Este artigo é um Preprint
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Genomic epidemiology of SARS-CoV-2 reveals multiple lineages and early spread of SARS-CoV-2 infections in Lombardy, Italy
Preprint
em Inglês
| medRxiv
| ID: ppmedrxiv-20152322
Artigo de periódico
Um artigo publicado em periódico científico está disponível e provavelmente é baseado neste preprint, por meio do reconhecimento de similaridade realizado por uma máquina. A confirmação humana ainda está pendente.
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ABSTRACT
From February to April, 2020, Lombardy (Italy) was the area who worldwide registered the highest numbers of SARS-CoV-2 infection. By extensively analyzing 346 whole SARS-CoV-2 genomes, we demonstrated the simultaneous circulation in Lombardy of two major viral lineages, likely derived from multiple introductions, occurring since the second half of January. Seven single nucleotide polymorphisms (five of them non-synonymous) characterized the SARS-CoV-2 sequences, none of them affecting N-glycosylation sites. These two lineages, and the presence of two well defined clusters inside Lineage 1, revealed that a sustained community transmission was ongoing way before the first COVID-19 case found in Lombardy.
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Texto completo:
Disponível
Coleções:
Preprints
Base de dados:
medRxiv
Tipo de estudo:
Estudo observacional
Idioma:
Inglês
Ano de publicação:
2020
Tipo de documento:
Preprint
