ABSTRACT
O HIV-1 geralmente utiliza o receptor CD4 em conjunto com um correceptor principal, CCR5 ou CXCR4, na etapa fundamental de entrada na célula hospedeira, determinando assim o tropismo viral por células que expressam estas moléculas. Diferenças no tropismo de HIV-1 têm contribuído para a compreensão da patogênese do HIV e são necessárias para suportar a decisão médica em relação ao uso de antagonistas do CCR5. O teste fenotípico de tropismo determina diretamente esta característica biológica, porém os custos e a complexidade restringem a sua utilização, sendo assim, a predição genotípica tem sido proposta como uma alternativa. O objetivo desse estudo foi padronizar e avaliar um teste de predição genotípica do tropismo. Foi adaptado para o nosso laboratório o protocolo desenvolvido pelo Centro de Excelência em HIV/Aids da Columbia Britânica (CECB)usando sequência em replicatas, avaliamos os parâmetros que possam influenciar na predição do tropismo e comparamos a predição na célula e no plasma. Produtos de PCR e plasma enviados pelo CECB foram sequenciados e analisados de forma independente no CECB e no IAL, com alta concordância. Sequências da V3 do envelope viral de 81 pacientes com consentimento informado mostraram uma correlação entre o número de ambiguidades e o menor valor de FPR, uma tendência a ter uma maior distância genética inter-sequência entre os isolados preditos como X4 e sem correlação entre o número de repetições de sequências e o menor FPR. Estudamos também diferenças na origem do material genético viral (RNA viral ou DNA pró-viral) e sua influência sobre a predição de tropismo. Em 56 amostras pareadas observou-se uma tendência na ocorrência de mais X4 em DNA pró-viral de células. Nós observamos maior distância genética entre as sequências de célula em comparação com as de plasma, e documentamos as discrepâncias na determinação do tropismo viral utilizando diferentes cut offs de uso clínico. Nosso trabalho permitiu o desenvolvimento...
Subject(s)
Humans , Male , Female , HIV-1 , Blood Cells , Acquired Immunodeficiency Syndrome , Viral TropismABSTRACT
OBJETIVO: Establecer la frecuencia y la relación del alelo CCR5-Δ32 con la infección y la progresión clínica de pacientes VIH+ y en individuos expuestos seronegativos. MATERIAL Y MÉTODOS: Se analizaron 355 muestras, 62 VIH+, 51 individuos expuestos seronegativos y 242 de la población general. Los VIH+ se subdividieron en: a) progresores normales n= 49; b) progresores lentos n= 10, y c) no progresores n= 3. RESULTADOS: Se identificó el genotipo wt/Δ32 en 17.7 por ciento de los VIH+, 13.7 por ciento de los individuos expuestos seronegativos y 6.2 por ciento en la población general. El genotipo Δ32/Δ32 se encontró en 3.9 por ciento de los individuos expuestos seronegativos. Según la progresión clínica de los VIH+, se identificó el genotipo wt/Δ32 en 10.2 por ciento de los progresores normales, 30 por ciento de los progresores lentos y en 100 por ciento de los no progresores. CONCLUSIÓN: El genotipo wt/Δ32 se observó en todos los no progresores, lo que apoya su papel en esta forma de progresión clínica en este grupo.
OBJECTIVE: CCR5-Δ32 allele frequency needs to be identified in HIV+ patients and exposed seronegative individuals in Yucatan, Mexico, to understand this mutation's relationship to infection and disease progression. MATERIAL AND METHODS: A total of 355 samples were analyzed: 62 from HIV+ patients, 51 from exposed seronegative individuals and 242 from general population. Infected patients were subdivided into a) normal progressors n= 49; b) slow progressors n= 10, and c) non-progressors n= 3. RESULTS: Genotype wt/Δ32 was identified in 17.7 percent of HIV+, 13.7 percent of exposed seronegative individuals and 6.2 percent of general population. Genotype Δ32/Δ32 was identified in 3.9 percent of exposed seronegative individuals. In infected patients, wt/Δ32 was identified in 10.2 percent of normal progressors, 30 percent of slow progressors and 100 percent of non-progressors. CONCLUSION: Genotype wt/Δ32 was observed in all non-progressing HIV+ patients, supporting its role in this group's disease development and clinical evolution.