Unveiling Xylanolytic Enzymes Production of Talaromyces wortmannii DR49 on Industrial Agro Wastes

Abstract Xylan degradation is an important step in different industries, such as in biorefinery for biomass hydrolysis. Talaromyces wortmannii is a known fungus due to second metabolite production but only few works showed the xylanolytic potential of this fungus. In this way, the aim of this study was to evaluate the production of xylanolytic enzymes from T. wortmannii DR49 on industrial agro wastes. Cultivation in shake flask showed highest xylanase titration (10.3 U/mL; 9.5 U/mL) for wheat bran (WB) and hydrothermal pretreated sugar cane bagasse (HB); in β-xylosidase production WB and xylose were the best carbon sources (0.57 U/mL; 0.34 U/mL) respectively. STR cultivation revealed that 29°C and pH 6.0 were the best conditions for xylanase (14.5 U/mL) and β-xylosidase (1.7 U/mL) production. T. wortmannii DR49 showed to be a potential candidate for xylanolytic enzymes production using agro wastes in bioreactors, which has never been previously reported in this fungus.

Microbiological quality of Brazilian artisanal cheese and fermented sausages / Qualidade microbiológica de queijos e salames artesanais brasileiros

Cheeses and sausages are ready-to-eat foods, and the products prepared by artisanal processare susceptible to microbial contamination. Few studies on the quality of foods from different Brazilian regions have been done. In this context, this study aimed at evaluating the microbiological quality of 32 cheese and 13 sausages samples purchased from artisanal food stores or producers markets located in the metropolitan areas of 10 capital cities of Brazilian states. Microbiological analyses were performed to determine the counts of microbial contamination indicators, including Escherichia coli and coagulase-positive staphylococci, as well as for evaluating the presence of Listeria monocytogenes and Salmonella spp. using bacteriological methods.E. coli was detected in 50.0 % of samples, coagulase-positive staphylococci in 34.4 %, and Salmonella spp. in 6.3 % of cheese samples. In fermented sausage samples, coagulase-positive staphylococci were isolated from 23.1 % samples and Salmonella spp. from 7.7 %. According tothe Brazilian Sanitary Legislation, 63.0 % of cheese samples and 23.0 % of artisanal fermentedsausage samples from the metropolitan areas of 10 Brazilian capital cities were unsuitable for consumption, indicating the importance of conducting the close monitoring of these foodsand the application of the effective measures for preventing food-borne outbreaks.

Queijos e salames são alimentos prontos para consumo e quando artesanalmente produzidos são suscetíveis à contaminação microbiana. A importância deste estudo em dez capitais brasileiras deve-se à carência de dados obtidos simultaneamente abrangendo-se diferentes regiões do Brasil. O objetivo do presente trabalho foi de avaliar a qualidade microbiológica de 32 amostras de queijos e 13 de salames artesanais, adquiridos em casas de produtos artesanais ou feiras de produtores nas regiões metropolitanas de dez capitais brasileiras. Análises microbiológicas com as respectivas contagens de indicadores de contaminação microbiana, Escherichia coli e Staphylococcus coagulase positiva, e a pesquisa de Listeria monocytogenes e Salmonella spp. foram realizadas por meio de métodos bacteriológicos. Nas amostras de queijos foram observadas E. coli em 50,0 %, Staphylococcus coagulase positiva em 34,4 % e Salmonella spp. em 6,3 %. Nas amostras de salames foram detectadas Staphylococcus coagulase positiva em 23,1 % e Salmonella spp. em 7,7 %. De acordo com a legislação sanitária brasileira, 63,0 % das amostras de queijos e 23,0 % das amostras de salames artesanais coletadas da Região Metropolitana de dez capitais brasileiras estavam impróprias para o consumo, o que demonstra a importância de realizar monitoramento próximo e efetivo para prevenir surtos de origem alimentar.

Microbiological quality of Brazilian artisanal cheese and fermented sausages / Qualidade microbiológica de queijos e salames artesanais brasileiros

Cheeses and sausages are ready-to-eat foods, and the products prepared by artisanal process are susceptible to microbial contamination. Few studies on the quality of foods from different Brazilian regions have been done. In this context, this study aimed at evaluating the microbiological quality of 32 cheese and 13 sausages samples purchased from artisanal food stores or producers markets located in the metropolitan areas of 10 capital cities of Brazilian states. Microbiological analyses were performed to determine the counts of microbial contamination indicators, including Escherichia coli and coagulase-positive staphylococci, as well as for evaluating the presence of Listeria monocytogenes and Salmonella spp. using bacteriological methods. E. coli was detected in 50.0 % of samples, coagulase-positive staphylococci in 34.4 %, and Salmonella spp. in 6.3 % of cheese samples. In fermented sausage samples, coagulase-positive staphylococci were isolated from 23.1 % samples and Salmonella spp. from 7.7 %. According to the Brazilian Sanitary Legislation, 63.0 % of cheese samples and 23.0 % of artisanal fermented sausage samples from the metropolitan areas of 10 Brazilian capital cities were unsuitable for consumption, indicating the importance of conducting the close monitoring of these foods and the application of the effective measures for preventing food-borne outbreaks.

Queijos e salames são alimentos prontos para consumo e quando artesanalmente produzidos são suscetíveis à contaminação microbiana. A importância deste estudo em dez capitais brasileiras deve-se à carência de dados obtidos simultaneamente abrangendo-se diferentes regiões do Brasil. O objetivo do presente trabalho foi de avaliar a qualidade microbiológica de 32 amostras de queijos e 13 de salames artesanais, adquiridos em casas de produtos artesanais ou feiras de produtores nas regiões metropolitanas de dez capitais brasileiras. Análises microbiológicas com as respectivas contagens de indicadores de contaminação microbiana, Escherichia coli e Staphylococcus coagulase positiva, e a pesquisa de Listeria monocytogenes e Salmonella spp. foram realizadas por meio de métodos bacteriológicos. Nas amostras de queijos foram observadas E. coli em 50,0 %, Staphylococcus coagulase positiva em 34,4 % e Salmonella spp. em 6,3 %. Nas amostras de salames foram detectadas Staphylococcus coagulase positiva em 23,1 % e Salmonella spp. em 7,7 %. De acordo com a legislação sanitária brasileira, 63,0 % das amostras de queijos e 23,0 % das amostras de salames artesanais coletadas da Região Metropolitana de dez capitais brasileiras estavam impróprias para o consumo, o que demonstra a importância de realizar monitoramento próximo e efetivo para prevenir surtos de origem alimentar.

Qualidade microbiológica da água e dialisato em clínicas de hemodiálise do Sul do Brasil / Microbiological quality of water and dialysate from haemodialysis units in Southern Brazil

Infectious diseases in renal patients may be associated with the dialysis water quality, which may be contaminated with microorganisms. In Brazil, the water quality is evaluated by analyzing total coliforms, heterotrophic bacteria, and bacterial endotoxin, but not Pseudomonas sp. and fungi. Water samples from haemodialysis units in Curitiba/PR were investigated on their conformity with the standard established by the Brazilian Health Ministry. Total coliforms, heterotrophic bacteria,P. aeruginosa and fungi counts were performed according to APHA, and LAL methodology for detecting bacterial endotoxin. All of the samples showed the total coliforms counts ≤1.1 MPN/100 mL,and ≥ 95 % of analyzed samples complied with the standards for heterotrophic bacteria counting.P. aeruginosa was recovered from 4 % of samples. In 15 % of samples, bacterial endotoxin was detected in values above the limit established by legislation. Yeasts were isolated from 26 % samples and filamentous fungi from 58 %, being 46 % characterized as melanized fungi. The fungi genera were Cladosporium spp., Penicillium spp., Beauveria spp., Exophiala spp., Fusarium spp., Aspergillus spp., Trichoderma spp, Acremonium spp. and Rinocladiella spp.. The study highlights the significance ofP. aeruginosa and fungi detection in those systems, as these microorganisms are potentially pathogenic to immunocompromised patients...

Occurrence of sulphate reducing bacteria (SRB) associated with biocorrosion on metallic surfaces in a hydroelectric power station in Ibirama (SC) - Brazil

The aim of this study was evaluate, two methods for the detection and identification of sulphate reducing bacteria (SRB): ML medium and PCR with specific primers for SRB groups. SRB were detected through the selective medium only on carbon steel, which showed corrosion. Employing specific PCR primer, SBR were detected from all the metallic components assayed, even those that did not present visible corrosion spots, such stainless steel and copper alloys. Despite the presence or absence of corrosion at the later stages effectively by using the selective medium,, the initial stages of the corrosion could only be detected by the amplification of total DNA with SRB specific primers. The early detection of SRB could be employed for preventing the damages on metal surfaces before the installation of corrosion processes. Strategies for reducing the time spent on SRB isolation and identification could be auxiliary tools for controlling the corrosion of materials.

Spore production in Paecilomyces lilacinus (Thom. ) samson strains on agro-industrial residues / Produção de esporos em linhagens de Paecilomyces lilacinus (Thom. ) samson em resíduos agro-industriais

Paecilomyces lilacinus has potential for pests control. We aimed to analyze mycelial growth and spore production in P. lilacinus strains in several agro-industrial residues and commercial media. This study suggests alternative nutrient sources for fungi production and that the biotechnological potential of agro-industrial refuses could be employed in byproducts development.

Paecilomyces lilacinus apresenta potencial para controle de pragas. O objetivo deste trabalho foi analisar o crescimento micelial e a produção de esporos de linhagens de P. lilacinus em resíduos agro-industriais e meios comerciais. Este estudo sugere fontes alternativas para produção de fungos com potencial biotecnológico para desenvolvimento de bioprodutos.

Contaminação fúngica em chás de camomila, erva-doce e erva-mate / Fungi contamination in the chamomile, anis and mate teas

A avaliação da qualidade microbiológica de produtos armazenados, utilizados como plantas medicinais, é fundamental para garantir a segurança alimentar, em função do potencial micotoxigênico apresentado por algumas espécies de fungos. No presente trabalho foram realizados o isolamento, a quantificação e a identificação de fungos potencialmente produtores de micotoxinas em amostras de chás de camomila (Chamomilla recutita L.), erva-doce (Pimpinella anisum L.) e erva-mate (Ilex paraguariensis St.-Hil.), adquiridas em estabelecimentos comerciais da cidade de Curitiba, PR, Brasil. As amostras foram analisadas nas formas de infusão fria, de infusão tradicional e de cocção. Não houve diferenças significativas nos valores de UFC/g nas amostras de camomila, erva-mate e erva-doce analisadas na forma de infusão. Foram observadas diferenças significativas em amostras de camomila e erva-doce em forma de infusão fria em relação às demais formas de processamento de amostras, contudo essas não foram evidentes nas amostras de erva-mate. Os principais gêneros de fungos isolados das amostras analisadas foram Aspergillus sp (35,9%); Penicillium sp (9,4%); Fusarium sp (0,21%); Rhizopus sp (11,5%), Ulocladium sp (18,4%) e Mycelia sterilia (6,84%). Entre os fungos potencialmente toxigênicos, o Aspergillus sp foi o mais frequente nos três tipos de chás, seguido de Penicillium sp e Fusarium sp. Considerando que os fungos com potencial micotoxigênico persistem mesmo após a infusão ou cocção, recomenda-se que estratégias sejam desenvolvidas para garantir a qualidade e a segurança alimentar dos produtos consumidos pela população.

Identification and colonization of endophytic fungi from soybean (Glycine max (L) Merril) under different environmental conditions

A total of 297 endophytic fungi were isolated from 1728 leaf and stem fragments collected about twenty and forty days after germination from soybean (Glycine max (L.) Merril) plants grown in the field and a greenhouse. The fungi belonged to eight groups, six dematiaceous genera (Alternaria, Cladosporium, Chaetomium, Curvularia, Drechslera and Scopulariopsis) and the non-dematiaceous genera Acremonium, Aspergillus, Colletotrichum, Fusarium, Paecilomyces and Penicillium along with some Mycelia sterilia.. There were qualitative and quantitative differences in the type and number of isolates obtained from greenhouse and field-grown plants, with more isolates being obtained from the latter. No difference was found in the number of fungi isolated from leaves and stems irrespective of where the plants was grown. For was field-grown plants, the number of isolates decreased as the plants aged and more fungi were found in tissues near the soil, while for greenhouse-grown plants the number of isolates increased as the plants aged but in this case no more fungi were isolated from those tissues nearer the soil. These results could have biotechnological relevance for the biological control of pests or plant growth promotion.

A partir de 1728 fragmentos de hastes e folhas de soja (Glycine max (L.) Merril). provenientes de plantas do campo e de casa de vegetação, coletadas cerca de 20 e 40 dias após a germinação das sementes, 297 fungos endofíticos foram isolados. Os gêneros encontrados foram: Alternaria, Cladosporium, Curvularia, Chaetomium, Scopulariopsis, Drechslera (todos dematiáceos) além de Colletotrichum, Fusarium, Acremonium, Aspergillus, Penicillium, Paecilomyces e Mycelia sterilia. Foram detectadas diferenças qualitativas e quantitativas entre os isolados, em relação a micobiota de hospedeiros provenientes do campo e de casa de vegetação com maior frequência de fungos isolados de plantas no campo em comparação com as de casa de vegetação. Houve diminuição da frequência de fungos com a idade das plantas crescidas no campo, ocorrendo o inverso com as da casa de vegetação, mas em ambos os casos, não houve diferença no número de fungos isolados de hastes e de folhas. Houve em plantas crescidas no campo uma maior incidência nas regiões próximas ao solo o que não ocorreu nas plantas provenientes da casa de vegetação. Os resultados podem ser de utilidade do ponto de vista biotecnológico pelo uso de endófitos introduzidos deliberadamente em plantas visando o controle biológico de pestes ou promoção de crescimento vegetal.

Diagnóstico laboratorial de micoses superficiais e cutâneas: comparaçäo dos métodos do hidróxido de potássio e do calcofluor white / Laboratory diagnosis of superficial and cutaneous mycosis: a comparison of the potassium hydroxide and calcofluor white methods

FUNDAMENTOS: As micoses superficiais e cutâneas têm surgido com grande prevalência no Hospital de Clínicas da Universidade Federal do Paraná. OBJETIVOS: Avaliar o método do calcofluor white (CFW) mediante comparaçäo com o método do hidróxido de potássio (KOH). MÉTODOS: Foram analisadas 74 amostras de raspados de pele, unha, couro cabeludo e cabelo de 62 pacientes de ambos os sexos em diferentes idades. O material foi coletado nos Ambulatórios de Dermatologia, Dermatopediatria e Pronto Atendimento do Hospital de Clínicas da Universidade Federal do Paraná, entre outubro de 1995 e março de 1996. Os espécimes foram analisados por ambos os métodos e comparados no presente trabalho. Os resultados obtidos foram submetidos à análise estatística do Qui-quadrado. RESULTADOS: Os resultados obtidos indicaram o CFW täo efetivo quanto o KOH. O hidróxido de potássio apresentou 38 (51 por cento) resultados positivos e 36 (49 por cento) negativos. O calcofluor white foi positivo em 35 (47 por cento) amostras e negativo em 39 (53 por cento). CONCLUSÄO: Os dados revelaram igual eficácia entre os métodos avaliados; no entanto, o método do calcofluor white necessita de um laboratório equipado com microscópio de imunofluorescência.

Isolamento de microorganismos degradadores de compostos lipídicos de origem vegetal em amostras de águas da barragem do rio Passaúna-Araucária, PR / Isolation of microorganisms that degrade lipidic compounds of vegetal origin in water samples of Passaúna river DAM- Araucária-PR(Brazil)

Avaliou-se o potencial de degradaçäo de compostos lipídicos, naturalmente presentes em amostras de água da Barragem do Rio Passaúna (Curitiba-Paraná/Brasil)ou artificialmente incorporados a meios de cultura, por cepas de Pseudomonas aeruginosa e por microorganismos näo-selecionados.Os resultados demonstraram degradaçäo do substrato lipídico (óleo de soja virgem e utilizado) apenas em relaçäo ao experimento em que näo houve o isolamento e seleçäo prévia de cepas específicas

Contagem de fungos no controle de qualidade da erva-mate (Ilex paraguariensis St. Hil) e isolamento de gêneros potencialmente micotoxigêncicos / Counting of fingi in the quality control of mate (Ilex paraguariensis St. Hil) and isolation of genera highly micotoxigenic

Realizou-se a contagem de fungos filamentosos e leveduras em cinco marcas de erva-mate, adquiridas em estabelecimentos comerciais da cidade de Curitiba, PR (BRASIL), visando à quantificaçäo, isolamento e identificaçäo de gêneros potencialmente micotoxigênicos. Foi utilizado o método de plaqueamento em superfície, em meio Agar Dicloran Rosa de Bengala Cloranfenicol. Os fungos isolados e identificados foram Asp[ergillus sp. (62,13 por cento), Penicillium sp. (32,35 por cento) e Rhizopus sp. (5,52 por cento), sendo os dois primeiros considerados potencialmente micotoxigênicos e o último considerado contaminante comumente encontrado em alimentos

Uso do método do substrato cromogênico para quantificaçäo do número de bactérias do grupo coliforme em águas minerais envasadas / The use of the method of the substratum chromogenic to quantification of the more probable number of bacterias of the fecal coliforms group in bottled mineral water

Avaliou-se a qualidade microbiológica da água mineral envasada e destinada ao mercado consumidor de Curitiba, quanto ao índice de contaminaçäo por coliformes totais e fecais (Escherichia coli), através do udo do método do substrato cromogênico. Seis marcas, codificadas com as letras A,B,C,D,E e F, foram analisadas. Todas apresentaram ausência de coliformes fecais (Escherichia coli) e duas apresentaram presença de coliformes totais. As amostras foram consideradas próprias para consumo sob ponto de vista microbiológico, pois no Brasil a legislaçäo em vigor estabelece como padräo de potabilidade apenas a ausência de Escherichia coli, näo fazendo referência a presença de outras bactérias do grupo coliforme. Os padröes de potabilidade especificados pelo CODEX ALIMENTARIUS e pela Comunidade Econômica Européia säo mais rígidos, pois a presença de colliformes na água mineral pode indicar ausência de cuidados sanitários, problemas as operaçöes de captaçäo, decantaçäo, canalizaçäo, elevaçäo mecânica, provisäo em reservatório, filtraçäo, envasamento, carbonataçäo ou outros que possam alterar as propriedades características e a composiçäo das mesmas. As amostras positivas foram submetidas a identificaçäo bioquímica que revelou a presença de Enterobacter gergoviae e Citrobacter freundii, na amostra A e de E. gergoviae e E. aerogenes, na B, microorganismos considerados coliformes totais, o que confirma o resultado obtido pelo método utilizado(AB)