Computing, Analyzing, and Comparing the Radius of Gyration and Hydrodynamic Radius in Conformational Ensembles of Intrinsically Disordered Proteins.

Ahmed, Mustapha Carab; Crehuet, Ramon; Lindorff-Larsen, Kresten

Ahmed, Mustapha Carab; Crehuet, Ramon; Lindorff-Larsen, Kresten.

Afiliação

Ahmed MC; Structural Biology and NMR Laboratory, Linderstrøm-Lang Centre for Protein Science, Department of Biology, University of Copenhagen, Copenhagen N, Denmark.
Crehuet R; Structural Biology and NMR Laboratory, Linderstrøm-Lang Centre for Protein Science, Department of Biology, University of Copenhagen, Copenhagen N, Denmark.
Lindorff-Larsen K; Institute for Advanced Chemistry of Catalonia (IQAC-CSIC), Barcelona, Spain.

Methods Mol Biol ; 2141: 429-445, 2020.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32696370

Assuntos

Proteínas Intrinsicamente Desordenadas/química; Conformação Proteica; Espalhamento a Baixo Ângulo; Difração de Raios X/métodos; Sequência de Aminoácidos; Teorema de Bayes; Proteínas de Ciclo Celular/metabolismo; Proteínas Inibidoras de Quinase Dependente de Ciclina/química; Proteínas Inibidoras de Quinase Dependente de Ciclina/metabolismo; Eletroforese em Gel de Campo Pulsado; Entropia; Proteínas F-Box/metabolismo; Hidrodinâmica; Interações Hidrofóbicas e Hidrofílicas; Imageamento por Ressonância Magnética; Modelos Moleculares; Ressonância Magnética Nuclear Biomolecular/métodos; Fosforilação; Dobramento de Proteína; Processamento de Proteína Pós-Traducional; Proteínas de Saccharomyces cerevisiae/química; Proteínas de Saccharomyces cerevisiae/metabolismo; Espectrometria de Fluorescência; Eletricidade Estática; Ubiquitina-Proteína Ligases/metabolismo

Palavras-chave

Compaction; Conformational ensemble; Hydrodynamic radius; Intrinsically disordered protein; Radius of gyration

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Conformação Proteica / Difração de Raios X / Espalhamento a Baixo Ângulo / Proteínas Intrinsicamente Desordenadas Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Methods Mol Biol Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article País de afiliação: Dinamarca País de publicação: Estados Unidos

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