Genetic power of a Brazilian three-generation family with generalized aggressive periodontitis

ABSTRACT

Aggressive periodontitis is a multifactorial disease with strong familial aggregation. Genetic linkage analysis is a method to localize causative or predisposing genes along the chromosome, thus helping to unravel important pathogenic pathways. Prior to applying this method, however, it is essential to estimate the power of the study design. The aim of this study was to estimate the power of a large Brazilian family with generalized aggressive periodontitis (GAgP) for future linkage analysis. A three-generation family was seen at the Dental School of the Federal University of Bahia. A full-mouth periodontal probing at 6 sites/tooth was performed in all 23 family members. Five out of 10 siblings were affected with GAgP. A parametric simulation (? = 0) was performed on 100 replicates using the statistical software SLINK for linkage analysis. The linkage LOD score criteria for complex diseases described by Haines was adopted. There was maximum expected LOD scores of 3.56 and 3.48 at penetrance rate F = 0.98, and both studied phenocopy rates p=0.0 and p=0.02, respectively. The analyzed family showed statistical power for future genetic linkage analysis of candidate genes to GAgP.

RESUMO

Periodontite agressiva é uma doença multifatorial que apresenta forte agregação familiar. Análise de ligação genética é um método que localiza genes que causem ou predisponham doenças ao longo do cromossomo e pode ser útil na descoberta de importantes mecanismos patogênicos. No entanto, antes de se realizar uma análise genética de ligação, é essencial estimar o poder do estudo delineado. O objetivo deste estudo foi estimar o poder de uma grande família apresentando periodontite agressiva generalizada para futura análise genética de ligação. Uma família de três gerações (23 membros) que procurou por tratamento periodontal na Faculdade de Odontologia da Universidade Federal da Bahia foi analisada. Em todos os membros familiares foi realizado um exame periodontal completo em seis sítios/dente em todas as unidades dentais presentes por um único examinador. Dos dez irmãos, cinco apresentaram a periodontite agressiva generalizada de acordo com o sistema de classificação da Academia Americana de Periodontia 1999. Uma simulação paramétrica (? = 0) foi realizada em 100 repetições com o uso do software SLINK para ligação genética. O escore logarítmico LOD descrito como critério para doenças complexas (poligênicas ou multifatoriais) por Haines foi adotado. Em nosso estudo foi encontrado um LOD esperado máximo de 3,56 e 3,48 na razão de penetrância F=0,98 nas duas razões de fenocópia estudadas p=0,0 e p =0,02, respectivamente. A família analisada mostrou ter poder estatístico suficiente para futura análise de ligação genética de genes candidatos para periodontite agressiva generalizada.