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1.
Neotrop. ichthyol ; 20(1): e210126, 2022. tab, graf
Article in English | VETINDEX, LILACS | ID: biblio-1375958

ABSTRACT

The species of Hypostomus from the Parnaíba River basin were reviewed through molecular and morphological analysis. Five species were found in the basin, including a new species herein described. The distribution of H. pusarum was expanded to this basin, and a closely related species was recorded (H. aff. pusarum), also the presence of H. johnii and H. vaillanti was confirmed. The new species is distinguished from most congeners by its large number of premaxillary and dentary teeth, a wide dental angle of 115° to 135°, presence of a rounded dark spots on a lighter background and anteromedial region of the abdomen depleted of plaques (vs. anteromedial region of the abdomen covered by platelets and odontodes in H. johnii, H. pusarum, H. aff. pusarum and H. vaillanti). Furthermore, an identification key of the species from the Maranhão-Piauí ecoregion and maps with the geographic distribution of these species are presented. The species of Hypostomus in the Parnaíba River basin have different geographic distributions, suggesting different niches or geographical barriers, providing an opportunity for ecological and evolutionary studies.(AU)


As espécies de Hypostomus da bacia do rio Parnaíba foram revisadas por meio de análises moleculares e morfológicas. Cinco espécies foram encontradas na bacia, incluindo uma nova espécie aqui descrita. A distribuição de H. pusarum foi expandida para esta bacia, uma espécie intimamente relacionada foi registrada (H. aff. pusarum), e a presença de H. johnii e H. vaillanti foi confirmada. A nova espécie se distingue da maioria das congêneres por seu grande número de dentes nos pré-maxilares e dentários, um amplo ângulo do dentário de 115° a 135°, presença de manchas escuras arredondadas em um fundo mais claro e região anteromedial do abdômen sem placas (vs. região anteromedial do abdômen coberta por placas e odontódios em H. johnii, H. pusarum, H. aff. pusarum e H. vaillanti). Além disso, é apresentada uma chave de identificação das espécies da ecorregião Maranhão-Piauí e mapas com a distribuição geográfica dessas espécies. As espécies de Hypostomus na bacia do rio Parnaíba apresentam diferentes distribuições geográficas, sugerindo diferentes nichos ou barreiras geográficas, proporcionando oportunidade para estudos ecológicos e evolutivos.(AU)


Subject(s)
Animals , Catfishes/classification , Catfishes/genetics , Brazil , Biodiversity , DNA Barcoding, Taxonomic/veterinary , Molecular Sequence Annotation
2.
Braz. j. biol ; 81(2): 258-267, 2021. tab, graf
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1153355

ABSTRACT

The ichthyofauna diversity of the Jebba Hydroelectric Power (HEP) Dam, Jebba, North-central Nigeria was studied. Fishes were sampled for 24 months using gill net, hook and line, and cast net. Individuals were identified using morphological and molecular (mitochondrial Cytochrome c Oxidase subunit I) data. A total of 9605 freshwater fishes were recorded during the sampling period. The use of an integrative taxonomic approach enabled the identification of 83 species belonging to 42 genera. Additionally, the study recorded three unidentified species ­ Ctenopoma sp, Malapterurus sp., and Protopterus sp. Analyses showed that individuals belonging to families Cichlidae and Mochokidae dominated the dam. The diversity analyses revealed relatively high fish diversity during the rainy season at the downstream section of Jebba HEP dam compared to the upstream section. The study, therefore, showed the presence of a diverse fish community comprising high species richness and diversity across the Jebba HEP dam. Finally, we recommend proper biodiversity monitoring and assessment of freshwater fish diversity across Nigeria. In addition, the use of an integrated taxonomic approach is recommended for appropriate species' identification and studies of freshwater fishes from Nigeria.


A diversidade da ictiofauna da hidrelétrica de Jebba (HEP), Jebba, centro-norte da Nigéria foi estudada. Os peixes foram amostrados por 24 meses, utilizando rede de emalhar, anzol e linha, e rede de arrasto. Os indivíduos foram identificados usando a abordagem combinada morfológica e molecular (citocromo c Oxidase mitocondrial subunidade I). Um total de 9605 peixes de água doce foram registrados durante o período de amostragem. A identificação das espécies utilizando a abordagem taxonômica integrada possibilitou a identificação de 83 espécies pertencentes a 42 gêneros. Além disso, o estudo registrou três espécies não identificadas - Ctenopoma sp, Malapterurus sp e Protopterus sp. Análises mostraram que indivíduos pertencentes às famílias Cichlidae e Mochokidae dominaram a barragem. As análises dos índices de diversidade revelaram uma diversidade de peixes relativamente alta durante a estação chuvosa na seção a jusante da barragem Jebba HEP em comparação com a seção a montante. O estudo mostrou, portanto, a presença de diversas comunidades de peixes, que incluem alta riqueza e diversidade de espécies através da barragem Jebba HEP. Finalmente, recomendamos o monitoramento adequado da biodiversidade e a avaliação da diversidade de peixes de água doce em toda a Nigéria. Além disso, recomenda-se o uso de abordagem taxonômica integrada para a identificação adequada das espécies e estudos de peixes de água doce da Nigéria.


Subject(s)
Humans , Animals , Catfishes/genetics , DNA Barcoding, Taxonomic/veterinary , Fishes , Seasons , Hydroelectric Power Plants (Environmental Health) , Biodiversity , Fresh Water , Nigeria
3.
Neotrop. ichthyol ; 16(4): e180029, out. 2018. ilus
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-976298

ABSTRACT

Farlowella is one of the most diverse genera of the Loricariinae, restricted to South America rivers. The taxonomic and phylogenetic relationships among its species are contentious and, while genetic studies would contribute to the understanding of their relationships, the only available datum refer to the karyotype description of only one species. In the present study two Amazonian species, Farlowella cf. amazonum and F. schreitmuelleri, were analyzed using conventional and molecular cytogenetic procedures. Both species had diploid chromosome number 58, but different fundamental numbers (NF) 116 and 112, respectively, indicative of chromosomal rearrangements. C-banding is almost poor, especially in F. cf. amazonum, and occurs predominantly in the centromeric and in some telomeric regions, although genome of F. schreitmuelleri possessed a much larger heterochromatin amount then those of F. cf. amazonum. The chromosomes bearing the NOR sites were likely the same for both species, corresponding to the 1st metacentric pair in F. cf. amazonum and to the 28th acrocentric in F. schreitmuelleri. The location of the 5S rDNA was species-specific marker. This study expanded the available cytogenetic data for Farlowella species and pointed the remarkable karyotype diversity among species/populations, indicating a possible species complex within genus.(AU)


Farlowella é um dos gêneros mais diversos de Loricariinae, restrito aos rios da América do Sul. As relações taxonômicas e filogenéticas entre suas espécies são contenciosas e, enquanto os estudos genéticos contribuem para a compreensão dessas relações, o único dado disponível refere-se à descrição cariotípica de apenas uma espécie. No presente estudo, foram analizadas duas espécies amazônicas Farlowella cf. amazonum e F. schreitmuelleri, empregando procedimentos citogenéticos convencionais e moleculares. Ambas as espécies apresentaram número diploide igual a 58 cromossomos, mas com números fundamentais diferentes (NF) de 116 e 112, respectivamente, indicando rearranjos cromossômicos. Bandas C são poucas, especialmente em F. cf. amazonum, e ocorre predominantemente nas regiões centroméricas e em algumas regiões teloméricas, embora F. schreitmuelleri apresenta uma quantidade de heterocromatina muito maior que F. cf. amazonum. Os cromossomos carreadores dos sítios da NOR foram provavelmente os mesmos para ambas as espécies, correspondendo ao primeiro par metacêntrico em F. cf. amazonum e ao 28º acrocêntrico em F. schreitmuelleri. A localização do DNAr 5S foi espécie-específico. Este estudo expandiu os dados citogenéticos disponíveis para espécies de Farlowella e apontou uma remarcável diversidade cromossômica entre espécies/populações, indicando um possível complexo de espécies neste gênero.(AU)


Subject(s)
Animals , Catfishes/classification , Cytogenetics , DNA Barcoding, Taxonomic/veterinary
4.
Neotrop. ichthyol ; 15(1): e160147, 2017. tab, ilus
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-841881

ABSTRACT

DNA barcoding is a widely utilized molecular-based identification of species and taxonomic resolutions. Until recently, Rhamdia voulezi and Rhamdia branneri were considered species synonyms of Rhamdia quelen; however, morphological and cytogenetic analyses have suggested the validity of distinct species. Due to the absence of molecular taxonomy of R. voulezi and R. branneri, the objective of this study was to test its validity through traditional DNA barcoding and the GMYC (General Mixed Yule Coalescent) COI-based analyses in 19 specimens from the Iguaçu River Basin. In both methodologies, three MOTUs (Molecular Operational Taxonomic Units) were identified based on the estimated optimum threshold (OT = 0.77). The average inter-MOTU distance (NJ, K2P) between R. branneri and R. voulezi was 1.4%, and 0% intra-MOTU distance in both species. The two species identified as R. branneri and R. voulezi showed correspondence with taxonomic and morphological identifications. With regard to R. quelen, the average intra-MOTU distance was greater than OT (2.7%), indicating that this species can be formed by different MOTUs. We suggest that molecular and taxonomic studies should be employed concurrently in R. quelen, to prevent contamination of wild species by hybridizations.(AU)


O DNA barcoding é uma ferramenta molecular precisa para a identificação de espécies e resoluções taxonômicas. Até recentemente, Rhamdia voulezi e Rhamdia branneri eram consideradas sinônimas de Rhamdia quelen, contudo caracteres morfológicos e citogenéticos têm apontado à validade de ambas. Devido à escassez de informações sobre a taxonomia molecular de R. voulezi e R. branneri, o objetivo do presente estudo foi testar a validade das mesmas através do método de DNA barcoding tradicional e GMYC (General Mixed Yule Coalescent), por meio da análise do gene COI em 19 espécimes do rio Iguaçu. Em ambos os métodos, três MOTUs (Unidades Taxonômicas Operacionais Moleculares) foram identificadas com base no ótimo threshold (OT = 0,77). A média inter-MOTU (NJ, K2P) entre R. branneri e R. voulezi foi 1,4%, com valores de 0% intra-MOTUs em ambas espécies. As duas espécies identificadas como R. voulezi e R. branneri apresentaram correspondência com a identificação taxonômica e morfológica dos respectivos vouchers. No que se refere a R. quelen, os resultados intra-MOTU foram superiores ao OT (2,7%), evidenciando a possibilidade de existirem diferentes MOTUs denominadas como R. quelen. Sugerimos que estudos moleculares e taxonômicos sejam empregados em R. quelen, para evitar a contaminação de espécies selvagens por hibridizações.(AU)


Subject(s)
Animals , Catfishes/genetics , Catfishes/growth & development , DNA Barcoding, Taxonomic/veterinary , Aquaculture
5.
Neotrop. ichthyol ; 15(4): e170046, 2017. tab, graf
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-895115

ABSTRACT

Poeciliids comprise around 300 species inhabiting the fresh and brackish waters of the Americas and Africa. Poecilia reticulata is native to Northeastern South America and Trinidad and Tobago. In this paper, introduced specimens of P. reticulata collected in the lower Paraguay River in Argentina, were characterized by means of molecular and taxonomic approaches. We further explore, by means of DNA Barcoding, the singularity of the genetic identity of these specimens. Ocurrence of P. reticulata in the lower Paraguay River represents the first record of this species in Argentina. Thirteen individuals of P. reticulata were collected. DNA barcoding showed that all five specimens sampled belong to a single mitochondrial lineage, which was also present in 11 countries from five continents. The distance-based tree clearly grouped separetely four different clusters of P. reticulata when including public data. Genetic distance between the most divergent P. reticulata almost paralleled distance between this species and Poecilia mexicana and P. vivipara. Established populations from Paraguay could be one of the plausible sources for the introduced populations recorded in the lower Paraguay River. The presence of P. reticulata in an open waterway with known drainage to a natural stream is of major concern.(AU)


Poecilídeos compreendem cerca de 300 espécies que habitam águas doces e salobras das Américas e África. Poecilia reticulata é nativa do nordeste da América do Sul e Trinidad e Tobago. Neste trabalho, espécimes introduzidos de P. reticulata coletados no baixo rio Paraguai na Argentina, foram caracterizados por meio de abordagens moleculares e taxonômicas. Exploramos ainda, por meio de DNA Barcoding, a singularidade da identidade genética destes espécimes. A ocorrência de P. reticulata no baixo rio Paraguai representa o primeiro registro dessa especie na Argentina. Treze indivíduos de P. reticulata foram coletados. O Barcoding mostrou que todos os espécimes pertencem a uma única linhagem mitocondrial, a qual está presente em 11 países dos cinco continentes. A árvore de distâncias agrupou separadamente quatro clusters diferentes de P. reticulata quando incluindo dados públicos. A distância genética entre os agrupamentos mais divergentes de P. reticulata quase igualou a distância entre esta espécie e Poecilia mexicana e P. vivipara. As populações estabelecidas no Paraguai poderiam ser uma das fontes plausíveis para as populações introduzidas registradas no baixo rio Paraguai. A presença de P. reticulata em um canal aberto com drenagem conhecida para um córrego natural é de grande preocupação.(AU)


Subject(s)
Animals , DNA Barcoding, Taxonomic/veterinary , Poecilia/classification , Poecilia/genetics
6.
Neotrop. ichthyol ; 13(1): 61-76, Jan-Mar/2015. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: lil-744498

ABSTRACT

Cichlids of the tribe Heroini have long been a source of taxonomical conflict. In particular, the species included in the Herichthys bartoni group have failed to be recovered as monophyletic in different molecular studies. In this paper we use traditional and geometric morphometrics to evaluate morphological variation in the species included in the H. bartoni complex in order to evaluate the number of species it contains. An update of a previously published DNA barcoding study suggests the existence of three genetic clusters that included the six recognized species analyzed in this study, none of them recovered as monophyletic. On the other hand, geometric morphometrics arise as a useful tool to discriminate species due that traditional morphometrics showed a high overlap in the characters analyzed that prevents the proposal of diagnostic characters.


Los cíclidos de la tribu Heroini han experimentado un largo conflicto taxonómico. En particular, las especies incluidas en el grupo Herichthys bartoni no han sido recuperadas como monofiléticas en diversos estudios moleculares. En este artículo nosotros usamos morfometría tradicional y geométrica para evaluar la variación morfológica de las especies incluidas en el complejo H. bartoni para evaluar el numero de especies que contiene. Una actualización de un estudio previo de código de barras de ADN sugiere la existencia de tres grupos genéticos que incluyen las seis especies reconocidas analizadas en este estudio, ninguna de las cuales fue recuperada como monofilética. Por otro lado, la morfometría geométrica surge como una herramienta de utilidad para discriminar especies debido a que la variación en caracteres morfométricos tradicionales muestra altos niveles de solapamiento que previene la propuesta de caracteres diagnósticos.


Subject(s)
Animals , Cichlids , DNA Barcoding, Taxonomic/veterinary , Species Specificity
7.
Neotrop. ichthyol ; 11(2): 459-466, jun. 2013. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: lil-778813

ABSTRACT

Molecular and cytogenetic data have provided evidence of cryptic speciation in the widespread South American trahira, Hoplias malabaricus. In the present study, karyotypes and DNA barcode sequences of specimens from seven populations inhabiting the lower Amazon River were analyzed in order to characterize the levels of genetic divergence within a single karyomorph. All the specimens presented karyotypes with 2n = 40 chromosomes (20m+20sm) that were consistent with the species' C karyomorph. The DNA barcodes revealed six haplogroups, with clear divergence between populations from Brazil and Argentina. The results support the species complex hypothesis and indicate that a single karyomorph of H. malabaricus may harbor more than one species...


Dados moleculares e citogenéticos tem evidenciado especiação críptica na traíra sul-americana, Hoplias malabaricus. No presente estudo, cariótipos e sequências de DNA barcode de espécimes de sete populações, habitando a região do baixo rio Amazonas, foram analisadas a fim de caracterizar o nível de divergência genética dentro de um único cariomorfo. Todos os espécimes possuem 2n = 40 cromossomos (20m+20sm) os quais são inseridos no grupo de traíras do cariomorfo C. DNA barcode revelou seis haplogrupos, com clara divergência entre populações do Brasil e da Argentina. Os resultados apoiam a hipótese de complexo de espécies e indicam que um único cariomorfo de Hoplias malabaricus pode conter mais de uma espécie...


Subject(s)
Animals , Cytogenetic Analysis/classification , Cytogenetic Analysis/veterinary , Characiformes/genetics , DNA Barcoding, Taxonomic , DNA Barcoding, Taxonomic/veterinary
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