A 16S rDNA PCR-based theoretical to actual delta approach on culturable mock communities revealed severe losses of diversity information.

Dos Santos, Hellen Ribeiro Martins; Argolo, Caio Suzart; Argôlo-Filho, Ronaldo Costa; Loguercio, Leandro Lopes

Dos Santos, Hellen Ribeiro Martins; Argolo, Caio Suzart; Argôlo-Filho, Ronaldo Costa; Loguercio, Leandro Lopes.

Afiliação

Dos Santos HRM; Department of Biological Sciences (DCB), State University of Santa Cruz (UESC), Pav. Jorge Amado, Rod. BR 415, Km 16, Salobrinho, Ilhéus, BA, 45662-000, Brazil.
Argolo CS; Department of Biological Sciences (DCB), State University of Santa Cruz (UESC), Pav. Jorge Amado, Rod. BR 415, Km 16, Salobrinho, Ilhéus, BA, 45662-000, Brazil.
Argôlo-Filho RC; Department of Biological Sciences (DCB), State University of Santa Cruz (UESC), Pav. Jorge Amado, Rod. BR 415, Km 16, Salobrinho, Ilhéus, BA, 45662-000, Brazil. ronaldoargolo@yahoo.com.br.
Loguercio LL; Department of Biological Sciences (DCB), State University of Santa Cruz (UESC), Pav. Jorge Amado, Rod. BR 415, Km 16, Salobrinho, Ilhéus, BA, 45662-000, Brazil.

BMC Microbiol ; 19(1): 74, 2019 04 08.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-30961521

Assuntos

DNA Ribossômico/genética; Endófitos/classificação; Variação Genética; Microbiota; Modelos Teóricos; Bactérias/classificação; Bactérias/crescimento & desenvolvimento; Cacau/microbiologia; Impressões Digitais de DNA; Primers do DNA; DNA Bacteriano/genética; Filogenia; Reação em Cadeia da Polimerase; RNA Ribossômico 16S/genética; Análise de Sequência de DNA; Células-Tronco

Palavras-chave

16S rDNA metagenomics; ARDRA; CAPS; Chimeric sequences; Community structure; Fingerprinting methods; Hypervariable regions; Microbial ecology and diversity; PCR-RFLP; Plant-associated bacteria

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Variação Genética / DNA Ribossômico / Endófitos / Microbiota / Modelos Teóricos Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: BMC Microbiol Assunto da revista: MICROBIOLOGIA Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil País de publicação: Reino Unido

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