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The complete mitochondrial genome of the Chilean endemic frog Telmatobius chusmisensis Formas, Cuevas & Nuñez, 2006 (Anura, Telmatobiidae).
Pastenes, Luis; Valdivieso, Camilo; Del Pozo, Talía; Méndez, Marco A.
Afiliação
  • Pastenes L; Laboratorio de Genética y Evolución, Departamento de Ciencias Ecológicas, Facultad de Ciencias, Universidad de Chile, Santiago, Chile.
  • Valdivieso C; Laboratorio de Genética y Evolución, Departamento de Ciencias Ecológicas, Facultad de Ciencias, Universidad de Chile, Santiago, Chile.
  • Del Pozo T; Laboratorio de Bioinformática y Expresión Génica, INTA, Universidad de Chile, Santiago, Chile.
  • Méndez MA; Laboratorio de Genética y Evolución, Departamento de Ciencias Ecológicas, Facultad de Ciencias, Universidad de Chile, Santiago, Chile.
Mitochondrial DNA B Resour ; 1(1): 136-137, 2016 Mar 28.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-33473436
Telmatobius chusmisensis is an endemic frog of northern Chile that is only known at its type locality, Chusmisa. In this study, the complete mitochondrial genome of Telmatobius chusmisensis was assembled using high-throughput sequencing data, yielding a circular genome of 19 312 bp with a nucleotide composition of A = 30.8%, C = 24.4%, G = 13.6% and T = 31.2%. Its gene composition and structure were similar to other anuran genomes available: 13 protein-coding genes, two rRNA genes, 22 tRNA genes and the D-loop region. Phylogenetic analysis using Bayesian inference (BI) and maximum likelihood (ML) showed that Telmatobius chusmisensis, T. bolivianus and T. vellardi are a highly supported monophyletic group. This genome information will allow us to gain a better understanding into phylogenetic and phylogeographic relationships in the genus Telmatobius.
Palavras-chave

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE País/Região como assunto: America do sul / Chile Idioma: En Revista: Mitochondrial DNA B Resour Ano de publicação: 2016 Tipo de documento: Article País de afiliação: Chile País de publicação: Reino Unido

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE País/Região como assunto: America do sul / Chile Idioma: En Revista: Mitochondrial DNA B Resour Ano de publicação: 2016 Tipo de documento: Article País de afiliação: Chile País de publicação: Reino Unido