Método de reacción en cadena de la polimerasa para determinar la replicación del virus de la hepatitis B / Polymerase chain reaction method to determine replication of hepatitis B virus

Objetivo: evaluar el desempeño clínico de un método de reacción en cadena de la polimerasa con modificaciones para la detección de la replicación del virus de la hepatitis B en pacientes infectados. Métodos: se estudiaron 266 muestras de suero de pacientes provenientes de los servicios de Gastroenterología, Trasplante, Hemodiálisis y Hematología del Hospital Clínicoquirúrgico Hermanos Ameijeiras, con el antígeno de superficie (HBsAg) positivo y altos valores de enzimas hepáticas (aspartatoaminotransferasa, aspartatoaminotransglutaminasa y ganmaglutamiltrasferasa), así como 5 muestras de individuos clínicamente sanos. El ADN se extrajo mediante el método del fenol-cloroformo. Se amplificó un fragmento de la región Pre S del virus de la hepatitis B y un fragmento del gen de la ß-globina como control interno de la reacción. Resultados: El fragmento del gen de la ß-globina se verificó en las 266 muestras estudiadas. La región Pre S del virus de la hepatitis B en cambio, fue detectada en 103 de ellas, siendo informadas como positivas para la replicación viral. En la muestra se obtuvo una prevalencia 98,15 por ciento para la replicación del virus de la hepatitis B. La especificidad clínica del ensayo fue del 100 por ciento, la sensibilidad clínica del 38 por ciento, el valor predictivo positivo del 100 por ciento y el valor predictivo negativo del 64 por ciento. El análisis de concordancia no mostró acuerdo (κ= 0,022 para una p= 0,07) entre las enzimas hepáticas y la reacción en cadena de la polimerasa. Los ensayos de repetitividad y de reproducibilidad mostraron que los resultados son reproducibles. El mayor porcentaje de positividad se encontró en los pacientes remitidos por el Servicio de Hematología (66,7 por ciento). Conclusiones: el método de reacción en cadena de la polimerasa evaluado constituye una herramienta certera para el monitoreo de la replicación del virus de la hepatitis B. Contar con su implementación y aplicación en la institución que se efectuó el estudio reviste gran importancia para el sistema de salud del país(AU)

Objective: evaluate the clinical performance of a modified polymerase chain reaction method to detect replication of the hepatitis B virus in infected patients. Methods: a study was conducted of 266 serum samples from patients cared for at gastroenterology, transplantation, hemodialysis and hematology services of Hermanos Ameijeiras Clinical Surgical Hospital with positive surface antigen HBsAg and high liver enzyme values (aspartate aminotransferase, aspartate aminotransglutaminase and gamma-glutamyltransferase), and 5 samples from clinically healthy individuals. The DNA was extracted by the phenol-chloroform method. Amplification was performed of a fragment of the Pre S region of the hepatitis B virus and a fragment of the ß-globin gene as internal control of the reaction. Results: the ß-globin gene fragment was found in the 266 samples studied. The Pre S region of the hepatitis B virus, however, was detected in 103 of them. These were reported as positive for viral replication. The sample exhibited a prevalence of 98.15 percent for replication of the hepatitis B virus. Clinical specificity of the assay was 100 percent, clinical sensitivity was 38 percent, positive predictive value was 100 percent and negative predictive value was 64 percent. Concordance analysis did not reveal any agreement (κ= 0.022 for p= 0.07) between the liver enzymes and the polymerase chain reaction. Repeatability and reproducibility assays showed that the results are reproducible. The highest positivity percentage was found in patients referred from the Hematology Service (66.7 percent). Conclusions: the polymerase chain reaction method evaluated is an accurate tool to monitor replication of the hepatitis B virus. The possibility of its implementation and application at the institution where the study was conducted is very important for the Cuban health system(AU)

Caracterización del sistema polimórfico inserción/deleción del gen de la enzima convertidora de angiotensina en una muestra poblacional cubana / Characterization of the angiotensin-converting enzyme gene insertion/deletion polymorphism in a sample of Cuban population

Introducción: El polimorfismo de inserción/deleción del gen de la enzima convertidora de angiotensina es uno de los marcadores de predisposición a enfermedades más estudiados del eje renina-angiotensina. Los hallazgos contradictorios de estudios de su asociación con diversas afecciones hacen necesario tipificar previamente las poblaciones de interés. Objetivos: Caracterizar el comportamiento de este polimorfismo en los principales grupos raciales cubanos: caucasoide y negroide. Métodos: Mediante un método basado en la reacción en cadena de la polimerasa se genotipificaron 93 muestras de sangre periférica obtenidas de adultos aparentemente sanos (49 caucasoides y 44 negroides). Se calcularon las frecuencias alélicas y genotípicas grupales. Resultados: Los genotipos ID y DD predominaron en los grupos caucasoide y negroide, respectivamente. La comparación de las frecuencias genotípicas entre ambos grupos evidenció diferencias significativas para el genotipo ID. El alelo D resultó el más frecuente en las 2 subpoblaciones estudiadas. Ambas se encuentran en equilibrio de Hardy-Weinberg para este polimorfismo. Las comparaciones de las distribuciones alélicas y genotípicas entre los grupos y poblaciones foráneas similares, no arrojaron diferencias significativas. Conclusiones: Los resultados permiten considerar los valores de frecuencias genotípicas y alélicas obtenidos como referencia para posteriores estudios de asociación con enfermedades en la población cubana e indican la necesidad de tener en cuenta las características particulares de este polimorfismo en cada grupo racial

Introduction: The insertion/deletion polymorphism of the angiotensin-converting enzyme is one of the more studied markers of predisposition to diseases of the renin-angiotensin axis. The contradictory findings from the studies of its association with diverse affection make necessary to typify previously the interesting population. Objectives: To characterize the behavior of this polymorphism in the main Cuban racial groups: Caucasoid and Negroid. Methods: By means of the polymerase chain reaction-based on method the genotyping was made in 93 samples of peripheral blood obtained from adults apparently healthy (49 Caucasoid and 44 Negroid). The allelic and genotypical-group frequencies were estimated. Results: The ID and DD genotypes were predominant in the Caucasoid and Negroid, respectively. The comparison of the genotype frequencies among both groups showed significant differences for the ID genotype. The D allele was more frequent in the two study subpopulations. Both are in balance of Hardy-Weinberg for this polymorphism. The comparisons of the allelic and genotypical distributions among similar foreign populations and groups had not significant differences. Conclusions: Results allows us to consider the values of genotypical and allelic frequencies obtained as reference for further studies on the association with diseases in Cuban population and suggest the need of to take into account the own features of this polymorphism in each racial group

Helicobacter pylori en pacientes con diferentes enfermedades gastroduodenales / Helicobacter pylori in patients with different gastroduodenal diseases

El papel que desempe±a Helicobacter pylori en el desarrollo de diferentes enfermedades digestivas ha sido ampliamente investigado y discutido. Se estudió la presencia de esta bacteria en muestras de biopsia obtenidas mediante endoscopia. Se tomaron 69 pacientes con úlcera duodenal, úlcera gástrica, gastritis crónica y dispepsia. Los diagnósticos de úlcera gástrica y gastritis crónica fueron confirmados histológicamente. Se analizaron 27 úlceras duodenales, 12 úlceras gástricas, 24 gastritis crónicas y 6 dispepsias. Se detectó la presencia de Helicobacter pylori a través de la amplificación de un fragmento del gen Ure A mediante la reacción en cadena de la polimerasa, en el 100 por ciento de las úlceras duodenales, en el 100 por ciento de las úlceras gástricas, en el 83 por ciento de las dispepsias y en el 92 por ciento de las gastritis crónicas, para una prevalencia total del 95,7 por ciento.

The role played by Helicobacter pylori in the development of different digestive diseases has been widely studied and discussed. The presence of this bacterium in biopsy samples obtained by endoscopy was studied. 69 patients with duodenal ulcer, gastric ulcer, chronic gastritis and dyspepsia were investigated. The diagnoses of gastric ulcer and chronic gastritis were histologically confirmed. 27 duodenal ulcers, 12 gastric ulcers, 24 chronic gastritis and 6 dyspepsias were analyzed. The presence of Helicobacter pylori was detected through the amplification of a fragment of the Ure A gene by polymerase chain reaction in 100 percent of the duodenal ulcers, in 100 percent of the gastric ulcers, in 83 percent of the dyspepsias and in 92 percent of chronic gastritis, for a total prevalence of 95.7 percent.

Genotipo cag A+ en cepas de Helicobacter pylori asociadas a úlcera péptica, gastritis crónica y cáncer gástrico / Cag A+ genotype in Helicobacter pylori strains associated with peptic ulcer, chronic gastritis and gastric cancer

Se estudiaron 171 pacientes con úlcera duodenal, úlcera gástrica, gastritis crónica y cáncer gástrico; los 3 últimos confirmados histológicamente. Se analizaron 56 casos con úlcera duodenal, 48 con úlcera gástrica, 47 con gastritis crónica y 20 con cáncer gástrico. Se detectó la presencia de Helicobacter pylori mediante PCR en el 98,2 por ciento de las úlceras duodenales; en el 95,8 por ciento de las úlceras gástricas; en el 95,0 por ciento de los cánceres gástricos y en el 93,6 por ciento de las gastritis crónicas, para una prevalencia total del 95,9 por ciento. El genotipaje cag A de las cepas detectadas reportó positividad en el 80,0 por ciento de las úlceras duodenales; en el 72,7 por ciento de las gastritis crónicas; en el 69,6 por ciento de las úlceras gástricas y en el 42,1 por ciento de los cáncer gástricos, para una prevalencia total del 70,7 por ciento. Tanto las úlceras en su conjunto, como la gastritis crónica presentaron una prevalencia de cepas Helicobacter pylori cag A+ significativamente superior al cáncer gástrico (p = 0,19).

171 patients with duodenal ulcer, gastric ulcer, chronic gastritis and gastric cancer were studied. The last 3 were histologically confirmed. 56 cases with duodenal ulcer, 48 with gastric ulcer, 47 with chronic gastritis and 20 with gastric cancer were analyzed. The presence of Helicobacter pylori was detected by PCR in 98.2 percent of the duodenal ulcers; in 95.8 percent of the gastric ulcers; in 95.0 percent of the gastric cancers; and in 93.6 percent of the chronic gastritis. The cag A genotyping of the strains found proved to be positive in 80.0 percent of the duodenal ulcers; in 72.7 percent of the chronic gastritis; in 69.6 percent of the gastric ulcers; and in 42.1 percent of the gastric cancers, for a total prevalence of 70.7 percent. Both, the ulcers as a whole and the chronic gastritis showed a prevalence of cag A+ strains of Helicobacter pylori significantly higher than gastric cancer (p = 0,19).

Detección de Chlamydia trachomatis en muestras de exudado endocervical por la reacción en cadena de la polimerasa / Detection of Chlamydia trachomatis in samples of endocervical exudate by polymerase chain reaction

Se procesaron 59 muestras de exudado endocervical, de mujeres que asistieron a 2 clínicas de infertilidad y a consulta de regulación menstrual de Ciudad de La Habana, para evaluar el desempeño de un método de detección de Chlamydia trachomatis, basado en la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) con cebadores KL1 y KL2, específicos para el plásmido. Las muestras se ensayaron por PCR-plásmido, por cultivo de células y por otro método de PCR basado en la amplificación de una región de la proteína principal de la membrana externa (MOMP) de la Chlamydia, este se utilizó como ensayo confirmatorio. Se comprobó que en 43 muestras los resultados coincidían entre el cultivo y el PCR-plásmido: 4 positivas y 39 negativas. Las 16 restantes brindaron resultados discordantes. Se les realizó un estudio de inhibición a las 8 muestras cultivo positivas/PCR-plásmido negativas y se comprobó que 2 de ellas presentaban inhibidores, cuya acción fue revertida al adicionar BSA a la mezcla de reacción. De las 8 discordantes, cultivo negativo/PCR-plásmido positivas, 5 se confirmaron como positivas después del procesamiento por PCR-MOMP. Tomando como criterio de verdadero positivo la coincidencia de al menos 2 de los 3 métodos ensayados, se obtuvo sensibilidad del 100(por ciento) y especificidad del 94(por ciento) para el PCR-plásmido en comparación con el 54 y 87(por ciento), respectivamente para el cultivo. El PCR-plásmido presentó un valor predictivo positivo de 79(por ciento) y negativo de 100(por ciento), mientras que para el cultivo fue de 50 y 89(por ciento), respectivamente. Se demostró que el PCR- plásmido, en nuestras condiciones de laboratorio, brinda resultados confiables en el diagnóstico de la Chlamydia en muestras de exudado endocervical(AU)

59 samples of endocervical exudate from women that were seen at infertility clinics and at the consultation room of menstrual regulation, in Havana City, were processed to evaluate the performance of a method to detect Chlamydia trachomatis, based on polymerase chain reaction (PCR) with primers KL1 and KL2 specific for the plasmid. The samples were assayed by PCR-plasmid, by cell culture and by another method of PCR based on the amplification of a region of the main protein of the external membrane (MOMP) of Chlamydia, which was used as a confirmatory trial. It was observed that in 43 samples the results of the culture and of the PCR-plasmid coincided: 4 positive and 39 negative. The other 16 had discordant results. An inhibition study was conducted in the 8 culture negative/PCR-plasmid positive samples and it was proved that 2 of them had inhibitors, whose action was reverted on adding BSA to the reaction mixture. Of the 8 negative culture/positive PCR-plasmid discordant samples, 5 were confirmed as positive after being processed by PCR-MOMP. Taking the coincidence of at least 2 of the 3 assayed methods as a positive true criterion, 100 percent of sensitivity and 94 percent of specificity were obtained for PCR-plasmid compared with 54 percent and 87 percent for the culture, respectively. The PCR-plasmid presented a positive predictive value of 79 percent and a negative predictive value of 100 percent; whereas the culture had 50 percent and 89 percent, respectively. It was proved that the results of the PCR-plasmid under our laboratory conditions are reliable in the diagnosis of Chlamydia in samples of endocervical exudate(AU)

Biología Molecular y Nutrición / Molecular Biology and Nutrition

La nutrición ha definido muchos de los constituyentes necesarios para una dieta adecuada en términos de macronutrientes y micronutrientes, no obstante, las necesidades nutricionales están influenciadas por las características individuales -bioquímicas y en fin de cuentas, genéticas- y hasta por factores ambientales o sociales, por lo que estas recomendaciones nutricionales generales no se ajustan estrictamente a las necesidades particulares de un individuo. Uno de los retos de la Nutrición Moderna es la necesidad de comprender las bases de esta diferenciación en cuanto a requerimientos nutricionales individuales y coyunturales, con vistas a establecer regímenes nutricionales individuales y específicos en situaciones comprometidas. Esto no será posible si la Nutrición no suma como objeto de estudio a su ya comprendida interacción con el estado endocrino de un individuo, la evaluación de las características genéticas de cada individuo o grupo poblacional. Con la contribución de la Biología Molecular se abren nuevas perspectivas de investigación en el campo de la Nutrición. El conocimiento de la interacción entre los nutrientes y la expresión de genes particulares, permitirá profundizar en el efecto de los nutrientes en la expresión génica de enzimas, receptores, transportadores y hormonas

Caracterizacion de Delecciones en el Gen Responsable de la distrofia Muscular de Duchenne: Su Frecuencia en Pacientes Cubanos / Characterization of deletions in the gene responsable of Duchenne muscular dystrophy. Its frequency in Cuban patients

La distrofia muscular de Duchenne es la mas comun y grave de las distrofias musculares, afecta a 1 de cada 3 500 varones nacidos vivos y provoca la muerte en la segunda o tercera decada de vida. Con nuestro trabajo nos propusimos calcular la frecuencia con que se encuentran las delecciones en el gran (DMD) como causa mas comun de la enfermedad y su caracterizacion. Se empleo la tecnica del PCR multiplex. Se estudiaron 30 individuos con diagnostico de DMD. En el 53 por ciento de los casos se presento una deleccion en el gen DMD y el 87 por ciento de la delecciones detectadas estuvieron localizadas en la region 3' del gen DMD, particularmente el 62,5 por ciento de ellas involucraban los exones 48-51 de dicho gen

Diagnóstico de distrofia muscular de Duchenne mediante análisis del ácido desoxinucleotico y su aplicación en la prevención

Se define una estrategia para la prevención en Cuba de la distrofia muscular de Duchenne (DMD), una de las enfermedades hereditarias letales más frecuentes, y se evalúan la factibilidad de su aplicación y los problemas que pudieran dificultar su implantación al nivel nacional. La estrategia se basa fundamentalmente en la necesidad de detectar las familias afectadas, la definición de las mujeres portadoras o en riesgo de serlo y el estudio molecular de los miembros de interés con anterioridad al ofrecimiento de los servicios de diagnóstico prenatal mediante análisis directo -detección de deleciones en el gen DMD mediante reacción en cadena de la polimerasa (PCR) o análisis indirecto- empleo de los marcadores denominados polimorfismos en la longitud de los fragmentos de restricción (RFLPs) en análisis de ligamento. Se concluye en que la aplicación de esta estrategia es factible y conveniente, pues permite ofrecer el diagnóstico prenatal al 75 % de las mujeres portadoras. Su eficiencia en la prevención del nacimiento de nuevos enfermos DMD se demuestra en 2 diagnósticos prenatales realizados, uno de los cuales detectó un embarazo afectado que fue interrumpido por solicitud de los padres.

A strategy is defined for the prevention in Cuba of the Duchenne's muscular dystrophy (DMD), one of the most frequent lethal hereditary diseases, and the feasibility of its application, and the troubles that might difficult its implantation at a national level, are evaluated. This strategy is mainly based on the need of detecting the affected families, the definition of the carrier women, or the women at risk of being carriers, and the molecular study of the members of interest with anteriority to the offering of prenatal diagnosis services by direct analysis -detection of DMD gen deletions by (PCR) polymerase chain reaction, or indirect analysis-, use of the markers called polymorphisms in the length of the restriction fragments (RFLPs) in ligament analysis. It is concluded that the application of this strategy is feasible and convenient, since it allows offtering a prenatal diagnosis to the 75 % of the carrier women. Its efficiency in the prevention of births of new DMD ill newborns is showed in two prenatal diagnosis, one of which detected an affected pregnancy, interrupted due to the parents'solicitude.

Diagnóstico molecular del Síndrome X Frágil en un grupo control y miembros de 3 familias afectadas

El síndrome X frágil constituye la forma de retraso mental hereditario más frecuente con una incidencia de 1 en 1 500 varones y de 1 en 2 500 hembras; es causado por mutaciones que aumentan el tamaño de un fragmento de ácido desoxinucleótico (DNA) específico en la región Xq 27.3 del cromosoma X. Se presenta el resultado en la introducción y aplicación de la sonda molecular StB12.3 en un grupo control y en miembros afectados de 3 familias. Se exponen las radiografías de los Southern blot que exhiben los patrones diagnósticos posibles a obtener. Esta metodología es mucho más directa, eficiente y confiable para el diagnóstico y prevención de esta forma de retraso mental.

The fragile X syndrome is the most frequent form of hereditary mental retardation, with an incidence of 1 in 1 500 males, and 1 in 2 500 females; it is caused by mutations that increase the size of a fragment of specific desoxinucleotic acid (DNA) in the Xq 27.3 region of the X chromosome. The outcome in the introduction and application of the StB12.3 molecular probe in a control group and in affected members of three families, is presented. The x-rays of the Southern blot that show the diagnosis patterns possible to obtain, are exposed. This methodology is more direct, effective and reliable for the diagnosis and prevention of this form of mental retardation.

Perfiles de densidad eritrocitaria en las diferentes hemoglobinopatias S / Profiles of erythrocytic density in the different hemoglobinopathies S

Se estudiaron los perfiles de densidad eritrocitaria obtenidos por el método del éster de ftalato de 34 pacientes con hemoglobina (Hb) SS heterocigóticos para la *talasemia, 31 pacientes con Hb SS con el genotipo * normal, 26 pacientes con Hb SC, 14 pacientes con Sß talasemia y 31 sujetos normales (Hb AA). Los pacientes se encontraban en condiciones basales. Se hallaron diferencias entre el grupo de individuos normales (Hb AA) Y ambos grupos de pacientes con Hb SS, y entre estos últimos. Los pacientes con Hb SS heterocigóticos para la *talasemia presentaron una reducción altamente significativa del porcentaje de células más densas en relación con los pacientes con Hb SS no talasémicos. Los resultados obtenidos en esta enfermedad concuerdan con los países como el nuestro, en el que hay una gran mezcla de genes caucásicos y africanos, y difieren de los encontrados en otras poblaciones con un ancestro africano más puro, lo que sugiere que la constitución genética tiene un papel importante en el cuadro hematológico de la hemoglobinopatia S. Los pacientes con Hb SC y Sß talasemia presentaron porcentajes de células densas más bajos que los de los pacientes con Hb SS. En la hemoglobinopatia SC se verificó un desplazamiento del perfil hacia la zona de más alta densidad. Este aumento de la concentración de hemoglobina corpuscular media se plantea que es el factor más importante en la patogenia de esta enfermedad

Estudio de la relación entre * talasemia y la glucosa -6- fosfato deshidrogenasa en un grupo de pacientes con anemia drepanocítica / Study of relationship between * - thalassemia and glucose -6- phosphate dehydrogenase in a group of patients with drepanocytic anemia

Se estudió la frecuencia de glucosa -6- fosfato deshidrogenasa (G6PD) y de talasemia en 123 pacientes con anemia drepanocítica (63 del sexo masculino y 60 del femenino). No se encontró diferencia significativa entre la gravedad del cuadro clínico, los genes * y el genotipo de C6PD. Se observó una mayor frecuencia de genotipo A- (GdA- : 14,28%) en los pacientes del sexo masculino, que en la población no blanca de Ciudad de La Habana (7,8%), lo que se sugiere que nuestra muestra tiene una mayor prevalencia de genes africanos

Programa de prevención de la anemia por hematies falciformes en ciudad de la Habana / Programme for preventing sickle cell anemia in Havana city

Se exponen los resultados del Programa de Prevención de la Anemia por Hematíes Falciformes en Ciudad de La Habana. Se informa que en el período que se analiza se estudiaron 69 527 muestras de sangre de mujeres embarazadas y se detectaron 2 106 portadoras de hemoglobina S (HbS), 458 portadoras de hemoglobina C (HbC) y 28 hemoglobinopatías SS, SC y CC. Se detecta un total de 118 parejas de alto riesgo. Se realizan 33 diagnósticos prenatales