Biomarcadores genéticos de la leucemia linfoide aguda de linaje B / Genetic biomarkers of B - cell acute lymphoid leukemia

Introducción: La leucemia linfoide aguda es una proliferación y transformación maligna de las células progenitoras linfoides en la médula ósea, la sangre y los sitios extramedulares. Es la neoplasia más frecuente en la infancia. Constituye el 80 % de todas las leucemias agudas de la edad pediátrica y la más frecuente de las que se originan a partir del linaje de células B. Desde el punto de vista genético se presentan múltiples alteraciones moleculares y cromosómicas que son utilizadas para la estratificación pronóstica. Objetivo: Describir los biomarcadores genéticos de la leucemia linfoide aguda de linaje B y su implicación pronóstica. Métodos: Se realizó una revisión de la literatura en los idiomas inglés y español, a través del sitio web PubMed y el motor de búsqueda Google académico, de artículos publicados en los últimos cinco años. Se efectuaron un análisis y resumen de la bibliografía revisada. Conclusiones: En la leucemia linfoide aguda de linaje B se detectan múltiples alteraciones citogenéticas como las traslocaciones t(9;22) y la t(12;21), rearreglos en 11q23 que generan genes de fusión, así como otras aberraciones cromosómicas y mutaciones génicas. Este espectro genético involucra genes que participan en el desarrollo de las células linfoides y en la regulación del ciclo celular. El conocimiento de su biología, a partir del estudio de las alteraciones genéticas como biomarcadores predictivos, permite la estratificación de la leucemia linfoide aguda y la aplicación de tratamientos más personalizados para evitar recaídas.

Introduction: Acute lymphoid leukemia is a proliferation and malignant transformation of lymphoid progenitor cells in the bone marrow, blood and extramedullary sites. It is the most common neoplasm in childhood; it constitutes 80% of all acute leukemias in children; and the most frequent of those that originate from the B cell lineage. From the genetic point of view, there are multiple molecular and chromosomal alterations. Objective: To describe the genetic biomarkers of the disease and its prognostic implication. Methods: A review of the literature in English and in Spanish was carried out, in the PubMed website and using the search engine of Google Scholar, for articles published in the last five years. We performed analysis and summary of the reviewed bibliography. Conclusions: In acute lymphoid leukemia, multiple cytogenetic alterations are detected, such as translocation t(9;22), t(12;21), rearrangements in 11q23 that generate fusions genes as well as other chromosomal aberrations and gene mutation. This genetic spectrum involves genes that participate in the development of lymphoid cells and in the regulation of the cell cycle. Knowledge of its biology, based on the study of genetic alterations as predictive biomarkers, allows the stratification of Acute lymphoid leukemia and the application of more personalized treatments to avoid relapses.

Cromosomopatías y malformaciones congénitas en Cochabamba: un análisis epidemiológico a través de los cariotipos

Objetivos: Describir las características epidemiológicas de las alteraciones cromosómicas y de las malformaciones congénitas en Cochabamba. Métodos: Se incluyeron en el estudio 166 pacientes con sospecha de alteración cromosómica, referidos de hospitales de Cochabamba. A cada paciente se le realizó la anamnesis, exploración física y la prueba de cariotipo en muestra de sangre periférica. Resultados: De los 166 pacientes estudiados, 79 (48 %) tenían cariotipo sin alteración y 87 (52 %) tenían alguna anomalía cromosómica. La alteración más frecuente fue Síndrome de Down (34 %), seguido por Síndrome de Turner, (11 %), Síndrome de Edwards, (2 %), trisomía 22 (1 %) Klinefelter (1 %), Deleciones (2 %) o cromosoma marcador 5 (1 %). La distribución de pacientes entre 0 y 1 año con dismorfia congènita fue la siguiente: 10% de recién nacidos hasta 7 días, 20 % neonatos entre 8 y 28 días y 70 % de lactantes menores y mayores desde 28 días a un año. Dentro este grupo encontramos alteración cromosómica confirmada en 43 pacientes (62 %) y en 26 (38%) cariotipo sin alteración. La edad promedio de los padres de niños con Sd. de Down, fue mayor a 40 años y para los otros síndromes fue menor a 30 años. Conclusiones: Las cromosomopatías más frecuentes fueron el Sd. de Down, Sd. de Turner y Sd. de Edwards. La mayor parte de los cariotipos fueron con alteración completa o libre en los diferentes Síndromes. La edad de la madre y del padre y el número de abortos parecen ser un factor de riesgo para el Síndrome de Down, y para el Síndrome de Turner.

Objectives: to describe the epidemiological characteristics of chromosomal abnormalities and congenital malformations in Cochabamba. Methods: 166 patients with suspected chromosomal abnormalities referred from hospitals in Cochabamba were included in the study. Each patient underwent a medical history, physical examination, and chromosomal analysis using a peripheral blood sample. Results: Of the 166 patients studied, 79 (48%) had normal chromosomal results and 87 (52%) had some chromosomal abnormality. The most common abnormality was Down syndrome (34%), followed by Turner syndrome (11%), Edwards syndrome (2%), trisomy 22 (1%), Klinefelter syndrome (1%), deletions (2%), or marker chromosome 5 (1%). The distribution of patients between 0 and 1 year of age with congenital dysmorphism was as follows: 10% of newborns up to 7 days, 20% of neonates between 8 and 28 days, and 70% of infants from 28 days to one year. Within this group, confirmed chromosomal abnormalities were found in 43 patients (62%) and normal chromosomal results in 26 (38%). The average age of parents of children with Down syndrome was over 40 years, while for other syndromes it was under 30 years. Conclusions: The most frequent chromosomal disorders were Down syndrome, Turner syndrome, and Edwards syndrome. Most chromosomal results were complete or free of alteration in the different syndromes. The mother's and father's age and the number of abortions appear to be risk factors for Down syndrome, and for Turner syndrome.

Diagnóstico genético preimplantacional no invasivo; datos preliminares en México / Non-invasive preimplantation genetic diagnosis; preliminary data in Mexico

Resumen: OBJETIVO: Analizar las tasas de concordancia, falsos positivos y negativos entre el ADN embrionario circulante en medio de cultivo y su relación con los reportes de la biopsia de trofoectodermo. MATERIALES Y MÉTODOS: Estudio observacional, prospectivo y comparativo, llevado a cabo en el Centro de Reproducción Arcos Nascere en noviembre 2018. Criterios: de inclusión: parejas en esquema de fertilización in vitro, con diagnóstico genético preimplantacional de aneuploidias. Criterios de exclusión: pacientes con anomalías estructurales o enfermedades monogénicas. Criterio de eliminación: blastocistos con eclosión asistida. Variables de respuesta: tasa de concordancia, falsos positivos y negativos entre las biopsias de trofoectodermo y los medios de cultivo. El análisis estadístico se realizó con SPSS 25.0, con pruebas t de Student y χ2 con valor de p < 0.05 significativa. RESULTADOS: Se analizaron 20 blastocistos de 5 parejas y se obtuvieron resultados informativos de 17 (amplificación global exitosa); 70% en día 5 y 100% en día 6. La tasa general de concordancia entre las biopsias de trofoectodermo y los medios de cultivo fue de 68.7% (42.8% en día 5 y 88.8% en día 6). En cuanto a las discrepancias, solo se observaron 2 falsos negativos en los medios de cultivo vs la biopsia de trofoectodermo (14.2% en día 5 y 11.11% en día 6); hubo 3 casos de falsos positivos (la mitad en día 5 y ninguno en día 6-7). CONCLUSIONES: Con la prueba genética no invasiva de aneuploidias se alcanzaron altas tasas de concordancia, sobre todo en embriones en día 6.

Abstract: OBJECTIVE: Analyze the concordance, false positive and false negative rates between circulating free DNA of the culture media compared to the results of the trophectoderm biopsy. MATERIALS AND METHODS: Observational, prospective and comparative study, conducted at Arcos Reproduction Center S.C. Nascere in november 2018. Couples with indication of preimplantation genetic diagnosis of aneuploidies undergoing In vitro Fertilization were included; carriers of structural anomalies or monogenic diseases were excluded and blastocysts with assisted hatching were eliminated. The response variables were the concordance, false positives and false negatives rates between trophoctoctoderm biopsies and culture media. Statistical analysis was performed with SPSS 25.0, using t-Student and chi-square tests with a value of p <0.05 significant. RESULTS: Informative results were obtained in 17 of the 20 culture media (85% successful global amplification); 70% on day 5 and 100% on day 6. The general concordance rate between trophectoderm biopsies and culture media was 68.7% (42.8% on day 5 and 88.8% on day 6). Regarding discrepancies, only 2 false negatives were observed in the culture media compared to the trophectoderm biopsy (14.2% on day 5 and 11.1% on day 6). There were 3 cases false positives (42.8% on day 5 and 0% on day 6). CONCLUSIONS: High rates of concordance were reached with the non-invasive genetic aneuploidy test, mainly in embryos on day 6.

El problema de la pérdida de Y: Revisión de la literatura

We review the different mechanisms for loss of chromosome Y, including environmental factors that cause mosaicism. The different pathological processes due to its loss, including neoplasms, autoimmune and neurodegenerative diseases, are summarized. A subgroup of newborns with numerical chromosome abnormalities (45 X /46 XY) presents a characteristic phenotype, so it should be included as a variant of congenital loss of chromosome Y.

Se revisa los informes que explican la pérdida de Y, así como los factores ambientales que causan el mosaicismo. Se resume los diferentes procesos patológicos que se desarrollan debido a la falta de Y, incluidas las neoplasias, enfermedades autoinmunes y procesos neurodegenerativos. Un grupo de casos de recién nacidos con anomalías cromosómicas numéricas (45 X/46 XY) presentan un fenotipo característico, por lo que deben ser considerados como una forma de pérdida de Y congénita.

Estudio genético preimplantación para aneuploidias: resultados de la transición entre diferentes tecnologías / Preimplantation genetic testing for aneuploidies PGT-A: Results of the transition between different technologies

Resumen OBJETIVO Comunicar los resultados obtenidos del análisis del estudio genético preimplantación para aneuploidias en dos centros de reproducción asistida de México en un periodo de tres años, utilizando dos diferentes técnicas moleculares. MATERIALES Y MÉTODOS Estudio observacional, retrospectivo, en donde se reporta el resultado de blastocistos sometidos a preimplantación para aneuploidias durante 2014-2017, en dos centros de reproducción asistida (Ciudad de México y Guadalajara). RESULTADOS Se analizaron 404 blastocistos de 129 pacientes (edad promedio 39 ± 4 años). Los embriones se dividieron en dos grupos según la técnica aplicada: 76 por a-CGH y 328 por secuenciación de nueva generación. El porcentaje de embriones euploides fue de 33%. Las aneuploidias numéricas fueron las más frecuentes. Hasta la terminación del estudio se habían transferido 69 embriones euploides con tasas de implantación de 78% para secuenciación de nueva generación y de 57% para a-CGH. CONCLUSIONES La tasa de implantación reportada en este estudio fue mayor con el análisis de preimplantación para aneuploidias por secuenciación de nueva generación. Los resultados reportados en nuestra experiencia soportan la necesidad de favorecer una opción de transferencia de embrión único. Es importante reconocer los retos de las nuevas tecnologías y la necesidad de técnicas moleculares más sensibles.

Abstract OBJECTIVE Communicate the results obtained from the analysis of the preimplantation genetic study for aneuploidy in two centers of assisted reproduction in Mexico in a period of three years, using two differentmolecular techniques. MATERIALS AND METHODS Descriptive, retrospective study, which reports the blastocysts PGT-A results, over 2014-2017, in two Fertility Centers (Ciudad de México and Guadalajara). The embryos where divided in two groups by their molecular techniques studied: 76 by a-CGH and 328 by NGS RESULTS We analyzed a total of 404 blastocysts from 129 patients (mean age 39 ± 4 years), with two different molecular techniques: a-CGH and NGS. The euploid embryos percentage was 33%. The numerical aneuploidies were the most frequent. Up to the ending of the study, 69% of the euploid embryos had been transferred. The implantation rates were 78% for those analyzed by NGS and 57% with a-CGH. CONCLUSIONS The implantation rate was bigger with the PGT-A by NGS. Our results reported, supports a single embryo transfer policy. It is important to recognize the challenges of new technologies and the need for more sensitive molecular techniques.

Frequency of Chromosomal Abnormalities in Products of Conception / Frequência de anomalias cromossômicas em material de aborto

Abstract Purpose To describe the frequencies of chromosomal abnormalities found in abortion material, and to observe its correlation to maternal age. Methods A retrospective study was conducted based on data obtained from the databank of a medical genetics laboratory in Belo Horizonte, MG, Brazil. A total of 884 results from products of conception analysis were included, 204 of which were analyzed by cytogenetics, and 680bymolecular biology basedon quantitative fluorescence polymerase chain reaction (QF-PCR). The frequency of individual chromosomal aberrations and the relationship between the presence of anomalies and maternal age were also evaluated. Results The conventional cytogenetics technique was able to detect 52% of normal and 48% of abnormal results in the analyzed material. Quantitative fluorescence polymerase chain reaction revealed 60% of normal and 40% of abnormal results from the samples evaluated by this method. The presence of trisomy 15 was detected only by cytogenetics, as it was not included in the QF-PCR routine investigation in the laboratory. A significant increase in abnormal results was observed among women aged 35 years or older compared with younger women (p = 0.02). Conclusion Chromosomal aberrations are still a major cause of spontaneous abortion, and the conventional cytogenetics technique is efficient for miscarriage material analysis, but molecular methods such as QF-PCR are adequate complementary strategies to detect the major chromosomal anomalies, leading to technical reports with reliable results.

Resumo Objetivos Descrever a frequência de anomalias cromossômicas encontradas em material de aborto, e observar se estas estão relacionadas com a idade materna. Métodos Foi realizado um estudo retrospectivo no banco de dados de um laboratório de genética médica em Belo Horizonte, MG. O estudo incluiu 204 resultados avaliados por citogenética, e 680 resultados por biologia molecular baseada em reação em ensaio fluorescente da reação em cadeia da polimerase (QF-PCR), totalizando um número de 884 análises. A frequência de diferentes anomalias cromossômicas e a relação entre a presença de anomalias e a idade materna também foi avaliada. Resultados A citogenética convencional foi capaz de detectar 52% de resultados normais e 48% de resultados anormais no material analisado. A QF-PCR revelou 60% de resultados normais e 40% de anormais nas amostras avaliadas por esta técnica. A presença da trissomia 15 foi detectada por citogenética,mas até então não era incluída na investigação por QF-PCR no laboratório. Umaumento significativo na quantidade de resultados anormais foi observado em mulheres comidade de 35 anos ou mais, quando comparado a mulheres mais jovens (p = 0,02). Conclusão As aberrações cromossômicas são causas importantes de abortos espontâneos, e o estudo citogenético é eficaz para a análise das amostras de material de aborto, mas as técnicas moleculares, como a QF-PCR, representam métodos complementares adequados para detectar as principais anomalias cromossômicas, possibilitando a liberação de laudos com resultados confiáveis.

Corrección de medianas de la fracción beta libre de gonadotrofina coriónica humana y proteína plasmática A del embarazo del primer trimestre para una muestra de población mexicana / Medians correction of free beta subunit of human chorionic gonadotropin and pregnancy-associated plasma protein-A during the first trimester for a Mexican population sample

Resumen Objetivo: determinar si en una muestra de población mexicana la distribución de los marcadores séricos del primer trimestre difiere del modelo de riesgos de The Fetal Medicine Foundation y calcular los factores de corrección necesarios para un desempeño adecuado de la prueba. Materiales y Métodos: estudio descriptivo y transversal en el que se midieron las concentraciones de beta-hCG-libre y proteína plasmática A del embarazo en sueros maternos del primer trimestre, por ensayo de electroquimioluminiscencia aprobado por la Fetal Medicine Foundation. Se obtuvieron los múltiplos de mediana ajustados por el algoritmo de la Fetal Medicine Foundation (astraia). Para describir la distribución de cada marcador y probar su diferencia estadística con la media 0.000, se hizo su transformación a log10 ideal mediante la prueba de t para una muestra. Además, se describen las distribuciones de los múltiplos de mediana por características del embarazo y lote de reactivo. Resultados: en 1008 sueros, el log10 MoM global fue de -0.121 ± 0.2706 para beta-hCG-libre y -0.049 ± 0.2372 para proteína plasmática A del embarazo. Conclusiones: en esta muestra poblacional mexicana las distribuciones de beta-hCG-libre y proteína plasmática A del embarazo difieren de las esperadas para población similar a la hispana europea. Se recomienda aplicar los respectivos factores de corrección de 0.756 y de 0.893 para las medianas del algoritmo.

Abstract Objective: To determine whether first trimester serum markers distribution on a Mexican population sample differ from The Fetal Medicine Foundation (FMF) risks model, and to calculate the necessary correction factors for accurate test performance. Materials and Method: Transverse descriptive study, Free-beta-hCG and PAPP-A were measured on unselected first trimester maternal sera using FMF approved electrochemiluminescence assay, the adjusted MoM were obtained from FMF algorithm (astraia); they were log10 transformed to describe each marker distribution and to test their statistical difference with the 0.000 ideal mean by one sample t-test. MoM distributions for pregnancy characteristics and reagent lot are additionally described. Results: On 1008 sera, the overall adjusted log10MoM was -0.121 ± 0.2706 SD for Free-beta-hCG and -0.049 ± 0.2372 SD for PAPP-A; these distributions differed significantly from tåzhe expected by FMF risks model. Conclusions: Free-beta-hCG and PAPP-A distributions on this Mexican population sample differ from expected for population similar to Hispanic European, median correction factors of 0.756 MoM and of 0.893 MoM, respectively, are recommended for the algorithm.

Frecuencia de aneuploidias segmentarias en biopsias de trofoectodermo durante un ciclo de FIV y su relación con la edad materna / Frequency of segmental aneuploidies in trophectoderm biopsies during an IVF cycle and its relationship with maternal age

Resumen ANTECEDENTES: las aneuploidias segmentarias se han propuesto como posible explicación para el subgrupo de embriones euploides transferidos al útero, que no logran un recién nacido saludable. OBJETIVO: conocer la frecuencia de aneuploidias cromosómicas segmentarias en biopsias de trofoectodermo durante un ciclo de fertilización in vitro y su relación con la edad materna. MATERIALES Y MÉTODOS: estudio retrospectivo efectuado en un centro privado de reproducción asistida de México de ciclos (2015-2016) en los que se obtuvieron embriones en estadio de blastocisto (día 5 y 6). Análisis mediante tamizaje genético preimplantacional, en su variante de microarreglos de polimorfismo de nucleótido único (SNP microarrays). Análisis con el algoritmo "Parental Support" (Natera) que permite la identificación de aneuploidias numéricas y segmentarias (pérdidas-duplicaciones). RESULTADOS: se incluyeron 615 blastocistos de 148 ciclos; los resultados se dividieron en 4 rangos, dependiendo de la edad materna: menos de 35, de 35 a 37, de 38 a 40 y más menos 40 años de edad. El 50.3% de los blastocistos fueron aneuploides, y de éstos 10.2% tuvieron aneuploidias segmentarias (6.8% solo pérdidas-duplicaciones y 3.4% pérdidas-duplicaciones más aneuploidias numéricas). Las pérdidas-duplicaciones disminuyeron con el aumento de la edad materna. Todos los resultados tuvieron tendencias más claras cuando solo se tomaron en cuenta los blastocistos aneuploides. CONCLUSIONES: las pérdidas-duplicaciones se encuentran en gran porcentaje de embriones en estadio de blastocisto y tienen una relación inversamente proporcional a la edad materna.

Abstract BACKGROUND: Segmental aneuploidies have been suggested as a possible explanation for the subgroup of euploid embryos transferred to the uterus, which have failed to produce a healthy child. OBJECTIVE: know the frequency of segmental chromosome aneuploidies in trophectoderm biopsies during IVF cycle and its relationship with maternal age. MATERIALS AND METHODS: 615 blastocysts from 148 cycles (2014-2016) were included, which were analyzed with preimplantation genetic screening (PGS), in its variant of single nucleotide polymorphism (SNP microarray), using the algorithm "Parental Support", which allows the identification of numerical aneuploidies and segmental aneuploidies (Deletions/Duplications). The results were divided into four ranges, depending of maternal age "<35", "35 to 37", "38 to 40" and "≥41". RESULTS: 50.3% of the blastocysts were aneuploid, of which 10.2% had segmental aneuploidies (6.8% only Deletions/Duplications and 3.4% Deletions/Duplications plus numerical aneuploidies). Deletions/Duplications decreased with increasing maternal age. The aforementioned results presented clearer trends when only aneuploid blastocysts were taken into account. CONCLUSIONS: The Deletions/Duplications is present in a large percentage of embryos in the blastocyst stage and show an inversely proportional relation to maternal age.

Manejo del feto con translucencia nucal aumentada / Management of the fetus with increased at nape translucency

La medida de la Translucencia Nucal (TN) es un método ampliamente aceptado en el cribado de anomalías cromosómicas. Su técnica está bien descrita y estandarizada, refiriéndose como aumentada cuando la medida está por encima del percentil 95. Su combinación con la edad materna, hueso nasal y marcadores bioquímicos, pueden detectar aproximadamente el 90% de los fetos con Trisomía 21 y en forma aislada el 70% con una tasa de falsos positivos del 5%. Se han atribuido como causa de su aumento a la falla cardíaca, alteración en la composición de la matriz extracelular, hipoproteinemia fetal, congestión venosa en cabeza y cuello, fallo del drenaje linfático, infecciones congénitas o anemia fetal. Su aumento se ha asociado a abortos o muertes fetales, anomalías fetales mayores y entre ellas las cardíacas o bien Síndromes genéticos, asociado a infecciones, macrosomía e incluso retraso en el desarrollo, por lo que no solamente se circunscribe a las alteraciones cromosómicas. De ahí radica su importancia de conocer el manejo de estas pacientes, en especial si el cariotipo es normal.

Have been attributed as the cause of his increase to the heart failure, alteration in the composition of the extracellular matrix, hypoproteinaemia fetal, venous congestion in the head and neck, failure of lymphatic drainage, congenital infections or fetal anemia. Its growth has been associated with abortion or fetal deaths, fetal abnormalities elderly and among them those of heart or genetic syndromes, associated to infections, macrosomia and even delay in development, so that not only is confined to the chromosomal alterations. Hence lies its importance of knowing the management of these patients, in particular if the karyotype is normal.

Análisis de los resultados de amniocentesis genética en un centro privado / Analysis of results of genetic amniocentesis in a private center

La identificación de anomalías cromosómicas fetales es una de las principales tareas a las que debe enfrentarse cualquier obstetra involucrado en el diagnóstico de anomalías congénitas. Se analizaron características clínicas y citogenéticas en gestantes sometidas a amniocentesis. Estudio observacional, descriptivo y retrospectivo, incluyó casos consecutivos en un centro privado de julio de 2010 a enero de 2015. Las muestras fueron procesadas en CGC Genetic (Porto-Portugal). Para el análisis estadístico se utilizó PEPI 4.0X. Se realizaron 67 estudios, en el 98,5% se pudo obtener el cariotipo y de éstos resultaron 74,2% normales y 25,8% anormales: 35,4% Trisomía 21, 17,6% Trisomía 18, Trisomía 13 y Sx Turner respectivamente, entre las principales. Indicaciones: 6,0% edad materna, 14,9% edad materna + alteración ecográfica, 77,6% alteración ecográfica (45,2 malformaciones congénitas mayores, 20,1% translucencia nucal aumentada, 17,7% higroma quístico entre otras). La edad gestacional promedio de la punción fue 19 semanas, la menor a las 15 y la mayor a las 30. El resultado del cariotipo se recibió 12 días posteriores a la técnica en promedio, mínimo 8 días y máximo 29. No se presentaron complicaciones obstétricas. El seguimiento de los casos encontró concordancia entre el cariotipo y el fenotipo del recién nacido. Si bien es un número bajo de muestras, la amniocentesis es un método diagnóstico confiable y de bajo riesgo. El diagnóstico prenatal de cromosomopatías permitió el asesoramiento genético y el manejo obstétrico y pediátrico de los casos de manera adecuada. En los embarazos con cariotipo normal, este resultado alivió la preocupación de muchos padres.

Identification of fetal chromosomal abnormalities is one of the main issues which need tobe addressed by any obstetrician involved in diagnosis of congenital anomalies. Clinical andcytogenetic characteristics were analyzed in pregnant women subjected to amniocentesis.This was an observational descriptive retrospective study that included consecutive cases ina private center from July, 2010 to January, 2015. The samples were processed in CGCGenetic (Porto - Portugal). For the statistical analysis, PEPI 4.0X. was used. Sixty sevenstudies were conducted, in 98.5% karyotype was obtained , 74.2% was normal and 25.8%abnormal: 35.4% Trisomy 21, and 17.6% Trisomy 18, Trisomy 13 and Sx Turnerrespectively. Among the the main indications: 6.0% maternal age, 14.9% maternal ageplus ultrasound alteration, 77.6% ultrasound alteration (45.2% major congenital malformations, 20.1 increased nuchal translucency , 17.7% cystic hygroma among others).The mean gestational age of the puncture was 19 weeks, the lowest 15 and the highest 30. The result of the karyotype was received 12 days after the technique, the minimum 8 daysand the maximum 29. There were no obstetric complications. The follow-up of cases found concordance between the karyotype and the phenotype of the newborn. Although this was alow number of samples, the amniocentesis was reliable diagnostic method with low risk. Theprenatal diagnosis of chromosomopathies allowed the genetic counseling and appropiate obstetric and pediatric management cases. In pregnancies with normal karyotype, thisresult alleviated the concern of many parents.

Noninvasive prenatal test for fetal chromosomal aneuploidies by massively parallel sequencing of cell-free fetal DNA in maternal plasma: The first clinical experience in Korea

PURPOSE: Noninvasive prenatal test (NIPT) by massively parallel sequencing (MPS) of cell-free fetal DNA in maternal plasma marks a significant advancement in prenatal screening, minimizing the need for invasive testing of fetal chromosomal aneuploidies. Here, we report the initial clinical performance of NIPT in Korean pregnant women. MATERIALS AND METHODS: MPS-based NIPT was performed on 910 cases; 5 mL blood samples were collected and sequenced in the Shenzhen BGI Genomic Laboratory to identify aneuploidies. The risk of fetal aneuploidy was determined by L-score and t-score, and classified as high or low. The NIPT results were validated by karyotyping for the high-risk cases and neonatal follow-up for low-risk cases. RESULTS: NIPT was mainly requested for two clinical indications: abnormal biochemical serum-screening result (54.3%) and advanced maternal age (31.4%). Among 494 cases with abnormal biochemical serum-screening results, NIPT detected only 9 (1.8%) high-risk cases. Sixteen cases (1.8%) of 910 had a high risk for aneuploidy: 8 for trisomy 21, 2 for trisomy 18, 1 for trisomy 13, and 5 for sex chromosome abnormalities. Amniocentesis was performed for 7 of these cases (43.8%). In the karyotyping and neonatal data, no false positive or negative results were observed in our study. CONCLUSION: MPS-based NIPT detects fetal chromosomal aneuploidies with high accuracy. Introduction of NIPT as into clinical settings could prevent about 98% of unnecessary invasive diagnostic procedures.

Prenatal Screening: Perspective for the Pediatrician.

Pediatricians are the first contact of a child with genetic disorders such as Down Syndrome. After diagnosis, parents often express and wish that if it was possible to detect it during pregnancy and could it be avoided in the future pregnancy. This makes it essential that pediatricians should have some idea about the basic screening methods and strategy used during pregnancy.

Origen de las aneuploidías en blastocistos humanos, analizados por la técnica de polimorfismo de nucleótido único con parental support

Introducción: El diagnóstico genético preimplantacional (PGD) por medio de las técnicas de aCGH y polimorfismo de nucleótido único (SNPs - single nucleotide polymorphism) se ha convertido en una herramienta útil en los ciclos de reproducción asistida, superando al PGD por hibridación fluorescente in situ (FISH). Estas técnicas nos permiten conocer las aneuploidías en cada uno de los cromosomas. Además, la SNPs con Parental Support (Natera, Inc) posibilita conocer el origen de la aneuploidía en los blastocistos, si por el espermatozoide o por el ovo-cito. Objetivos: Determinar la tasa de aneuplodías únicas en embriones humanos obtenidos por reproducción asistida, utilizando la técnica de polimorfismo de nucleótido único. Diseño: Estudio retrospectivo. Institución: Grupo PRANOR, Sede Monterrico, y Genomics Perú, Lima, Perú. Material biológico: Embriones humanos. Intervenciones: Análisis de los registros de 429 embriones estudiados con PGD por SNPs, embriones obtenidos de 105 ciclos de reproducción asistida, entre 2011 y 2013. Principales medidas de resultados: Aneuploidía de embriones, relación con edad materna y origen paterno o materno. Resultados: El 48,8% de embriones resultó normal, con tasa de aneuploidía de 51,2%. La proporción de embriones sanos varió de acuerdo a la edad de la madre, disminuyendo cuando la edad aumentaba. En todos los grupos etarios estudiados más de 66% de las aneuploidías fue de origen materno, incluyendo el grupo de ovodonación (OD). Conclusiones: El diagnóstico preimplantacional mediante SNPs tendría gran valor pronóstico y sería una herramienta útil para conocer el origen de las aneuploidías en los embriones de las pacientes que se someten a procedimientos de reproducción asistida.

Background: Preimplantation genetic screening (PGS) using comparative genomics hybridization (aCGH) and single nucleotide polymorphism (SNP) technology has become a useful tool in assisted reproduction by improving clinical outcomes. Both techniques identify aneuploidies and chromosomal rearrangement. However, SNPs with Parental Support (Natera Inc.) give extra information of the aneuploidy origin either from the sperm or the oocyte. Objectives: To determine single aneuplodies rate in human embryos obtained by assisted reproduction using single nucleotide polymorphism microarray. Design: Retrospective study. Setting: Grupo PRANOR, Sede Monterrico, and Genomics Peru, Lima, Peru. Biologic material: Human embryos. Interventions: From 2011 to 2013, 105 patients underwent IVF/ ICSI with SNPs and Parental Support. In total, 429 embryos were analyzed and records were reviewed. Main outcome measures: Embryos aneuploidy, relation with maternal age and paternal or maternal origin. Results: From the 429 embryos 208 (48.8%) were chromosomally normal. The proportion of normal embryos decreased with increasing maternal age. In all age groups more than 66% of aneuploidies had maternal origin, including the ovodonation group (OD). Conclusions: PGS by SNPs with Parental Support resulted in good prognostic value and would be useful in determining the origin of aneuploidy in embryos of patients who underwent assisted reproduction technology.

Rapid detection of chromosome X, Y, 13, 18, and 21 aneuploidies by primed in situ labeling/synthesis technique.

AIMS AND OBJECTIVE: Primed in situ labeling/synthesis (PRINS) technique is an alternative to fluorescent in situ hybridization for chromosome analysis. This study was designed to evaluate the application of PRINS for rapid diagnosis of common chromosomal aneuploidy. MATERIALS AND METHODS: We have carried out PRINS using centromere specific oligonucleotide primers for chromosome X, Y, 13, 18 and 21 on lymphocyte metaphase and interphase cells spread. Specific primer was annealed in situ, followed by elongation of primer by Taq DNA polymerase in presence of labeled nucleotides. Finally, reaction was stopped and visualized directly under fluorescent microscope. RESULTS: Discrete centromere specific signals were observed with each primer. CONCLUSION: PRINS seems to be a rapid and reliable method to detect common chromosome aneuploidy in peripheral blood lymphocyte metaphase and interphase cells.

Aneuploidías en mujeres de edad avanzada, ¿cuál es el riesgo real?

Durante los últimos años, y debido a mejores oportunidades laborales, educativas y mayor información sobre planeamiento familiar, se ha observado que la edad en la que las parejas deciden tener hijos ha aumentado considerablemente. En la actualidad la edad de la madre es el principal factor de riesgo conocido para embarazos con aneuploidías cromosómicas. Sin embargo, no existe una probabilidad exacta ni se conoce la causa principal de esto. Por este motivo, existe una necesidad de entender mejor los mecanismos que conllevan a este incremento en las aneuploidías en mujeres mayores. El objetivo de este artículo de revisión es examinar los datos recolectados hasta el momento y poder determinar la probabilidad más cercana a la realidad, así como también, revisar las posibles causas del efecto de la edad materna en el aumento de las aneuploidías cromosómicas. Con esto esperamos poder brindar mayor información a parejas que planean empezar una familia y/o a parejas que estén considerando iniciar ciclos de fertilización asistida y que se encuentren dentro del grupo considerado de edad materna avanzada (mayores de 35 años).

Over the last decades, there has been a clear tendency in couples planning to have children later in life. Better educational and career opportunities and broad availability of contraception have been some of the contributing factors in couples postponing the beginning of a family. Advanced maternal age (AMA) is currently considered the main risk factor for chromosome aneuploidies, but there is no exact number as to the probability of actually producing aneuploid embryos or a mayor reason for this to happen. The object of this review is to address the recent findings and to near down the probability of actually producing aneuploid embryos in AMA women. Also we will try to elucidate the actual reason as to why this is happening and how it is related to the age of the mother. We hope these findings will help couples that are thinking about starting a family and couples that are starting or thinking about IVF treatment.

Estudio descriptivo del cribado de cromosomopatías en el primer trimestre de la gestación, en el Hospital Clínico San Carlos de Madrid, España / Observational study of screening for chromosomal abnormalities during first trimester of gestation in Clinic Hospital San Carlos, Madrid, Spain

Antecedentes: El cribado combinado de cromosomopatías, fundamentalmente trisomía 21, en el primer trimestre de gestación, se introdujo en los años '90 y está basado en un cálculo del riesgo a través de la combinación de la edad materna, la translucencia nucal fetal (TN), y los marcadores bioquímicos maternos (PAPP-A y fBHCG). Mediante esta combinación de marcadores se obtiene una sensibilidad para aneuploidías del 85-90 por ciento, con una tasa de falsos positivos (FP) del 5 por ciento. Objetivo: El propósito de este trabajo es describir la población cribada y analizar los resultados desde la implantación de la técnica en nuestro centro. Método: Estudio observacional de la población gestante que acudió para cribado de cromosomopatías durante el primer trimestre de la gestación al Hospital Clínico San Carlos, desde julio de 1999 hasta diciembre de 2009. Resultados: El tamaño muestral fue de 21.194 gestaciones simples, con un 12,5 por ciento de mujeres con más de una gestación y 141 casos de aneuploidía (6,6 por ciento). Se describe las características de la población y el comportamiento de las variables estudiadas. La sensibilidad del cribado combinado fue del 70 por ciento, con una tasa de FP de 2,3 por ciento. Conclusión: La tasa de detección del cribado combinado de cromosomopatías en el primer trimestre de gestación, es menor que la publicada en la literatura, aunque ha ido mejorando con los años, probablemente por una mejor formación de los ecografistas. En contraposición, la tasa de FP es muy baja.

Background: Screening for aneuploidies, mainly trisomy 21, during the first trimester of gestation, was introduced in the '90s and is based on a calculation of the risk through the combination of maternal age, nuchal translucency (NT) and biochemical parameters (PAPP-A and fBHCG). By means of this combination we can obtain a detection rate for aneuploidies of 85-90 percent, with a false positive rate of 5 percent. Objective: To describe our population and analyze our results related to combined screening for aneuploidies, during the period of time it has been performed in our hospital. Methods: Observational study of all pregnant women who attended Hospital Clínico San Carlos for screening of chromosomopaties during first trimester of gestation, from July 1999 to December 2009. Results: Sample size was 21,194 single pregnancies, with 12,5 percent of women with more than one gestation, and 141 cases of aneuploidy (6,6 percent). We describe the characteristics of our population and the distribution of the parameters studied. Combined screening had a detection rate of 70 percent with a false positive rate of 2,3 percent. Conclusion: Screening for aneuploidies during first trimester of gestation, in Hospital Clínico San Carlos, has a lower detection rate than previously reported. However, the false positive rate is very low.

Hallazgos ecográficos en fetos con alteraciones cromosómicas / Ecographic findings in fetus with cromosomal alterations

Describir los hallazgos ecográficos detectados en los fetos y su relación con el cariotipo anormal obtenido en las amniocentesis genéticas realizadas en el segundo trimestre. Se revisaron todos los informes de los estudios ecográficos realizados previamente a la amniocentesis de los fetos que resultaron con cromosomopatías durante el año 2006. Centro Nacional de Genética Humana y Experimental. Universidad Central de Venezuela. Caracas. En 1786 amniocentesis, se obtuvieron 32 fetos (1,79 por ciento) con cromosomopatías, siendo la trisomía 21 la más frecuente (47 por ciento). De todos los casos con alteraciones cromosómicas 15 fetos (46,9 por ciento) tuvieron uno o más marcadores ecográficos. Los hallazgos ecográficos encontrados en el grupo general fueron pliegue nucal engrosado en 40 por ciento, higroma quístico en 19,5 por ciento, ectasia pielocalicial en 12,5 por ciento, e intestino hiperecogénico, ausencia de hueso nasal, foco ecogénico intracardíaco y pie equino varo, cada uno en un 7 por ciento. Un 53 por ciento de los fetos con trisomía 21 presentaron algún tipo de hallazgo ecográfico anormal, así mismo un 67 por ciento de los fetos con trisomía 18 y 100 por ciento de los fetos que tenían monosomía X, trisomía 22 y triploidía. El ultrasonido juega un papel muy importante en el diagnóstico prenatal. El diagnóstico apropiado de las anomalías estructurales y hallazgos menores, incrementa la sospecha de alguna alteración cromosómica y puede sugerir la realización de procedimientos invasivos de diagnóstico prenatal

To describe the abnormalities detected by detailed second trimester ultrasonography among the fetuses with abnormal karyotype after amniocentesis. Ultrasound studies belonging to fetuses with diagnosed chromosomal anomalies in 2006 were reviewed. Centro Nacional de Genética Humana y Experimental. Universidad Central de Venezuela. Caracas. A total of 1,786 patients underwent amniocentesis with a result of 32 (1.79 percent) fetuses detected with an abnormal karyotype, trisomy 21 (47 percent). Out of all cases with chromosomal anormalies 15 fetuses (46.9 percent) had one or more sonographic markers. Ultrasound markers were: increased nucal fold 40 percent , cystic hygroma (19.5 percent) , pyelectasis 12.5 percent, and echogenic bowel, absent nasal bone, echogenic intracardiac foci and club foot (7 percent) each one. A 53 percent of fetuses with trisomy 21 had some adnormal sonographic marker, as well as 67 percent of trisomy 18 and 100 percent of fetuses with X0, trisomy 22 and triploidy. The second trimester ultrasound plays an important role in prenatal diagnosis. The appropriate detection of structural anomalies and sonographic markers increase the diagnosis of aneuploidies and can suggest the necessity to practice an invasive study

Clinical experience with the use of Fluorescence in Situ Hybridization on uncultured cells for prenatal diagnosis.

The aim of the study was to prospectively evaluate the usefulness and limitations of Fluorescence In Situ Hybridization (FISH) on uncultured cells for prenatal diagnosis of numeric aneuploidies of chromosomes 13, 18, 21, X and Y. Hundred prospectively selected pregnant women that were at high risk of giving birth to an abnormal child were offered prenatal diagnosis by FISH after appropriate counseling. Fetal tissue was obtained by chorionic villus sampling (n=26), amniocentesis (n=62) and or fetal blood sampling (n=12) and processed for FISH using commercial probes. Six cases were excluded initially owing to maternal blood contamination or inadequate sample. FISH results were available in 98% of cases, in 2% of cases there was FISH failure. Of the remaining 92 cases, chromosome aneuploidy was detected in eleven cases. FISH was found extremely valuable in cases presenting with fetal abnormalities detected on ultrasonography and also for rapid screening of aneuploidies in cases of abnormal triple marker test. But as the diagnosis is limited to only a small number of chromosomes, appropriate evaluation of the cases with counseling regarding the limitations of FISH is mandatory before offering this test for prenatal diagnosis.