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1.
Rev. biol. trop ; 71(1): e54636, dic. 2023. tab, graf
Article in Spanish | LILACS, SaludCR | ID: biblio-1550730

ABSTRACT

Resumen Introducción: La Rata de Magdalena, Xenomys nelsoni, es un roedor endémico de México, de distribución restringida a las selvas bajas caducifolias densas, en una pequeña región de la costa del Pacífico mexicano. Es una especie poco conocida, catalogada como "En Peligro" de acuerdo con la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza (IUCN). Este desconocimiento unido a la alta tasa de deforestación de su hábitat hace que su conservación sea prioritaria. Objetivo: Realizar un recuento histórico de los registros depositados en las colecciones científicas, generar mapas de distribución potencial y analizar el estado de conservación de la especie. Método: Los datos de ocurrencia de las especies se obtuvieron de la literatura y bases de datos digitales y se analizaron por décadas. Se utilizaron los programas GARP y MaxEnt para generar los modelos de nicho ecológico. La importancia de las variables en el modelo se estimó mediante un análisis Jackknife. Resultados: A lo largo de 129 años 19 recolectores registraron 69 ejemplares, de los cuales 65 están depositados en siete colecciones internacionales y una nacional. Aunque la especie sólo se ha recolectado en Jalisco y Colima, la distribución potencial de X. nelsoni incluye también el estado de Michoacán. De esta área estimada, sólo el 1.5 % se encuentra dentro de un Área Natural Protegida. Conclusiones: Los resultados de la distribución potencial podrían ser utilizados para verificar la presencia de la especie en lugares donde no ha sido recolectada como el norte de la Reserva de la Biosfera Chamela-Cuixmala y en algunas zonas de la provincia fisiográfica Costas del Sur en el estado de Michoacán. Es necesario incrementar los muestreos en regiones poco estudiadas predichas por el modelo y aumentar el área de protección.


Abstract Introduction: The Magdalena Rat, Xenomys nelsoni, is a rodent endemic to Mexico, whose distribution is restricted to dense tropical dry forests in a small region on the Pacific coast of Mexico. It is a poorly known species categorized as "Endangered" by the International Union for Conservation of Nature (IUCN). This lack of knowledge and the high rates of deforestation of its habitat makes its conservation a priority. Objective: To summarize the historical records deposited in scientific collections, to create potential distribution maps, and to analyze the conservation status of the species. Methods: We obtained species occurrence data from literature and digital databases, analyzing them by the decade. We used GARP and MaxEnt software to generate the ecological niche models. The importance of the variables in the model was estimated using the Jackknife technique. Results: Over 129 years, 19 collectors registered 69 specimens, of which 65 are deposited in one national and seven international collections. Although the species has only been collected in Jalisco and Colima, the potential distribution for X. nelsoni also includes the state of Michoacán. Of this estimated area, only 1.5 % is in a Protected Natural Area. Conclusions: The results of the potential distribution could be used to verify the presence of the species in places where it has not been collected, such as the northern part of the Chamela-Cuixmala Biosphere Reserve and in some areas of the physiographic province Costas del Sur in the state of Michoacán. It is needed to increase samplings in the least studied regions predicted by the model and expand the area of protection.


Subject(s)
Animals , Rats , Rats/anatomy & histology , Ecosystem , Endangered Species , Mexico
2.
Psico USF ; 28(4): 685-696, Oct.-Dec. 2023. ilus, tab
Article in English | LILACS, INDEXPSI | ID: biblio-1529170

ABSTRACT

Nonparametric procedures are used to add flexibility to models. Three nonparametric item response models have been proposed, but not directly compared: the Kernel smoothing (KS-IRT); the Davidian-Curve (DC-IRT); and the Bayesian semiparametric Rasch model (SP-Rasch). The main aim of the present study is to compare the performance of these procedures in recovering simulated true scores, using sum scores as benchmarks. The secondary aim is to compare their performances in terms of practical equivalence with real data. Overall, the results show that, apart from the DC-IRT, which is the model that performs the worse, all the other models give results quite similar to those when sum scores are used. These results are followed by a discussion with practical implications and recommendations for future studies.(AU)


Procedimentos não paramétricos são usados para adicionar flexibilidade aos modelos. Três modelos não paramétricos de resposta ao item foram propostos, mas não comparados diretamente: o Kernel smoothing (KS-IRT); a Curva Davidiana (DC-IRT); e o modelo semiparamétrico Rasch Bayesiano (SP-Rasch). O objetivo principal do presente estudo é comparar o desempenho desses procedimentos na recuperação de escores verdadeiros simulados, utilizando escores de soma como benchmarks. O objetivo secundário é comparar seus desempenhos em termos de equivalência prática com dados reais. De forma geral, os resultados mostram que, além do DC-IRT, que é o modelo que apresenta o pior desempenho, todos os outros modelos apresentam resultados bastante semelhantes aos de quando se usam somatórios. Esses resultados são seguidos de uma discussão com implicações práticas e recomendações para estudos futuros.(AU)


Se utilizan procedimientos no paramétricos para agregar flexibilidad a los modelos. Se propusieron tres modelos de respuesta al ítem no paramétricos, pero no se compararon directamente: Kernel smoothing (KS-IRT); la curva davidiana (DC-IRT); y el modelo bayesiano de Rasch semiparamétrico (SP-Rasch). El objetivo principal del presente estudio es comparar el desempeño de estos procedimientos en la recuperación de puntajes verdaderos simulados, utilizando puntajes de suma como puntos de referencia. El objetivo secundario es comparar su desempeño en términos de equivalencia práctica con datos reales. En general, los resultados muestran que, a excepción de DC-IRT, que es el modelo con peor desempeño, todos los otros modelos presentan resultados bastante similares a los obtenidos cuando se utilizan sumatorios. Estos resultados son seguidos por una discusión con implicaciones prácticas y recomendaciones para estudios futuros.(AU)


Subject(s)
Statistics as Topic , Monte Carlo Method , Models, Statistical , Bayes Theorem , Statistics, Nonparametric , Correlation of Data
3.
Rev. argent. salud publica ; 15: 84-84, jun. 2023. graf
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1449441

ABSTRACT

RESUMEN INTRODUCCIÓN Los modelos matemáticos de la transmisión de enfermedades infecciosas permiten estudiar distintos mecanismos que afectan su comportamiento temporal. Este trabajo analizó el efecto sobre la dinámica de la influenza y el virus sincitial respiratorio (VSR) de la disminución de la transmisibilidad debida a las medidas de cuidado adoptadas para reducir la circulación de COVID-19. MÉTODOS Se empleó un modelo determinista tipo SIRS (susceptible-infectado-recuperado-susceptible) con modulación estacional para representar la influenza y el VSR, en ambos casos con inmunidad de corta duración y ciclo anual. Los cambios en la transmisibilidad de la enfermedad se modelaron reduciéndola durante dos años y planteando distintos escenarios. RESULTADOS En el modelo planteado, la reducción en la transmisibilidad genera cambios que se sostienen en los años siguientes: eventos epidémicos muy pronunciados con alargamiento del intervalo interbrote. Este efecto resulta dominante respecto del comportamiento estacional. El escenario de una reducción inicial de la transmisibilidad del 40% resulta compatible con el comportamiento de influenza y VSR reportados actualmente para Argentina. DISCUSIÓN El modelo general propuesto, en condiciones de disminución transitoria en la transmisibilidad, exhibe una epidemiología compatible con la observada recientemente en Argentina para ambas enfermedades e ilustra el modelado como herramienta útil en la comprensión de efectos no intuitivos.


ABSTRACT INTRODUCTION Mathematical models of infectious diseases transmission allow to study different mechanisms which affect their temporal behavior. This work analyzed the impact of the decrease in transmissibility, as a result of measures of personal care adopted to reduce circulation of COVID-19, on the dynamics of influenza and respiratory syncytial virus (RSV). METHODS A deterministic SIRS (susceptible-infected-recovered-susceptible) model with seasonal modulation was used to represent two diseases with short-term immunity and annual cycle: influenza and RSV. Changes in disease transmissibility were modeled by reducing it for two years and analyzing different scenarios. RESULTS In the proposed model, transmissibility reduction brings changes which sustain in the following years: very pronounced epidemic events with lengthening of the inter-outbreak interval. This effect prevails over the seasonal behavior. The scenario of 40% initial reduction in transmissibility is compatible with the behavior of influenza and RSV currently reported in Argentina. DISCUSSION The general model proposed here, under conditions of temporary reduced transmissibility, shows an epidemiology compatible with recently reported data of influenza and RSV in Argentina. This result illustrates modeling as a useful tool to understand non-intuitive effects.

4.
Rev. biol. trop ; 71abr. 2023.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1449488

ABSTRACT

Introducción: Los arrecifes de coral son ecosistemas altamente degradados, por lo que ha sido necesario implementar acciones de restauración activa para recuperar su estructura y funcionamiento. Se ha implementado la propagación clonal para obtener fragmentos pequeños (~ 10 cm) de las ramas distales de colonias donadoras de corales de la especie Acropora palmata, para posteriormente fijarlos en el sustrato arrecifal, simulando el efecto de dispersión que ocurre de manera natural en esta especie, a lo que en este trabajo se denomina ''dispersión asistida". Sin embargo, es necesario evaluar los efectos de esta técnica como son: la cantidad de fragmentos que se puede obtener de cada colonia, el periodo de recuperación de tejido de las colonias donadoras y los fragmentos sembrados. Objetivo: Evaluar el efecto de poda en las colonias donadoras estimando el porcentaje de tejido podado de colonias donadoras de A. palmata y su tasa de recuperación 30 meses después. Métodos: Se realizaron cuatro monitoreos: antes, inmediatamente después de la poda, un mes después de la siembra, y 30 meses después, en cuatro colonias de A. palmata localizadas en el Parque Nacional Costa Occidental de Isla Mujeres, Punta Cancún y Punta Nizuc en el Caribe mexicano. La modelación 3D basada en fotogrametría se realizó con el software Agisoft Metashape Pro, mientras que las métricas de área de superficie de tejido, extensión radial y apical se obtuvieron mediante el software CloudCompare. Resultados: Posterior a la colecta de fragmentos de las colonias, se observó que el material utilizado en la dispersión asistida representa menos del 12% del tejido vivo. Después de un mes, las colonias donadoras presentaban una recuperación del 5% con tejido nuevo recubriendo las áreas de corte. Las colonias donadoras perdieron, en promedio, 65% de tejido vivo tras el impacto de cuatro huracanes, y en un caso la colonia fue totalmente eliminada, pero con los fragmentos sembrados se pudo conservar el genotipo. Conclusiones: La dispersión asistida podría incrementar el tejido vivo de corales ramificados en intervalos de tiempo relativamente cortos, sin comprometer la integridad de la colonia donadora, si se poda menos del 12%.


Introduction: Coral reefs are highly degraded ecosystems, for which it has been necessary to implement active restoration actions to recover their structure and functioning. Asexual propagation has been implemented to obtain small fragments (~10 cm) from the distal branches of donor colonies of corals of the species Acropora palmata, to subsequently relocate them in the reef substrate, simulating the dispersion effect that occurs naturally in the species, which in this work is called assisted propagation. However, it is necessary to evaluate the effects of this technique, such as the number of fragments that can be obtained from each colony, the tissue recovery period of the donor colonies and fragments. Objective: To address the effect of pruning on donor colonies by estimating the percentage of live tissue removed from donor colonies of A. palmata and their recovery rate after 30-months. Methods: Four surveys were carried out: before, immediately after pruning, one month after outplanting, and 30 months after pruning on four colonies of A. palmata located in the Parque Nacional Costa Occidental de Isla Mujeres, Punta Cancún and Punta Nizuc in the Mexican Caribbean. Photogrammetry-based 3D modeling was performed using Agisoft Metashape Pro software, while tissue surface area, radial and apical growth were obtained using CloudCompare software. Results: After fragment collection, the material used in the assisted propagation represents less than 12% of the living tissue. After one month, the donor colonies showed a recovery of 5%, with new tissue covering the cut areas. The donor colonies lost on average 65 % of living tissue after four hurricanes, and in one case the colony was lost all together, but with the outplanted fragments the genotype could be preserved. Conclusions: Assisted propagation could increase living tissue of branching corals in relatively short intervals of time, without serious damage to the donor colony if less than 12 % is removed.

5.
Cad. Saúde Pública (Online) ; 39(7): e00087822, 2023. tab, graf
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1447780

ABSTRACT

Abstract: Habits and behaviors related to obesity risk are strongly associated with the family environment and are affected by socioeconomic factors. Structural equation modeling (SEM) allows us to hypothesize on how the relationships between these factors occur and measure their impact. This study aimed to explore the relationship between family socioeconomic indicators and childhood obesity, mediated by habits linked to energy balance, applying a SEM. A cross sectional study was performed on 861 Argentinian schoolchildren aged 6-12 years, from 2015 to 2016. The model included three latent variables: socioeconomic status, healthy habits, and obesity. Socioeconomic status indicators and healthy habits were surveyed by self-administered parental questionnaires, whereas obesity indicators were evaluated with anthropometry. The applied model showed an acceptable fit (NFI = 0.966; CFI = 0.979; RMSEA = 0.048). Socioeconomic status positively influenced parental education, health insurance, and car possession, while negatively influenced crowding (p < 0.001). Healthy habits significantly influenced physical activity, meals frequency, and sleep hours, while negatively influenced sedentary hours and mother's nutritional status (p < 0.001). Obesity factor positively influenced body mass index, body fat, and waist-to-height ratio (p < 0.001). Finally, socioeconomic status positively influenced health habits, which in turn negatively influenced obesity factor. Healthy habits (especially physical activity and mother's nutritional status) mediated the relationship between socioeconomic status and child obesity. Further research should include other indicators related to diet, eating habits, and physical activity like neighborhood characteristics.


Resumen: Los hábitos y comportamientos relacionados con el riesgo de obesidad están fuertemente asociados al entorno familiar y se ven afectados por factores socioeconómicos. El modelo de ecuaciones estructurales (MEE) permite plantear hipótesis sobre cómo se dan las relaciones entre estos factores y medir su impacto. El objetivo del presente estudio fue explorar la relación entre los indicadores socioeconómicos familiares y la obesidad infantil, mediada por hábitos relacionados con el balance energético, aplicando un MEE. Se realizó un estudio transversal con 861 escolares argentinos de 6 a 12 años entre 2015 y 2016. El modelo incluyó tres variables latentes: nivel socioeconómico, hábitos saludables y obesidad. Los indicadores nivel socioeconómico y hábitos saludables se midieron mediante cuestionarios autoadministrados a los padres, mientras que los indicadores de obesidad se obtuvieron mediante antropometría. El modelo aplicado presentó un ajuste aceptable (NFI = 0,966; CFI = 0,979; RMSEA = 0,048). El nivel socioeconómico influyó positivamente en la escolaridad de los padres, en el plan de salud y en el hecho de tener automóvil, mientras que influyó negativamente en el hacinamiento (p < 0,001). La variable hábitos saludables influyó significativamente en la actividad física, en la frecuencia de las comidas y en las horas de sueño, pero influyó negativamente en las horas sedentarias y en el estado nutricional materno (p < 0,001). El factor obesidad influyó positivamente en el índice de masa corporal, en la grasa corporal y en la razón cintura/talla (p < 0,001). Finalmente, el nivel socioeconómico influyó positivamente en los hábitos saludables, que, a su vez, influyeron negativamente en la obesidad. Los hábitos saludables, en especial la actividad física y el estado nutricional materno, moderan la relación entre el nivel socioeconómico y la obesidad infantil. Las nuevas investigaciones deberían incluir otros indicadores relacionados con la dieta, con los hábitos alimentarios y con la actividad física, así como con las características del vecindario.


Resumo: Hábitos e comportamentos relacionados ao risco de obesidade estão fortemente associados ao ambiente familiar e afetados por fatores socioeconômicos. A modelagem de equações estruturais (MEE) permite levantar hipóteses sobre como ocorrem as relações entre esses fatores e medir seu impacto. O objetivo do presente estudo foi explorar a relação entre os indicadores socioeconômicos familiares e a obesidade infantil, mediada por hábitos ligados ao balanço energético, aplicando uma MEE. Um estudo transversal foi realizado com 861 escolares argentinos de 6 a 12 anos entre 2015 e 2016. O modelo incluiu três variáveis latentes: nível socioeconômico, hábitos saudáveis e obesidade. Os indicadores do nível socioeconômico e de hábitos saudáveis foram medidos por meio de questionários autoaplicáveis aos pais, enquanto os indicadores de obesidade foram obtidos por meio de antropometria. O modelo aplicado apresentou um ajuste aceitável (NFI = 0,966; CFI = 0,979; RMSEA = 0,048). O nível socioeconômico influenciou positivamente a escolaridade dos pais, o plano de saúde e a posse de automóvel, enquanto influenciou negativamente a aglomeração (p < 0,001). A variável hábitso saudáveis influenciou significativamente a atividade física, a frequência das refeições e as horas de sono, mas influenciou negativamente as horas sedentárias e o estado nutricional materno (p < 0,001). O fator obesidade influenciou positivamente o índice de massa corporal, a gordura corporal e a relação cintura/estatura (p < 0,001). Finalmente, o nível socioeconômico influenciou positivamente os hábitso saudáveis, que por sua vez influenciou negativamente a obesidade. Hábitos saudáveis, especialmente atividade física e estado nutricional materno, mediam a relação entre nível socioeconômico e obesidade infantil. Novas pesquisas devem incluir outros indicadores relacionados à dieta, hábitos alimentares e atividade física, como características da vizinhança.

6.
Investig. enferm ; 25: 1-12, 20230000. a.1 Tab b: 3 ilus
Article in Spanish | LILACS, BDENF, COLNAL | ID: biblio-1517383

ABSTRACT

Introducción: el síndrome coronario agudo (SCA) se caracteriza por diferentes síntomas, por lo cual la experiencia varía de persona a persona. El Modelo conceptual del manejo de los síntomas (MCMS) de Dodd aborda este aspecto que requiere ser comprobado dentro de la práctica de enfermería. Objetivo: comprobar los postulados de la dimensión de la experiencia de los síntomas del Modelo conceptual de Dodd en personas con síndrome coronario agudo. Métodos: comprobación teórica por medio de ecuaciones estructurales. Participaron 256 individuos con diagnóstico de síndrome coronario agudo, seleccionados por muestreo probabilístico estratificado. Se recolectaron datos clínicos, sociodemográficos y se midió la evaluación y respuesta a los síntomas con cinco instrumentos válidos. Se realizó un análisis estadístico con ajuste absoluto, ajuste incremental y ajuste de parsimonia del cual derivó un modelo de ecuaciones estructurales. Resultados: se comprobó la relación bidireccional entre la severidad del síntoma (evaluación) y la toma de decisiones (respuesta al síntoma). Se conformó un modelo que explica el 44 % de la varianza sobre la toma de decisiones. Sobre esta variable también influyen otras variables como la evaluación cognitiva y el control personal. Conclusión: este modelo conceptual permitió comprender la dimensión de la experiencia del síntoma en pacientes con síndrome coronario agudo, comprobando sus postulados en la práctica.


Introduction: acute coronary syndrome (ACS) is characterized by different symptoms, so the experience varies from person to person. Dodd's Conceptual Model of Symptom Management addresses this aspect that requires testing within nursing practice. Objective: to test the postulates of the symptom experience dimension of Dodd's Conceptual Model of Symptom Management in persons with acute coronary syndrome. Methods: theoretical testing by means of structural equations. A total of 256 individuals with a diagnosis of acute coronary syndrome, selected by stratified probability sampling, participated. Clinical and sociodemographic data were collected, and symptom assessment and response were measured with five valid instruments. Statistical analysis was performed with absolute adjustment, incremental adjustment and parsimony adjustment from which a structural equation model was derived. Results: the bidirectional relationship between symptom severity (assessment) and decision making (symptom response) was tested. A model was formed that explains 44% of the variance on decision making. This variable is also influenced by other variables such as cognitive evaluation and personal control. Conclusion: this conceptual model allowed us to understand the dimension of symptom experience in patients with acute coronary syndrome, proving its postulates in practice.


Introdução: Síndromes coronarianas agudas (SCA) caracterizam-se por diferentes sintomas, pelo que a experiência muda de pessoa para pessoa. O Modelo conceitual do manejo dos sintomas (MCMS) de Dodd aborda esse aspecto que precisa testes na prática de enfermagem. Objetivo: verificar os postulados da dimensão da experiência dos sintomas do Modelo conceitual de Dodd em pacientes com síndrome coronariana aguda. Métodos: verificação teórica por meio de equações estruturais. Participaram 256 indivíduos com diagnóstico de síndrome coronariana aguda, selecionados por amostragem probabilística estratificada. Dados clínicos e sociodemográficos foram coletados e a avaliação e resposta aos sintomas foi medida com cinco instrumentos válidos. Foi realizada análise estatística com ajuste absoluto, ajuste incremental e ajuste de parcimônia que derivou num modelo de equaciones estruturais. Resultados: verificou-se o relacionamento bidirecional entre a gravidade do sintoma (avaliação) e a tomada de decisão (resposta ao sintoma). Um modelo que explica 44% da variância sobre a tomada de decisão foi conformado. Sobre essa variável também influem outras variáveis como a avaliação cognitiva e o controlo pessoal. Conclusão: este modelo conceitual permitiu compreender a dimensão da experiência do sintoma em doentes com síndrome coronariana aguda, verificando seus postulados na prática.


Subject(s)
Humans
7.
Vitae (Medellín) ; 29(3): 1-12, 2022-08-18. Ilustraciones
Article in English | LILACS, COLNAL | ID: biblio-1393178

ABSTRACT

Background: This research was motivated by the complaints of tomato farmers about their crops that quickly rotted before being sold, as well as the many research results (raw materials and methods) that edible coating films could not be applied optimally. Objectives: The research was a practical recommendation by comparing the effectiveness of raw materials (polysaccharides, proteins, and lipids) with the dipping and spray methods. Materials and methods used in the comparison process were the application of Structural Equation Modeling (SEM) with the Partial Least Square (PLS) approach. Results: Dipping has a strong effect (f2 ≥ 0.35; p<0.05), while spray had a moderate effect (f2: 0.15-0.35; p<0.05). Thus, the role of dipping as a mediator was more dominant than spray. Compared to proteins and lipids, polysaccharides had the best effectiveness (ß:0.460-0.584; f2: 0.15-0.35; p<0.05). Conclusion: the three ingredients improved the quality of tomatoes, and the dipping method was easier to apply by farmers than the spray method, which had many obstacles in its application


Antecedentes: esta investigación está motivada por las quejas de los productores de tomate sobre sus cultivos que se pudren rápidamente antes de ser vendidos, así como por los muchos resultados de la investigación (materias primas y métodos) de que las películas de recubrimiento comestibles no se pudieron aplicar de manera óptima. Objetivos: La investigación consiste en recomendaciones prácticas mediante la comparación de la eficacia de las materias primas (polisacáridos, proteínas y lípidos) con los métodos de inmersión y aspersión. Métodos: El método utilizado en el proceso de comparación es la aplicación del modelo de ecuaciones estructurales (SEM) con el enfoque de mínimos cuadrados parciales (PLS). Resultados: La inmersión tiene un efecto fuerte (f2 ≥ 0,35; p<0,05), mientras que la pulverización tiene un efecto moderado (f2: 0,15-0,35; p<0,05). Por lo tanto, el papel de la inmersión como mediador es más dominante que el del rociado. Los polisacáridos tienen la mejor eficacia (ß:0,460-0,584; f2: 0,15-0,35; p<0,05) en comparación con las proteínas y los lípidos. Conclusión: es que los tres ingredientes pueden mejorar la calidad de los tomates, y el método de inmersión es más fácil de aplicar por los agricultores que el método de aspersión, que tiene muchos obstáculos en su aplicación


Subject(s)
Humans , Food Quality , Solanum lycopersicum , Immersion , Polysaccharides/administration & dosage , Effectiveness , Proteins/administration & dosage , Latent Class Analysis , Lipids/administration & dosage
8.
Rev. colomb. quím. (Bogotá) ; 51(1): 14-23, Jan.-Apr. 2022. tab, graf
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1408078

ABSTRACT

Resumen El modelamiento ¡n silíco ha sido de gran contribución en los procesos proteómicos, desarrollando estructuras de las secuencias proteicas ya existentes, que por motivos de altos costos y las diferentes tecnologías necesarias para el desarrollo de estas metodologías, se encuentran deficientes en el número de modelamientos de proteínas disponibles. Entre aquellas secuencias con carencia de estructura proteica se encuentra la proteína liasa organomercurial (MerB) de Pseudomonas /luorescens, importante en la resistencia al mercurio. En el presente artículo se analizó tanto estructural como funcionalmente la proteína MerB en Pseudomonas jluorescens, utilizando la herramienta de la química estructural "modelamiento por homología" mediante plataformas bioinformáticas, con el fin de obtener un modelo que represente la estructura 3D más precisa y que capturen las mejores variantes estructurales entre todas las posibles conformaciones de las proteínas en la familia. En este trabajo, se desarrolló un método comparativo de la secuencia estudiada con las reportadas en las bases de datos para las proteínas MerB del género Pseudomonas. Se propone un modelo tridimensional para la enzima (MerB) en P. jluorescens, mediante el modelamiento por homología, se muestra la caracterización en la estructura secundaria, terciaria, la caracterización del dominio catalítico y los motivos estructurales presentes.


Abstract In silico modeling has made a great contribution to proteomic processes, developing structures of the already existing protein sequences, which for reasons of high costs and the different technologies necessary for the development of these methodologies, are deficient in the number of models of available proteins. Among those sequences lacking protein structure is the organomercurial lyase (MerB) protein from Pseudomonas fluoresceins, important in mercury resistance. In this article, the MerB protein in Pseudomonas fluorescens was analyzed both structurally and functionally, using the structural chemistry tool "homology modeling" using bioinformatic platforms, in order to obtain a model that represents the most accurate 3D structure and that captures the best structural variants among all the possible conformations of the proteins in the family. In this work, a comparative method of the sequence studied with those reported in the databases for MerB proteins of the genus Pseudomonas was developed. A three-dimensional model for the enzyme (MerB) in P. fluorescens is proposed, through homology modeling, the characterization at the secondary and tertiary structure level, the characterization of the catalytic domain and the structural motifs present is shown.


Resumo A modelagem in silico tem dado um grande contributo para os processos proteómicos, desenvolvendo estruturas de sequências de proteínas já existentes, as quais, pelos elevados custos e pelas diferentes tecnologias necessárias ao desenvolvimento destas metodologias, são deficientes no número de modelos de proteínas disponíveis. Entre as sequências sem estrutura protéica está a proteína organomercurial liase (MerB) de Pseudomonas fluorescens, importante na resistência ao mercúrio. Neste artigo, a proteína MerB em Pseudomonas fluorescens foi analisada estrutural e funcionalmente, usando a ferramenta de química estrutural "modelagem de homologia" usando plataformas de bioinformática, a fim de obter um modelo que represente a estrutura 3D mais precisa e que capture as melhores variantes estruturais. entre todas as conformações possíveis das proteínas da família. Neste trabalho, foi desenvolvido um método comparativo da sequência estudada com aqueles relatados em bancos de dados para proteínas MerB do gênero Pseudomonas. Um modelo tridimensional para a enzima (MerB) em P. fluorescens é proposto, através de modelagem por homologia, a caracterização em nível de estrutura secundária e terciária, a caracterização do domínio catalítico e os motivos estruturais presentes são mostradas.

9.
Rev. argent. microbiol ; 53(3): 11-20, Sept. 2021. graf
Article in English | LILACS | ID: biblio-1376411

ABSTRACT

ABSTRACT Animal feeds are characterized by low water activity values. Nevertheless, fungal contamination withEurotiumspecies are quite common, causing nutritional depletion, spoilage and economic losses. The aim of this work was to assessEurotiumamstelodami,E. chevalieri,E. repensandE. rubrumgrowth in a feed matrix at different conditions of water activity (0.71-0.97) and temperature (5, 15, 25, 30 and 37°C). It was found thatEurotiumspecies are able to grow in a wide range of water activity and temperature in a short period of time (7 days) and faster than in synthetic media. Rosso and probabilistic models were applied in order to determine the limiting and optimum growth conditions as well as growth probability at certain combinations of environmental factors. Both models provided an accurate fit to the cardinal parameters and good performance for growth/no growth cases. This is the first report assessing the growth parameters ofEurotiumspecies directly in animal feed. Data obtained in the present study is useful to predict and avoidEurotiumspecies growth in animal feed.


RESUMEN Los alimentos balanceados se caracterizan por tener bajos valores de actividad de agua. Sin embargo, la contaminación por hongos con especies deEurotiumes bastante común y causa agotamiento nutricional, deterioro y pérdidas económicas. El objetivo de este trabajo fue evaluar el crecimiento deEurotiumamstelodami,E. chevalieri,E. repensyE. rubrumen una matriz de alimento balanceado a diferentes condiciones de actividad de agua (0,71-0,97) y temperatura (5, 15, 25, 30 y 37°C). Se determinó que las especies deEurotiumpueden crecer en un amplio rango de actividades de agua y temperatura en un corto período de tiempo (7 días), y a mayor velocidad que en medio sintético. Se utilizaron los modelos de Rosso y probabilísticos para determinar las condiciones de crecimiento limitantes y óptimas, así como la probabilidad de crecimiento en ciertas combinaciones de factores ambientales. Ambos modelos proporcionaron un ajuste preciso a los parámetros cardinales y una buenaperformancepara los casos de crecimiento/sin crecimiento. Este es el primer trabajo que evalúa los parámetros de crecimiento de las especies deEurotiumdirectamente en alimento balanceado. Los datos obtenidos en el presente estudio son útiles para predecir y evitar el crecimiento de especies deEurotiumen este tipo de alimentos.


Subject(s)
Animals , Eurotium , Aspergillus , Temperature , Water
10.
Rev. biol. trop ; 69(1)2021.
Article in English | LILACS | ID: biblio-1507816

ABSTRACT

Introduction: Chlorophyll a concentration proxies the phytoplankton biomass which directly involves in signifying the production functions of aquatic ecosystem. Thus, it is imperative to understand their spatio-temporal kinetics in lotic environment with reference to regional climatic variabilities in the tropical inland waters. Objective: In-situ studies were conducted to examine the changes in phytoplankton biomass in lower Ganga basin as influenced by various environmental parameters under regional climatic variability during 2014-2016. Methods: Firstly, the most key influential environmental parameters on riverine Chl-a concentration were determined. Then the direct cascading effect of changing climatic variables on key environmental parameters were derived through modeling and quantified probable changes in mean Chl-a concentration in the lower stretch of river. Results: Only five environmental parameters namely water temperature, total dissolved solid, salinity, total alkalinity and pH were key factors influencing Chl-a (Multiple R2: 0.638, P < 0.05). Present estimates indicate that if the present rate of regional climatic variability over the last 3 decades (mean air temperature + 0.24 °C, total annual rainfall -196.3 mm) remain consistent over the next three decades (2015-2045), an increase in mean Chl-a by + 170 µgL-1 may likely be expected grossly reaching about 475.94 µg L-1 by the year 2045 or more. Conclusions: The present study is first such comprehending a gross hint towards the probable ecosystem response with an alternative model based methodology in data-deficient situations. Subsequently, the output would also be of great benefit for increase water governance and developing strategy protocol for sustainable water management for greater ecosystem services.


Introducción: La concentración de clorofila a representa la biomasa de fitoplancton la cual influye directamente en las funciones de producción de los ecosistemas acuáticos. Por lo tanto, es imperativo comprender su cinética espacio-temporal en el ambiente lótico con respecto a las variabilidades climáticas regionales en las aguas continentales tropicales. Objetivo: Se realizaron estudios in situ para examinar la influencia de varios parámetros ambientales en la biomasa del fitoplancton en la cuenca baja del Ganges durante 2014-2016. Métodos: En primer lugar, se determinaron los parámetros ambientales más influyentes en la concentración de Chl-a fluvial. Luego, el efecto directo en cascada de las variables climáticas sobre los parámetros ambientales clave, mediante el modelado y los cambios en la concentración media de Chl-a en el tramo inferior del río. Resultados: Solo cinco parámetros ambientales, entre ellos, temperatura del agua, sólidos disueltos totales, salinidad, alcalinidad total y pH, fueron factores clave que influyeron en la Chl-a (R2 múltiple: 0.638, P < 0.05). Las estimaciones actuales indican que si la tasa actual de variabilidad climática regional durante las últimas 3 décadas (temperatura media del aire + 0.24 °C, precipitación total anual -196.3 mm) permanece constante durante las próximas tres décadas (2015-2045), se presente un aumento en el promedio de la Chl-a en +170 µgL-1 y alcance aproximadamente 475.94 µgL-1 para el 2045 o más. Conclusiones: Este estudio presenta una metodología basada en modelos alternativos en situaciones de escasez de datos, la información generada también podría contribuir a mejorar la gobernanza del agua y a desarrollar un protocolo para la gestión sostenible del agua y de esta manera mejorar los servicios ecosistémicos.


Subject(s)
Animals , Phytoplankton , Chlorophyll/analysis , Biomass , Aquatic Microorganisms , India
11.
Rev. argent. salud publica ; 13(Suplemento COVID-19): 1-8, 2021.
Article in Spanish | LILACS, ARGMSAL, BINACIS | ID: biblio-1247765

ABSTRACT

INTRODUCCIÓN: Al inicio de la pandemia, la Organización Mundial de la Salud alertó que la transmisión simultánea de dengue y la enfermedad por el nuevo coronavirus (COVID-19) en algunas regiones podría ocasionar casos de coinfección y agravamiento por la superposición de síntomas y la dificultad extra en el manejo. En julio de 2020, la Organización Panamericana de la Salud declaró el alerta epidemiológico por dengue en pandemia, y agregó, como posibles agravantes, la subnotificación, la demora en la consulta y la interrupción del control entomológico. Sin embargo, el impacto de la superposición de ambas enfermedades no está claro aún. El objetivo de este trabajo fue analizar las curvas de coinfección en distintos escenarios de coepidemia y se consideran los posibles efectos de la pandemia sobre la epidemiología del dengue. MÉTODOS: Se desarrolló un modelo matemático de coinfección, de tipo determinista, basado en modelos previos de ambas enfermedades. RESULTADOS: Para un dado brote de dengue, la fracción final de coinfectados depende del número reproductivo de la COVID-19. La curva de coinfectados depende de la superposición de las epidemias; el área de superposición permite estimar su fracción final. Una cuarentena que reduzca los casos de COVID-19 también reduciría la coinfección, y sería más efectiva cuanto más temprana. Si la cuarentena modifica la dinámica del dengue, el modelo predice el aumento y el adelantamiento de los casos, cuyo efecto sobre la curva de coinfectados depende de la dinámica de superposición. DISCUSIÓN: El modelo propuesto ofrece un primer abordaje para visibilizar la coinfección y comprender los mecanismos que podrían afectarla


Subject(s)
Coronavirus Infections , Dengue , Coinfection , Argentina
12.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1505597

ABSTRACT

Actualmente, la gestión de datos en el departamento de oncología es compleja y requiere sistemas de información avanzados para procesar datos donde la información "ómica" debe integrarse junto con los datos clínicos del paciente para mejorar el análisis de datos y el proceso de toma de decisiones. Este trabajo de investigación presenta una experiencia práctica en este contexto. Se ha diseñado un Modelo Conceptual (MC) para desarrollar un Sistema de Información (SI) con el fin de gestionar datos clínicos, patológicos y moleculares de manera integral en el departamento de oncología de dos hospitales principales en Paraguay. Además, se han propuesto arquetipos basados en modelos para especificar la estrategia de interacción del usuario. El MC y los arquetipos asociados son la base para desarrollar un SI clínico con el fin de cargar -primero- y gestionar -segundo- todos los datos clínicos que requiere el dominio, mostrando cuán factible es el enfoque en la práctica y cuánto se mejora la gestión de datos. En este trabajo, queremos reforzar con esta experiencia real, cómo el uso correcto de un MC junto con los arquetipos ayuda a diseñar, desarrollar y administrar mejores sistemas de información, enfatizando la relevancia del dominio clínico seleccionado.


Currently, data management in oncology department is complex and requires advanced Information Systems (ISs) to process data where "omic" information should be integrated together with patient's clinical data to improve data analysis and decision-making process. This research paper reports a practical experience in this context. A Conceptual Model (CM) has been designed to develop an Information System (IS) in order to manage clinical, pathological, and molecular data in a holistic way at the oncology department of two main Hospitals in Paraguay. Additionally, model-based archetypes have been proposed to specify the selected user interaction strategy. The CM and its associated archetypes are the basis to develop a clinical IS in order to load -firstly- and manage -secondly- all the clinical data that the domain requires, showing how feasible the approach is in practice, and how much the corresponding clinical data management is improved. In this work, we want to reinforce with this real experience how using a CM along with archetypes correctly helps to design, develop and manage better information systems, emphasizing the relevance of the selected clinical domain.

13.
An. Fac. Cienc. Méd. (Asunción) ; 53(1): 17-30, 20200401.
Article in English | LILACS | ID: biblio-1095632

ABSTRACT

Actualmente, la gestión de datos en el departamento de oncología es compleja y requiere sistemas de información avanzados para procesar datos donde la información "ómica" debe integrarse junto con los datos clínicos del paciente para mejorar el análisis de datos y el proceso de toma de decisiones. Este trabajo de investigación presenta una experiencia práctica en este contexto. Se ha diseñado un Modelo Conceptual (MC) para desarrollar un Sistema de Información (SI) con el fin de gestionar datos clínicos, patológicos y moleculares de manera integral en el departamento de oncología de dos hospitales principales en Paraguay. Además, se han propuesto arquetipos basados en modelos para especificar la estrategia de interacción del usuario. El MC y los arquetipos asociados son la base para desarrollar un SI clínico con el fin de cargar -primero- y gestionar -segundo- todos los datos clínicos que requiere el dominio, mostrando cuán factible es el enfoque en la práctica y cuánto se mejora la gestión de datos. En este trabajo, queremos reforzar con esta experiencia real, cómo el uso correcto de un MC junto con los arquetipos ayuda a diseñar, desarrollar y administrar mejores sistemas de información, enfatizando la relevancia del dominio clínico seleccionado.


Currently, data management in oncology department is complex and requires advanced Information Systems (ISs) to process data where "omic" information should be integrated together with patient's clinical data to improve data analysis and decision-making process. This research paper reports a practical experience in this context. A Conceptual Model (CM) has been designed to develop an Information System (IS) in order to manage clinical, pathological, and molecular data in a holistic way at the oncology department of two main Hospitals in Paraguay. Additionally, model-based archetypes have been proposed to specify the selected user interaction strategy. The CM and its associated archetypes are the basis to develop a clinical IS in order to load -firstly- and manage -secondly- all the clinical data that the domain requires, showing how feasible the approach is in practice, and how much the corresponding clinical data management is improved. In this work, we want to reinforce with this real experience how using a CM along with archetypes correctly helps to design, develop and manage better information systems, emphasizing the relevance of the selected clinical domain


Subject(s)
Electronic Health Records
14.
Rev. biol. trop ; 67(4)sept. 2019.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1507544

ABSTRACT

El tomate (Solanum lycopersicum) es una de las principales hortalizas en el mundo debido a las importantes ganancias económicas que genera su comercialización; sin embargo, a pesar de que la especie es ampliamente cultivada en el mundo, su diversidad genética se considera restringida. Esto hace que su resistencia a plagas y enfermedades en las variedades actualmente cultivadas sea baja. Existe la forma silvestre S. l. var ceraciforme que se distribuye desde Suramérica (centro de origen) hasta México (área de domesticación), específicamente en la vertiente del Golfo de México en Veracruz. Como objetivo, se quiso identificar patrones de diversificación ambiental con los que se pudiesen inferir procesos de adaptación de las poblaciones en el área de domesticación con respecto a su centro de origen. Asimismo, se planteó proponer medidas de conservación y rescate del tomate S. l. var. cerasiforme. Se realizaron modelos de nicho ecológico (MNE) con Maxent versión 3.4.1 (evaluados con AUC y ROC-parcial) para determinar la idoneidad de las condiciones ambientales, incluyendo proyecciones del centro de domesticación al área de origen y viceversa. Esto se realizó con base en ocho variables de temperatura y precipitación. Los registros de tomate fueron tomados de fuentes bibliográficas y trabajo de campo. Seguidamente, se realizó la prueba de comparación de nichos (equivalencia y similitud), propuesta por Broennimann et al. (2012), para evaluar la similitud de condiciones ambientales en ambas regiones. Posteriormente, se realizó un análisis de varianza seguido de una prueba de comparación de medias (Tukey, P ≤ 0.05) con las ocho variables ambientales utilizadas. Los valores de AUC (0.93 y 0.80) y ROC-parcial obtenidos (1.86 y 1.71; P = 0.0001) de los MNE muestran que fueron buenos modelos predictores. Se observó que en el centro de México existen condiciones ambientales similares a las del centro de origen, a diferencia de la vertiente del Golfo de México donde son diferentes. La prueba de equivalencia mostró que la comparación ambiental entre ambas regiones es menos equivalente que lo esperado por azar (P = 0.003). Mientras tanto, la otra prueba indica que la similitud que existe entre ambas regiones también se puede obtener por azar (P = 0.683). También, se encontraron diferencias significativas en tres variables de temperatura y precipitación. En conclusión, el centro de origen y de domesticación de S. l. var. cerasiforme tienen características ambientales en común a pesar de la distancia geográfica, pero existen zonas geográficas (vertiente del Golfo de México en Veracruz) en el área de domesticación con condiciones ambientales diferentes a las de su centro de origen y con un potencial importante como bancos de germoplasma.


The tomato (Solanum lycopersicum) is one of the main horticultural crops in the world because of the important economic benefits that its commercialization generates. Even though the species is widely cultivated in the world, it is susceptible to pests, diseases, and environmental stresses due to the loss of its genetic diversity. There is a wild form called S. l. var ceraciforme that is distributed from South America (its center of origin) to Mexico (its area of domestication), specifically on the slope of the Gulf of Mexico in Veracruz. Due to the large genetic diversity of these wild tomatoes, it is important to improve its crop. The objective of this investigation was to identify patterns of environmental diversification of the tomato, infer the processes of adaptation of the populations in the area of domestication with respect to their center of origin and propose measures of conservation and variation of S. l. var. cerasiforme. We generated two ecological niche models (MNE) with Maxent version 3.4.1 (evaluated with AUC and partial-ROC) to determine the suitability of environmental conditions including their respective projections from the domestication center to the area of origin and vice versa. We used eight variables of temperature and precipitation. Additionally, we included tomato records from bibliographical sources and fieldwork. We also used the niche comparison test (equivalency and similarity) proposed by Broennimann et al. (2012) to evaluate the similarity of environmental conditions in both regions. Subsequently, we carried out an analysis of variance followed by a mean comparison test (Tukey, P ≤ 0.05) with all environmental variables measured. The values of AUC (0.93 and 0.80) and partial-ROC (1.86 and 1.71, P = 0.0001) of the MNE showed that they were good predictive models. We observed that, in the center of Mexico, there are environmental conditions similar to those of the center of origin, unlike the slope of the Gulf of Mexico where they are different. The equivalency test showed that the environmental comparison between both regions is less similar than expected by chance (P = 0.003). The similarity test indicated that the existing similarity between both regions can also be obtained by chance (P = 0.683). We also found significant differences in three temperature and precipitation variables. In conclusion, we determined that the center of origin and domestication of S. l. var. cerasiforme has similar environmental characteristics despite the geographic distance; nevertheless, there are geographical zones (the Gulf of Mexico in Veracruz) in the area of domestication with different environmental conditions. Those places have the potential to contain valuable germplasms.

15.
Rev. mex. ing. bioméd ; 40(2): e201835, may.-ago. 2019. tab, graf
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1058586

ABSTRACT

Abstract Pancreatic alpha and beta cells release the main hormones involved in blood glucose regulation: glucagon and insulin, respectively. Based on the observation that metabolic oscillations are related to electrical activity and, in turn, to insulin secretion in beta cells, in the present work we use a mathematical modelling approach to explore the contribution of glycolytic oscillations to electrical activity in alpha cells. Due to lack of data about metabolism in alpha cells and taking into account that pancreatic cells comes from a common progenitor, we used a previous model of pancreatic beta cells and focus on the main differences between both cell types. The main finding contrasts with beta cells since electrical activity in alpha cells could be triggered independently of glycolic oscillations. It suggests that alpha cells are stimulated by blood glucose through a different pathway, which is in agreement with the role of alpha cells during hypoglycemia.


Resumen Las células alfa y beta de páncreas secretan las dos hormonas más importantes para la regulación de la glucosa en sangre: el glucagón y la insulina, respectivamente. Dado que en células beta se ha observado la presencia de oscilaciones metabólicas relacionadas con su actividad eléctrica y, por tanto, con la secreción de insulina, en este trabajo se presenta un estudio de la posible relación entre las oscilaciones glicolíticas y la actividad eléctrica en células alfa mediante un enfoque de modelación matemática. Debido a la falta de información sobre el metabolismo en las células alfa y tomando en cuenta que las células pancreáticas provienen de un progenitor común, se utilizó un modelo previamente propuesto de células beta y se tomaron en cuenta las principales diferencias entre ambos tipos celulares para el análisis. Nuestros resultados muestran que, a diferencia de las células beta, la actividad eléctrica en células alfa puede dispararse independientemente de la presencia de oscilaciones glicolíticas, lo cual sugiere que estas células son estimuladas por la glucosa a través de una ruta metabólica diferente a la propuesta para células beta, lo cual es congruente con su papel regulador durante periodos de baja glucosa.

16.
Rev. mex. ing. bioméd ; 40(1): e201803EE1, Jan.-Apr. 2019. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: biblio-1043135

ABSTRACT

Abstract One of the most used bacteria in the Quorum Sensing (QS) experimental works is the Vibrio harveyi, which is used as reporter bacteria to detect the Autoinducers-2 (AI-2) activity of other bacteria. Nevertheless, the description of its QS mechanism by the mathematical modeling is an approach still unexploited. For biological systems, it is necessary to consider the high variability of the experimental data, thus identifiability and parametric reliability analyses must be performed before a model could be used. The following work describes a methodology for parameter fitting and parametric identifiability analysis in a model that describes the dynamics of AI-2 in V. harveyi bacteria. Identifiability analyses showed that all parameters are identifiable, but parametric dependency analyses showed two linearly dependent parameters. According to our results, the model is adequate to describe the AI-2 dynamics in V. harveyi.


Resumen Una de las bacterias más utilizadas en los trabajos experimentales de detección de quorum (QS) es la Vibrio harveyi, que se utiliza como bacteria reportera para detectar la actividad de Autoinductores-2 (AI-2) de otras bacterias. Sin embargo, la descripción de su mecanismo de QS por medio del modelado matemático es un enfoque aún no explotado. En el caso de los sistemas biológicos, es necesario considerar la alta variabilidad de los datos experimentales, por lo que deben realizarse análisis de identificabilidad y fiabilidad paramétrica antes de que un modelo pueda ser usado. El siguiente trabajo describe una metodología para el ajuste de parámetros y el análisis de la identificabilidad paramétrica en un modelo que describe la dinámica de la AI-2 en las bacterias V. harveyi. Los análisis de identificabilidad mostraron que todos los parámetros son identificables, pero los análisis de dependencia paramétrica mostraron dos parámetros linealmente dependientes. De acuerdo con los resultados, el modelo es adecuado para describir la dinámica AI-2 en V. harveyi.

17.
Prensa méd. argent ; 105(1): 1-8, mar 2019. fig
Article in Spanish | BINACIS, LILACS | ID: biblio-1026309

ABSTRACT

La disección virtual es una herramienta educativa sumamente valiosa en anatomía. Es particularmente útil cuando hay escasez de cadáveres o en los casos en que la disección no sea posible por motivos religiosos o éticos. En este trabajo los autores presentan una reconstrucción 3D de un corazón masculino a partir de la información del proyecto Korean Visible Human, realizado en el marco de asociaciones de la cátedra de anatomía digital de la UNESCO creada recientemente en la Universidad Descartes. La segmentación manual de 1640 cortes anatómicos se logró a través del software Winsurf, produciendo un modelo vectorial 3D interactivo del corazón y la anatomía que lo rodea. Se reconstruyeron ochenta y cuatro estructuras, incluyendo el corazón y sus vasos (27 estructuras), tráquea, esófago, pulmones, cayado aórtico, vena cava inferior, riñones, sistema esquelético conformado por 58 estructuras, entre ellas: esternón, cartílagos costales, vértebras torácicas y discos intervertebrales, sacro, coxales y piel. El modelo vectorial 3D obtenido se exportó en formato PDF 3D produciendo una verdadera herramienta de disección virtual a través de la interfaz de Acrobat: las estructuras anatómicas pueden individualizarse y manipularse interactivamente como 84 objetos 3D separados. Además, se pueden agregar "etiquetas" con el nombre de cada elemento anatómico. Esta nueva mesa de disección virtual computarizada es una herramienta simple y poderosa tanto para alumnos como para docentes de anatomía. Además, resulta ser la base para futuras herramientas de simulación que contribuirán al entrenamiento de cirujanos


The virtual dissection is a remarkable learning tool in anatomy. It is particularly useful in the case of lack of cadavers or if anatomical dissection is impossible due to ethical or religious reasons. The authors present here a 3D reconstruction of the female's heart from the Visible Korean human data, made in the frame of the projects of the UNESCO chair of digital anatomy created recently at the Descartes University.The manual segmentation of 1640 anatomical slices was achieved with the Winsurf ® software producing an interactive 3D vectorial model of the heart and surrounding anatomy. Eighty four anatomical structures were reconstructed, including the heart and its vessels (27 structures), trachea, oesophagus, lungs, aortic arch, superior vena cava, azygos system, inferior vena cava, right and left kidneys, skeletal system (58) structures including: sternum, xiphoid process, clavicles, ribs, costal cartilage, thoracic vertebrae, intervertebrales discs, sacrum, hip bones, and femurs) and skin. The obtained 3D vectorial model was exported in 3D PDF format, producing a true virtual dissection tool through the Acrobat's interface: the anatomical structures can be individually and interactively manipulated as 84 separated 3D objects. 3D labels can be added with the name of each anatomical element. This new computerized virtual dissection table is a simple and powerful learning tool for students and anatomy teachers. It is also the basis of future simulation tools for surgeon's training


Subject(s)
Humans , Male , Adult , Cadaver , Anatomy, Cross-Sectional , Coronary Vessels , Dissection/education , Visible Human Projects , Simulation Training , Virtual Reality , Heart , Models, Anatomic
18.
Trends Psychol ; 27(1): 219-232, Jan.-Mar. 2019. graf
Article in English | LILACS | ID: biblio-991764

ABSTRACT

Abstract The present study investigated the justifications' effects, presented in children's stories, on the installment and maintenance of targeted behaviors: to copy, to answer and to present the exercise and competitive activities. Four children were exposed to three phases. In Phase 1, baseline, the registration of the target behaviors' events was made. Phase 2 was constituted of six steps. In each step, at the beginning, the experimenter would read a children's story with Type 5 justification that indicated the advantages of studying mathematics in the Steps 1, 2 and 5, and portuguese in the Steps 3, 4 and 6. Then, the teacher would write the exercise on the board and would request the students to copy, to answer and to present the exercise finished. Afterwards, the registration of the target behaviors' events was made for 30 minutes. In Phase 3 (Follow-up), fulfilled two months after Phase 2, it wasn't presented stories with justifications. The registration of targeted behaviors was made. In Phase 2, it occurred higher duration of activities to copy and to answer the exercise and lower duration of competitive activities. In Phase 3, occurred the opposite. It's suggested that, besides justifications, other variables contributed to maintain the observed behaviors.


Resumo O estudo investigou os efeitos de justificativas, apresentadas em histórias infantis, sobre a instalação e manutenção dos comportamentos alvos: copiar, responder e apresentar o exercício e atividades concorrentes. Quatro crianças foram expostas a três fases. Na Fase 1, linha de base, era feito o registro de eventos dos comportamentos alvos. A Fase 2 era constituída de seis passos. Em cada passo, no início, a experimentadora lia uma história infantil com justificativa do Tipo 5 que indicava as vantagens de se estudar matemática, nos Passos 1, 2 e 5, e português, nos Passos 3, 4 e 6. Depois, a professora escrevia o exercício na lousa e pedia para os alunos copiarem, responderem e apresentarem o exercício respondido. Em seguida, era feito um registro de eventos dos comportamentos alvos durante 30 min. Na Fase 3 (Follow-up), realizada dois meses após a Fase 2, não eram apresentadas histórias com justificativas. Era feito um registro de eventos dos comportamentos alvos durante 30 min. Na Fase 2, houve elevação da duração das atividades de copiar e responder o exercício e diminuição da duração das atividades concorrentes. Na Fase 3, ocorreu o inverso. Sugere-se que, além de justificativas, outras variáveis contribuíram para manter os comportamentos observados.


Resumen Se investigó los efectos de justificaciones sobre la instalación y mantenimiento de los comportamientos objetivos: copiar, responder y presentar el ejercicio y actividades concurrentes. Cuatro niños fueron expuestos a tres fases. En Fase 1, línea de base, se hacía el registro de eventos de los comportamientos objetivos. Fase 2 estaba constituida de seis pasos. En cada paso, al principio, la experimentadora leía una historia infantil con justificación del Tipo 5 que indicaba las ventajas de estudiar matemáticas en Pasos 1, 2 y 5, y portugués en los Pasos 3, 4 y 6. Después, la profesora escribía el ejercicio en la pizarra y pedía a los alumnos copiar, responder y presentar el ejercicio respondido. En seguida, se hacía el registro de eventos de los comportamientos objetivos durante 30 min. En Fase 3 (Follow-up), realizada dos meses después de la Fase 2, no se presentaban historias con justificaciones. Se hacía el registro de los comportamientos objetivos. En Fase 2, hubo elevación de la duración de las actividades de copiar y responder el ejercicio y disminución de la duración de las actividades concurrentes. En Fase 3, ocurrió lo contrario. Se sugiere que, además de justificaciones, otras variables contribuyeron a mantener los comportamientos observados.

19.
Rev. chil. fonoaudiol. (En línea) ; 17: 1-14, nov. 2018. ilus, tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-966368

ABSTRACT

El análisis de cuestionarios respondidos por alumnos de la disciplina Sistemas Sensoriales del curso de Fonoaudiología mostró que había dificultades para entender la histología de las regiones anatómicas del oído. Se estableció que la compresión de la histología demandaba una actividad didáctica complementaria. Por ello, se decidió crear una clase teórico-práctica diferenciada (CTP) usando un modelo tridimensional (3D) del oído humano y preparaciones histológicas de sus regiones. El modelo es una réplica anatómica muy aumentada del oído humano que permite la manipulación exploratoria de modo más eficaz que con piezas anatómicas clásicas. La CTP fue implementada en los dos semestres de 2014. La evaluación de la CTP incluyó un cuestionario de opiniones, más un cuaderno de actividades. Los resultados mostraron medias finales de mejores desempeños en ese año respecto al 2013, donde no fue dada este tipo de clase teórico-práctica. Se concluye que la CTP, asociada al modelo tridimensional y las explicaciones teóricas-prácticas de las preparaciones histológicas, permitió una mejor comprensión del contenido enseñado e introdujo una metodología más eficiente para el proceso de enseñanza-aprendizaje de un tema tan complejo así como importante para la formación académica de los estudiantes de Fonoaudiología. Adicionalmente, a partir de esta experiencia teórico-práctica se ha demostrado, una vez más, la importancia de la relación personal y profesional entre el profesor, preparador estudiantil y los alumnos para la calidad del trabajo académico.


We designed a differentiated theoretical-practical class (CTP) after analyzing questionnaires (Qs) answered by Speech-therapy students that attended the course "Sensory Systems". The Qs showed difficulties related with understanding the practical histology of the sensory systems, as well as problems to correlate it with the learning of the anatomy. We therefore established the to implement an auxiliary didactic activity (CTP). We used a three-dimensional model (3D) AS-001, of the University Extension Project (3D Museum). AS-001, is an enlarged anatomical replica of the human ear which is much more efficient for exploratory manipulation much than anatomical modeling. The assessment of CTP included a questionnaire and a notebook of activities. The CTP was implemented in both semesters during the year 2014. Results showed improvements when compared to 2013's data, when this type of theoretical-practical contents were not implemented. We conclude that the association of the three -dimensional model along with histological analysis of the parts of the ear effectively improved students' understanding of the subject. We therefore consider that CTP is a suitable methodology for the teaching-learning process of a complex, important subject for the academic training of Speech-therapy undergraduate students. Our experience allowed us to determine how important the personal and professional relationship between teachers and students is to improve academic work.


Subject(s)
Humans , Imaging, Three-Dimensional/methods , Ear/anatomy & histology , Speech, Language and Hearing Sciences/education , Histology/education , Models, Anatomic , Data Interpretation, Statistical , Surveys and Questionnaires , Educational Measurement
20.
Rev. adm. pública (Online) ; 52(1): 149-168, jan.-fev. 2018. tab, graf
Article in Portuguese | LILACS | ID: biblio-897269

ABSTRACT

Resumo O artigo apresenta a análise espacial da sustentabilidade nos municípios cearenses a partir da construção de um índice de desenvolvimento sustentável, embasado em dimensões social, ambiental, econômica e institucional. Os índices de sustentabilidade forçam instituições e governos a questionarem seus padrões e atuam como "forças motrizes" para a elaboração de políticas públicas. A validade dos índices de sustentabilidade depende da definição do conjunto de indicadores e das técnicas adotadas para definição dos ponderadores e agregação dos indicadores. A pesquisa é de natureza quantitativa, desenvolvida por meio de dados secundários, e adotou análise fatorial confirmatória para a construção do índice de desenvolvimento sustentável (IDS) e modelagem econométrica espacial para representação das desigualdades no mapa dos municípios cearenses. Os resultados da pesquisa revelam um ajuste regular do índice de desenvolvimento sustentável. O IDS permite uma visualização geográfica e identificação de associação espacial dos indicadores de desenvolvimento sustentável, e apresenta-se como uma ferramenta de suporte à definição de políticas públicas. A pesquisa revelou que áreas mais urbanas do estado do Ceará apresentam um melhor índice de desenvolvimento sustentável, e confirmou a fragilidade das políticas públicas em promover o equilíbrio regional.


Resumen El artículo presenta el análisis espacial de la sostenibilidad en los municipios cearenses a partir de la construcción de un índice de desarrollo sostenible, basado en dimensiones social, ambiental, económica e institucional. Los índices de sostenibilidad obligan a instituciones y gobiernos a cuestionar sus patrones y actúan como "fuerzas motrices" para la elaboración de políticas públicas. La validez de los índices de sostenibilidad depende de la definición del conjunto de indicadores y de las técnicas adoptadas para definir los ponderadores y la agregación de los indicadores. La investigación es de naturaleza cuantitativa, desarrollada por medio de datos secundarios, y adoptó análisis factorial confirmatorio para la construcción del índice de desarrollo sostenible (IDS) y modelado econométrico espacial para representación de las desigualdades en el mapa de los municipios cearenses. Los resultados de la investigación revelan un ajuste regular del índice de desarrollo sostenible. El IDS permite una visualización geográfica e identificación de asociación espacial de los indicadores de desarrollo sostenible, y se presenta como una herramienta de apoyo a la definición de políticas públicas. La investigación reveló que áreas más urbanas del estado de Ceará presentan un mejor índice de desarrollo sostenible, y confirmó la fragilidad de las políticas públicas en promover el equilibrio regional


Abstract The paper builds a sustainable development index based on environmental, social, economic and institutional dimensions and presents a spatial assessment of municipalitties inequalities in the State of Ceará. Sustainability indices force institutions and governments to question their standards and act as "driving forces" for public policy-making. The validity of sustainability indexes is heavily dependent on how their components are weighted and aggregated. The research is quantitative developed through secondary data acquired in public agency databases of the country (Brazil) and federal unit (State of Ceara). Data analysis included confirmatory factor analysis for the construction of general sustainability indexes, descriptive analysis of these indices and spatial econometric modeling to represent on the map of Ceará municipalities. The survey results reveal a regular adjustment of the sustainable development index. The model allows a geographical view of sustainable development indicators and presents with a tool in the definition of public policies for social equity, environmental and economic. The analysis of social, economic, environmental, institutional and general indices revealed that the most urban areas of the State of Ceará have a greater sustainable development and confirms the fragility of public policies in promoting regional balance.


Subject(s)
Models, Econometric , Municipal Management , State , Sustainable Development Indicators , Spatial Analysis , Sustainable Development , Factor Analysis, Statistical
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