Diagnóstico de las infecciones por subtipos no B del VIH-1 y por VIH-2 / Diagnosis of HIV-1 non-B subtypes and HIV-2

RESUMEN

La diversidad genética del virus de la inmunodeficienciahumana (VIH) constituye un reto para su identificación ycaracterización microbiológica. A la continua aparición denuevas variantes se une la diseminación global de tipos,subtipos y formas recombinantes, lo que obliga a conocerla fiabilidad de las pruebas diagnósticas empleadas parareconocer dichas cepas. En esta revisión se analizan losproblemas que actualmente plantean los métodos decribado, diagnóstico y monitorización de las variantesgenéticas distintas del VIH-1 subtipo B. También seexamina el rendimiento de algunos algoritmosdiagnósticos de introducción más reciente, como lospropuestos para caracterizar el tropismo viral. Mientrasque el comportamiento de las pruebas serológicas y deácidos nucleicos es excelente para la mayoría de las cepasdel VIH, exceptuando las genéticamente más separadas(VIH-1 grupos O, N y VIH-2), el de las herramientasbioinformáticas es más pobre, y principalmente es fiablepara el subtipo B del VIH-1. En conclusión, la continuadiversidad genética del VIH obliga a estar atento alrendimiento de las pruebas de cribado y es un estímuloconstante para el desarrollo de técnicas moleculares queaseguren la detección de todas las infecciones por VIH. Laincorporación de los resultados de estudios in vitro yclínicos sobre las variantes distintas del VIH-1 subtipo Bpermitirá una mejora de las plataformas bioinformáticas(AU)

ABSTRACT

The high genetic diversity of human immunodeficiencyvirus (HIV) poses a significant challenge to the diagnosisand microbiological characterization of HIV infection.Because of the continual emergence of new variants and the global spread of HIV groups, subtypes andrecombinant forms, accurate diagnostic tools are of primeimportance.The present review analyzes the problems posed by HIVassays for antibody screening, nucleic acid testing andpatient monitoring in HIV-1 non-B subtypes, as well as theutility of some recently introduced genetic algorithms,such as those proposed for the characterization of viraltropism. Overall, the reliability of serological andmolecular tests for HIV-1 strains is high, except for themore genetically diverse HIV variants (HIV-1 group O, N,and HIV-2). In contrast, genetic algorithms showacceptable accuracy for HIV-1 subtype B, but are lessaccurate for non-B subtypes.In conclusion, the ongoing evolution of HIV requiresconstant monitoring of the performance of screening testsand provides a stimulus to the development of molecularassays to detect all spreading and emerging HIV variants.The availability of both in vitro and clinical data fromstudies of HIV-1 non-B subtypes will improve theperformance of bioinformatics tools(AU)