Where do we aspire to publish? A position paper on scientific communication in biochemistry and molecular biology

The scientific publication landscape is changing quickly, with an enormous increase in options and models. Articles can be published in a complex variety of journals that differ in their presentation format (online-only or in-print), editorial organizations that maintain them (commercial and/or society-based), editorial handling (academic or professional editors), editorial board composition (academic or professional), payment options to cover editorial costs (open access or pay-to-read), indexation, visibility, branding, and other aspects. Additionally, online submissions of non-revised versions of manuscripts prior to seeking publication in a peer-reviewed journal (a practice known as pre-printing) are a growing trend in biological sciences. In this changing landscape, researchers in biochemistry and molecular biology must re-think their priorities in terms of scientific output dissemination. The evaluation processes and institutional funding for scientific publications should also be revised accordingly. This article presents the results of discussions within the Department of Biochemistry, University of São Paulo, on this subject.

Estudo etnofarmacológico em entorno de floresta urbana como subsídio para a implantação da Fitoterapia no Sistema Único de Saúde / Ethnopharmacological study surrounding urban forest as a resource for the implementation of herbal medicine in the National Health System

RESUMO O estudo etnofarmacológico pode ser definido como exploração científica interdisciplinar dos agentes biologicamente ativos, tradicionalmente utilizados por populações humanas e que fazem parte de um acervo de conhecimento compartilhado. Desta forma o presente estudo teve como objetivo o estudo etnofarmacológico de plantas medicinais, no entorno de floresta urbana na Reserva Biológica Poço D’Anta em Juiz de Fora/MG visando a implantação da fitoterapia no Sistema Único de Saúde. Para este, realizou-se levantamento com três diferentes amostras: profissionais de saúde, domicílios em geral e especialistas locais. Quanto aos profissionais de saúde, pôde-se constatar que nenhum entrevistado soube conceituar o termo “Fitoterápico” e que não conheciam as políticas vigentes. Constatou-se que há aceitabilidade da implantação de Fitoterapia na saúde pública, porém, o conhecimento do tema é limitado. A partir das entrevistas nos domicílios em geral e com os especialistas locais, selecionou-se um total de 20 espécies botânicas para análise estatística e confirmação farmacológica. Esses resultados possibilitaram confrontar o conhecimento cultural com científico, com base em 14 espécies que poderiam ser cultivadas em horto na Reserva Biologica Poço D´Anta, com base em suas relevâncias locais. Os resultados obtidos podem subsidiar a aproximação do saber popular em relação ao científico, servindo de base para manutenção e fomento da implantação da Fitoterapia no sistema único de saúde.

ABSTRACT The ethnopharmacological study can be defined as an interdisciplinary scientific exploration of biologically active agents, traditionally used by human populations and part of a shared body of knowledge. Thus, the current study focused on the ethnopharmacological research of medicinal plants, in the surroundings of the urban forest in the Biological Reserve PoçoD’Anta in Juiz de Fora / MG, aiming on the implementation of the herbal medicine in the Public Health System. For this purpose, a survey was held with three different groups: health professionals, members of the community and local experts.Concerning the health professionals, it could be verified that none of the participants were able to explain the term Phytotherapic and neither they had knowledge about the relevant and applicable policies.The acceptability for the implantation of Phytotherapy for public health use was observed, but the knowledge about this subject is limited. From the interviews with members of the community and local experts, a total of 20 plant species were selected for a statistical analysis and pharmacological confirmation. These results made possible to compare the cultural knowledge with the scientific one, defining 14 species that could be grown in the garden of the Biological Reserve Poço D’Anta, based on their local relevance. The results can support the approximation of the popular knowledge with the scientific one, providing a basis for the maintenance and promotion of the Phytotherapy in the Public Health System.

Avaliação do efeito do alho (Allium sativum L. ) sobre o colesterol plasmático em coelhos com hipercolesterolemia induzida / Evaluation of garlic (Allium sativum L. ) effects on the serum cholesterol of rabbits with induced hypercholesterolemia

A utilização de plantas no tratamento de doenças ou como meio curativo é uma tradição popular e altamente difundida, sendo que muitos trabalhos abordam as propriedades terapêuticas e farmacológicas do alho na redução das hiperlipidemias. O objetivo deste estudo foi investigar a influência do extrato aquoso (E.A.) do alho (Allium sativum L.) no tratamento do colesterol plasmático em coelhos com hipercolesterolemia experimental. Os animais foram divididos em G1 (grupo controle) e G2 (grupo tratado com alho). O experimento foi desenvolvido em três fases: na 1ª fase os animais receberam dieta comercial de coelhos para avaliar o nível basal de colesterol nos animais; na 2ªfase, todos os animais passaram a receber dieta suplementada com gema de ovo, até o final do experimento, para desenvolver hipercolesterolemia, e; na 3ª fase os animais do grupo G2 receberam o tratamento com E. A. de alho. O colesterol na 1ª fase foi de 39,94 ± 9,57 mg dL-1. Na 2ª fase houve elevação significativa (p<0,05) no nível de colesterol plasmático nos dois grupos -acima de 100 mg dL-1. Com relação ao tratamento, o alho não promoveu redução no colesterol plasmático dos coelhos, contrapondo os dados da literatura.

The use of plants to treat diseases or even to cure them is a high diffused popular tradition, and several studies discuss the therapeutic and pharmacological properties of garlic in the reduction of hyperlipidaemias. The objective of the present study was to investigate the influence of the aqueous extract of garlic (Allium sativum) to treat the serum cholesterol of rabbits with experimental hypercholesterolemia. The animals were divided into G1 (control group) and G2 (group treated with garlic). The experiment was developed according to 3 phases: during the 1st phase, all animals were provided with a regular diet to evaluate the basal cholesterol; during the 2nd phase, all animals received a supplemented diet until the end of the experiment, in order to develop hypercholesterolemia and, in the 3rd phase, the animals on G2 received the garlic treatment. The cholesterol registered on the 1st phase was 39.94 ± 9.57 mg dL-1. On the 2nd phase, there was an increase on the serum cholesterol level in both groups - higher than 100 mg dL-1. Concerning the treatment, the garlic did not reduce the serum cholesterol in rabbits.

Efeito do extrato aquoso de cabelo de milho (Zea mays L. ) sobre a excreção renal de água e eletrólitos e pressão arterial em ratos Wistar anestesiados / Effect of aqueous extract of corn silks (Zea mays L. ) on the renal excretion of water and electrolytes and arterial pressure in anesthetized Wistar rats

O milho (Zea mays L.) possui nos estigmas (cabelo de milho) substâncias que o tornam diurético, podendo ser importante no controle da hipertensão. No presente estudo, foi investigado o efeito do extrato aquoso (EA) do cabelo de milho sobre o fluxo renal de água (V) e eletrólitos e a pressão arterial (PA) em ratos Wistar anestesiados. Foram realizados 3 grupos: I) Controle - administração intragástrica (AI) de 1mL de água destilada; II) AI de 1 mL de EA de cabelo de milho a 20 por cento e III) AI de 1 mL de solução contendo furosemida. Canulou-se a artéria carótida esquerda para mensuração da PA, de 10 em 10 minutos, e a bexiga urinária, para mensuração de V de 30 em 30 minutos e da carga excretada dos íons sódio (Qe (Na+)) e potássio (Qe (K+)). Protocolo experimental: quatro períodos de 30 minutos cada: basal (avaliação dos parâmetros basais) e experimentais (Ex) 1, 2 e 3 (30, 60 e 90 minutos após a AI, respectivamente). O Grupo I não apresentou alterações significativas entre os períodos nos parâmetros analisados (p>0,05). O Grupo II apresentou aumento significativo (p<0,05) em V, em Qe (Na+) e em Qe (K+) nos períodos Ex2 e Ex3, com redução significativa na PA (p<0,05) em Ex2 e Ex3. Conforme esperado, o Grupo III apresentou aumento significativo em V nos períodos Ex2 (p<0,05) e Ex3 (p<0,001), aumento em Qe (Na+) em Ex1 (p<0,05), Ex2 (p<0,001) e Ex3 (p<0,001) e aumento em Qe (K+) em Ex2 (p<0,05) e Ex3 (p<0,001), com redução significativa na PA (p<0,05) em Ex2 e Ex3. Os dados mostram que o EA do cabelo de milho possui efeito diurético, porém não age como um diurético "de alça", uma vez que não levou à expoliação de potássio e nem a uma excreção tão acentuada de sódio quanto à furosemida.

The corn (Z. mays) has in its stigmas (corn silks) substances that make it diuretic, which may be important in hypertension control. In this study, the effect of aqueous extract (AE) of corn silks on the renal flow of water (V) and electrolytes and arterial pressure (AP) was investigated in anesthetized Wistar rats. Three groups were tested: I) Control - intragastric administration (IA) of 1mL of distilled water, II) IA of 1 mL of AE of corn silks at 20 percent and III) IA of 1 mL of a solution containing furosemide. Cannulation was performed in the left carotid artery to measure AP, at every 10 minutes, and in the urinary bladder to measure V, at every 30 minutes, and the excreted load of ions sodium (Qe (Na+)) and potassium (Qe (K+)). Experimental protocol: four periods of 30 minutes each: basal (evaluation of basal parameters) and experimental (Ex) 1, 2 and 3 (30, 60 and 90 minutes after IA, respectively). Group I had no significant differences between periods for the analyzed parameters (p>0.05). Group II presented a significant increase (p<0.05) in V, Qe (Na+) and Qe (K+) in periods Ex2 and Ex3, with significant reduction in AP (p<0.05) in Ex2 and Ex3. As expected, Group III had a significant increase in V in periods Ex2 (p<0.05) and Ex3 (p<0.001), an increase in Qe (Na+) in Ex1 (p<0.05), Ex2 (p<0.001) and Ex3 (p<0.001) and an increase in Qe (K+) in Ex2 (p<0.05) and Ex3 (p<0.001), with an important reduction in AP (p<0.05) in Ex2 and Ex3. These data show that AE of corn silks has a diuretic effect but does not act as a loop diuretic since it did not lead to potassium loss or marked sodium loss, compared to furosemide.

Immunocytochemical and biochemical detection of alpha-L-fucosidase in Trypanosoma cruzi

The aim of the present study was to demonstrate the presence of alpha-L-fucosidase in Trypanosoma cruzi. Immunocytochemical and biochemical techniques were used to localize and characterize a membrane-associated, neutral-pH-optimum, alpha-L-fucosidase from the parasite. Light and electron microscopy localized the alpha-L-fucosidase specifically on the surface of the parasite and on membranes in the posterior region of the epimastigote stage. Although much less intense, labeling was also detected on the surface of trypomastigotes. At least 50 percent of the alpha-L-fucosidase activity was associated with epimastigote membrane solubilized with 1 M NaCl or 1 percent Triton X-100, suggesting that alpha-L-fucosidase is peripherally associated with membranes. The enzyme from epimastigotes had a neutral pH optimum (near 7) but displayed low specific activity when p-nitrophenyl-alpha-L-fucoside was employed as substrate (0.028 U/mg protein for epimastigotes and 0.015 U/mg protein for tissue culture-derived trypomastigotes). Polyacrylamide gel electrophoresis and Western blotting analysis both showed an expected 50-kDa polypeptide which was immunoreactive with anti-alpha-L-fucosidase antibodies

Inquérito sobre conhecimentos e atitudes da população sobre a transmissão do dengue - região de Campinas São Paulo, Brasil - 1998 / A survey of knowledge and attitudes in a population about dengue transmission - region of Campinas São Paulo, Brazil - 1998

A survey with 502 interviews was realized in the region of Campinas (S.P.) to evaluate the community's knowledge and concepts regarding dengue: disease, vector and prevention. This information was then compared with the actual behavior towards prevention and the presence of breeding sites. Three neighborhoods of Santa Barbara D'Oeste (170,000 inhabitants) were chosen because they were located in the first municipality with autochthonous transmission, since 1995. Areas with better social and urban conditions scored higher in terms of knowledge compared with peripheral neighborhoods, even though these regions had priority in the local education program, due to case notification. However, breeding sites were found equally in both regions. A major gap between knowledge and attitude was detected in all regions. The results of the survey can help the organization of education programs to find ways to put this knowledge into practice. This instrument is useful to monitor the impact of dengue control programs.

Trata-se de um inquérito amostral (502 entrevistas) realizado na região de Campinas SP, em Santa Bárbara D'Oeste (170.000 habitantes), por ser o primeiro município a registrar casos de dengue autóctone na região, desde 1995. Avaliou-se o conhecimento da população sobre o dengue, seu vetor e prevenção em 3 bairros da cidade. Estas informações foram comparadas com a presença de criadouros no ambiente domiciliar, em áreas com e sem transmissão. O bairro com melhores condições sociais e urbanas apresentaram conhecimento mais adequado sobre a doença, embora os bairros periféricos tenham sido priorizados em atividades educativas devido à ocorrência de casos. Observou-se criadouros em todas as áreas examinadas, em quantidades semelhantes. Constatou-se a distância entre conhecimento e mudanças de comportamento. Identificou-se as fontes de informações mais referidas e os criadouros predominantes nos domicílios. Os resultados deste inquérito podem servir como subsídios para (re)orientar ações educativas das equipes de controle de vetores, bem como avaliar um instrumento simplificado para acompanhamento do impacto do programa local de controle do dengue.

RNA and DNA aptamers as potential tools to prevent cell adhesion in disease

Recent research has shown that receptor-ligand interactions between surfaces of communicating cells are necessary prerequisites for cell proliferation, cell differentiation and immune defense. Cell-adhesion events have also been proposed for pathological conditions such as cancer growth, metastasis, and host-cell invasion by parasites such as Trypanosoma cruzi. RNA and DNA aptamers (aptus = Latin, fit) that have been selected from combinatorial nucleic acid libraries are capable of binding to cell-adhesion receptors leading to a halt in cellular processes induced by outside signals as a consequence of blockage of receptor-ligand interactions. We outline here a novel approach using RNA aptamers that bind to T. cruzi receptors and interrupt host-cell invasion in analogy to existing procedures of blocking selectin adhesion and function in vitro and in vivo

Uso de escores preditivos na parada cardiorrespiratória em UTI pediátrica / Application of predictive score in cardiopulmonary arrest in pediatric ICU

Foram estudados prospectivamente em todos os 108 casos de parada cardiorrespiratoria (PCR) que ocorreram nas 501 internacoes na UTIP da Unesp em dois anos, a idade, estado nutricional, patologias envolvidas, escores prognosticos disfuncao de multiplos orgaos e evolucao. Os principais foram: Insuficiencia Respiratoria, Choque, Broncopneumonia. Houve grande incidencia de entroficos, porem a mortalidade foi crescente com a piora nutricional (eut. - 55,8 por cento; DPCI - 66,7 por cento; DPCII - 75 por cento; DPCIII - 75,9 por cento). O tempo de internacao foi prolongado (apneia/bradicardia - 11,5 + 6,6 d.; PCR sob. - 9,8 + 7,4 d.; PCR =b. - 6,2 + 10.3 d.). A mortalidade foi maior (88,6 por cento nas criancas maiores de um ano com maior instabilidade fisiologica (PRISM - 31.1 + 10,8) e maior intervencao terapeutica (TISS - 50,6 + 7). Com o aumento do numero de disfuncoes organicas aumentou a mortalidade devido a uma maior instabilidade fisiologica e maior necessidade de intervencao terapeutica (um sistema (d.s.) - 16,7 por cento mortalidade; tempo de internacao (t.i) - 2,7 + 2 d.; PRISM 15,5 + 5,7; TISS 27,5 + 6,4; 2 d.s. - 51, 7 por cento mort.; t.i. - 5,3 + 4,7 d.; PRISM 20,5 + 7,7,; TISS 44,1 + 7,3; 3 d.s. - 69 por cento mort., t.i. - 8,5 + 10,8 d.; PRISM 28,2 + 9,1; TISS 50,6 + 5,6; 4 ou + d.s. - 77,3 por cento mort.; t.i. - 9,2 + 11 d.; PRISM 34,7 + 9,1; TISS 53,8 + 4,6). Os sistemas que apresentaram maior incidencia de disfuncao foram o hemodinamico em 104 pacientes com mortalidade de 69 por cento e o respiratorio com mortalidade de 65,4 por cento, porem a disfuncao gastrointestinal, renal e neurologica apresentaram a maior mortalidade (respectivamente 100 por cento, 89,3 por cento e 85,1 por cento) com maior instabilidade fisiologica (PRISM 35,4 + 9,3; 37,5 + 7,7; e 34,7 + 9,6) e maior intervencao terapeutica (TISS 54,3 + 4,6; 55,9 + 5,5; e 52,2 + 6,5). Quando a mortalidade prevista pelo PRISM foi maior que 60 por cento, 81,8 por cento destes pacientes faleceram demonstrando a boa correlacao em prever o obito deste escore preditivo. A medida que a instabilidade fisiologica e a necessidade de intervencao terapeutica aumentou, diminuiu o tempo ate o obito. Concluimos entao ser freqnente a PCR em UTIP (21,6 por cento das internacoes); com mortalidade de 64,8 por cento semelhante a dados de literatura, sendo bem avaliados por dados de escores prognostico; a mortalidade aumenta com a piora nutricional, com o aumento na instabilidade fisiologica medida...

Members of the Tc-85 protein family from Trypanosoma cruzi are adhesion proteins

In recent years, attention has been focused on the characterization of surface proteins from Trypanosoma cruzi in an attempt to understand the invasion mechanism of the parasite. Among the molecules described by different laboratories, we report an 85-KDa glycoprotein specific for the trypomastigote stage (Tc-85) which has been implicated in the invasion of host cells by the parasite. The hypothesis that different members of the Tc-85 protein family are involved in the adhesion of the parasite to the host is discussed.

Turnover and shedding of the Tc-85 surface glycoprotein of Trypanosoma cruzi trypomastigotes

Tc-85 is an 85-kDa surface glycoprotein specific for the trypomastigote stage of Tripanosoma cruzi which has been implicated in the invasion of host cells by the parasite. Tc-85 has a half-life of 3.5-4 h and is synthesized as a 95-kDa precursor. Processing of the 95-kDa precursor is inhibited by N-p-tosyl-L-lysine chloromethyl ketone, p-chloromercuriphenylsulfonic acid, iodoacetamide or N-ethylmaleimide, but not by aprotinin, antipain or phenylmethylsulfonil fluoride. Tc-85, but not the precursor, is rapidly shed into the medium, allowing a correlation between the decrease of Tc-85 in trypomastigotes and its increase in the culture medium. The shedding of Tc-85 was inhibited 50 per cent by 1 muM tunicamycin, but not by 10 muM swainsonine or 10 muM 1-deoxynojirimycin under the experimental conditions employed. This suggests that N-linked oligosaccharides are important for the shedding phenomenon, although it appears that they do not have to be fully processed for shedding to occur.

Análise dos casos de choque séptico e coagulaçäo intravascular disseminada em UTI: pediatria / Septic shock and disseminated intravascular coagulation in the intensive care unit

Realizou-se uma análise retrospectiva de 44 internaçöes na UTI pediátrica da Universidade Estadual Paulista-Unesp por choque séptico e coagulaçäo intravascular disseminada (CIVD), diagnosticados de acordo com os critérios propostos por Sprung (1991) e história crônica e laboratorial compativel com CIVD, segundo os critérios descritos por Forbes (1990) e Montgomery e Hathaway (1980). No periodo estudado 27,5 por cento dos pacientes sépticos apresentaram choque séptico e CIVD, grupo de risco foram lactentes menores de 6 meses (mais ou menos 55 por cento), desnutridos de II e II grau (>60 por cento), associaçäo infecciosa e falência de múltiplos órgäos e sistemas de acordo com critérios propostos por Wilkinson (DMOS> 4 órgäos.=80 por cento mortalidade). Encontrou-se alteraçäo hematológica no grupo de óbitos e nos sobreviventes, porém com maior gravidade nos óbitos

Leishmaniose tegumentar americana na regiäo nordeste do Estado de Säo Paulo - Brasil / American tegumentary leishmaniasis in the norheastern state of Säo Paulo - Brasil

Os autores descrevem um surto de leishmaniose tegumentar americana (LTA) instalado na regiao nordeste do Estado de Sao Paulo em 1992. Após a notificaçao de doze casos humanos em uma área rural do município de Itupeva, foi realizado um inquérito epidemiológico, destacando-se 34 por cento de positividade da populaçao à Reaçao Intradérmica de Montenegro. Constatou-se uma grande diversidade da fauna flebotomínica local, com predominância de L. migonei, L. intermedia e L. whitmani, tanto no domicílio, quanto na margem da mata. Ressalta-se a presença na margem da mata de L. longipalpis.

Trypanosoma cruzi binds to laminin in a carbohydrate-independent way

The bindings of 125I-laminin to trypomastigotes is specific and 2-5 x 10**3 laminin-binding sites were calculated to be presented on the surface of a live trypomastigote. Anti-laminin antibodies were able to inhibit the invasion of cultured cells by trypomastigotes (62-75 per cent), suggesting that laminin may be involved in the adhesion of the parasite to host cells. By affinity chromatography, an 85-KDa glycoprotein was isolated (laminin-bindign glycoprotein, LBG) from trypomastigote lysates, but not from epimastigote lysates. It is suggested that at least fragment E8 (but not E1) from laminin could be involbed in the reaction which is independent of the carbohydrate moieties from both ligand and recepto. It is also shown that LBG is member of the Tc-85 family, previously shown to be related to the invasion process of the parasite

Adenocarcinoma do apendice cecal. Relato de um caso do tipo colico. / Adenocarcinoma of the cecal appendix.Report of a case of the colic type

A proposito de um caso de adenocarcinoma do tipo colico do apendice cecal, operado no Hospital de Ensino da Faculdade de Medicina do ABC, e feita uma revisao do assundo, assinalando que, dentre os carcinomas do apendice, este tem tendencia a metastizacao por via linfatica e venosa, alem de se propagar por contiguidade. Praticamente destituido os sintomatologia propria, revela-se, na maioria das vezes, por manifestacoes de apendicite aguda. Sao ressaltadas as dificuldades de diagnostico macroscopico, o que faz com que a sua real natureza seja estabelecida, em geral, apos o exame histopatologico da peca cirurgica.A hemicolectomia direita e a operacao indicada e cujos melhores resultados sao obtidos como primeira intervencao ou dentro de 30 dias desta. No caso estudado, o paciente foi operado com o diagnostico pre e intra-operatorio de apendicite aguda e o exame histopatologico alem de confirma-lo, demonstrou a presenca da neoplasia. Indicada a reintervencao, a rapida propagacao da doenca neoplasica impediu a realizacao de qualquer procedimento desejado, demonstrando o grande potencial maligno da afeccao