ABSTRACT
The molecular characterization of SPH253157, a new strain of St. Louis encephalitis virus (SLEV), isolated in 2004 from the first case of human infection recognized in the state of São Paulo, Brazil, is reported. The patient, presenting a febrile illness without neurological involvement, was hospitalized as a probable case of dengue fever. Genomic RNA was isolated from the supernatant of C6/36 cells infected with acute phase-serum specimen of the patient and the envelope gene was amplified by reverse-transcription-polymerase chain reaction. The complete nucleotide sequence of the envelope gene of this isolate was directly sequenced from the amplified products and compared with other Brazilian and American SLEV strains. Phylogenetic analyses were carried out under maximum likelihood criterion with outgroups both included and excluded. Outgroups comprised four flavivirus of the Japanese encephalitis group. Phylogeny also included Bayesian analysis. The results indicated that the new SLEV isolate belongs to lineage III, being closely related to an Argentinean strain recovered from Culex sp. in 1979. It is concluded that there are at least 3 lineages of SLEV in Brazil.
Subject(s)
Humans , Encephalitis Virus, St. Louis/genetics , RNA, Viral/genetics , Viral Envelope Proteins/genetics , Brazil , Genome, Viral , Molecular Sequence Data , Phylogeny , Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction , Sequence Analysis, DNAABSTRACT
Casos de infecções simultâneas por vírus dengue em um mesmo paciente podem ocorrer em epidemia em que circulam múltiplos sorotipos do vírus. No Brasil esse fato foi relatado pela primeira vez em Miranda, MS em 1996 e em Barretos, SP em 2001. Em ambos foram isolados dengue 1 e 2. Em 2003 foi observado mais um caso, em Itapevi, município de São Paulo. O isolamento dos vírus foi obtido em cultura de células C6/36 e a identificação foi feita por imunofluorescência indireta com anticorpos monoclonais para os quatro sorotipos. Foram isolados vírus dengue tipo 1 e tipo 3, resultado confirmado pela reação de RT/PCR, usando RNA extraído do sobrenadante da cultura de células infectada. Este caso demonstra mais uma vez a importância do isolamento viral na vigilância epidemiológica do dengue, pois ele pode ajudar a determinar a freqüencia das infecções com dois ou mais sorotipos, assim como verificar se essas infecções podem estar associadas a formas mais severas da doença