Identificacao e caracterizacao de transcritos humanos: novas famílias de pequenas GTPases e novos Longos RNAs intrônicos não-codificantes / Identification and caracterization of human transcripts: novel small GTPase gene families and novel Long Intronic non-coding RNAs
São Paulo; s.n; 27 nov. 2006. 202 p. ilus, tab, graf.
Thesis
em Pt
| LILACS
| ID: lil-450118
Biblioteca responsável:
BR40.1
Localização: BR40.1; 574.88, L892i
RESUMO
Terminado o sequenciamento do genoma humano, as atenções se voltaram para a determinação do conjunto completo de transcritos humanos. Diversos trabalhos sugerem que enquanto apenas uma pequena fração de mRNAs codificantes para proteína não é conhecida, existe um grande número de RNAs não-codificantes (ncRNAs) ainda não caracterizados. Nesse contexto, o presente trabalho visou explorar as informações de expressão gênica contidas em ESTs para identificar e caracterizar novos transcritos humanos. A busca genômica por membros de famílias gênicas relacionadas com câncer levou a identificação de novas pequenas GTPases, destacando uma subfamília que deve apresentar função supressora tumoral em próstata. Uma classe de ncRNAs longos, sem splicing, expressos antisenso a partir de regiões intrônicas foi descrita utilizando plataformas de microarrays, construídas pelo grupo, enriquecidas com seqüências sem anotação. O perfil de expressão de 23 ncRNAs intrônicos estava significativamente correlacionado com o grau de diferenciação de tumores de próstata (Gleason Score), e pode ser utilizado como candidato a marcador molecular de prognóstico. Um total de 39 ncRNAs intrônicos responderam à estimulação por andrógeno, apontando para um mecanismo regulatório da expressão intrônica por sinais fisiológicos hormonais. A biogênese da expressão intrônica parece ser complexa, pois uma fração não é transcrita pela RNA Polimerase II. A transcrição intrônica estava correlacionada com uso de exons em células tratadas com andrógeno. Assinaturas de expressão intrônica conservadas em tecidos humanos e de camundongos, e interações de transcritos intrônicos com proteínas regulatórias foram observadas. Este trabalho contribui com novas e originais evidências que dão apoio ao papel postulado para esses ncRNAs no controle fino do programa transcricional humano
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Coleções:
01-internacional
Base de dados:
LILACS
Assunto principal:
Neoplasias da Próstata
/
Precursores de RNA
/
Íntrons
/
Expressão Gênica
/
Genômica
/
GTP Fosfo-Hidrolases
/
Androgênios
Tipo de estudo:
Diagnostic_studies
/
Prognostic_studies
Limite:
Animals
Idioma:
Pt
Ano de publicação:
2006
Tipo de documento:
Thesis
País de publicação:
Brasil