Laboratory surveillance of invasive Haemophilus influenzae disease in Argentina, 2011-2019

Abstract The incorporation of Haemophilus influenzae type b (Hib) vaccine into the Argentine National Immunization Program in 1998 resulted in a dramatic decrease in the incidence of invasive disease due to this serotype. We assessed 1405 H. influenzae (Hi) isolates causing invasive infections referred to the National Reference Laboratory between 2011 and 2019. Non-encapsulated Hi were the most common strains (44.5%), followed by types b (41.1%) and a (10.0%). Significant increase in the proportion of type b was observed, from 31.2% in 2011, to 50% in 2015, correlating with the peak incidence rate, later decreasing to 33.6% by 2019. We compared the genetic relationship between clones circulating during the period of increased Hib incidence (2011-2015) and those of the prevaccination-transition period (1997-1998). Four pulsotypes predominated in both periods, G, M, P and K, G being the most common. Multilocus sequence typing revealed that the 4 pulsotypes belonged to ST6, or one of its simple or double locus variants. Isolates from fully vaccinated individuals did not differ from those of the rest of the population studied. After ruling out aspects associated with emergence of specific clones, we concluded that factors such as low booster coverage rates, delayed vaccination schedules and use of different vaccines may have contributed to the reemergence of Hib infections.

Resumen La introducción de la vacuna contra Haemophilus influenzae tipo b (Hib) en el Programa Nacional de Inmunización de Argentina en 1998 produjo una drástica disminución de la incidencia de enfermedad invasiva causada por este serotipo. En el Laboratorio Nacional de Referencia se estudiaron 1405 aislamientos de H. influenzae causantes de enfermedad invasiva recibidos en el período 2011-2019. H. influenzae no capsulado fue el más frecuente (44,5%), seguido por los tipos b (41,1%) y a (10,0%). Se observó un aumento significativo de la proporción del tipo b, de 31,2% en 2011 a 50% en 2015, que se correlacionó con un pico de incidencia en ese mismo año. Hacia 2019, descendió a 33,6%. Con el objetivo de evaluar los clones circulantes durante el incremento de la proporción de Hib y comparar con el período prevacunal-transición, se determinó la relación genética de una selección de aislamientos de los períodos 1997-1998 y 2011-2015. El análisis por PFGE mostró 4 pulsotipos predominantes en los 2 períodos, G, M, P y K, y el pulsotipo G fue mayoritario en ambos períodos. Por MLST se demostró que los 4 pulsotipos pertenecieron al ST6 o sus variantes (simple o doble locus). Entre los aislamientos de pacientes con vacunación completa no se hallaron clones diferentes respecto del resto de la población. Se postula que las coberturas de vacunación no satisfactorias en las dosis de refuerzo, los esquemas atrasados y el uso de diferentes vacunas pudieron haber contribuido a la reemergencia de Hib.

Caracterización de los tipos capsulares de Pasteurella multocida en exudado faríngeo de bovinos productores de carne clínicamente sanos en el estado de Querétaro / Characterization of capsular types of Pasteurella multocida isolated from clinically healthy beef cattle pharyngeal exudate in the state of Querétaro

El objetivo del presente estudio fue identificar y caracterizar los tipos capsulares de P. multocida en exudado faríngeo en bovinos destinados a la producción de carne en el estado de Querétaro. Se obtuvieron, mediante hisopo, 227 muestras de exudado faríngeo de animales clínicamente sanos en una planta de sacrificio ubicada en el municipio de Ezequiel Montes, Querétaro. Las muestras se sembraron en agar sangre y se incubaron a 37°C por 24 h en aerobiosis. Las cepas aisladas fueron identificadas mediante características morfológicas, pruebas bioquímicas convencionales y el microsistema comercial API 20NE. La tipificación de los grupos capsulares A y D se realizó por medio de una PCR múltiple para la amplificación de los genes hyaD-hyaC y dcbF, respectivamente. De acuerdo con los valores establecidos por el software API WEB, se logró la identificación de 14.09% (32/227) de cepas de P. multocida, que mostraron 96% de identidad y una tipicidad de 1 a P. multocida. Por medio de la PCR múltiple se logró la amplificación de los genes hyaD-hyaC correspondientes al grupo capsular A en el 100% (32/32) de las cepas identificadas previamente como P. multocida. No existen datos similares en México sobre la identificación y caracterización de P. multocida en bovinos destinados a la producción de carne. Con los resultados obtenidos se corrobora que, de manera similar a otros países de Europa y América, en México el grupo capsular predominante de P. multocida es el A.

The objective of the present study was to identify and characterize capsular types of P. multocida isolated from beef cattle pharyngeal exudate in the state of Querétaro. Two hundred and twenty seven pharyngeal exudate swab samples from clinically healthy animals in a slaughterhouse in the municipality of Ezequiel Montes, Querétaro were obtained. Samples were seeded in blood agar and incubated at 37°C for 24 h under aerobiosis. Strains were identified through morphological characteristics, conventional biochemical tests and commercial API 20NE Micro-System. Capsular typing of groups A and D was performed by a multiplex PCR for amplification of genes hyaD-hyaC and dcbF, respectively. According to the values established by API WEB software, it was possible to identify 14.09% (32/227) of P. multocida strains, which showed an identification percentage of 96% and a typicality of 1 to P. multocida. By multiplex PCR, the amplification of genes hyaD-hyaC, correspondent to capsular group A in 100% (32/32) of the strains previously identified as P. multocida, was achieved. There are no similar data in Mexico on the identification and characterization of P. multocida in beef cattle. With the results obtained it is confirmed that, in a similar way with other countries of Europe and America, capsular type A of P. multocida is predominant in Mexico.

Caracterización fenotípica y molecular de cepas de Pasteurella multocida aisladas de exudado nasal de bovinos, en dos cuencas lecheras de México / Phenotypic and molecular strain characterization of Pasteurella multocida isolated from cattle nasal exudate from two dairy complexes in Mexico

Two hundred and fifty strains of P. multocida isolated from nasal exudate were obtained, 182 clinically healthy bovine strains and 68 clinically ill with pneumonia bovine strains, from two dairy complexes, one in the Tizayuca region of Hidalgo state (n = 81), and another in the Region Lagunera of the states of Coahuila and Durango (n = 169), Mexico. Strains were identifed by conventional biochemical tests and API 20NE commercial system. Capsular typing was performed by testing hyauloronidase and acrifavine, as well as by a multiplex PCR for amplification of genes hyaC-hyaD and dcbF. The overall results of hyaluronidase by the test showed that 90.4% (226/250) of the strains were capsular type A and through the acrifavine test 9.6% (24/250) was capsular type D. Using the multiplex PCR, 92% (230/250) was capsular type A and 8% (20/250) was capsular type D. The comparison of results between biochemical tests and PCR are consistent in identifying strains of capsular type A but not with the capsular type D. It was possible to confrm that capsular type A of P. multocida is predominat in Mexico.

Se obtuvieron 250 cepas de P. multocida aisladas de exudado nasal, 182 cepas de bovinos clínicamente sanos y 68 cepas de bovinos clínicamente enfermos de neumonía, de dos complejos lecheros, uno en la región de Tizayuca estado de Hidalgo (n = 81), y otro en la Región Lagunera de los estados de Coahuila y Durango (n = 169), México. Las cepas fueron identificadas mediante pruebas bioquímicas convencionales y el sistema comercial API 20NE. La tipificación capsular se realizó por medio de las pruebas de hiauloronidasa y acrifavina, así como por medio de una PCR múltiple para la amplificación de los genes hyaD-hyaC y dcbF. Los resultados globales mediante la prueba de hialuronidasa mostraron que 90.4% (226/250) de las cepas fueron del tipo capsular A y por medio de la prueba de acrifavina, 9.6% (24/250) fue del tipo capsular D. Por medio de la PCR múltiple, 92% (230/250) fue tipo capsular A y 8% (20/250) fue tipo capsular D. La comparación de los resultados entre las pruebas bioquímicas y la técnica de PCR concuerdan en la identificación de las cepas del tipo capsular A, pero no así con las del tipo capsular D. Se corrobora que en México el tipo capsular predominante de P. multocida es el A.

Distributions of pathogenic capsular types and in vitro antimicrobial susceptibility of different serotypes of Streptococcus suis isolated from clinically healthy sows from 10 provinces in China / 中华流行病学杂志

Objective To determine the distributions of major pathogenic capsular types and in vitro antimicrobial susceptibility of different serotypes of Streptococcus suis isolated from clinically healthy sows in China. Methods Tonsil specimens of clinically healthy sows from 10 different provinces in China were collected, a total of 421 S.suis were isolated. Capsular types of S.suis were decided using the sera agglutination reaction. Antimicrobial susceptibility testing was performed using a broth microdilution method and the differences between serotypes were decided statistically. Results The prevalent capsular types of S.suis isolated from clinically healthy sows were 9(26.6% ), 3 (23.5%) and 7(15.7% ) types, respectively. 7.4% of isolates were confirmed to be S.suis type 2. Overall, differences in antimicrobial susceptibility among serotypes of S. suis were found. By comparison, lower resistance was observed for S.suis type 2 from clinically healthy sows. Conclusion The prevalence of pathogenic S.suis serotypes from clinically healthy sows again indicates S.suis is a conditional pathogenic bacterium. Differential prevention and treatment regimes should be considered according to antimicrobial susceptibility of different serotypes of S.suis.