Este artigo é um Preprint
Preprints são relatos preliminares de pesquisa que não foram certificados pela revisão por pares. Eles não devem ser considerados para orientar a prática clínica ou comportamentos relacionados à saúde e não devem ser publicados na mídia como informação estabelecida.
Preprints publicados online permitem que os autores recebam feedback rápido, e toda a comunidade científica pode avaliar o trabalho independentemente e responder adequadamente. Estes comentários são publicados juntamente com os preprints para qualquer pessoa ler e servir como uma avaliação pós-publicação.
Effective high-throughput RT-qPCR screening for SARS-CoV-2 infections in children
Preprint
em Inglês
| medRxiv
| ID: ppmedrxiv-22270304
ABSTRACT
Systematic SARS-CoV-2 testing is a valuable tool for infection control and surveillance. However, broad application of high sensitive RT-qPCR testing in children is often hampered due to unpleasant sample collection, limited RT-qPCR capacities and high costs. Here, we developed a high-throughput approach ( Lolli-Method) for SARS-CoV-2 detection in children, combining non-invasive sample collection with an RT-qPCR-pool testing strategy. SARS-CoV-2 infections were diagnosed with sensitivities of 100% and 93.9% when viral loads were >106 copies/ml and >103 copies/ml in corresponding Naso-/Oropharyngeal-swabs, respectively. For effective application of the Lolli-Method in schools and daycare facilities, SEIR-modeling indicated a preferred frequency of two tests per week. The developed test strategy was implemented in 3,700 schools and 698 daycare facilities in Germany, screening over 800,000 individuals twice per week. In a period of 3 months, 6,364 pool-RT-qPCRs tested positive (0.64%), ranging from 0.05% to 2.61% per week. Notably, infections correlated with local SARS-CoV-2 incidences and with a school social deprivation index. Moreover, in comparison with the alpha variant, statistical modeling revealed a 36.8% increase for multiple ([≥]2 children) infections per class following infections with the delta variant. We conclude that the Lolli-Method is a powerful tool for SARS-CoV-2 surveillance and infection control in schools and daycare.
cc_by_nc_nd
Texto completo:
Disponível
Coleções:
Preprints
Base de dados:
medRxiv
Tipo de estudo:
Estudo diagnóstico
/
Experimental_studies
/
Estudo observacional
/
Revisão sistemática
Idioma:
Inglês
Ano de publicação:
2022
Tipo de documento:
Preprint