Guaiaca a software tool for supporting the use of scientific applications designed for data analysis part I: execution assistant / Guaiaca uma ferramenta de apoio ao uso de aplicativos científicos destinados a análises de dados parte I: assistente de execução

ABSTRACT

The aim of this work is to develop a software tool that provides a user-friendly graphical interface of generic and configurable design in order to ease the researchers tasks in data manipulation and analysis. Two primary targets have influenced the design: data preparation for analysis in animal breeding programs and usability increase for those applications that perform important analysis methods, but interact with users only through text files and command lines. The Guaiaca tool was designed as a utility belt in the form of two integrated assistants, and it can be combined with multiple analysis applications. This tool offers facilities to (a) collect, manipulate, and reorganize data; (b) organize, register, and retrieve analyses through descriptors; and (c) prepare and activate analysis processes. Guaiacas Execution Assistant module is described in this paper, where is also emphasized the parameters to configure, the main data structures to maintain, and the form of the relationship between its generic interface and combined analysis applications. The generic interface has been customized and validated for the peculiarities of two applications, WOMBAT (mixed models) and INTERGEN (Bayesian models). Several data analyses were performed with the interface support to prove its generality and ease of installation, configuration and operation. Data sets from 5,726 quails in

RESUMO

O objetivo deste trabalho foi desenvolver uma ferramenta de software com interface gráfica amigável, genérica e configurável, para facilitar pesquisadores na organização e gerenciamento das atividades de manipulação e análises de dados. A concepção foi baseada nas características de dois focos principais a preparação de dados para análises em pesquisas de melhoramento genético de animais e o incremento da usabilidade para aplicativos que implementam importantes métodos de análises, mas interagem com o usuário via arquivos de texto e linha de comando. A ferramenta Guaiaca foi modelada como um cinto de utilidades e desenvolvida na forma de dois assistentes integrados. Pode ser combinada com múltiplos aplicativos executores de análises. Oferece facilidades para coleta, manipulação e reorganização de dados; organização, catalogação e recuperação de análises via descritores; ativação de processos de análise. Apresenta-se uma descrição sobre o Assistente de Execução destacando os parâmetros configuráveis, as estruturas de dados mantidas e a forma de relacionamento entre a interface genérica e os aplicativos de análise combinados. A personalização de sua interface foi testada para peculiaridades dos aplicativos WOMBAT (modelos mistos) e INTERGEN (modelos bayesianos). Foram realizadas diversas análises para comprovar sua generalidade e facilidade de instalação, configuração e opera