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1.
Chinese Journal of Clinical Infectious Diseases ; (6): 272-277, 2023.
Article in Chinese | WPRIM | ID: wpr-993739

ABSTRACT

Objective:To analyze the risk factors of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae (CRKP) infection in intensive care unit (ICU) patients and to construct a prediction model for infection. Methods:The clinical data of 204 patients with Klebsiella pneumoniae infection admitted in ICU of Jining First Hospital during January 2020 to December 2022 were retrospectively analyzed. Patients admitted during January 2020 to December 2021 were selected as model set ( n=150), and patients admitted during January to December 2022 were selected as validation set ( n=54). In model set, there were 59 cases infected with CRKP (CRKP group) and 91 cases infected with carbapenem-sensitive Klebsiella pneumonia (CSKP group). The risk factor of CRKP infection in ICU patients were analyzed with multivariate Logistic regression, based on which an infection prediction model was constructed. The predictive value of the model was evaluated by ROC, and verified in the validation group. Results:Multivariate Logistic regression analysis showed that empirical use of beta-lactam antibiotics( OR=6.985, 95 % CI 1.658-29.423, P=0.008), central vein catheterization( OR=7.486, 95 % CI 2.776-20.186, P<0.001)and tracheal intubation/incision( OR=10.695, 95 % CI 2.701-42.351, P=0.001)were risk factors for CRKP infection in ICU patients. The regression equation for predicting the risk of infection was -4.851+ empirical use of beta-lactam antibiotics×1.944+ central vein catheterization×2.013+ tracheal intubation/incision×2.370. The area under the ROC curve (AUC) of the model for predicting infection in the model group was 0.905, with sensitivity and specificity of 79.7% and 90.1%, respectively. The AUC of the model for predicting infection in validation group was 0.881, with sensitivity and specificity of 84.2% and 85.7%, respectively. Conclusion:The constructed infection prediction model in the study can effectively predict CRKP infection in ICU patients.

2.
Rev. med. vet. zoot ; 69(3): 245-258, sep.-dic. 2022.
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1424219

ABSTRACT

ABSTRACT Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae are the most common pathogens causing urinary tract infections in humans and animals. Close contact between humans and companion animals can facilitate the spread of multidrug resistant pathogens between both species. The objective of the research was to characterize extended-spectrum ß-lactamases (ESBL) -producing E. coli and K. pneumoniae isolated from dogs with urinary tract infections in the metropolitan area of Valle del Aburrá (Antioquia, Colombia). Three-hundred seventy-one urine samples collected from March 2018 to March 2019 in a veterinary clinical laboratory were analyzed. E. coli and K. pneumoniae isolates were detected in chromogenic agar and identified by biochemical tests. Susceptibility testing was performed by disc diffusion and ESBL production was evaluated by the double disk test in all isolates. MIC determination of ESBL-positive isolates were performed on the automated VITEK®2 system. Multiple PCR was used for the detection of CTX-M beta-lactamases (group 1, 2, 9 and 8/25), SHV, TEM, and AmpC of plasmid origin in ESBL-positive isolates. In total 22 out 371 isolates were positive for ESBL production by double disc test, 11 E. coli (ESBL-Ec) and 11 K. pneumoniae (ESBL-Kp). The multiple PCR detected CTX-M group 1 in the 22 ESBL-positive isolates. Multi-drug resistance was observed in all ESBL-producing isolates. In conclusion, a high frequency of antibiotic multi-resistance was found in ESBL-Ec and ESBL-Kp. The main ESBL detected was CTX-M group 1, which also prevails in human isolates.


RESUMEN Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae son los patógenos más comunes causantes de infecciones en tracto urinario en humanos y animales. El contacto estrecho con los animales de compañía puede favorecer la diseminación de patógenos multiresistentes entre ambas especies. El objetivo de la investigación fue caracterizar E. coli (Ec -BLEE) y K. pneumo-niae (Kp -BLEE) productores de betalactamasas de espectro extendido provenientes de aislados de caninos con infecciones del tracto urinario del Área Metropolitana del Valle de Aburrá. 371 muestras de orina de caninos colectadas entre marzo de 2018 y marzo 2019 en un laboratorio clínico veterinario fueron analizadas. E. coli y K. pneumoniae se detectaron en agar cromogénico y se identificaron mediante pruebas bioquímicas. La prueba de susceptibilidad se realizó por difusión en disco y la producción de BLEE se evaluó por test de doble disco en todos los aislados. La determinación de la CIM en aislados positivos a BLEE se realizó en el sistema automatizado VITEK®2. Se utilizó PCR múltiple para la detección de betalactamasas tipo CTX-M (grupo 1, 2, 9 y 8/25), SHV, TEM y AmpC de origen plasmídico en aislados positivos a BLEE. Un total de 22 de 371 aislados fueron positivos a BLEE por test de doble disco, 11 E. coli (Ec -BLEE) y 11 K. pneumoniae (Kp-BLEE). La PCR detectó CTX-M grupo 1 en los 22 aislados positivos a BLEE. Se observó multirresistencia en todos los aislamientos productores de BLEE. En conclusión, se encontró una alta frecuencia de multirresistencia en Ec-BLEE y Kp-BLEE. La principal BLEE detectada fue CTX-M grupo 1, que también predomina en aislados humanos.

3.
Biomédica (Bogotá) ; 42(3): 470-478, jul.-set. 2022. tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1403599

ABSTRACT

Introducción. Las infecciones asociadas con la atención en salud constituyen un problema de salud pública porque aumentan la morbimortalidad de los pacientes, sobre todo de aquellos con factores de riesgo, como la inmunosupresión debida a enfermedades oncológicas. Es importante conocer la diversidad genética de los principales microorganimos causantes de infecciones hospitalarias mediante la vigilancia epidemiológica tradicional y la epidemiología molecular, para hacer un mejor seguimiento y detectar brotes tempranamente. Objetivo. Determinar el grupo filogenético y la resistencia a antibióticos de las cepas de Escherichia coli aisladas de pacientes con cáncer hospitalizados. Materiales y métodos. Se hizo un estudio de tipo transversal que incluyó 67 cepas de Escherichia coli productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE). Se determinó el grupo filogenético, el perfil de resistencia a los antibióticos, los genes de resistencia a betalactámicos, el tipo de las muestras y los servicios de hospitalización de donde fueron recuperadas. Resultados. El grupo filogenético más frecuente fue el B2 (36 %). El 57 % de las cepas B2 fueron aisladas de muestras de orina y el 33 % provenía del servicio de urología. La resistencia a ciprofloxacino y gentamicina fue de 91 y 53 %, respectivamente, y el 79 % de las cepas tenía el gen blaCTX-M. Se encontró una relación significativa (p<0,05) entre los grupos filogenéticos y la resistencia a ciprofloxacina, así como a la edad del paciente. Conclusión. El filogrupo de E. coli predominante fue el B2. Se evidenció una gran resistencia a ciprofloxacina y gentamicina, una proporción elevada de cepas BLEE con el blaCTX-M, y una relación entre el grupo filogenético y la resistencia a ciprofloxacino.


Introduction: Healthcare-associated infections are a public health problem due to the increased morbimortality of patients, especially those with risk factors such as immunosuppression due to oncological diseases. It is essential to determine the genetic diversity of the main microorganisms causing healthcare infections by combining traditional epidemiological surveillance and molecular epidemiology for better outbreak follow-up and early detection. Objective: To determine the phylogenetic group and antibiotic resistance of Escherichia coliisolated from hospitalized oncologic patients. Materials and methods: We conducted a cross-sectional study of 67 strains of ESBL-producing Escherichia coli to determine their phylogenetic group and described their antibiotic resistance profile, beta-lactam resistance genes, as well as the type of sample and the hospitalization areas from which they were recovered. Results: The most frequent phylogenetic group was B2 (36%); 57% of B2 strains were isolated from urine and 33% came from the urology department. Resistance to ciprofloxacin and gentamicin was 92% and 53%, respectively, and 79% of the strains had the blaCTX-Mgene. A significant association (p<0.05) was found between the phylogenetic groups, ciprofloxacin resistance, and the age of the patients. Conclusion: The predominant E. coli phylogroup was B2. We evidenced high resistance to ciprofloxacin and gentamicin, a high proportion of ESBL strains with the blaCTX-M gene, and a significant association between the phylogenetic group and the resistance to ciprofloxacin.


Subject(s)
beta-Lactam Resistance , Escherichia coli , Phylogeny , Gentamicins , Ciprofloxacin
4.
Rev. peru. med. exp. salud publica ; 39(1): 98-103, ene.-mar. 2022. tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1389934

ABSTRACT

RESUMEN Los asilos de ancianos son instituciones con una alta prevalencia de infecciones del tracto urinario ocasionado por Escherichia coli productoras de ß-lactamasas de espectro extendido (BLEE), con diversos factores de virulencia. El objetivo del estudio fue determinar la frecuencia del gen bla CTX-M y de ocho genes de virulencia en 35 E. coli uropatógenas productoras de BLEE provenientes de seis asilos en Perú, durante el 2018. El 57,1% (20/35) de las E. coli fueron portadores del gen bla CTX-M. Además, se obtuvo una frecuencia del 46% (15/35) y 37% (13/35) de hly-alfa y cnf-1, respectivamente; elevada presencia de los genes iucC (63%, 22/35), aer (94%, 33/35) y chuA (94%, 33/34) y una frecuencia del 46% (16/35) y del 91% (32/34) de los genes pap GII y nanA, respectivamente. Existe predominancia en la distribución del gen bla CTX-M, además de una alta frecuencia de exotoxinas que le confieren una ventaja competitiva para diseminarse hacia el torrente sanguíneo.


ABSTRACT Nursing homes are institutions with high prevalence of urinary tract infections caused by ESBL-producing E. coli with several virulence factors. The aim of this study was to determine the frequency of the bla CTX-M gene and eight virulence genes in 35 ESBL-producing uropathogenic E. coli from six nursing homes in Peru during 2018. Of the E. coli samples, 57.1% (20/35) were carriers of the bla CTX-M gene. Furthermore, we obtained frequencies of 46% (15/35) and 37% (13/35) for hly-alpha and cnf-1, respectively; we also found high presence of the iucC (63%, 22/35), aer (94%, 33/35) and chuA genes (94%, 33/34) as well as a frequency of 46% (16/35) and 91% (32/34) for the pap GII and nanA genes, respectively. The bla CTX-M gene is predominant and a high frequency of exotoxins gives it a competitive advantage for spreading into the bloodstream.


Subject(s)
Humans , Male , Female , Aged , Aged, 80 and over , Virulence , Escherichia coli , Uropathogenic Escherichia coli , Anti-Bacterial Agents , Urinary Tract Infections , beta-Lactam Resistance , Virulence Factors , Enterobacteriaceae Infections , Homes for the Aged , Infections
5.
Vive (El Alto) ; 4(12)dic. 2021.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1390543

ABSTRACT

Resumen La bacteria Klebsiella pneumoniae es la causante de infecciones intrahospitalarias multirresistentes, posee diversos mecanismos de resistencia como la producción de enzimas betalactamasas cuya acción afecta a los antibióticos betalactámicos. Objetivo: Caracterizar los mecanismos de resistencia presentes en aislados clínicos con Klebsiella pneumoniae identificados mediante métodos fenotípicos en el Hospital Monte Sinai desde enero de 2018 hasta agosto de 2020. Materiales y métodos: Estudio positivista con un enfoque cuantitativo de corte transversal descriptivo de diseño documental. La población estuvo conformada por 274 datos de aislados clínicos identificados con Klebsiella pneumoniae. Los cuales conformaron la totalidad de la muestra con un muestreo por cobertura total. Mismos que fueron recopilados de fuentes secundarias ingresados en la base de datos del departamento de Microbiología. Para el análisis se utilizó estadística descriptiva. Resultados: Klebsiella pneumoniae mostró mayor frecuencia en el año 2020 con el 35%. Se identificó al mecanismo de resistencia BLEE con el 27,7% y carbapenemasas tipo KPC con el 7.7 %, con mayor presencia en el sexo masculino. Presentó una mayor resistencia a Penicilinas, una sensibilidad moderada a Cefalosporinas, Aminoglucósidos, Quinolonas y una alta sensibilidad a los Carbapenémicos, Tigeciclina y Colistina. Los aislados se clasificaron como multidrogorresistentes, con mayor frecuencia en Urocultivo, Aspirado bronquial, Líquido corporal, Punta de Catéter y Hemocultivo en áreas de Hospitalización, UCI y Neonatología. Conclusiones: Los mecanismos de resistencia de K. pneumoniae a los antibióticos son un hallazgo común en ambientes hospitalarios independientemente de sexo, servicio hospitalario o tipo de muestra, convirtiéndose en un problema de salud pública.


Abstract The bacterium Klebsiella pneumoniae is the cause of multiresistant intrahospital infections, it has various resistance mechanisms such as the production of beta-lactamase enzymes whose action affects beta-lactam antibiotics. Objective: To characterize the resistance mechanisms present in clinical isolates with Klebsiella pneumoniae identified by phenotypic methods at Monte Sinai Hospital from January 2018 to August 2020. Materials and methods: Positivist study with a descriptive cross-sectional quantitative approach to documentary design. The population consisted of 274 data from clinical isolates identified with Klebsiella pneumoniae. Which made up the entire sample with a total coverage sampling. The same ones that were collected from secondary sources entered in the database of the Microbiology department. Descriptive statistics were used for the analysis. Results: Klebsiella pneumoniae showed a higher frequency in 2020 with 35%. The ESBL resistance mechanism was identified with 27.7% and KPC-type carbapenemases with 7.7%, with a higher presence in males. It presented a greater resistance to Penicillins, a moderate sensitivity to Cephalosporins, Aminoglycosides, Quinolones and a high sensitivity to Carbapenems, Tigecycline and Colistin. The isolates were classified as multidrug resistant, more frequently in Urine culture, Bronchial aspirate, Body fluid, Catheter Tip and Blood culture in Hospitalization, ICU and Neonatology areas. Conclusions: The resistance mechanisms of K. pneumoniae to antibiotics are a common finding in hospital settings regardless of sex, hospital service or type of sample, becoming a public health problem.


Resumo A bactéria Klebsiella pneumoniae é causa de infecções intra-hospitalares multirresistentes, possui diversos mecanismos de resistência como a produção de enzimas beta-lactamase cuja ação afeta os antibióticos beta-lactâmicos. Objetivo: Caracterizar os mecanismos de resistência presentes em isolados clínicos de Klebsiella pneumoniae identificados por métodos fenotípicos no Hospital Monte Sinai de janeiro de 2018 a agosto de 2020. Materiais e métodos: Estudo positivista com abordagem quantitativa transversal descritiva do design documental. A população consistia em 274 dados de isolados clínicos identificados com Klebsiella pneumoniae. O que constituiu toda a amostra com uma amostra de cobertura total. Os mesmos que foram coletados em fontes secundárias e cadastrados no banco de dados do departamento de Microbiologia. Estatísticas descritivas foram utilizadas para a análise. Resultados: Klebsiella pneumoniae apresentou maior frequência em 2020 com 35%. O mecanismo de resistência a ESBL foi identificado com 27,7% e carbapenemases do tipo KPC com 7,7%, com maior presença no sexo masculino. Apresentou maior resistência às Penicilinas, sensibilidade moderada às Cefalosporinas, Aminoglicosídeos, Quinolonas e alta sensibilidade aos Carbapenêmicos, Tigeciclina e Colistina. Os isolados foram classificados como multirresistentes, com maior frequência em Urocultura, Aspirado Brônquico, Fluido Corporal, Ponta de Cateter e Hemocultura em Hospitalização, UTI e Neonatologia. Conclusões: Os mecanismos de resistência de K. pneumoniae aos antibióticos são um achado comum em ambientes hospitalares independentemente do sexo, serviço hospitalar ou tipo de amostra, tornando-se um problema de saúde pública.

6.
Biomédica (Bogotá) ; 41(supl.2): 180-187, oct. 2021. tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1355769

ABSTRACT

Resumen | Introducción. La aparición de enterobacterias multirresistentes y productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) en pacientes de consulta externa con infecciones urinarias, representa un problema de salud pública en Perú. Objetivos. Caracterizar molecularmente enterobacterias multirresistentes aisladas de pacientes con diagnóstico de infección urinaria y procedentes de dos departamentos de la selva peruana. Materiales y métodos. Se hizo un estudio descriptivo, observacional y retrospectivo de 61 aislamientos de urocultivo procedentes de la selva peruana durante 2017 y 2018. Los perfiles de resistencia se identificaron utilizando el sistema automatizado MicroScan™ y para la detección de los genes blaTEM, blaCTX-M, blaSHV se empleó una reacción en cadena de la polimerasa (PCR) convencional. Resultados. Las enterobacterias positivas para BLEE más frecuentes por departamento fueron Escherichia coli en Madre de Dios (25 %, 10/40) y Ucayali (76,2 %, 16/21). En ambos departamentos, el gen blaCTX-Mfue el más frecuente (25/61; 41 %), seguido por blaTEM(15/61; 24,6 %) y blaSHV (10/61; 16,4 %). En el perfil de sensibilidad antimicrobiana, se detectó 72,6 % de resistencia contra ampicilina, 82,3 % contra cefalotina y 88,7 % contra nitrofurantoína. Conclusiones. El porcentaje de cepas de enterobacterias multirresistentes productoras de BLEE en ambos departamentos fue del 57,4 % y el gen bla CTX-M fue el más frecuente.


Abstract | Introduction. The emergence of multiresistant enterobacteria producing extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) in outpatients with urinary tract infections represents a public health problem in Perú. Objectives. To characterize multiresistant enterobacteria isolated from patients diagnosed with urinary tract infection in two Peruvian jungle departments using molecular techniques. Materials and methods. We conducted a descriptive, observational, and retrospective study of 61 urine culture isolates from two departments in the Peruvian jungle during 2017-2018. Resistance profiles were identified using the MicroScan™ automated system and a conventional polymerase chain reaction (PCR) was used for the detection of blaCTX-M, blaTEMand blaSHV genes. Results. The most common positive ESBL enterobacteria for each department were Escherichia coli in Madre de Dios (10/40; 25%) and Ucayali (16/21; 76.2%). Gene blaCTX-Mwas the most prevalent in both departments (25/61; 41%), followed by blaTEM (15/61; 24.6%), and blaSHV (10/61; 16.4%). As for the antimicrobial susceptibility profile, we detected resistance levels of 72.6% for ampicillin, 82.3% for cephalothin, and 88.7% for nitrofurantoin. Conclusions. BLEE-producing multi-resistant enterobacteria strains in both departments were 57.4% and blaCTX-M was the most common gene.


Subject(s)
Drug Resistance, Microbial , Enterobacteriaceae , beta-Lactam Resistance , Genes
7.
Med. infant ; 28(1): 38-42, Marzo 2021. Tab
Article in Spanish | LILACS, UNISALUD, BINACIS | ID: biblio-1283476

ABSTRACT

Últimamente, se están detectando mutaciones en las proteínas ligadoras de penicilina (PBP) de los estreptococos beta-hemolíticos que corresponden a sitios que en Streptococcus pneumoniae han determinado sensibilidad disminuida a los antibióticos beta-lactámicos. Primero, se describieron cepas con sensibilidad intermedia a penicilina en Streptococcus agalactiae (estreptococos del grupo B), luego en Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis (mayormente grupos C y G) y, más recientemente, cepas con sensibilidad disminuida a aminopenicilinas y cefalosporinas de tercera generación en Streptococcus pyogenes (grupo A). El costo biológico de estas modificaciones nos permite pensar que los niveles de resistencia no han de ser tan elevados como para comprometer por ahora la efectividad clínica de los beta-lactámicos (AU)


Recently, mutations in penicillin-binding proteins (PBPs) of beta-hemolytic streptococci have been detected corresponding to sites that in Streptococcus pneumoniae have been determined to have decreased sensitivity to beta-lactam antibiotics. First, strains with intermediate sensitivity to penicillin were described in Streptococcus agalactiae (group B streptococci), subsequently in Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis (mainly groups C and G) and, more recently, strains with decreased sensitivity to third-generation aminopenicillins and cephalosporins were found in Streptococcus pyogenes (group A). The biological cost of these modifications suggests that, for now, resistance levels are not high enough to compromise the clinical effectiveness of beta-lactams (AU)


Subject(s)
Streptococcus agalactiae/drug effects , Streptococcus pyogenes/drug effects , Penicillin Resistance , Microbial Sensitivity Tests , beta-Lactam Resistance , beta-Lactams/pharmacology , Anti-Bacterial Agents/pharmacology
8.
Rev. peru. med. exp. salud publica ; 38(1): 119-123, ene-mar 2021. tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1280556

ABSTRACT

RESUMEN Se caracterizó la resistencia antimicrobiana de 70 aislados de Escherichia coli obtenidos de pacientes con infección del tracto urinario (ITU) provenientes de ocho hospitales públicos en el Perú. Los perfiles de resistencia fueron identificados mediante el uso del sistema automatizado MicroScan®. Se utilizó una reacción en cadena de la polimerasa convencional para la detección de los genes bla TEM, bla CTX-M, bla SHV y bla PER. El 65,7% (46/70) de los aislados presentó un fenotipo multidrogorresistente y el 55,7% (39/70) fue identificado como productores de betalactamasas de espectro extendido. Se detectaron altos niveles de resistencia para ampicilina (77,1%), ciprofloxacina (74,3%), trimetoprim/sulfametoxazol (62,9%), cefepime (57,1%) y cefuroxima (57,1%). El gen bla TEM fue el más frecuente con un 31,4%, seguido por bla CTX-M (18,6%) y bla SHV (2,9%). Los resultados evidencian altos niveles de resistencia a antimicrobianos de importancia clínica en aislados de E. coli de pacientes con ITU en el Perú.


ABSTRACT We characterized the antimicrobial resistance of 70 Escherichia coli isolates obtained from patients with a urinary tract infection (UTI) from 8 public hospitals in Peru. Resistance profiles were identified using the automated MicroScan® system. A standard polymerase chain reaction was used for the detection of the bla TEM, bla CTX-M, bla SHV and bla PER genes. The 65.7% (46/70) of the isolates presented a multidrug-resistant phenotype and 55.7% (39/70) were extended-spectrum beta-lactamases producers. High levels of resistance were detected for ampicillin (77,1%), ciprofloxacin (74,3%), trimethoprim/sulfamethoxazole (62,9%), cefepime (57,1%), and cefuroxime (57,1%). The bla TEM gene was the most frequent (31,4%), followed by bla CTX-M (18,6%) and bla SHV (2,9%) genes. These results show high resistance levels to antimicrobials of clinical use in E. coli isolates from hospital UTI patients in Peru.


Subject(s)
Humans , Male , Peru , Urinary Tract Infections , Polymerase Chain Reaction , Drug Resistance, Bacterial , Escherichia coli , Hospitals, Public , Patients , Urologic Diseases , beta-Lactam Resistance , Uropathogenic Escherichia coli
9.
Rev. peru. med. exp. salud publica ; 38(1): 119-123, ene-mar 2021. tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1280574

ABSTRACT

RESUMEN Se caracterizó la resistencia antimicrobiana de 70 aislados de Escherichia coli obtenidos de pacientes con infección del tracto urinario (ITU) provenientes de ocho hospitales públicos en el Perú. Los perfiles de resistencia fueron identificados mediante el uso del sistema automatizado MicroScan®. Se utilizó una reacción en cadena de la polimerasa convencional para la detección de los genes bla TEM, bla CTX-M, bla SHV y bla PER. El 65,7% (46/70) de los aislados presentó un fenotipo multidrogorresistente y el 55,7% (39/70) fue identificado como productores de betalactamasas de espectro extendido. Se detectaron altos niveles de resistencia para ampicilina (77,1%), ciprofloxacina (74,3%), trimetoprim/sulfametoxazol (62,9%), cefepime (57,1%) y cefuroxima (57,1%). El gen bla TEM fue el más frecuente con un 31,4%, seguido por bla CTX-M (18,6%) y bla SHV (2,9%). Los resultados evidencian altos niveles de resistencia a antimicrobianos de importancia clínica en aislados de E. coli de pacientes con ITU en el Perú.


ABSTRACT We characterized the antimicrobial resistance of 70 Escherichia coli isolates obtained from patients with a urinary tract infection (UTI) from 8 public hospitals in Peru. Resistance profiles were identified using the automated MicroScan® system. A standard polymerase chain reaction was used for the detection of the bla TEM, bla CTX-M, bla SHV and bla PER genes. The 65.7% (46/70) of the isolates presented a multidrug-resistant phenotype and 55.7% (39/70) were extended-spectrum beta-lactamases producers. High levels of resistance were detected for ampicillin (77,1%), ciprofloxacin (74,3%), trimethoprim/sulfamethoxazole (62,9%), cefepime (57,1%), and cefuroxime (57,1%). The bla TEM gene was the most frequent (31,4%), followed by bla CTX-M (18,6%) and bla SHV (2,9%) genes. These results show high resistance levels to antimicrobials of clinical use in E. coli isolates from hospital UTI patients in Peru.


Subject(s)
Humans , Male , Female , beta-Lactam Resistance , Escherichia coli , Hospitals, Public , Infections , Patients , Peru , Urinary Tract Infections , Urologic Diseases , beta-Lactamases , Drug Resistance, Bacterial
10.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1408496

ABSTRACT

RESUMEN Introducción: En microorganismos gramnegativos la producción de enzimas betalactamasas es el mecanismo más común de resistencia. Las de espectro extendido constituyen un grupo importante por su capacidad de inactivar las cefalosporinas de tercera y cuarta generación y el aztreonam. Su detección es vital para indicar el tratamiento óptimo y las medidas de aislamiento que eviten la dispersión de los microorganismos que las portan. Objetivos: Determinar la incidencia y principales características de los aislados de Escherichiacoli y Klebsiellapneumoniae productores de betalactamasas de espectro extendido en muestras no urogenitales. Métodos: Estudio transversal realizado en el hospital "Salvador Allende" durante el año 2017. Se determinó la frecuencia de Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae productoras de betalactamasas de espectro extendido, su procedencia según servicio del hospital, tipo de muestra clínica, y su sensibilidad antimicrobiana. La identificación de betalactamasas de espectro extendido se hizo por el método de doble disco de Jarlier. Resultados: Fueron productores de betalactamasas de espectro extendido 46 y 50 % de aislados de Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae, respectivamente. La mayoría provenían de muestras de las salas del Instituto de Angiología, el antimicrobiano con mayor efectividad fue el meropenem, la sensibilidad al resto de los antimicrobianos estuvo por debajo de 80 % y no hubo aislados sensibles a las cefalosporinas de tercera generación. Conclusiones: Se demuestra una alta incidencia de aislados de Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae productores de betalactamasas de espectro extendido en el Hospital "Salvador Allende" de La Habana, más marcada en las salas del Instituto de Angiología y en muestras de piel.


ABSTRACT Introduction: Beta-lactamase production is the most common resistance mechanism in gram-negative microorganisms. Extended-spectrum beta-lactamases are an important group of enzymes capable of inactivating third- and fourth-generation cephalosporins and aztreonam. Their detection is important to indicate the optimum treatment as well as isolation measures aimed at preventing the spread of carrier microorganisms. Objectives: Determine the incidence and main characteristics of isolates of extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae from non-urogenital samples. Methods: A cross-sectional study was conducted at Salvador Allende hospital during the year 2017. Determination was made of the frequency of extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae, their origin by hospital service, the type of clinical sample and their antimicrobial sensitivity. Identification of extended-spectrum beta-lactamases was based on the Jarlier double disc method. Results: Of the total Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolates studied, 46% and 50%, respectively, were extended-spectrum beta-lactamase producers. Most had been obtained from samples taken in wards of the Institute of Angiology; the most effective antimicrobial was meropenem; sensitivity to the remaining antimicrobials was below 80%; no isolates were sensitive to third-generation cephalosporins. Conclusions: A high incidence was found of extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolates at Salvador Allende Hospital in Havana, more noticeably in Institute of Angiology wards and skin samples.

11.
Ciênc. rural (Online) ; 51(4): e20200679, 2021. tab, graf
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1153873

ABSTRACT

ABSTRACT: This research aimed to investigate the genotypic relatedness of 18 Staphylococcus aureus strains isolated from intramammary infections in primiparous cows and extramammary sites on five dairy herds by rep-PCR using RW3A primers, and by PFGE using the endonuclease SmaI. The isolates were also evaluated in vitro for the susceptibility against beta-lactam antimicrobials drugs (penicillin and oxacillin), considering that beta-lactams are frequently used for treating staphylococcal intrammamary infections. The rep-PCR typing was highly discriminatory (D value= 0.9804) and a total of 15 patterns were detected. The PFGE method was also highly discriminatory (D value= 0.9667) and a total of 13 patterns were observed. A total of 15 out of 18 (83%) isolates were resistant to penicillin and one out of 18 (6%) to oxacillin. In conclusion, these findings confirmed the occurrence of a high genetic diversity of S. aureus strains at the herds and the presence of clonally-related strains only at the same herd, emphasizing a variety of genotypic profiles among the isolates.


RESUMO: Objetivou-se com este estudo investigar a correlação genética de 18 cepas de Staphylococcus aureus isoladas de infecções intramamárias em vacas primíparas e de locais extramamários em cinco propriedades leiteiras através das técnicas de PCR por sequências palindrômicas extragênicas repetitivas (rep-PCR), usando iniciadores RW3A, e de eletroforese em gel de campo pulsado (PFGE), usando a endonuclease SmaI. Os isolados também foram avaliados in vitro quanto à suscetibilidade aos antimicrobianos beta-lactâmicos (penicilina e oxacilina). A tipagem por rep-PCR foi altamente discriminatória (valor D = 0,9804) e um total de 15 padrões foram detectados. Os isolados de S. aureus foram agrupados em três grupos diferentes (A a C), com 80% de similaridade. A técnica de PFGE também foi altamente discriminatória (valor D = 0,9667) e um total de 13 padrões foi observado. A análise do dendrograma com um coeficiente de similaridade de 80% gerou dois grupos diferentes (A e B). Além disso, cepas clonais isoladas do leite foram identificadas na mesma propriedade pelos dois métodos de tipificação e, apesar da presença de cepas dominantes, nossos resultados sugerem uma alta diversidade genética dentre as cepas de S. aureus analisadas. Um total de 15, dos 18 (83%) isolados, eram resistentes à penicilina e um dos 18 (6%) à oxacilina. Assim, esses achados confirmam a ocorrência de uma alta diversidade genética de cepas de S. aureus nas propriedades e a presença de cepas clonalmente relacionadas apenas na mesma propriedade, enfatizando uma variedade de perfis genotípicos entre os isolados.

12.
Rev. chil. infectol ; 37(6): 683-689, dic. 2020. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1388189

ABSTRACT

INTRODUCCIÓN: Para el caso de infección urinaria adquirida en la comunidad la identificación de enterobacterias con beta-lactamasas de espectro extendido (BLEE) puede optimizar las estrategias de tratamiento, control y seguimiento; sin embargo, el efecto de prevalencias variables de este patrón de resistencia ha afectado la validez externa de este tipo de modelos. OBJETIVO: Desarrollar un modelo predictor diagnóstico que ajuste el error de predicción en prevalencias variables utilizando la regresión LASSO. MÉTODOS: Se diseñó un modelo predictor diagnóstico de infección urinaria adquirida en la comunidad por enterobacterias productoras de BLEE. Se empleó un estudio de corte transversal, tanto para la construcción como para la validación. Para evaluar el efecto de la prevalencia variable del desenlace, la validación se realizó con población en la que la proporción de aislados con este mecanismo de resistencia fue menor, los participantes fueron pacientes adultos que consultaron a servicios de urgencias de dos instituciones hospitalarias de mediano nivel de complejidad de la ciudad de Medellín. Para ajustar el efecto de un medio ambiente con menor proporción de resistencia antimicrobiana, utilizamos la contracción de predictores por regresión LASSO. RESULTADOS: Se incluyeron 303 pacientes para la construcción del modelo, se evaluaron seis predictores y la validación se realizó en 220 pacientes. CONCLUSIÓN: El modelo ajustado con regresión LASSO favoreció la validez externa del modelo en poblaciones con proporción de aislados productores de BLEE en urocultivo de pacientes ambulatorio entre 11 y 16%. Este estudio brinda criterios para un aislamiento temprano cuando los predictores están presentes en poblaciones con proporciones de resistencia en urocultivos ambulatorios cercanas a 15% y propone una metodología para ajuste de error en el diseño de modelos de predicción en resistencia antimicrobiana


BACKGROUND: In the case of community-acquired urinary tract infection, the identification of Enterobacteriaceae with extended spectrum beta-lactamases (ESBL) can optimize treatment, control and follow-up strategies, however the effect of variable prevalences of this resistance pattern has affected the external validity of this type of models. AIM: To develop a diagnostic predictive model that adjusts the prediction error in variable prevalences using the LASSO regression. METHODS: A diagnostic predictive model of community-acquired urinary tract infection by infection by ESBL producing Enterobacteriaceae was designed. A cross-sectional study was used for both construction and validation. To assess the effect of the variable prevalence of the outcome, the validation was performed with a population in which the proportion of isolates with this resistance mechanism was lower, the participants were adult patients who consulted the emergency services of two medium-level hospital institutions. complexity of the city of Medellin. To adjust for the effect of an environment with a lower proportion of antimicrobial resistance, we used the contraction of predictors by LASSO regression. RESULTS: 303 patients were included for the construction of the model, six predictors were evaluated and validation was carried out in 220 patients. CONCLUSION: The adjusted model with LASSO regression favored the external validity of the model in populations with a proportion of ESBL producing isolates in urine culture of outpatients between 11 and 16%. This study provides criteria for early isolation when predictors are present in populations with proportions of resistance in ambulatory urine cultures close to 15% and proposes a methodology for the adjustment of errors in the design of prediction models for antimicrobial resistance.


Subject(s)
Humans , Male , Female , Adult , Middle Aged , Aged , Aged, 80 and over , Urinary Tract Infections/drug therapy , Urinary Tract Infections/epidemiology , Community-Acquired Infections/drug therapy , Enterobacteriaceae Infections/drug therapy , Enterobacteriaceae Infections/epidemiology , beta-Lactamases , Microbial Sensitivity Tests , Logistic Models , Prevalence , Cross-Sectional Studies , Drug Resistance, Bacterial , Anti-Bacterial Agents/therapeutic use , Anti-Bacterial Agents/pharmacology
13.
Rev. peru. med. exp. salud publica ; 37(4): 700-704, oct.-dic. 2020. graf
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1156832

ABSTRACT

RESUMEN Con el objetivo de determinar la utilidad de la citometría de flujo para la detección de Pseudomonas aeruginosa productoras de metalobetalactamasas (MBL), se estudiaron aislamientos de P. aeruginosa genotípicamente caracterizados del cepario del laboratorio de Epidemiología Molecular y Genética de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos. Se analizaron 29 aislamientos (17 productoras de MBL y 12 no productoras de MBL) con el kit de viabilidad celular FACSCalibur (Becton Dickinson). Se utilizaron dos tratamientos, uno con meropenem y el otro con meropenem-EDTA. Usando la razón de aumento de fluorescencia en las células no vivas, se demostró una diferencia significativa entre las productoras de MBL y las no MBL, considerando como punto de corte una razón >1,6. Se determinó una sensibilidad de 94,1% y una especificidad del 100%. La citometría de flujo constituye una alternativa para la detección de P. aeruginosa productora de MBL.


ABSTRACT In order to determine the utility of flow cytometry for detecting metallo-beta-lactamase (MBL)-producing Pseudomonas aeruginosa, we used genotypically characterized P. aeruginosa isolates from the Molecular Epidemiology and Genetics Laboratory of the Universidad Nacional Mayor de San Marcos. A total of 29 isolates (17 MBL-producing and 12 non-MBL-producing) were analyzed with the FACSCalibur (Becton Dickinson) cell viability kit. Two treatments were used, one with meropenem and the other with meropenem-EDTA. A significant difference between MBL and non-MBL-producing P. aeruginosa was demonstrated using the fluorescence ratio in non-living cells, considering a cut-off point of >1.6. We determined a sensitivity of 94.1% and a specificity of 100%. Flow cytometry represents an alternative for the detection of MBL-producing P. aeruginosa.


Subject(s)
Pseudomonas aeruginosa , Molecular Epidemiology , Flow Cytometry , beta-Lactamases , Carbapenems , beta-Lactam Resistance
14.
Article | IMSEAR | ID: sea-215870

ABSTRACT

Beta-lactam antibiotic is the most common antibiotic prescribed by dental students. However, the actual knowledge on beta lactam is important as antimicrobial resistance is currently an alarming and growing phenomenon and in turn becoming a public health challenge. A survey was conducted to assess the knowledge and awareness of beta-lactam antibiotics prescriptions among dental students in their third years, final years and interns. A total of 145 responses were obtained and the results were analyzed using the SPSS statistical software.Based on their knowledge on beta-lactam antibiotics, 59.3% of the participants knew exactly the mechanisms of action of beta-lactam antibiotic which was by interfering with the synthesis of the bacterial cell wall. In the case of penicillin allergy, 40% ofthe participants chose erythromycin as the alternative for penicillin allergy. 84% of the participants were aware that the combination of amoxicillin with clavulanic acid may increase its effectiveness. Meanwhile, 98% of the participants were aware that amoxicillin is the drug of choice for bacterial endocarditis prophylaxis. 72% of the participants were aware that most beta-lactam antibiotics are considered safe for pregnant and lactating women which was statistically significant (p<0.05). In conclusion, the students had quite a good knowledge and awareness regarding the prescription of beta-lactam antibiotics since they have been practicing under guidance from the practitioner in the college

15.
Horiz. méd. (Impresa) ; 20(2): e915, abr.-jun 2020. tab
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1143015

ABSTRACT

RESUMEN Objetivo Determinar las características clínico-microbiológicas de 7 casos de infección nosocomial por Klebsiella pneumoniae productora de carbapenemasa MBL, tipo NDM, en el Hospital Geriátrico San Isidro Labrador (HG SIL) en el periodo de febrero a mayo de 2018. Materiales y métodos Es un estudio descriptivo y retrospectivo realizado en adultos mayores con infecciones urinarias, neumonías, úlceras sacras e infecciones de herida operatoria que recibieron terapia antibiótica múltiple no protocolizada. El método usado para detectar la MBL fue el de doble disco con ácido fenilborónico (APB) y ácido etilendiaminotetraacético (EDTA) en los aislados de Klebsiella pneumoniae con sensibilidad disminuida a carbapenémicos. La identificación del gen NDM se realizó en el Instituto Nacional de Salud mediante reacción en cadena de la polimerasa. Resultados En total, fueron 7 casos positivos para el gen NDM y todos resistentes al meropenem lo que confirmó el brote epidémico. La mortalidad fue 28,6 % (2 de 7 pacientes) pero, debido a la existencia de comorbilidades en todos los casos, no se pudo determinar la mortalidad atribuible. Conclusiones Destacan el rol clave inicial del laboratorio para detectar y tipificar las carbapenemasas y las medidas de control integral de las infecciones. Además, son los primeros casos reportados en nuestra red asistencial.


ABSTRACT Objective To determine the clinical and microbiological characteristics of seven (7) cases of New Delhi MBL (NDM)- producing Klebsiella pneumoniae nosocomial infections at the Hospital Geriátrico San Isidro Labrador (HG SIL) from February to May 2018. Materials and methods A descriptive and retrospective study conducted in elderly people with urinary infections, pneumonia, sacral ulcers and surgical wound infection who received multiple non-protocolized antibiotic therapy. The methods used to detect MBLs in the Klebsiella pneumoniae isolates that showed decreased sensitivity to carbapenems were the phenylboronic acid-based (PBA) and ethylenediaminetetraacetic acid-based (EDTA) double disk tests. The identification of the NDM gene was performed by polymerase chain reaction at the Instituto Nacional de Salud. Results In total, the seven cases were positive for the NDM gene and resistant to meropenem, which confirmed the epidemic outbreak. Mortality accounted for 28.6 % (2 of 7 patients) of the cases. However, due to the presence of comorbidities in all cases, the attributable mortality could not be determined. Conclusions Labs have a key initial role for detecting and classifying the carbapenemases and the measures of comprehensive control of infections. The aforementioned cases are the first ones reported in our healthcare network.

16.
Oncología (Guayaquil) ; 29(3): 165-178, 31 de diciembre del 2019.
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1140775

ABSTRACT

Introducción: Los programas de optimización del uso de antimicrobianos (PROA) surgen ante la necesidad de disminuir el porcentaje de infecciones por microorganismos resistentes a los antimicrobianos, lo cual beneficiaria con mejores resultados clínicos, disminuyendo efectos adversos y reduciendo el gasto que involucra el uso de los mismos. Este programa se implementó en la unidad de cuidados intensivos del hospital oncológico SOLCA Guayaquil, durante un año. Es objetivo del presente estudiofueestablecer la tasa de uso de antimicrobianos en una Unidad de Cuidados Intensivos(UCI) el porcentaje de descalamiento y la epidemiología de las infecciones en UCI. Métodos: En este estudio observacional prospectivo, con muestra no probabilística se incluyeron todos los casos ingresados en la UCIdel Instituto Oncológico Nacional Dr. Juan Tanca Marengo de la ciudad de Guayaquil, en el período julio 2018 a junio 2019. Las variablesfueron prevalencia del uso de antibióticos, tipo de antibiótico usado, descalamiento de antibioterapia, adherencia del personal a las guías clínicas y dosis diarias definidas (DDD) y el índice días-paciente mes por área de internación. Resultados: Se incluyeron 246 pacientes; el 81% se encontraba recibiendo antibióticos, con un máximo de dos antibióticos por paciente; la profilaxis quirúrgica se mantuvo dentro de las primeras 24 horas en el 50% de la veces y el 25.66% la recibió por un periodo mayor a 24 horas; 57.25% tuvo un decalamiento mantenido, en el 20.75% de tipo escalado y el13.66% de tipo descalado. Entre los patógenos aislados están las enterobacterias productoras de beta lactamasas de espectro extendido positivas (BLEE+) con un 57% y las enterobacterias resistentes a los carbapenémicos con un 32%. El mayor consumo fue de carbapenémicos con 625.24g. seguidos de los inhibidores de betalactamasas con 402.94 g. La tasa de tratamientos empíricos del 49.58% vs el 26.41% de tratamientos dirigidos; y mortalidad bruta del 22.76%. Conclusión:La tasa de uso de antibióticos en UCI es alta, el porcentaje de descalamiento fue aceptable comparada con las tasas reportadas regionalmente, la epidemiología de gérmenes reportados más frecuentes son las enterobacterias productoras de beta lactamasa espectro extendido.


Introduction: Antimicrobial use optimization programs (PROA) arise due to the need to decrease the percentage of infections by antimicrobial resistant microorganisms, which would benefit from better clinical results, reducing adverse effects and reducing the expense involved in the use of the same. This program was implemented in the intensive care unit of the SOLCA Guayaquil cancer hospital for one year. The objective of the present study was to establish the rate of use of antimicrobials in an Intensive Care Unit (ICU), the percentage of descaling and the epidemiology of infections in the ICU. Methods:In this prospective observational study, with a non-probability sample, all the cases admitted to the ICU of the Dr. Juan Tanca Marengo National Oncological Institute in the city of Guayaquil, in the period July 2018 to June 2019 were included. The variables were prevalence of the antibiotic use, type of antibiotic used, antibiotics displacement, staff adherence to clinical guidelines and defined daily doses (DDD) and the patient-day-month index by hospitalization area. Results:246 patients were included; 81% were receiving antibiotics, with a maximum of two antibiotics per patient; Surgical prophylaxis was maintained within the first 24 hours 50% of the time and 25.66% received it for a period greater than 24 hours; 57.25% had a sustained offset, in 20.75% the scaled type and 13.66% the bare type. Isolated pathogens include 57% positive extended spectrum beta lactamase-producing enterobacteriaceae (ESBL +) and 32% carbapenem-resistant enterobacteriaceae. The highest consumption was of carbapenems with 625.24 g. followed by beta-lactamase inhibitors with 402.94 g. The empirical treatment rate of 49.58% vs. 26.41% of targeted treatments; and gross mortality of 22.76%. Conclusion:The rate of use of antibiotics in the ICU is high, the percentage of descaling was acceptable compared to the rates reported regionally, the epidemiology of the most frequent reported germs are the extended spectrum beta lactamase-producing enterobacteriaceae.


Subject(s)
Humans , Cross Infection , beta-Lactam Resistance , Intensive Care Units , Pneumonia, Pneumococcal , Antimicrobial Stewardship
17.
Rev. chil. infectol ; 36(4): 433-441, ago. 2019. tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1042659

ABSTRACT

Resumen Introducción: Las infecciones causadas por enterobacterias productoras de β-talactamasas de espectro extendido (EP-BLEE) tienen implicaciones sobre la morbilidad y mortalidad neonatal. Objetivo: Describir la prevalencia de EP-BLEE en sepsis neonatal y los factores asociados. Métodos: Estudio de cohorte prospectivo, desde agosto del 2016 a agosto del 2017. Se incluyeron recién nacidos (RNs) ingresados en el Hospital Civil de Guadalajara "Dr. Juan I. Menchaca". Mediante prueba de difusión de doble disco se indagó la presencia de EP-BLEE y su asociación con características clínicas y demográficas de los RNs. Resultados: Se estudiaron 1.501 RNs hospitalizados, con edad gestacional promedio de 36,3 semanas. Se diagnosticaron 196 eventos de sepsis neonatal, la etiología más frecuente fueron enterobacterias (45,5%); 88,8% demostraron resistencia a ampicilina y más de 42% a cefalosporinas de amplio espectro. El 22,9% presentó fenotipo BLEE positivo. Tener Apgar ≤ 7 a los cinco minutos de vida (OR 4,6; IC 95% 1,47-14,6) y edad gestacional < 37 semanas (OR 5,4; IC 95%1,04-27,7) incrementaron el riesgo. Conclusión: En las enterobacterias causantes de sepsis neonatal, 22,9% son EP-BLEE; la infección es más probable en pacientes con Apgar ≤ 7 a los cinco minutos de vida y en prematuros.


Background: Infections caused by extended-spectrum beta-lactamases enterobacteria (ESBL-EP) have implications for neonatal morbidity and mortality. Aim: To describe the prevalence of ESBL-EP in neonatal sepsis and associated factors. Methods: A prospective cohort study was conducted from August 2016 to August 2017; newborn babies (NB) hospitalized in the Hospital Civil de Guadalajara "Dr. Juan I. Menchaca" were included. The ESBL-EP were investigated by double-disk synergy test and its association with clinical and demographic characteristics of the NB. Results. A total of 1,501 hospitalized NB were studied, with an average gestational age of 36.3 weeks. They were diagnosed 196 neonatal sepsis events, the most frequent etiologies were enterobacteria (45.5%). Resistance to ampicilin was found in 88.8% and to broad spectrum cephalosporins in more than 42% of the strains; 22.9% of them were ESBL phenotype. Apgar ≤ 7 at five minutes of life (OR 4.6; 95% CI 1.47-14.6) and gestational age < 37 weeks (OR 5.4; 95% CI 1.04-27.) increase the risk. Conclusion: In enterobacteria that cause neonatal sepsis, 22.9% were EP-ESBL; infection was more likely in patients with Apgar ≤ 7 at five minutes of age and in preterm infants.


Subject(s)
Humans , Male , Female , Infant, Newborn , Child , Adolescent , Adult , Middle Aged , Young Adult , beta-Lactamases/biosynthesis , Cross Infection/microbiology , Enterobacteriaceae/drug effects , Enterobacteriaceae Infections/microbiology , Neonatal Sepsis/microbiology , Anti-Bacterial Agents/pharmacology , Intensive Care Units, Neonatal , Microbial Sensitivity Tests , Prevalence , Prospective Studies , Risk Factors , Enterobacteriaceae/classification
18.
INSPILIP ; 2(2): 1-9, jul.-dic. 2018.
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-980194

ABSTRACT

Se analizó un total de 274 muestras de orina de pacientes ambulatorios que acudieron a los centros de salud 1, 2 y 3 de la ciudad de Cuenca durante el periodo comprendido entre mayo y junio del año 2013, con el fin de obtener al menos 100 muestras de orina con presencia de Escherichia coli. Se recuperaron 103 cepas de Escherichia coli y se continuó el estudio con la identificación de la producción de Betalactamasas de Espectro Extendido (BLEE), mediante la técnica descrita en el manual CLSI. Se realizaron las pruebas presuntivas y confirmatorias, aplicando el método convencional de difusión en agar, en placas de agar Mueller-Hinton, con un inóculo Mac Farland 0,5 y ensayando los discos de antimicrobiano. Para la prueba presuntiva se emplearon los discos de aztreonam, cefotaxime, ceftazidime y ceftriaxona; para la prueba confirmatoria se utilizaron los discos de ceftazidime y cefotaxime en combinación con ácido clavulánico; la producción de BLEE se determinó mediante la diferencia del diámetro de los halos según se indica en la técnica. Los resultados mostraron que de 103 cepas de E. coli se recuperaron siete (6,8 %) cepas productoras de BLEE y si se considera que la población con la que se trabajó fue de pacientes ambulatorios resulta muy importante la realización de los métodos de identificación de BLEE como apoyo para la correcta terapia antimicrobiana, previniendo de esta manera la diseminación de cepas de E. coli productoras de BLEE.


A total of 274 urine samples were analyzed from outpatients presenting to Health Centers 1, 2 and 3 of the city of Cuenca during the period between May and June 2013, with the purpose to get at least 100 samples positive urine with Escherichia coli. Were retrieved 103 strains of Escherichia coli and the study was continued with the identification of the production of Extended Spectrum Beta Lactamases (ESBL), using the technique described in the CLSI manual. Were performed presumptive and confirmatory tests, applying the conventional method of agar diffusion plates in Mueller-Hinton agar, with a 0.5 McFarland inoculum and tested antimicrobial discs. For the presumptive test was used discs aztreonam, cefotaxime, ceftazidime and ceftriaxone, for the confirmatory test were used discs of ceftazidime and cefotaxime in combination with clavulanic acid. ESBL production was determined by the difference in the diameter of the halos as indicated in the technique. The results showed that of 103 strains of E. coli recovered seven (6,8 %) ESBL producing strains, when considering that the population which was worked was of outpatient, is very important the implementation of identification methods as ESBL for correct support of antimicrobial therapy, preventing this way the spread of strains of E. coli ESBL producing.


Subject(s)
Humans , beta-Lactamases , Prevalence , Escherichia coli , Ecuador
19.
Rev. peru. med. exp. salud publica ; 35(4): 363-641, oct.-dic 2018. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1020775

ABSTRACT

Con el objetivo de caracterizar y determinar la frecuencia de genes que codifican metalo-β-lactamasas (MBL) en aislados clínicos de Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa), se realizó un estudio transversal en el Hospital Militar Central (HMC) de Lima, Perú, entre enero y setiembre del 2016. Se analizaron 76 aislados de P. aeruginosa con sensibilidad disminuida a carbapenémicos y resistentes a ceftazidima. La detección fenotípica de MBL se realizó por el método de sinergia de doble disco entre imipenem y meropenem frente al ácido etilendiaminotetraacético (EDTA), y la identificación de los genes por reacción en cadena de la polimerasa. De los 76 aislados, 24 (31,6 %) fueron positivos para MBL por el método fenotípico, confirmándose genéticamente todos. Se encontró el gen blaIMP en 23/24 (95,8 %) y blaVIM en 1/24 (4,2 %). Ningún aislado presentó blaNDM. El gen blaIMP resultó ser el más frecuente entre los aislados clínicos de P. aeruginosa no sensibles a carbapenémicos en el HMC.


hat codify metallo-β-lactamases (MBL) in clinical isolates of Pseudomona aeruginosa (P. aeruginosa), a cross-sectional study was conducted in the Central Military Hospital (HMC) of Lima, Peru, between January and September, 2016. Seventy-six (76) isolates of P. aeruginosa with diminished sensitivity to carbapenemes and resistant to ceftazidime were analyzed. The phenotype detection of MBL was made by double disc synergy between imipenem and meropenem versus ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA), and the identification of the genes was performed by polymerase chain reaction. Of the 76 isolates, 24 (31.6%) were positive for MBL by the phenotype method, genetically confirming all. The blaIMP gene was found in 23/24 (95.8%) and blaVIM in 1/24 (4.2%). No isolate had blaNDM. The blaIMP gene turned out to be the most frequent among clinical isolates of P. aeruginosa not sensitive to carbapenemics at this Hospital.


Subject(s)
Humans , Pseudomonas aeruginosa/genetics , Bacterial Proteins/genetics , beta-Lactamases/genetics , Peru , Pseudomonas aeruginosa/isolation & purification , Pseudomonas aeruginosa/enzymology , Bacterial Proteins/analysis , beta-Lactamases/analysis , Cross-Sectional Studies , Hospitalization , Hospitals, Military
20.
Indian J Med Microbiol ; 2018 Sep; 36(3): 334-343
Article | IMSEAR | ID: sea-198804

ABSTRACT

Antimicrobial resistance (AMR) is a major public health concern across the globe, and it is increasing at an alarming rate. Multiple classes of antimicrobials have been used for the treatment of infectious diseases. Rise in the AMR limits its use and hence the prerequisite for the newer agents to combat drug resistance. Among the infections caused by Gram-negative organisms, beta-lactams are one of the most commonly used agents. However, the presence of diverse beta-lactamases hinders its use for therapy. To overcome these enzymes, beta-lactamase inhibitors are being discovered. The aim of this document is to address the burden of AMR in India and interventions to fight against this battle. This document addresses and summarises the following: The current scenario of AMR in India (antimicrobial susceptibility, resistance mechanisms and molecular epidemiology of common pathogens); contentious issues in the use of beta-lactam/beta-lactamase inhibitor as an carbapenem sparing agent; role of newer beta-lactam/beta-lactamase inhibitor agents with its appropriateness to Indian scenario and; the Indian Council of Medical Research interventions to combat drug resistance in terms of surveillance and infection control as a national response to AMR. This document evidences the need for improved national surveillance system and country-specific newer agents to fight against the AMR.

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