Detección del SARS-CoV-2 mediante RT-qPCR utilizando saliva en pacientes ambulatorios con estudio de COVID-19

Resumen Introducción: La pandemia de COVID-19 ha afectado a millones de personas en todo el mundo. La identificación de sujetos infectados ha sido importante para el control. Objetivo: Evaluar el rendimiento de una reacción de polimerasa en cadena (RPC) cuantitativa en tiempo real (en inglés: RT-qPCR) para SARS-CoV-2, utilizando saliva como matriz en comparación con un hisopado nasofaríngeo (HNF). Metodología: Se reclutaron adultos en atención ambulatoria, la mayoría sintomáticos. Fueron estudiadas 530 muestras pareadas de saliva e HNF con RT-qPCR. Resultados: Fueron positivas 59 muestras de HNF y 54 de saliva. La sensibilidad con saliva fue 91%, especificidad 100%, el valor predictor positivo (VPP) 100%, valor predictor negativo (VPN) 98%. El índice Kappa fue de 0,95 y LR-0,08. En promedio, el umbral de ciclo (en inglés cycle threshold-CT) de la saliva fue 3,99 puntos más alto que los de HNF (p < 0,0001) mostrando que la carga viral (CV) es menor en saliva. La carga viral en ambas disminuyó con el tiempo después del inicio de los síntomas. El muestreo de saliva fue preferido por los sujetos en lugar de HNF. Conclusión: Este estudio demuestra que la RPC para SARS-CoV-2 utilizando saliva, es adecuada para el diagnóstico de COVID-19 en adultos ambulatorios, especialmente en la etapa temprana de los síntomas.

Abstract Background: The COVID-19 pandemic has affected millions of people around the world. Part of control strategies is testing a large proportion of the population to identify and isolate the infected subjects. Aim: To evaluate the SARS-CoV-2 detection by the performance of a reverse transcription and quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) against SARS-CoV-2, using saliva as a matrix compared to a nasopharyngeal swab (NPS) to simplify obtaining a diagnostic sample. Methods: Adults in outpatient care were recruited, 95% of them symptomatic. We studied 530 paired saliva and NPS samples by SARS-CoV-2 RT-qPCR. Results: Fifty-nine individuals tested positive in NPS and 54 in saliva samples. Sensitivity for saliva sample was 91%, specificity 100%, positive predictive value (PPV) 100%, negative predictive value (NPV) 98%. The Kappa index was 0.95 and LR-0.08. On average, the cycle threshold (CT) of saliva was 3.99 points higher than those of NPS (p < 0.0001) showing that viral load (VL) is lower in saliva than in NPS. Viral load in both decreased over the time after onset of symptoms. Saliva sampling was preferred by subjects instead of NPS. Conclusion: This study demonstrates that SARS-CoV-2 RT-qPCR using saliva, even with lower VL, is suitable for the diagnosis of COVID-19 in outpatient adults, especially at early stage of symptoms.

Modelo de atención integral en salud familiar y comunitaria en la atención primaria chilena / Model of comprehensive care in family and community health in primary care in Chile / Modelo de atenção integral na saúde da família e da comunidade na atenção básica chilena

RESUMEN Objetivo Describir el estado actual de la implementación de Modelo de Atención Integral en Salud Familiar y Comunitaria (MAIS) en la atención primaria de Chile. Métodos Estudio transversal que evaluó la implementación del MAIS en un total de 1 263 establecimientos de atención primaria. Por medio de correlaciones se estudió la relación entre la autoevaluación (interna) y la evaluación de los servicios de salud (externa) para cada centro. Con los análisis multinivel se evaluaron los factores de establecimientos, comunas y regiones asociados con el nivel de implementación del MAIS. Resultados La correlación entre autoevaluación interna y la evaluación externa de la implementación total del MAIS fue muy alta (0,819, p < 0,001). El eje tecnología presentó mayor implementación (83,0% de cumplimiento) y enfoque familiar (37,8% de cumplimiento), el menor. Los centros de salud familiar, las comunas urbanas, aquellas con mayor número de inscritos y con menor índice de pobreza, fueron los establecimientos que presentaron mayor implementación. No se identificó una asociación estadísticamente significativa entre la implementación del MAIS y los gastos comunales totales (p = 0,132) ni específicos de salud (p = 0,244). Conclusiones La mayoría de los establecimientos de salud de atención primaria han evaluado el nivel de implementación del. MAIS. Las estrategias de acompañamiento para su implementación son prioritarias para establecimientos de atención primaria ubicados en zonas rurales y con bajo número de usuarios inscritos. Aún persiste el desafío de avanzar en la instalación del enfoque familiar y la calidad del cuidado como centro de la atención de salud.

ABSTRACT Objective Describe the current status of the implementation of the Model of Comprehensive Care in Family and Community Health (MAIS, by its acronym in Spanish) in primary care in Chile. Methods Cross-sectional study that evaluated the implementation of MAIS in a total of 1 263 primary care facilities. Through correlations, the relationship between internal self-evaluation and external evaluation of health services for each center was studied. The factors of facilities, communes and regions associated with the level of implementation of the MAIS were evaluated with multilevel analyses. Results The correlation between internal self-evaluation and the external evaluation of the total implementation of the MAIS was very high (0.819, p <0.001). The technology axis presented the highest implementation (83.0% compliance), and family focus the lowest (37.8% compliance). The facilities with the highest implementation were family health centers, the urban communes, those with the highest number of enrollees and those with the lowest poverty index. A statistically significant association was not identified between the implementation of the MAIS and the total community expenses (p = 0.122) nor specific health expenditures (p = 0.244). Conclusions Most of the primary care health facilities have evaluated the level of implementation of the MAIS. The accompanying strategies for its implementation are priorities for primary care facilities located in rural areas and with a low number of registered users. Improving the family focus and the quality of care —key aspects of health care— are still a challenge.

RESUMO Objetivo Descrever o estado atual da implementação do Modelo de Assistência Integral em Saúde da Família e da Comunidade (MAIS) na atenção primária no Chile. Métodos Estudo transversal que avaliou a implementação do MAIS em um total de 1 263 estabelecimentos de atenção primária. Por meio de correlações, foi estudada a relação entre a autoavaliação (interna) e a avaliação dos serviços de saúde (externa) para cada centro. Os fatores dos estabelecimentos, municípios e regiões associados ao nível de implementação do MAIS foram avaliados com análises multiníveis. Resultados A correlação entre a autoavaliação interna e a avaliação externa da implementação total do MAIS foi muito alta (0,819, p <0,001). O eixo tecnológico apresentou maior implementação (83,0% de cumprimento) e foco familiar o menor (37,8% de cumprimento). Os centros de saúde da família, as comunas urbanas, aqueles com maior número de inscritos e com o menor índice de pobreza, foram os estabelecimentos que apresentaram a maior implementação. Não foi identificada associação estatisticamente significativa entre a implementação do MAIS e as despesas totais da comunidade (p = 0,122) nem gastos específicos com saúde (p = 0,244). Conclusões A maioria dos estabelecimentos de atenção primária avaliaram o nível de implementação do MAIS. As estratégias de acompanhamento para sua implementação são prioritárias para estabelecimentos de atenção primária em áreas rurais e com baixo número de usuários cadastrados. Enfatiza-se o desafio de avançar na instalação do enfoque familiar e na qualidade de atenção.

Descripción clínica y epidemiológica de un grave brote de salmonelosis transmitida por alimentos / Clinical and epidemiological description of severe outbreak of foodborne infection by Salmonella Enteritidis

Background: Foodborne diseases have increased considerably. Aim: To report a foodborne outbreak, remarking the importance of early notification to activate the epidemiological surveillance system. Results: During February 2011 we observed a Salmonella Enteritidis outbreak. 31.6% of the cases were seen in the same Emergency Care Unit where all required intravenous fluid rehydration, and 41.7% were hospitalized because of severe dehydration. In the Emergency Room 45.5% of cases required a second visit to be diagnosed correctly. Discussion: Physicians under report the cases of this disease, delaying the activation of the epidemiological surveillance system. Conclusions: Besides providing good treatment to patients, physicians need to be qualified to recognize foodborne diseases and communicate early the suspicion of an outbreak to the epidemiological surveillance system in order to prevent new cases of disease in the community.

Introducción: Las enfermedades transmitidas por alimentos (ETA) han aumentado considerablemente. Objetivo: Reportar un grave brote de ETA destacando la importancia de la notificación precoz para la activación del sistema de vigilancia epidemiológica. Resultados: Durante febrero de 2011 se observó un brote de Salmonella Enteritidis. Un 31,6% de los casos fueron atendidos en un mismo servicio de urgencia, donde todos requirieron la administración de fluidos endovenosos y 41,7% fueron hospitalizados por deshidratación grave. El 45,5% de los casos necesitó de una segunda consulta para ser diagnosticados correctamente. Discusión: La identificación de pacientes integrantes de un brote de ETA es difícil en los servicios de urgencia y los médicos sub-reportan los casos, retrasando al sistema de vigilancia epidemiológica. Conclusiones: Junto con brindar un adecuado tratamiento, los médicos deben estar capacitados para reconocer las ETA y comunicar tempranamente la sospecha de un brote para prevenir nuevos casos en la comunidad.