Usefulness of rapid urease test samples for molecular analysis of clarithromycin resistance in Helicobacter pylori / Utilidad de las muestras de test rápido de ureasa para el análisis molecular de resistencia a claritromicina en Helicobacter pylori

Helicobacter pylori is a gastric pathogen that is widely recognized as a causative agent of gastric disease. Its eradication is variable, mainly due to increased resistance to clarithromycin. Our objective was: to evaluate (i) if the biopsy specimen used for the rapid urease test is a useful sample to detect resistance to clarithromycin by PCR-RFLP and (ii) the distribution of A2142G and A2143G point mutations in the 23S rRNA gene, in relation to virulence factors in our region. Gastric specimens were collected from adult dyspeptic patients (n = 141) and H. pylori was investigated by the rapid urease test, histopathological analysis and PCR for the hsp60 gene. Clarithromycin resistance was detected by PCR-RFLP in 62 H. pylori (+) paired biopsy specimens submitted to molecular analysis and the rapid urease test. H. pylori virulence factors were analyzed by multiplex PCR using specific primers for the cagA, vacA and babA2 genes. Thirteen out of 62 strains (20.9%) were resistant to clarithromycin: 6/13 (46.2%) harbored the A2143G mutation whereas 7/13 (53.8%) carried the A2142G point mutation. vacA m1s1 was the most frequent genotype among the resistant strains. In conclusion, the biopsy specimens used for the rapid urease test were suitable samples for clarithromycin resistance detection in patients infected with H. pylori, which became especially useful in cases where the number or size of the biopsies is limited. In addition, this is the first report of a molecular analysis for clarithromycin resistance performed directly from gastric biopsies in our region.

Helicobacter pylori es un patógeno ampliamente reconocido como causante de enfermedad gástrica. Su erradicación es variable, principalmente debido al incremento de la resistencia a claritromicina. Nuestros objetivos fueron evaluar la utilidad de la biopsia usada para realizar el test rápido de ureasa en la detección de resistencia a claritromicina por PCR-RFLP y conocer la distribución de las mutaciones puntuales A2142G y A2143G en el gen ARNr 23S, en relación con los factores de virulencia en nuestra región. Se recolectaron muestras gástricas (n=141) provenientes de pacientes adultos dispépticos y se investigó la presencia de H. pylori mediante el test rápido de ureasa, análisis histopatológico y PCR para el gen hsp60. La resistencia a claritromicina se analizó por PCR-RFLP en 62 muestras pareadas de biopsias gástricas H. pylori+ destinadas al análisis molecular y al test rápido de ureasa. Los factores de virulencia de H. pylori fueron analizados mediante PCR multiplex usando oligonucleótidos específicos para los genes cagA, vacA y babA2. Trece de 62 cepas (20,9%) fueron resistentes a claritromicina, 6/13 (46,2%) llevaron la mutación A2143G, mientras que 7/13 (53,8%) presentaron la mutación A2142G. El genotipo vacA s1m1 fue el más frecuente entre las cepas resistentes a claritromicina. En conclusión, las biopsias destinadas al test rápido de ureasa fueron muestras apropiadas para la detección de la resistencia a claritromicina en pacientes infectados con H. pylori. Esto es especialmente útil en aquellos casos en los que el número o el tamaño de las muestras son limitados. Además, este es el primer reporte de estudio de resistencia a claritromicina (mediante técnicas moleculares), directamente de biopsias gástricas en nuestra región.

Nematode infection in small ruminants and the management of the farms in Terengganu, Peninsular

Abstract. This study was conducted to determine the current prevalence of nematode infections in small ruminants and the management of farms in Terengganu, Malaysia. A total of 267 faecal samples from sheep and goats were collected and examined by the Modified McMaster method, larval culture and third stage larva identification. Results revealed that the worm egg count (WEC) for nematode infections ranged between 0–26,800 e.p.g. and the distribution of the WEC was different between farms (χ2 (15) = 165.72, p<0.05). Haemonchus contortus was the dominant species observed (75.0%), followed by Trichostrongylus sp. (24.0%) and Oesophagostomum sp. (1.0%) (χ2(2, N=100)=86.06, p<0.05). The schedule for grazing management, limited grazing area and extensive usage of anthelminthic could have been the main influences of nematode infections to be severe in small ruminants. The results obtained from this study will update the status of nematode infection in small ruminants in Terengganu. This information will help the farmers and the Department of Veterinary Services to plan on treatment and management to improve the animals’ health.

A new musculoskeletal ultrasound scoring system (US10) of the hands and wrist joints for evaluation of early rheumatoid arthritis patients / Novo sistema de escore ultrassonográfico (US10) musculoesquelético das articulações das mãos e punho para avaliação de pacientes com artrite reumatoide em fase inicial

ABSTRACT Objective: To propose a novel ultrasound scoring system for hand and wrist joints (US10) for evaluation of patients with early rheumatoid arthritis (RA) and to correlate the US10 with clinical, laboratory and functional variables. Methods: Forty-eight early RA patients underwent clinical and laboratory evaluations as well as blinded ultrasound (US) examinations at baseline, three, six and 12 months. The proposed US10 system involved the assessment of the wrist, second and third metacarpophalangeal and proximal interphalangeal joints. The score consisted of inflammation parameters (synovial proliferation [SP], power Doppler [PD] and tenosynovitis [TN]) and joint damage parameters (bone erosion [BE] and cartilage damage [CD]). SP, PD, BE and CD were scored qualitatively (0–1) and semi-quantitatively (grades 0–3). Tenosynovitis was scored as presence/absence. The evaluation also involved the 28-Joint Disease Activity Score (DAS28), Health Assessment Questionnaire (HAQ) and C-reactive protein level (CRP). Results: Mean duration of symptoms was 7.58 ± 3.59 months. Significant correlations (p < 0.05) were found between inflammation parameters and CRP at baseline and between the changes in these variables throughout the study. Significant correlations (p < 0.05) were found between DAS28 score and both PD and TN at baseline and between the changes in DAS28 score and both SP and TN throughout the follow up. Moreover, significant correlations were found between the changes in inflammation parameter scores and HAQ score throughout the follow up. Conclusion: The proposed US10 scoring system proved to be a useful tool for monitoring inflammation and joint damage in early RA patients, demonstrating significant correlations with longitudinal changes in disease activity and functional status.

RESUMO Objetivo: Propor um novo sistema de escore ultrassonográfico das articulações da mão e punho (US10) para a avaliação de pacientes com artrite reumatoide (AR) e correlacionar o US10 com variáveis clínicas, laboratoriais e funcionais. Métodos: Foram submetidos 48 pacientes com AR em fase inicial a avaliações clínicas e laboratoriais, bem como a exames cegos de ultrassom (US) no início do estudo e com 3, 6 e 12 meses. O sistema US10 proposto envolveu a avaliação do punho e das articulações metacarpofalângicas e interfalângicas proximais do segundo e terceiro dígitos. O escore consistiu em parâmetros inflamatórios (proliferação sinovial [PS], Power Doppler [PD] e tenossinovite [TN]) e parâmetros de danos articulares (erosão óssea [EO] e danos na cartilagem [DC]). PS, PD, EO e DC foram pontuados qualitativamente (0 a 1) e semiquantitativamente (graus 0 a 3). A tenossinovite foi pontuada como presença/ausência. A avaliação envolveu também o escore 28-Joint Disease Activity (DAS28), o Health Assessment Questionnaire (HAQ) e o nível de proteína C-reativa (PCR). Resultados: A duração média dos sintomas foi de 7,58 ± 3,59 meses. Foram encontradas correlações estatisticamente significativas (p < 0,05) entre os parâmetros de inflamação e a PCR no início do estudo e entre as mudanças nessas variáveis ao longo do estudo. Foram encontradas também correlações significativas (p < 0,05) entre o escore DAS28 e a PD e TN no início do estudo e entre as mudanças no escore DAS28 e PS e TN em todo o seguimento. Além disso, foram encontradas correlações significativas entre as mudanças no escore dos parâmetros de inflamação e no escore HAQ ao longo do seguimento. Conclusão: O sistema de escore US10 proposto provou ser uma ferramenta útil para monitorar a inflamação e o dano articular em pacientes com AR em fase inicial, demonstra correlações significativas com as alterações longitudinais na atividade da doença e no estado funcional.

Biodegradation of kerosene: Study of growth optimization and metabolic fate of P. janthinellum SDX7

Penicillum janthinellum SDX7 was isolated from aged petroleum hydrocarbon-affected soil at the site of Anand, Gujarat, India, and was tested for different pH, temperature, agitation and concentrations for optimal growth of the isolate that was capable of degrading upto 95%, 63% and 58% of 1%, 3% and 5% kerosene, respectively, after a period of 16 days, at optimal growth conditions of pH 6.0, 30 °C and 180 rpm agitation. The GC/MS chromatograms revealed that then-alkane fractions are easily degraded; however, the rate might be lower for branched alkanes, n-alkylaromatics, cyclic alkanes and polynuclear aromatics. The test doses caused a concentration-dependent depletion of carbohydrates of P. janthinellum SDX7 by 3% to 80%, proteins by 4% to 81% and amino acids by 8% to 95% upto 16 days of treatment. The optimal concentration of 3% kerosene resulted in the least reduction of the metabolites of P. janthinellum such as carbohydrates, proteins and amino acids with optimal growth compared to 5% and 1% (v/v) kerosene doses on the 12th and 16th day of exposure. Phenols were found to be mounted by 43% to 66% at lower and higher concentrations during the experimental period. Fungal isolate P. janthinellum SDX7 was also tested for growth on various xenobiotic compounds.

Esclerodermia localizada familiar: relato de caso / Localized familial scleroderma: report of a case

A esclerodermia localizada (EL) é uma entidade caracterizada por infiltração e espessamento da pele, de distribuição assimétrica, sem envolvimento de órgãos internos, mas que pode levar, em alguns casos, a importante comprometimento estético do paciente. São reconhecidas cinco variantes morfológicas desta entidade: morféia em placa, morféia generalizada, morféia profunda, morféia em bollous e morféia linear. Casos familiares de EL são bastante raros, tendo sido documentados até hoje na literatura em apenas oito famílias. Neste trabalho os autores relatam mais uma família na qual dois irmãos apresentaram simultaneamente morféia generalizada. Caso 1 - J.P.S., 10 anos, masc., pardo, vinha havia um ano da primeira consulta apresentando manchas cutâneas "café com leite" de consistência endurecida e aspecto esclerótico, de tamanhos variados, em tronco e membros. O restante do exame físico era normal, assim como os exames laboratoriais, exceto por eosinofilia mantida (25 por cento) em leucograma. Biópsia de pele compatível com esclerodermia. Iniciada d-enicillamida (d-PA) 250 mg e, posteriormente, vit. E 800 mg por dia. Houve melhora progressiva das lesões cutâneas, permanecedo com hipercronia nas áreas afetadas. Caso 2 - D.S.S., 14 anos, fem., parda, irmã do paciente 1, havia 6 meses da primeira consulta referia manchas cutâneas hipercrômicas endurecidas e múltiplas em abdome e dorso. O exame físico, exceto o cutâneo, também era normal, assim como exames laboratoriais e toda a investigação reumatológica realizada. A biópsia de pele foi compatível com esclerodermia. A paciente foi tratada apenas com vit. E 800mg por dia, com regressão total do endurecimento das lesões após seis meses. Em ambos os casos permaneceu a hipercromia das áreas afetadas. Os autores, neste relato, acrescetam mais um caso familiar de EL e fazem uma revisão de literatura

Comprometimento da coluna cervical nas artropatias inflamatórias / Cervical spine involvement in inflammatory arthropathies

As artropatias inflamatórias, principalmente a artrite reumaóide (AR), podem acometer a coluna cervical em vários estágios da evolução dessas enfermidades. O acometimento da coluna cervical nesses casos pode dar-se na junção craniovertebral, nas articulações subaxiais e, como é mais conhecido, na articulaão atanto-axial. Neste último caso temos a subluxação atlanto-axial (SAA) como achado mais frequente e de maior risco, dada a possibilidade de compressão neurológica regional. Vários são os métodos de imagens que podem ser utilizados no estudo dessa região. A radiografia simples ajuda na detecção da SAA e na avaliação das articulações subaxiais; a tomografia computadorizada é um exame indicado no estudo de fraturas vertebrais, de erosões ósseas e na avaliação das articulações interapofisárias; e a ressonância magnética é atualmente exame obrigatório quando se deseja estudar a relação entre osso e partes moles quando nos referimos ao comprometimento inflamatório entre atlas, dente do áxis e tecido neurológico. Neste artigo, os autores fazem uma revisão do comprometimento da coluna cervical nas várias doenças inflamatórias e discorrem sobre as indicações e limitações dos métodos de diagnóstico por imagem