Discrepancies in HLA typing: use of different methods to confirm doubtful or inconclusive results / Discrepâncias na tipagem HLA: diferentes métodos para confirmar resultados duvidosos ou inconclusivos

The major histocompatibility complex (MHC) is a set of genes found on the short arm of chromosome 6. MHC molecules in human beings are known as human leukocyte antigens (HLA). HLA polymorphism can be determined by serological and molecular typing methods, which may yield discordant results. The present analysis performed HLA typing of samples with discordant results by PCR-SSP and PCR-SSO, so that typing discrepancies could be clarified. The cross-sectional study analyzed 33 samples from individuals included in an HLA-disease association study. Discrepant alleles were observed in 6 of 33 samples. Discordant samples were retyped using One Lambda Micro SSP™, Dynal RELI™ SSO and Luminex™ SSO assays for HLA class I (HLA-A, HLA-B) and class II (HLA-DRB1) molecules. The three methods produced concordant results after HLA retyping. Human error occurred in interpreting the initial results, which led to discrepancies in the results obtained. The participation of experienced professionals and the availability of at least two different methods to confirm doubtful or inconclusive results are mandatory for effective HLA typing.

O complexo principal de histocompatibilidade (MHC) é um conjunto de genes encontrados no braço curto do cromossomo 6. Em humanos, as moléculas de MHC são conhecidas como antígenos leucocitários humanos (HLA). Polimorfismo HLA pode ser determinado por métodos de tipagem sorológica e molecular que são susceptíveis de produzir resultados discordantes. Este estudo teve como objetivo realizar a tipagem HLA de amostras com resultados discordantes por PCR-SSP e-SSO e para esclarecer discrepâncias de digitação. Este estudo transversal analisou 33 amostras de indivíduos incluídos em um estudo de associação HLA-doença. Alelos discrepantes foram observados em seis das 33 amostras. Amostras discordantes foram retyped usando One Lambda Micro SSP™, Dynal RELI™ SSO Luminex e ensaios ™ SSO para HLA de classe I (HLA-A, HLA-B) e classe II (HLA-DRB1) moléculas. Todos os três métodos apresentaram resultados concordantes após HLA redigitação. Houve erro humano na interpretação dos resultados iniciais o que levou a uma discrepância entre os resultados obtidos. Concluiu-se que a participação de profissionais experientes e com a disponibilidade de pelo menos dois métodos diferentes para confirmar os resultados duvidosos ou inconclusivos são essenciais para a tipagem de HLA eficaz.

Breve história da ciência moderna: v.2: das máquinas do mundo ao universo-máquina (séc. XV a XVII) / Brief history of modern science: v.2: the machines in the world to the universe-machine (fifteenth to seventeenth century)

Dando continuidade à série "Breve História da Ciência Moderna", esse segundo volume apresenta o período que vai do século XV ao XVII, quando as profundas transformações iniciadas ainda na Idade Média atingiram o seu ápice. A partir de um cotidiano repleto de máquinas, os europeus começaram a acreditar que tudo poderia ser compreendido por meio de sistemas mecânicos. Com isso, matemática e experimentação migraram do comércio e do trabalho dos engenheiros para os escritos dos filósofos naturais e assim nasceu a ciência moderna. O livro inclui sugestões de leitura e indicações de manifestações artísticas - pinturas, filmes e livros - ilustrativas do período e das questões estudadas. Projetada em cinco volumes, a série trata do conhecimento científico que se desenvolveu num curto período de tempo da história da humanidade - da Idade Média até hoje. Enfatizando o diálogo entre diferentes campos do conhecimento, os autores constroem um painel útil para quem deseja encontrar a porta de entrada dos principais problemas que formam o universo da ciência.

Extração de DNA a partir de sangue humano coagulado para aplicação nas técnicas de genotipagem de antígenos leucocitários humanos e de receptores semelhantes à imunoglobulina / DNA extraction from coagulated human blood for application in genotyping techniques for human leukocyte antigen and immunoglobulin-like receptors

O objetivo deste estudo foi padronizar uma metodologia de extração de DNA de alta qualidade a partir de amostras de sangue coagulado. Quarenta e oito amostras de sangue humano coagulado foram utilizadas para a extração de DNA pelo kit comercial EZ-DNA® (Biological Industries, Beit Haemek, Israel), pelo kit de coluna Neoscience® (One Lambda Inc., San Diego, CA) e pelo método modificado de salting out. Apenas o método de salting out foi capaz de extrair altas concentrações de DNA (média, 180ng/µL), as quais foram medidas pelo detector de fluorescência Qubit® (Invitrogen, USA). Este método permitiu a amplificação dos genes HLA (human leukocyte antigens) pela tecnologia PCR-SSO (polymerase chain reaction - specific sequence of oligonucleotides) Luminex, a qual exige DNA de boa qualidade, e de genes KIR (killer cell immunoglobulin-like receptors) pela técnica made in house PCR-SSP (polymerase chain reaction-sequence specific of primers), a qual demanda uma concentração específica de DNA (10ng/µL). Concluímos que a técnica de salting out modificada foi muito eficiente, simples e rápida para a extração de DNA de amostras de sangue humano coagulado, com o objetivo de realizar a genotipagem de genes HLA e KIR.

The objective of this study was to standardize a method for extracting high-quality DNA from samples of coagulated blood. Forty-eight samples of human coagulated blood were used for DNA extraction by means of the EZ-DNA® commercial kit (Biological Industries, Beit Haemek, Israel), the Neoscience® column kit (One Lambda Inc., San Diego, CA, USA) and a modified salting-out method. Only the salting-out method was able to extract high concentrations of DNA (mean, 180 ng/»l), which were measured using the Qubit® fluorescence detector (Invitrogen, USA). This method enabled amplification of HLA (human leukocyte antigen) genes using the Luminex PCR-SSO (polymerase chain reaction - sequence-specific oligonucleotide) technology, which demands good quality DNA, and amplification of KIR (killer-cell immunoglobulin-like receptor) genes using an in-house PCR-SSP (polymerase chain reaction - sequence-specific primer) technique, which demands a specific concentration of DNA (10 ng/»l). We concluded that the modified salting-out technique was very efficient, simple and fast for DNA extraction from human coagulated blood samples, with the aim of genotyping the HLA and KIR genes.

Breve história da ciência moderna: v.1: convergência de saberes (idade média) / Brief history of modern science: v.1: convergence of knowledge (mean age)

Esse primeiro volume da série Breve História da Ciência Moderna acompanha a fixação dos alicerces da ciência moderna na Europa medieval ? período que, embora chamado de Idade das Trevas, conheceu intensa ebulição cultural. Com linguagem acessível, o livro retraça o percurso do que veio a ser o novo saber científico que incorporava as contribuições da cultura árabe, numa teia de inovações nas áreas da filosofia, das artes e das técnicas até a Península Ibérica. Isso ocorreu num momento em que a Europa atravessava um processo de intensas transformações, tanto no campo econômico quanto nas antigas formas de pensar. O livro inclui sugestões de leitura, comentários de filmes sobre as questões estudadas e o período em foco e indicações de manifestações artísticas ilustrativas da Idade Média. Breve História da Ciência Moderna apresenta, em cinco volumes, o processo de desenvolvimento do pensamento científico em seus contextos históricos. Num trabalho que procura enfatizar o diálogo entre diferentes campos do conhecimento, os autores constróem um painel útil para quem deseja encontrar a porta de entrada dos principais problemas que formam o universo da ciência.

Breve história da ciência moderna: v.4: a belle-époque da ciência (séc. XIX) / Brief history of modern science: v.4: the belle-époque of science (nineteenth century)

O quarto volume da série 'Breve História da Ciência Moderna' trata de um período de grande euforia em relação às conquistas da ciência, sobretudo às ligadas à tecnologia. No século XIX, a eletricidade passou a iluminar as cidades e a acelerar as comunicações; surgiram os motores a explosão que iriam dar origem aos automóveis. O século se defrontou ainda com a teoria da evolução das espécies por seleção natural – que revolucionou não apenas a ciência, mas também o olhar do homem sobre si mesmo. Essa explosão de temas gerou uma onda de otimismo em relação ao futuro. O progresso era inevitável. Os homens e mulheres do século XIX viviam a belle-époque da ciência. Dividida em cinco volumes, esta série trata do conhecimento científico que se desenvolveu num curto período de tempo da história da humanidade – da Idade Média até hoje. Enfatizando o diálogo entre diferentes campos do conhecimento, os autores constroem um painel útil para quem deseja encontrar a porta de entrada dos principais problemas que formam o universo da ciência.

Ciência e arte: relações improváveis? / Science and art: unlikely relations?

Este artigo discute as relações entre ciência e arte, principalmente entre física e pintura, com o objetivo de apresentar uma abordagem cultural para a ciência. Dessa forma, entendemos que a compreensão dos conteúdos da ciência torna-se mais significativa. Abordamos diferentes momentos da história desde a revolução científica até o século XX. As relações aqui salientadas não buscam uma relação causal entre ciência e arte, mas sim uma visão mais significativa do que é o processo de construção do conhecimento. Assim, a ciência se desnuda para nós como parte da cultura e pode nos ajudar a compreender melhor o processo histórico que nos trouxe até aqui.

With the goal of presenting a cultural approach to science, the article discusses relations between science and art, especially between physics and painting. From this standpoint, we can see how understanding the substance of science becomes more important. Different moments in history are examined, from the scientific revolution down through the twentieth century. The relations highlighted herein are not chosen in an effort to undercover a causal relation between science and art but to arrive at a more meaningful understanding of how knowledge is constructed. Science is thus revealed to be part of culture, which can help us better understand the historical process through which we have come to this point.

Breve história da ciência moderna: v. 3: das luzes ao sonho do Doctor Frankenstein (séc. XVIII) / Brief history of modern science: v. 3: the lights to the dream of Doctor Frankenstein (XVIII)

A série "Breve História da Ciência Moderna" apresenta - em linguagem acessível para um público amplo - o processo de desenvolvimento do pensamento científico em seus diversos contextos históricos. Esse terceiro volume trata da consolidação da racionalidade científica, no auge do Iluminismo, e também de sua crítica ao longo do século XVIII. As Revoluções Francesa e Industrial definiram um novo mundo, no qual a razão e a objetividade se estabeleceram definitivamente como padrão de verdade. Assim, o poder da nova sociedade deveria estar necessariamente entrelaçado com a ciência, unindo filosofia e técnica. Apesar do sucesso alcançado por essa visão mecanicista, outras manifestações filosóficas e artísticas começaram a contestar a concepção do homem e do Universo como máquinas. O leitor tomará contato com essa discussão, em uma ampla abordagem do panorama científico, artístico e social de uma época que, com suas revoluções, marcou definitivamente o mundo ocidental. Projetada em cinco volumes, a série trata do conhecimento científico que se desenvolveu num curto período de tempo da história da humanidade - da Idade Média até hoje.