SARS-CoV-2 Drive/Walk-Thru screening centers in Colombia: The CoVIDA Project / Centros de tamizaje masivo para SARS COV-2 en Colombia: Proyecto CoVIDA

Abstract Objective: The CoVIDA project is a public-private collaboration led by Universidad de los Andes that contributed to the SARS-CoV-2 epidemiological surveillance in Bogotá and nearby municipalities. We aimed to describe the development and performance of the Drive/Walk-through free RT- PCR for SARS-CoV-2 testing strategy implemented by CoVIDA. Material and method: We performed a descriptive analysis of the characteristics and performance of the CoVIDA Drive/Walk-through testing centers. The model and the process indicators to assess the model's performance were based on international experiences and scientific literature. Two screening centers were imple mented in shopping centers in the north and south of Bogotá. We reported the number of tests taken, the number of positive tests, and the number of participants that used the model by the type of occupations. Results: In total, 36,689 nasopharyngeal RT-PCR tests for SARS-CoV-2 were performed with a 5.75% cumulative positivity. Process indicators showed an excellent performance and an important contribution in reducing barriers to access to testing. Conclusions: the CoVIDA Drive/Walk-through testing centers supported the epidemiological surveillance in asymptomatic or mild-symptomatic population in Bo gotá. Low and middle-income countries can use this model as a cost-effective and innovative solution strategy to intensify testing and help mitigate the pandemic.

Resumen Objetivo: El proyecto CoVIDA es una colaboración público-privada liderada por la Universidad de los Andes que contribuyó a la vigilancia epidemiológica del SARS-CoV-2 en Bogotá y municipios cercanos. Nuestro objetivo fue describir el desarrollo y rendimiento de la estrategia de tamizaje gratuito con RT-PCR mediante un modelo Drive/Walk through para SARS-CoV-2 implementado por CoVIDA. Materiales y métodos: Realizamos un análisis descriptivo de las características y desempeño de los centros de tamizaje Drive/Walk through de CoVIDA. El modelo y los indicadores de proceso para evaluar el desempeño del modelo se basaron en experiencias internacionales y la literatura científica. Se implementaron dos cen tros de tamizaje en centros comerciales del norte y sur de Bogotá. Se reportó la cantidad de pruebas tomadas, pruebas positivas y de participantes que utilizaron el modelo de acuerdo con el tipo de ocupaciones. Resultados : En total, se realizaron 36,689 pruebas RT-PCR nasofaríngeas para SARS-CoV-2 con una positividad acumulada del 5,75%. Los indicadores de proceso mostraron un excelente desempeño y una contribución importante en la reducción de las barreras de acceso a las pruebas. Conclusiones: los centros de tamizaje con modelo Drive/Walk through de CoVIDA apoyaron la vigilancia epidemiológica en población asintomática o con síntomas leves en Bogotá. Los países de ingresos bajos y medianos pueden utilizar este modelo como una estrategia innovadora y rentable para aumentar la realización de las pruebas y ayudar a mitigar la pandemia.

Fagoterapia, alternativa para el control de las infecciones bacterianas. Perspectivas en Colombia / Phage-therapy, an alternative to control bacterial infections. Perspectives in Colombia / Fagoterapia, alternativa para o controle das infeccóes bacterianas. Perspectivas na Colombia

La capacidad de las bacterias para adquirir resistencia a agentes antimicrobianos ha reducido el número de antibióticos efectivos para combatir infecciones bacterianas. De otro lado, existen bacterias contaminantes de alimentos, que no pueden controlarse con antibióticos por tratarse de productos de consumo humano, lo que se traduce en pérdidas económicas y riesgos para la salud. Si a esto se suma la falta de desarrollo de nuevos antibióticos, es evidente que se requiere desarrollar otras estrategias para el tratamiento y control de las bacterias. Los bacteriófagos (fagos), virus que infectan bacterias, se proponen como uno de estos tratamientos alternativos en una estrategia conocida como fagoterapia. Diversos estudios han evaluado y demostrado su efectividad contra bacterias patógenas y ya existen empresas privadas que desarrollan productos basados en cocteles de fagos para controlar algunas infecciones bacterianas. En Colombia no existen antecedentes del uso de fagos pero estos representan una gran oportunidad para el aprovechamiento de la diversidad de la microbiota nativa. En este artículo presentamos las perspectivas de uso de la fagoterapia en Colombia como tratamiento de infecciones bacterianas.

Bacteria easily acquire resistance to antimicrobial agents and this reduces the number of effective antibiotics available to treat bacterial infections. Food contamination by bacteria also generates important economic losses and health risks. Products for human consumption must be free of antibiotics used in clinical treatments, and the control of bacteria with antimicrobials is strictly regulated; however, there is a lack of development of new antibiotics. As a result, the development of new antimicrobial strategies is vital. Viruses that infect bacteria called bacteriophages (phages) have been proposed as an alternative treatment in an approach known as phage-therapy. Several studies have evaluated and demonstrated their effectiveness against pathogenic bacteria; currently, there are private companies dedicated to the development of new products based on phage cocktails, to control some bacterial infections. In Colombia, there is no previous information about the use of phages, but phage-therapy represents a great opportunity to use the diversity of the native microbiota. In this review, we present the perspectives for phage-therapy in Colombia as a treatment against bacterial infections.

A capacidade das bactérias para adquirir resistencia a agentes antimicrobianos tem levado a que o número de antibióticos efetivos para combater infectes bacterianas em humanos seja cada vez menor. Nos alimentos se reportam bactérias causantes de contaminares que representam grandes perdas económicas e riscos para a saúde; estas bactérias nao podem ser tratadas com antibióticos por tratar-se de produtos para consumo humano. Tendo em conta a situado, e a falta de novos antibióticos, precisa-se do desenvolvimento de novas estratégias para o tratamento e controle das bactérias. Os bacteriófagos (fagos), vírus que infectam bactérias, propoem-se como um destes tratamentos alternativos, numa estratégia conhecida como fagoterapia. Diversos estudos tem demostrada a efetividade contra bactérias patógenas e já existem empresas privadas desenvolvendo produtos baseados em coqueteis de fagos, para controlar algumas infectes bacterianas. Na Colombia nao existe antecedente do uso de fagos, mas este apresenta uma grande oportunidade para o aproveitamento da diversidade da microbiota nativa. Nesta revisao apresentamos as perspectivas para a fagoterapia na Colombia como tratamento alternativo contra infectes bacterianas.

Evaluación preliminar del bioensayo para la detección de antimicrobianos en músculo bovino / Preliminary evaluation of the bioassay for the detection of antimicrobial in bovine muscle

Antecedentes: En Colombia, la vigilancia del cumplimiento de los Límites Máximos de Residuos LMRs de antimicrobianos veterinarios en carne bovina es exigua, debido a que la capacidad analítica es insuficiente para monitorear un gran número de muestras y un amplio rango de antibióticos. El bioensayo es un método microbiológico desarrollado por la agencia de salud pública (FSIS) del Departamento de Agricultura de Estados Unidos, para la detección, identificación y semicuantificación de residuos antimicrobianos. Objetivos: Se evaluó preliminarmente el bioensayo para determinar su uso como prueba de detección cualitativa para el monitoreo y vigilancia de residuos de cuatro antimicrobianos en músculo bovino, como contribución al sistema de gestión de inocuidad en el marco del Acuerdo sobre la aplicación de Medidas Sanitarias y Fitosanitarias, bajo lineamientos de la Comisión Europea, Decisión 2002/657/CE. Métodos: El protocolo de experimentación usó tejidos fortificados con diferentes concentraciones de penicilina G potásica, oxitetraciclina, eritromicina y estreptomicina, como representantes de cuatro familias de antibióticos de uso veterinario en Colombia. Para el establecimiento de los criterios de funcionamiento del bioensayo se prepararon seis repeticiones de cada uno de los niveles o concentraciones probadas por antimicrobiano, incluyendo un nivel sin fortificación y cinco niveles de concentraciones antibióticas menores, iguales y superiores al Límite Máximo de Residuos LMRs de cada uno de los antimicrobianos analizados. Resultados: Se establecieron preliminarmente los criterios de funcionamiento del método (especificidad, límites de detección y estabilidad). La técnica mostró excelente especificidad (ningún falso-positivo); los límites de detección se determinaron para los cuatro antibióticos con relación a sus respectivos LMRs: Betalactámicos (penicilina G =LMR), tetraciclinas (oxitetraciclina =LMR), macrólidos (eritromicina =LMR) y aminoglucósidos (estreptomicina >4 LMR); sin embargo, la sensibilidad del bioensayo para estreptomicina no fue satisfactoria. La estabilidad de los analitos en la matriz fortificada al límite de detección, resultó adecuada durante el período de tiempo evaluado. Conclusiones: El método del bioensayo preliminarmente evaluado es aplicable a la detección de una amplia gama de residuos antimicrobianos en músculo bovino, a concentraciones iguales a los LMRs.

Background: In Colombia, the vigilance of the Maximum Residue Limits MRLs of veterinary antimicrobials in cattle meat is limited, because the analytical capacity is insufficient to monitor a large number of samples and a wide range of antibiotics. The bioassay is a microbiological method developed by the health public agency (FSIS) of the United States Department of Agriculture (USDA) for the detection, identification and semiquantification of antimicrobial residues in cattle muscle. Objective: It was evaluated preliminary the bioassay for use as a test for the qualitative detection for monitoring and surveillance of four antimicrobials in cattle muscle, as contribution to the inocuity management system within the agreement framework about the application of Sanitary and Phytosanitary Measures; using some guidelines of the European Decision 2002/657/EC. Methods: The experimental protocol used fortified tissues with varying concentrations of penicillin G potassium, oxytetracycline, erythromycin and streptomycin, as representatives of the four important families of veterinary antibiotics used in Colombia. To establish the performance criteria of the bioassay were prepared six replicates of each of the levels or concentrations tested for antimicrobial, including a level without fortification and five levels of lower antibiotic concentrations, equal and above MRL Maximum Residue Limit for each one of the tested antimicrobials. Results: The performance characteristics of method were preliminarily determined (specificity, detection limits and stability). The test showed excellent specificity (no false positive); detection limits were determined for the four antibiotics in relation to their respective Maximum Residue Limit MRLs: Beta-lactams (penicillin G =MRL), tetracyclines (oxytetracycline =MRL), macrolides (erythromycin =MRL) and aminoglycosides (streptomycin >4 MRL); however, the sensitivity of bioassay for the streptomycin was unsatisfactory. Stability of the analytes in the matrix was adequate during the period evaluated. Conclusions: The preliminary bioassay method evaluated is applicable to the detection of a broad range of antimicrobial residues in bovine muscle at concentrations at the MRLs.

Azoospermia y fertilización asistida: rol de la histología testicular en el éxito de icsi / Azoospermia and assisted reproduction: role of testicular histology in the success of ICSI

Introducción: La infertilidad masculina afecta aproximadamente al 7por ciento de los hombres, presentándose hasta el 15 por ciento de ellos con azoospermia. El conocimiento del tipo de azoospermia (obstructiva o no obstructiva) y la localización de la falla (pre-testicular, testicular o post-testicular) es vital para conocer el pronóstico de fertilidad de la pareja y plantear un plan terapéutico adecuado. Actualmente, la extracción de espermatozoides desde epidídimo o testículo de pacientes azoospérmicos, y la posterior inyección intracitoplásmática de éstos (ICSI, por sus siglas en inglés) ha permitido obtener embriones viables para su posterior transferencia. Materiales y métodos: Estudio descriptivo retrospectivo de 42 parejas infértiles con diagnóstico de azoospermia; que se sometieron a biopsia testicular, ICSI y posterior transferencia de embriones, entre los años 2004 y 2012. Se lleva a cabo un análisis de la edad de los pacientes, resultados de la histopatología testicular y su asociación con los resultados de la fertilización asistida. Resultados: 42 pacientes azoospérmicos se sometieron a biopsia testicular y extracción de espermatozoides en el mismo acto quirúrgico. La edad promedio de los pacientes fue de 36 años para los hombres y 32 años para las mujeres. En el análisis histológico de los tejidos testiculares, el 31por ciento de los pacientes presentaban espermatogénesis conservada (EC), el 35.7 por ciento atrofia mixta (AM), el 14.3 por ciento hipoespermatogénesis (HE), el 14.3 por ciento detención de la maduración (DM) y un 4.8 por ciento presentaba otras histologías. Lograron embarazo clínico 14 de 42 parejas (33,3 por ciento), siendo la tasa de embarazo específica por patología de 38,5 por ciento para EC, 26.7 por ciento para AM, 50 por ciento para HE, 16,7 por ciento para DM y 50 por ciento para las otras histologías. 12 de las 42 parejas realizaron más de un ciclo de transferencias...

Introduction: Male infertility affects approximately 7percent of men, presenting up to 15 percent with azoospermia. Knowing the type of azoospermia (obstructive or non-obstructive) and the location of the problem (pre-testicular, testicular and post-testicular) is vital to recognize the fertility prognosis of the couple and present a proper treatment plan. Currently, the extraction of sperm from epididymis or testis of azoospermic patients, and subsequent intracytoplasmic sperm injection (ICSI) has yielded viable embryos for transfer. Materials and Methods: Retrospective study of 42 infertile couples diagnosed with azoospermia, who underwent testicular biopsy, ICSI and subsequent embryo transfer, between 2004 and 2012. We performed an analysis of the patients’ age, testicular histopathology results and their association with assisted fertilization outcome. Results: 42 azoospermic patients underwent testicular biopsy and sperm extraction in the same surgery. The average age of patients was 36 years for men and 32 years for women. Histologic analysis of testicular tissue showed that 31 percent of patients had normal spermatogenesis (NS), 35.7 percent mixed atrophy (MA), 14.3 percent hypospermatogenesis (HS), 14.3 percent maturation arrest (MTA) and 4.8 percent had other histologies. 14 of 42 couples achieved clinical pregnancy (33.3 percent), with a specific pregnancy rate of 38.5 percent for NS, 26.7 percent for MA, 50 percent for HS, 16.7 percent for MTA and 50 percent for other histologies. 12 of 42 couples underwent more than one transfer cycle. Conclusions: The use of ICSI is a suitable alternative for infertile couples with severe male factor. The results of this technique are favorable for most histologies. Patients with MA exhibit sertoli solo syndrome and / or tubular sclerosis foci associated to regions with normal spermatogenesis, enabling the sperm extraction for ICSI.

Síndrome HELLP. A propósito de un caso en el Hospital Universidad del Norte / Hellp Syndrome. About a case at Hospital Universidad del Norte

El Síndrome Hellp es descrito como una enfermedad ocasional en la que ocurre hemólisis, enzimashepáticas elevadas y trombocitopenia en pacientes con preeclampsial severa. Aunque las característicasdel Síndrome Hellp pueden ser similares a las de la preeclampsia severa, muchos estudios han reportadoalgunas diferencias en su presentación clínica.Se hizo una revisión del número de casos de Síndrome Hellp en el servicio de gineco-obstetricia denuestra institución, y encontramos 8 casos de abril a diciembre del 2005, lo que nos estimuló a revisaresta patología debido al incremento de su presentación. El objetivo de este caso clínico fue revisarfactores de riesgo, curso clínico, manejo y hacer énfasis en la importancia del control prenatal en uncaso presentado en el Hospital Universidad del Norte.

The Hellp syndrome is described as an occasional disease where a combination of hemolysis, elevatedliver enzymes, and thrombocytopenia is displayed in patients with severe gestational hypertension.While many features of Hellp syndrome may be similar to severe preeclampsia, several studies havereported some differences in their clinical presentation. A casesreview of Hellp syndrome was performedin gynecology and obstetric service. Eight cases were found from april to december of 2005, whichstimulate to review this pathology. The aim of this clinic case was to review the risk factors, the cliniccourse and the management, with an emphasis on the importance of prenatal care in a case presentedin Universidad del Norte Hospital.