Investigation of rodent reservoirs of emerging pathogens in Côte d'Ivoire, West Africa

Background: One of the main health problems in West Africa remains upsurge of emerging pathogens. Ebola virus disease outbreak occurred in 2014 in Liberia, Guinea and Sierra Leone, Monkeypox virus in Nigeria in 2017 and most recently Lassa virus in Nigeria, Togo and Benin in 2018. These pathogens have animal reservoirs as vectors for transmission. Proper investigation of the pathogens in their rodent vectors could help reduce and manage their emergence and spread. Methodology: This study was conducted with an approval from the Côte d'Ivoire Bioethics Community. Small mammal trappings were carried out in 9 sites within three zones namely, peri-urban, peri-rural and protected areas. Liver, lung and kidney tissues from trapped small mammals were sampled in accordance with the recommended conditions of biosafety and bioethics. The organs were transported in liquid nitrogen to the laboratory. Molecular tests were used to detect pathogens. Orthopoxviruses and Monkeypox virus were detected in the organs by PCR using consensus primers targeting the virus surface membrane haemagglutinin (HA) genes, while Leptospira species were detected by PCR using primers targeting the rrs and lfb1 genes. Results: Out of 4930 night-traps, 256 (5.19%) small mammals were trapped including Crocidura, Rattus, Lophuromys, Praomys, Mus and Mastomys. Leptospira species were detected in 6 genera from 7 study sites and the infected small mammals accounted for 13.3%. Leptospira sp was detected mainly in the rodent vector genera Rattus (32.3%), Lophuromys (29.0%), and Praomys (16.1%). Three species of Leptospira were detected and Leptospira interrogans was the most common frequent species (74.2%). Monkeypox virus was not detected from studied small mammals. Conclusion: The initial data from our investigation indicates the presence of Leptospira sp in rodent vectors, Rattus, Lophuromys and Praomys, which are the potential small mammalian reservoirs of this pathogen in Cote d'Ivoire.

Evaluation du premier jet d'urine dans la detection de Neisseria gonorrhoeae chez des patients paucisymptomatiques a Abdidjan (Cote d'Ivoire)

Il existe differentes methodes de diagnostic sur differents types de prelevement pour mettre en evidence Neisseria gonorrhoeae. Le prelevement de premier jet d'urine presente l'avantage d'etre non invasif; facilement reproductible et est deja utilise dans la detection de N. gonorrhoeae par des techniques moleculaires. L'objectif de cette etude etait d'evaluer le premier jet d'urine dans la detection de N. gonorrhoeae par les methodes classiques de bacteriologie chez des patients paucisymptomatiques. Elle a porte sur les prelevements de premier jet d'urine et de secretions uretrales de 87 patients de sexemasculin recus pour le diagnostic etiologique d'un syndrome d'infections sexuellement transmissibles. Un examen direct du frottis colore par la technique de Gram et des cultures sur le milieu de Thayer et Martin modifie et sur gelose au sang cuit enrichie en polyvitamines ont ete realises sur chacun des echantillons. La frequence des uretrites etait de 58;0. La gonococcie representait 7;5des cas. Le premier jet d'urines avait une sensibilite de 85;7et une specificite de 97;5dans la mise en evidence des diplocoques Gram negatif a l'examen direct. Par contre; il etait moins sensible que le prelevement de secretions uretrales dans la mise en evidence des uretrites microscopiques (sensibilite de 44;4et specificite de 100) et de la flore uretrale d'accompagnement (sensibilite de 59et specificite de 96;9). Les bonnes performances du premier jet d'urines dans la mise en evidence microscopique des diplocoques Gram negatif pourraient justifier son utilisation dans la detection deNeisseria gonorrhoeae dans un laboratoire de niveau 1. Il pourrait egalement etre utilise dans les etudes epidemiologiques et dans les enquetes de depistage a grande echelle

Place de l'infection a chlamydia trachomatis dans les oligoasthenospermies a Abidjan

Dans le but de rechercher la prevalence de l'infection a chlamydia trachomatis dans les oligoasthenospermies a Abidjan; 58 patients africains; de sexe masculin; sans symptomes uretraux et presentant une oligoasthenospermie ont ete analyses. L'age moyen des patients etait de 34;8 ans et 55;17 avaient un antecedent de maladie sexuellement transmissible (uretrite d'etiologie non determinee). La presence de Chlamydia trachomatis a ete recherchee par la coloration de Giemsa et la technique Elisa. A l'examen direct (coloration de Gram); 79;3 pour cent des patients presentaient des signes d'uretrite (polynucleaires neutrophiles superieurs a 5 par champ X 1000). Parmi ceux-ci; 45;65 pour cent avaient des cellules a inclusion et 19 pour cent etaient positifs pour l'antigene chlamydia en Elisa. La severite de l'oligoasthenospermie; semble liee a l'infection a Chlamydia trachomatis et la place de Neisseria gonorrhoeae n'est pas negligeable (26 pour cent)