Sequence-based typing of clinical and environmental Legionella pneumophila isolates in Shenyang, China / Tipificación mediante secuenciación de aislados clínicos y ambientales de Legionella pneumophila en Shenyang, China

ABSTRACT

Introduction: We performed SBT (sequence-based typing) on clinical and environmental Legionellapneumophila isolates in Shenyang (China). We analyzed and compared the results with those obtained by PFGE (pulsed field gel electrophoresis). Methods: Twenty-two L. pneumophila isolates were collected from two patients with L. pneumophila infection, two hospitals, and 13 office buildings. There were two clinical isolates, one strain isolated from domestic tap water, another from shower water and 18 strains from cooling tower water. All these isolates were analyzed by SBT and PFGE methods. Results: The 22 isolates were divided into 7 types by SBT. Five isolates belonged to novel sequence types (ST2345, ST2344, ST2406, ST2407, and ST2408) and one isolate belonged to ST328. The STs were not obtained for two of the isolates. The remaining 14 isolates belonged to ST1. PFGE typing divided the 22 isolates into 14 pulsotypes. The main pulsotype was SYC, which included seven isolates. Conclusion: Both typing methods showed that predominant clonal lines exist in the Shenyang region, with high levels of genetic polymorphisms. Five novel STs were identified, indicating a unique genetic composition of L. pneumophila strains in this region, which are significantly different from those found in other environmental water systems in the world.(UA)

RESUMEN

Introducción: Realizamos una tipificación mediante secuenciación (SBT) de aislados clínicos y ambientales de Legionellapneumophila en Shenyang, China. Analizamos y comparamos los resultados con los obtenidos por electroforesis en campo pulsado (PFGE). Métodos: Se recogieron 22 aislados de Legionella pneumophila de dos pacientes con infección por Legionella pneumophila, dos hospitales y 13 edificios de oficinas. Hubo dos aislados clínicos, una cepa aislada del agua del grifo doméstico, otra del agua de la ducha y 18 cepas del agua de la torre de refrigeración. Todos estos aislados se analizaron por los métodos SBT y PFGE. Resultados: Los 22 aislados se dividieron en siete tipos de SBT; cinco aislados pertenecían a nuevos tipos de secuencia (ST2345, ST2344, ST2406, ST2407 y ST2408) y un aislado pertenecía a ST328. No se obtuvieron secuenciotipos (ST) de dos de los aislados. Los 14 aislados restantes pertenecían a ST1. La tipificación por PGGE dividió los 22 aislados en 14 pulsotipos. El pulsotipo principal fue SYC, e incluyó siete aislados. Conclusión: Ambos métodos de tipificación mostraron que existen líneas clonales predominantes en la región de Shenyang, con altos niveles de polimorfismos genéticos. Se identificaron cinco nuevos ST, lo que indica una composición genética única de las cepas de Legionellapneumophila en esta región, que difieren significativamente de las que se encuentran en otros sistemas hídricos ambientales del mundo.(AU)