aimed to analyze the frequency in the Spanish population of each genotype combination of four polymorphisms, one of them -1561CT of the glutamate carboxypeptidase II (GCPII) gene- being the first time that is studied in Spain. The study included a meta-analysis of the published data. Subjects and method: Using the Spanish Collaborative Study of Congenital Malformations (ECEMC) Network, blood samples of 190 mother-child couples with newborns without any congenital defect, were obtained from 15 Spanish autonomous regions. The study polymorphisms were the 677C-T and 1298A-C polymorphisms of the methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR), the 66A-G of the methionine synthase reductase (MTRR), and the 1561C-T polymorphism of the GCPII gene. To estimate the range for the population frequencies, 99% confidence intervals were calculated. Results: The frequencies observed in our country were significantly different from others, being similar to those obtained in countries of the Mediterranean European area. The 1561C-T polymorphism of the GCPII gene has a frequency in Spain of 5.11%, which is also similar to the values observed in France (5%) and in Italy (6%). On the other hand, the frequency of the genotypes CTCC, TTAC is quite few, while the genotype TTCC was not observed in any mother or infants. A meta-analysis was performed for a big sample (23,612 individuals) and the results showed that with a 99% of probability the values for the genotype combinations CTCC, TTAC, and TTCC were within 0.10-0.24; 0.20-0.36; and 0.003-0.05, respectively. Conclusions: Our results are important to further analyze the relationship with some health problems and individual susceptibilities. Indeed, considering the published observations of the structure and function of the MTHFR enzyme, it is understandable that those genotype combinations that are quite little frequent, may be related to the embryo-fetal viability, and to the life style of each population