El olvido de una buena educación [Editorial] / Forgetting a good education [Editorial]

No sorprende que en instituciones de educación superior como las universidades,y particularmente aquellas reconocidas como las más destacadas alma máter anivel mundial, el olvido de una buena educación haya llegado a las aulas de clase.Tampoco asombra que entre sus principales propósitos se encuentre la formaciónde personas con los más altos niveles éticos, culturales, políticos y profesionales,herramientas de gran valor, a las cuales se suman las cualidades humanas,capacidades de sus empleados y la excelencia académica de sus profesores.Indiscutiblemente se cuenta con un exquisito cuerpo docente, hombres y mujeresDEPARTAMENTO DE POSIBILIDADES EDITORIALESREVISTA MÉDICAS UISaltamente calificados y con experiencia, en ocasiones superior a la requerida,para ilustrar a la comunidad aprendiz con el contenido de determinadosprogramas. Dado que actualmente se cuenta con acceso rápido a la información yal conocimiento, los estándares para la selección de profesores y alumnos incluyeun alto grado de competencias, habilidades, conceptos y destrezas que desplazanel dominio y capacidad para transmitir el conocimiento aprendido por parte de losdocentes y el interés de los estudiantes por aprender determinada profesión,quienes enfrentan situaciones difíciles por la falta de oportunidades...

No wonder that in higher education institutions such as universities, particularlythose recognized as the leading worldwide alma mater, forgetfulness of goodeducation has come to the classroom. Nor wonder that its main purpose thetraining of people with the highest ethical, cultural, political and professional,valuable tools, to which human qualities, abilities of its employees and academicexcellence add be their teachers. Unquestionably it has an exquisite faculty, menand highly qualified and experienced women, sometimes greater than thatrequired to illustrate the learner community with the content of certain programs.Since it now has quick access to information and knowledge, standards for theselection of teachers and students includes a high degree of competence, skills,concepts and skills that move the domain and the ability to transmit knowledgelearned by teachers and student interest in learning particular profession, who facedifficult situations due to lack of opportunities...

Tuberculosis Multidrogoresistente / Multidrug-resistant tuberculosis

La tuberculosis es una enfermedad infecciosa causada por el Mycobacterium tuberculosis. En el año 2010 se registraron 8.8 millones de casos incidentes en el mundo y en los últimos años han aparecido poblaciones bacterianas de micobacterias con resistencia a los fármacos de primera línea. Se ha definido la presencia de resistencia a rifampicina e isoniacida como multidrogoresistencia, estimándose una incidencia mundial aproximada de 3.6%. Esta revisión de tema se centrará en la situación de la tuberculosis multidrogoresistente en el mundo, incluyendo un análisis regional de la casuística Colombiana. Se comentarán los principales mecanismos de resistencia del microorganismo, los genes implicados en la misma y los factores de riesgo asociados a la generación de resistencia en algunas comunidades.

Tuberculosis is an infectious disease caused by Mycobacterium tuberculosis. In 2010, there were 8.8 million incident cases in the world, and, in recent years, populations of mycobacteria with resistance to first-line drugs have emerged. The resistance to rifampin and isoniazid has been defined as multidrugresistant tuberculosis (TB MDR). TB MDR has an incidence of approximately 3.6% in the world. This review will focus on the current stage TB MDR in the world, including a regional analysis of Colombian cases. It will discuss the mechanism of resistance of the microorganism, genes involved, and the risk factors associated with the generation of resistance in some communities.

Micobacteriosis diseminada con compromiso de válvula aórtica protésica: primer caso de Mycobacterium peregrinum de tipo III reportada en Colombia / Disseminated mycobacteriosis affecting a prosthetic aortic valve: first case of Mycobacterium peregrinum type III reported

Las micobacterias de rápido crecimiento son microorganismos pertenecientes a las micobacterias no tuberculosas que tienen amplia distribución ambiental. Aunque usualmente no son patógenas para los humanos, en condiciones desfavorables, pueden causar enfermedad en la población general o en huéspedes inmunocomprometidos, por lo cual se consideran oportunistas. Mycobacterium preregrinum es una micobacteria de rápido crecimiento perteneciente al complejo fortuitum que ha sido reportado como responsable de casos de micobacteriosis en humanos.Se presenta el caso de una micobacteriosis por M. peregrinum de tipo III, el primero reportado en Colombia, en una paciente de 17 años de edad con una endocarditis de una válvula aórtica protésica, implantada inicialmente por estenosis subaórtica congénita con insuficiencia y, posteriormente, por estenosis aórtica relacionada con la válvula inicialmente implantada. Un año después del segundo implante, presentó sintomas respiratorios y pérdida de peso sugestivos de tuberculosis pulmonar.Las coloraciones de Ziehl-Neelsen del esputo fueron positivas aunque la radiografía de tórax no mostró compromiso del parénquima. En el ecocardiograma se encontró una vegetación en la válvula aórtica. En las muestras de sangre y de esputo, se identificó M. peregrinum de tipo III por cultivo, pruebas bioquímicas y análisis molecular del gen hsp65 por PCR-restriction pattern analysis (PRA). La paciente se sometió a cambio de válvula y recibió tratamiento combinado contra la micobacteria, con rápida recuperación. Las muestras tomadas del sistema respiratorio y sanguíneo se tornaron negativas para micobacterias.

Rapidly growing mycobacteria are non-tuberculous mycobacteria amply present in the environment. Although they are not usually pathogenic for humans, they are opportunistic in that they can cause disease in people with disadvantageous conditions or who are immunocompromised. Mycobacterium peregrinum, an opportunistic, rapidly growing mycobacteria, belongs to the M. fortuitum group and has been reported as responsible for human cases of mycobacteriosis. A case of M. peregrinum type III is herein reported as the first in Colombia. It presented as a disseminated disease involving a prosthetic aortic valve (endocarditis) in a seventeen-year-old girl with a well-established diagnosis of prosthetic aortic valve endocarditis who was referred for a surgical replacement. Due to a congenital heart disease (subaortic stenosis with valve insufficiency), she had two previous aortic valve implantation surgeries. One year after the second implantation, the patient presented with respiratory symptoms and weight lost indicative of lung tuberculosis. A chest X-ray did not show parenchymal compromise but several Ziehl-Neelsen stains were positive. An echocardiography showed a vegetation on the prosthetic aortic valve. In blood and sputum samples, M. peregrinum type III was identified through culture, biochemical tests and hsp65 gene molecular analysis (PRA). The patient underwent a valve replacement and received a multidrug antimycobacterial treatment. Progressive recovery ensued and further samples from respiratory tract and blood were negative for mycobacteria.

Tuberculosis cutánea por mesoterapia, estudio de seis casos / Cutaneous tuberculosis after mesotherapy: report of six cases

Introducción. La tuberculosis cutánea secundaria a la inyección con agujas es rara; se presenta en personal médico y de laboratorio, y en pacientes que reciben tratamientos percutáneos.Objetivo. Presentar seis pacientes con tuberculosis cutánea secundaria a tratamiento por mesoterapia.Materiales y métodos. Entre 1 y 4 meses después de la inyección en la piel glútea y abdominal de material no precisado, como tratamiento para la obesidad y la celulitis, cinco mujeres y un hombre desarrollaron pápulas, nódulos y senos de drenaje de material seroso en los sitios de inoculación, interpretados clínicamente como infección por micobacterias no tuberculosas. Se practicaron cultivos de las secreciones y de las biopsias de piel para la identificación fenotípica y estudio de histopatología. Con los resultados iniciales se realizaron pruebas moleculares de PRA (PCR-restriction pattern analysis) en las biopsias de piel y estudio ampliado de los pacientes.Resultados. Se demostró Mycobacterium tuberculosis en los cultivos, hallazgo confirmado por la técnica de PRA en las biopsias incluidas en parafina. Los pacientes no habían padecido tuberculosis. Las placas de tórax fueron normales y la tuberculina midió entre 17 y 20 mm. Cinco curaron con terapia antituberculosa y otro curó espontáneamente luego de la resección-biopsia de la lesión más grande. No se encontraron adenopatías satélites ni recurrencias. Conclusiones. Se demostró una nueva forma de adquirir la tuberculosis cutánea. Esta es la segunda demostración de tuberculosis cutánea por mesoterapia en Colombia. El estudio de las lesiones de la piel en el sitio de la inyección cutánea debe incluir pruebas para detectar micobacterias, entre ellas M. tuberculosis. Las autoridades sanitarias deben prestar atención y prevenir esta modalidad de adquirir la tuberculosis.

Introduction. Cutaneous tuberculosis as a result of a needle injection is a rare event; it generally occurs among medical and laboratory personnel and among patients receiving percutaneous treatment. Objective. Six patients are presented who developed cutaneous tuberculosis after mesotherapy cosmetic treatment. Material and methods. One to four months after injection of an unknown product as treatment for obesity and cellulites, five women and a man developed papules, nodules and drainage of wax like material at the inoculated sites; this was interpreted clinically as a non tuberculous mycobacterium infection. Skin biopsies were taken for a histopathologic study; the biopsy and exudates were cultured to make a phenotypic identification. Polymerase chain reaction and restriction enzyme pattern analyses (PCR-restriction pattern analysis)) procedures were applied to the skin biopsies. Results. Mycobacterium tuberculosis was confirmed in the culture and by PRA analysis in the paraffin-embedded biopsies. The patients had never had tuberculosis. Their thoracic X rays were normal and the size of the tuberculin reaction was 17 to 20 mm. Five patients recovered with antituberculosis treatment and the sixth spontaneously healed after the removal of the largest cutaneous module. No satellite adenopathy or recurrences were observed. Conclusions. A previously undescribed mode of acquisition cutaneous tuberculosis was described. This was the second incident of a demonstrated cutaneous tuberculosis following mesotherapy in Colombia. Skin lesions induced by injections must be tested to detect mycobacterias to include M. tuberculosis.

Molecular tools for Mycobacterium tuberculosis genotyping / Herramientas moleculares empleadas en genotipificación de Mycobacterium tuberculosis

Objective The present work studied molecular typing methods used for Mycobacterium tuberculosis characterization in order to learn about their advantages, disadvantages and discrimination power as regards the implementation of tuberculosis surveillance and control programs. Methods To analyze the discrimination power of each method we studied articles that included Hunter-Gaston discrimination index (HGDI) values or data allowing their calculation. Results The highest discrimination power was registered for LM-PCR followed by FLiP and 15-loci MIRU. The most frequently used methods showed an HGDI of 0.9491, 0.9519 and 0.8630 for 12-loci MIRU, RFLP-IS6110 and spoligotyping, respectively. Conclusion M. tuberculosis isolates molecular characterization requires at least two molecular markers to discriminate non related isolates, as well as previous analysis to their implementation.

Objetivo En el presente trabajo se estudiaron las metodologías de tipificación molecular empleadas para caracterizar Mycobacterium tuberculosis con el objetivo de conocer las ventajas, desventajas y poder discriminatorio para ser consideradas al momento de la implementación en los programas de vigilancia y control de la tuberculosis. Métodos Para el análisis del poder discriminatorio de cada metodología se estudiaron los artículos que suministraban el valor del Hunter-Gaston discrimination index (HGDI) ó los datos que permitían su determinación. Resultados Se documentó que el LM-PCR tiene una mayor capacidad discriminatoria seguida de FLiP y MIRU de 15 loci. Las metodologías más comúnmente empleadas mostraron un HGDI de 0.9491, 0.9519 y 0.8630 para MIRU de 12 loci, RFLP-IS6110 y spoligotyping respectivamente. Conclusión La caracterización molecular de aislamientos de M. tuberculosis requiere mínimo el análisis de al menos dos marcadores moleculares para discriminar aislamientos no relacionados y la necesidad de realizar análisis previos a la implementación de estas metodologías.

The molecular diagnosis of pelvic tuberculosis: a case report / Diagnóstico molecular de tuberculosis pélvica: reporte de caso

Tuberculosis is a re-emerging infectious disease. A retrospective analysis was made of the clinical history of a 48-year-old woman in April 2009; she was a secretary at a third-level hospital living in an urban area. Pelvic tubercular infection was suggested as a possible diagnosis; spoligotyping molecular methodology was used on a peritoneal secretion sample to confirm such diagnosis and confirmed the presence of Mycobacterium tuberculosis (octal code 777777777760771, SIT 53, Family T1).

La tuberculosis es una enfermedad infecciosa reemergente. Durante el mes de abril de 2009 se realizó el análisis retrospectivo de la historia clínica de una mujer de 48 años de edad, residente en área urbana, secretaria de un hospital de tercer nivel. Se determinó infección tuberculosa pélvica como diagnóstico presuntivo. Con el fin de confirmar dicho diagnóstico, se realizó la metodología molecular de spoligotyping en muestra de secreción peritoneal y confirmó la presencia de Mycobacterium tuberculosis, código octal 777777777760771, SIT 53, familia T1.

Biosafety evaluation of the DNA extraction protocol for Mycobacterium tuberculosis complex species, as implemented at the Instituto Nacional de Salud, Colombia

Introducción. El trabajo con Mycobacterium tuberculosis se considera un factor de riesgo para el personal de laboratorio que manipula especímenes clínicos y cultivos. Uno de los procesos que requiere de una alta concentración de microorganismos es la extracción de ADN para realizar metodologías moleculares. Se han reportado casos de tuberculosis pulmonar en profesionales que realizan procedimientos moleculares en los que se requiere previa manipulación del microorganismo en masa, lo cual ha motivado la investigación sobre la bioseguridad del protocolo de extracción, sin que a la fecha haya consenso sobre los riesgos del proceso. Objetivo. Evaluar la bioseguridad del protocolo de extracción de ADN reportado por van Soolingen et al., 2002, mediante la determinación de la viabilidad de M. tuberculosis en cada etapa del proceso. Materiales y métodos. Se realizaron 880 cultivos a partir de 220 aislamientos clínicos de M. tuberculosis que se procesaron para las tres primeras fases de extracción de ADN. A los cultivos positivos se les realizó identificación molecular por PRA hsp65 y caracterización por spoligotyping. Resultados. Se obtuvo crecimiento en uno de los procedimientos realizados. Por caracterización molecular, se determinó que no correspondió al aislamiento analizado originalmente, sino que fue producto de contaminación cruzada. Conclusión. Se determinó que el protocolo de extracción de ADN descrito por van Soolingen et al. (2002) e implementado en el Instituto Nacional de Salud de Colombia, es seguro para el personal de laboratorio y el medio ambiente.

Introduction. Manipulating Mycobacterium tuberculosis clinical specimens and cultures represents a risk factor for laboratory personnel. One of the processes that requires high concentrations of microorganisms is DNA extraction for molecular procedures. Pulmonary tuberculosis cases have occurred among professionals in charge of molecular procedures that require manipulation of massive quantities of microorganisms. This has prompted research studies on biosafety aspects of extraction protocols; however, as yet, no consensus has been reached regarding risks associated with the process. Objective. The biosafety was evaluated for the DNA extraction protocol of van Soolingen, et al. 2002 by determining M. tuberculosis viability at each process stage. Materials and methods. Eight hundred eighty cultures were grown from 220 M. tuberculosis clinical isolates that had been processed through the first three DNA extraction stages. Molecular identifications of positive cultures used a PCR isolation of a fragment of the heat shock protein PRA-hsp65 and examination of its restriction enzyme profile (spoligotyping). Results. Growth was seen in one culture with one of the procedures used. The molecular characterization did not correspond to the initially analyzed isolate, and therefore was deduced to be the product of a cross-contamination. Conclusion. The DNA extraction protocol, as described by van Soolingen, et al. 2002 and as implemented at the Instituto Nacional de Salud, was established to be safe for laboratory personnel as well as for the environment.

Actividad antituberculosa de plantas colombianas / Anti-tubercular activity of eleven aromatic and medicinal plants occurring in Colombia

Introduction. Human tuberculosis is a contagious-infectious disease mainly caused by Mycobacterium tuberculosis. Although regimens exist for treating tuberculosis, they are far from ideal. Development of effective strategies for treatment of human tuberculosis has posed a challenge, considering the increase in infections associated with the human immunodeficiency virus and immunocompromised patients. Essential oils -volatile, aromatic oil extracts from plants-have been used in traditional treatment of many diseases; however careful investigation of these oils has not been undertaken with respect to treatments of tuberculosis.Objective. The in vitro antitubercular activity of essential oils from 11 medicinal plants grown in Colombia were assessed for efficacy as new medications (phytomedicines) for treatment of M. tuberculosis H37Rv.Material and methods. Essential oil extraction and analysis were performed as described Stashenko et al. (2004). Minimal inhibitory concentrations were determined by a colorimetric macrodilution method, following the protocol described by Abate et al. (1998). Isoniazide and rifampin were used as control treatments. Bactericidal and bacteriostatic activity was measured using the method developed by the Clinical and Laboratory Standards Institute consigned in the M26-A protocol. Results. Essential oils from Achyrocline alata and Swinglea glutinosa were the most active with minimal inhibitory concentrations of 62.5 À0.1 and 100 À36 Ìg ml-1, respectively. Carvacrol, thymol, p-cymene, 1,8-cineole, limonene, and A-pinene were the major components, most often identified in the 11 plant extracts of essential oils. Time-kill curve assays demonstrated the bacteriostatic activity of these essential oils. Conclusions. The essential oils from A. alata and S. glutinosa plants, and the components identified therein, are candidates as potential phytotherapeutic agents for human tuberculosis control.

Introducción. La tuberculosis es una enfermedad infecto contagiosa causada por Mycobacterium tuberculosis. Aunque existen protocolos para su tratamiento, no son ideales. Actualmente, el desarrollo de estrategias terapéuticas efectivas ha tomado nuevos rumbos, considerando el incremento de pacientes positivos para el virus de la inmunodeficiencia humana. Los medicamentos basados en plantas medicinales se usan ampliamente en la medicina tradicional para el tratamiento de diversas afecciones. Los aceites esenciales obtenidos de plantas medicinales presentan amplia actividad antimicrobiana, sin embargo, existen pocos estudios que reporten la actividad antituberculosa de los mismos. Objetivo. Evaluar la actividad antituberculosa in vitro de 11 aceites esenciales provenientes de plantas medicinales que crecen en Colombia, los cuales podrían ser candidatos para el desarrollo de futuros fitofármacos. Materiales y métodos. La extracción y el análisis de los aceites esenciales se realizó bajo la metodología desarrollada por Stashenko et al.. La obtención de la concentración inhibitoria mínima se llevó a cabo por un método colorímetrico de macrodilución en caldo descrito por Abate y et al.; la isoniacida y la rifampicina se usaron como medicamentos control. La actividad bactericida y bacteriostética se determinaron mediante el protocolo M26-A del Clinical and Laboratory Standards Institute. Resultados. Los aceites esenciales provenientes de las plantas Achyrocline alata y Swinglea glutinosa fueron los más activos con concentraciones inhibitorias mínimas de 62.5 À0.1 y 100À36 Ìg ml-1, respectivamente. Carvacrol, timol, p-cymene, 1,8-cineole, limoneno, y Â-pineno fueron los componentes mayoritarios identificados en los 11 aceites. Los ensayos de curva de letalidad evidenciaron que ambos aceites son bacteriostáticos. Conclusiones. Los aceites esenciales obtenidos de las plantas A. alata y S. glutinosa, así como sus componentes, son candidatos potenciales como fitoterapéuticos para el control de la tuberculosis.

Mycobacteriosis in wild birds: the potential risk of disseminating a little-known infectious disease / Micobacteriosis en aves silvestres: riesgo potencial de diseminación de una infección poco conocida en el mundo

Avian mycobacteriosis is important for animal and human health; wild birds play an important role in mycobacterial species' ecology and movement. This review was aimed at reporting the role of birds in the spread of avian mycobacteriosis in human and animal populations at risk and thus a systematic review was made of PubMed, Science Direct, Scielo and Scirus databases. Mycobacteria are classified into the Mycobacterium tuberculosis complex and non-tuberculous mycobacteria; the Mycobacterium avium complex represents the most important part of the latter because it is primarily responsible for mycobacterial infection in wild birds and is a potential pathogen for mammals, especially for immunocompromised patients. The clinical signs in birds are variable as it is a chronic and debilitating disease, involving emaciated carcasses, white nodules in different organs and microscopically it presents granulomatosous multifocal inflammation. Diagnosis begins by suspicion based on clinical signs and finishes with microbiological confirmation. New diagnostic techniques include testing with DNA-RNA probes. No effective treatment is currently available and chemoprophylaxis on suspicion of infection is not recommended at the start; these factors increase the potential risk of mycobacteriosis becoming one of the most frequently documented zoonotic diseases which is difficult to treat in birds and humans. Recent concern regarding mycobacterial infection lies in the increased frequency of these opportunistic infections occurring in immunocompromised individuals and these infections' potential impact on bird conservation, this being increased by greater contact between humans and wild and captive birds.

La micobacteriosis aviar es de importancia para la salud animal y humana. El objetivo de esta revisión fue reportar el papel de las aves en la diseminación de la micobacteriosis aviar en poblaciones vulnerables. Se realizó una revisión sistemática en las bases de datos PubMed, Science Direct, Scielo and Scirus. Las aves silvestres juegan un papel importante en la ecología y movimiento de micobacterias. Estas se clasifican en el Complejo Mycobacterium tuberculosis y las micobacterias no tuberculosas, dentro de este último grupo se destaca el Complejo Mycobacterium avium , principal responsable de micobacteriosis en aves silvestres y patógeno potencial para los mamíferos principalmente pacientes inmunosuprimidos. Los signos clínicos son variables, siendo una enfermedad debilitante y crónica, e involucra carcasas emaciadas, nódulos blanquecinos en diferentes órganos, microscópicamente presenta inflamaciones granulomatosas multifocales. El diagnóstico inicia por la sospecha basada en los síntomas clínicos y termina con la confirmación microbiológica. Adicionalmente, las nuevas técnicas diagnósticas incluyen pruebas con sondas de ADN-ARN. Actualmente, no existe un tratamiento efectivo y no se recomienda iniciar quimioprofilaxis; estos factores incrementan el riesgo potencial para convertir la micobacteriosis aviar en una enfermedad zoonótica más frecuente de lo documentado y de difícil tratamiento en aves y humanos. La reciente preocupación de las infecciones micobacterianas, radica en el aumento de la frecuencia de estas infecciones oportunistas en personas inmunocomprometidas y el impacto potencial de estas infecciones sobre la conservación de las especies de aves, favorecido por el mayor contacto entre humanos y aves tanto silvestres como cautivas.

Identificación molecular de micobacterias no tuberculosas mediante el análisis de los patrones de restricción, Colombia 1995-2005 / Molecular Identification of non-tuberculous mycobacteria

Introducción. Las micobacterias no tuberculosas pueden ser saprofitas, patógenas u oportunistas; las enfermedades más comunes producidas por estos microorganismos son las infecciones posquirúrgicas, principalmente por procedimiento estéticos, infecciones asociadas con catéteres, enfermedades cutáneas diseminadas, enfermedades pulmonares y del sistema nervioso central que afectan especialmente a pacientes infectados con el virus de la inmunodeficiencia humana. La identificación fenotípica de las micobacterias no tuberculosas incluye pruebas microbiológicas y bioquímicas, las cuales pueden tomar varias semanas y algunas veces no logran diferenciar entre los miembros de un complejo. Objetivo. El objetivo fue evaluar la metodología de reacción en cadena de la polimerasaanálisis de restricción, como método de identificación genotípica de micobacterias no tuberculosas aisladas de muestras clínicas que pertenecen a la colección del Instituto Nacional de Salud. Materiales y métodos. Se estudiaron 70 aislamientos clínicos de micobacterias no tuberculosas, criopreservados en glicerol al 50 por ciento e identificados mediante metodologías fenotípicas. La identificación genotípica se realizó por reacción en cadena de la polimerasa-análisis de restricción y se evaluó la concordancia entre las metodologías. Resultados. Se obtuvo una concordancia del 100 por ciento en la identificación de Mycobacterium terrae, M. szulgai, M. avium, M. chelonae y M. scrofulaceum, en las especies M. fortuitum, M. abscessus M. gordonae y M. intracellulare varió de 44 por ciento a 89 por ciento; no se obtuvo concordancia en la identificación de las especies M. flavescens y M. malmoense. Conclusiones. El análisis de restricción es una alternativa para la identificación de especies de micobacterias no tuberculosas, rápida, económica y segura para la identificación, que permite la diferenciación entre especies de un complejo y la determinación del subtipo de cada especie.

Introduction. Nontuberculous mycobacteria can be saprophytic, pathogenic or opportunistic. The most common diseases produced by these microorganisms are the post-surgical infections due to anesthetic procedures, infections associated with catheters, disseminated cutaneous diseases and pulmonary and central nervous system diseases that especially affect HIV patients. Identification of the nontuberculous mycobacteria can take several weeks and even then, differentiation of complex members is not possible. Objective. The PCR-restriction analysis (PRA) technique was evaluated as a method for genotypic identification of nontuberculous mycobacteria isolated of clinical samples located in the culture collection of the Instituto Nacional de Salud (National Institute of Health), Bogotá, Colombia. Materials and methods. Seventy clinical isolates of nontuberculous mycobacteria stored in 50% glycerol at -70°C were identified by phenotypic techniques. The genotypic identification was made using the PCR-restriction analysis (PRA) using the restriction enzymes BstEII and HseIII, the restriction products were visualized on gels of agarose to 3%, and the concordance between the methodologies was evaluated. Results. A matching of 100% was obtained in the identification of Mycobacterium terrae, M. szulgai, M. avium, M. chelonae and M. scrofulaceum, the matching between M. fortuitum species, M. abscessus, M. gordonae and M. intracellulare varied from 44 to 89%; there was no concurrence in the identification of species M. flavescens and M. malmoense. Conclusions. PRA provided a fast, inexpensive and accurate alternative for the identification of nontuberculous mycobacteria that permited the differentiation among species of a complex and determining the subtype of each species sample.

Reacción en cadena de la polimerasa: una contribución para el diagnóstico de la tuberculosis extrapulmonar y de las micobacteriosis / Polymerase chain reaction (PCR): a contribution for diagnosis of extrapulmonary tuberculosis and micobacteriosis

Introducción. La Organización Mundial de la Salud define la tuberculosis extrapulmonar como la enfermedad tuberculosa localizada en cualquier órgano diferente a los pulmones y, la micobacteriosis, como la infección bacteriana producida por micobacterias no tuberculosas. El diagnóstico de tuberculosis extrapulmonar y micobacteriosis se hace fundamentalmente por el cultivo y la posterior identificación de la micobacteria por pruebas bioquímicas, así como por baciloscopia para el primer caso. El cultivo de micobacterias presenta limitaciones, especialmente, por el tiempo de incubación que puede tardar hasta 12 semanas y por la sensibilidad para determinar la presencia del microorganismo. Actualmente, se utilizan herramientas moleculares que permiten disminuir el tiempo de diagnóstico. Entre ellas está la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) que es una prueba rápida con buena sensibilidad y especificidad para la identificación de patógenos. Objetivo. Implementar la (PCR) como apoyo para el diagnóstico de la tuberculosis extrapulmonar y la micobacteriosis, para disminuir el tiempo en la obtención de resultados y contribuir a la instauración de tratamientos oportunos para estas patologías. Materiales y métodos. El estudio se llevó a cabo entre junio de 2005 y agosto de 2006. Se procesaron 57 muestras clínicas provenientes de 15 centros hospitalarios del país, analizadas por PCR para la secuencia de inserción IS6110 y para el gen hsp65. Se incluyeron datos clínicos del paciente, edad, sexo y prueba de VIH.Resultados. Los resultados de amplificación para PCR IS6110 fueron positivos en 6 pacientes, lo que sugiere tuberculosis extrapulmonar, y para PCR hsp65, en igual número, lo que sugiere un proceso de micobacteriosis. Se confirmó el diagnóstico de tuberculosis meníngea en 4 (6,9 por ciento) pacientes, seguida por tuberculosis en piel y tuberculosis miliar, cada una en un (1,7 por ciento) paciente. Se identificaron micobacterias no tuberculosas en 6 (10,3 por...

Molecular epidemiology of tuberculosis: methodology and applications

The resurgence of tuberculosis around the world has renewed interest in understanding the epidemiology and pathogenesis of this disease. A revolutionary advance in the field of tuberculosis research has been the development of molecular techniques that permit identification and tracking of individual strains of Mycobacterium tuberculosis. With these techniques, molecular epidemiology has been established as a new discipline that adds another dimension to the classical epidemiology of tuberculosis and has increased our understanding of the transmission dynamics of M. tuberculosis. The increased epidemiological knowledge has led to discovery of inadequacies in tuberculosis control programs; this information has helped garner resources for program improvement and has highlighted the need for the continuous surveillance of tuberculosis. Additional genetic methods are being developed based on the knowledge of the genome sequence of M. tuberculosis. These simpler and less costly genotyping techniques promise to expand the application of molecular epidemiology to developing nations (where 90% of the disease burden occurs) in support of national tuberculosis programs. Further more, these tools permit ever more effective probes into the dynamics of transmission, the population structure, evolution and pathogenesis of M. tuberculosis.

Epidemiología molecular de la tuberculosis: métodos y aplicaciones La reemergencia de la tuberculosis en el mundo ha despertado el interés en el entendimiento de la epidemiología y patogénesis de esta enfermedad. Un revolucionario avance en este campo de investigación ha sido el desarrollo de técnicas moleculares que permiten identificar y establecer la huella particular de cada cepa de M. tuberculosis. Con el uso de estas técnicas, y el establecimiento de la epidemilogia molecular como nueva disciplina se adicionó otra dimensión a la epidemiologia clásica de la tuberculosis y ha incrementado el conocimiento de la dinámica de la transmisión de M. tuberculosis dentro de una población. En el proceso han sido identificados problemas en los programas de control, lo cual ha ayudado a obtener recursos para su mejoramineto e implementación. Aún más, se ha resaltado la necesidad de continuar vigilando esta enfermedad. Otras metodologías genotípicas han sido desarrolladas a partir del conocimiento de la secuencia del genoma de M. tuberculosis. Estas metodologías genotípicas de fácil implementación y bajo costo se deben aplicar en países en vía de desarrollo, donde existe el 90% de la enfermedad, como apoyo a los programas de control de la tuberculosis. Estas herramientas permitirán conocer la dinámica de transmisión de la tuberculosis, la estructura de la población, la evolución y patogénesis de M. tuberculosis.