External Apical Root Resorption and IL-1A, IL-1RN Gene Polymorphisms: A Systematic Review and Meta-Analysis of Prospective Studies

ABSTRACT Objective: To reconnoiter the IL-1A (-889) and IL-1RN (+2018) gene polymorphisms and their association with EARR. Material and Methods: The Science Direct, PubMed and Scopus databases were comprehensively searched by two independent reviewers. In addition, the bibliographies of all relevant publications and textbooks were searched manually. A meta-analysis was performed using data available up to May 9, 2020. Results: A total of 13 and 9 publications were selected for the systematic review and meta-analysis, respectively for both IL-1A and IL-1RN genes. Odds ratio (OR) was used to evaluate the association of the gene polymorphism and the risk of EARR. The risk of EARR was estimated using the overall OR from the published studies. No association was found for IL-1A gene for the risk of EARR. However, the dominant and co-dominant models of IL-1RN gene polymorphism were associated with the risk of EARR. Conclusion: More studies are warranted to determine the relationship between IL-1A and IL-1RN gene polymorphisms and EARR for a clearer understanding of their interactions.

High interleukin-4 expression and interleukin-4 gene polymorphisms are associated with susceptibility to human paracoccidioidomycosis

Paracoccidioidomycosis (PCM) is caused by dimorphic fungi from theParacoccidioides brasiliensis complex. Previous studies have demonstrated that the severity of disease is associated with a T-helper 2 immune response characterised by high interleukin (IL)-4 production. In the present study we analysed two polymorphisms in the IL-4gene (-590 C/T and intron-3 microsatellite) in 76 patients with PCM and 73 control subjects from an endemic area. The production of IL-4 by peripheral blood mononuclear cells after antigen or phytohaemagglutinin stimulation was determined by ELISA. A significant correlation was observed between the RP2/RP2 intron-3 genotype and infection with Paracoccidioides sp.(p = 0.011), whereas the RP1/RP1 genotype was correlated with resistance. No significant correlation was observed for the IL-4promoter polymorphism. Furthermore, the low IL-4 expression observed in the control group compared with patients was associated with the RP1/RP1 genotype. These results suggest that IL-4polymorphisms might be associated with the ability of the host to control Paracoccidioides sp.infection. The relevance of this polymorphism is supported by the observation that patients with disease produce high levels of IL-4 following mitogen or antigen stimulation. The IL-4gene is located in the cytokine cluster region of chromosome 5 where other polymorphisms have also been described.

Identificación de polimorfismos en RXam2, un gen candidato de resistencia a la bacteriosis vascular de yuca / Identification of polymorphisms in RXam2 a cassava bacterial blight resistance gene candidate

La yuca se constituye en la base de la alimentación para más de mil millones de personas en el mundo. Una de las principales enfermedades de la yuca y que podría comprometer la seguridad alimentaria es la bacteriosis vascular ocasionada por la bacteria Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam). El gen candidato de resistencia RXam2 codifica para una proteína con dominios NBS (Nucleotide Binding Site) y LRR (Leucine Rich Repeats) y colocaliza con un QTL (Quantitative Trait Loci) que explica el 61.6% de la resistencia a la cepa CIO151 de Xam. En este trabajo se secuenció parcialmente el gen RXam2 en tres variedades de yuca: MCOL2246, TMS60444 y SG107-35 con el objetivo de tener una visión preliminar del grado de polimorfismos tipo SNP (Single Nucleotide Polymorphism) que se presenta en este gen. La región secuenciada incluye 507 pb de la región promotora y 1309 pb de la secuencia codificante. Se logró identificar 5 y 31 SNPs al interior de las variedades MCOL2246 y TMS60444, respectivamente. Al mismo tiempo el número de SNPs entre las variedades fue de 44, 34 y 23 para MCOL2246-TMS60444, TMS60444-SG107-35 y MCOL2246-SG107-35, respectivamente. El mayor número de SNPs estuvieron localizados en la región -500 a -300 pb que corresponden a un fragmento de la región promotora del gen, aunque también se identificó un importante número de polimorfismos en la región codificante. Este estudio permitirá identificar el número de polimorfismos en este gen en un mayor grupo de variedades de yuca con el fin de asociar estos polimorfismos con el fenotipo de resistencia/susceptibilidad.

Cassava is a staple food for more than a billion people. One of the major diseases of cassava which could compromise food security is known as cassava bacterial blight, caused by the bacterium Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam). The RXam2 resistance gene candidate encodes a protein with Nucleotide Binding Site and Leucine Rich Repeats domains, and colocalizes with a QTL (Quantitative Trait Loci) that accounts for 61.6% of the resistance to the Xam strain CIO151. In this work we sequenced 1816 bp corresponding to a partial sequence of this gene in three cassava varieties with the aim of having a preliminary overview of the degree of Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs). The sequenced regions included 507 bp of the promotor and 1309 bp of the coding sequence. It was possible to identify five and 31 intravarietal SNPs in MCOL2246 and TMS60444, respectively. In addition, the number of SNPs between varieties was 44, 34 and 23 for MCOL2246-TMS60444, TMS60444-SG107-35 and MCOL2246-SG107-35, respectively. The largest number of SNPs was located in the promoter region -500 to -300 bp. This study may help to develop alternatives to identify SNPs in a more diverse group of cassava varieties, and possibly associate them with resistance/susceptible phenotypes.

Variantes polimórficas Ala513Pro y Gly972Arg del gen IRS-1 no se asocian a la diabetes mellitus tipo 2 en un grupo de la población cubana / The Ala513Pro and Gly972ARg polymorphous variants of IRS-1 gen are not associated with type diabetes mellitus in a group of the Cuban population

Introducción: la diabetes mellitus tipo 2 es una enfermedad heterogénea y multifactorial, que está determinada por factores genéticos y no genéticos. El sustrato 1 del receptor de la insulina (IRS-1) cumple una función fundamental en la transmisión de la señal insulínica, por tanto sus variantes génicas constituyen blancos importantes en el estudio de la susceptibilidad genética a esta enfermedad en las diferentes poblaciones. Objetivo: explorar el papel de las variantes polimórficas Gly972Arg y Ala513Pro del gen IRS-1 en la susceptibilidad genética de la diabetes mellitus tipo 2 en un grupo de la población cubana.Métodos: se determinó la frecuencia de los polimorfismos Gly972Arg y Ala513Pro del IRS-1 en 499 ciudadanos cubanos, con un índice de masa corporal entre 22-30, con edades comprendidas entre los 40 y 70 años: de ellos 272 (54,5 por ciento) diabéticos y 227 (45,5 por ciento) no diabéticos.Resultados: la frecuencia del alelo Pro513 fue baja (1,2 por ciento) y similar para ambos grupos (1,1 por ciento vs. 1,3 por ciento para el grupo de diabéticos y el grupo control, respectivamente). La frecuencia del polimorfismo Gly972Arg fue de 16,2 por ciento, superior a la reportada para la mayoría de las poblaciones estudiadas. No se encontraron diferencias significativas en la frecuencia del alelo Arg972 entre el grupo de diabéticos y el grupo control (15,4 por ciento vs. 17,3 por ciento), ni cambios en los niveles de glucemia e insulinemia asociados a la presencia del alelo polimórfico Arg972.Conclusiones: en este grupo de sujetos de la población cubana, las variantes polimórficas Ala513Pro y Gly972Arg del gen IRS-1 no participan en la etiología de la diabetes mellitus tipo 2(AU)

Introduction: the type 2 diabetes mellitus is a heterogeneous and multifactor disease determined by genetic and no-genetic factors. The substrate 1 of insulin receptor (IRS-1) has a fundamental function in transmission of insulin signal, thus its genic variants are significant targets in study of genetic susceptibility to this disease in different populations. Objective: to explore the role of the Gly972Arg and Ala513PRo of IRS-1 gen polymorphous variants in the genetic susceptibility of type 2 diabetes mellitus in Cuban population. Methods: the frequency of above mentioned polymorphous variants in 499 Cuban citizens with a 22-30 body mass index aged between 40 to 70 including 272 diabetics (54,5 por ciento) and 227 non-diabetic (45,5 por ciento). Results: frequency of Pro513 allele was low (1,2 por ciento) and similar en both groups (1,1 por ciento versus 1,3 por ciento for diabetic group and the control one, respectively). Frequency of Gly972Arg polymorphism was of 16,2 por ciento, higher than that reported for most of study populations. There were not significant differences in frequency of Arg972 allele between the diabetic group and the control one (15,4 por ciento versus 17,3 por ciento). Also, there were not changes in glycemia and insulinemia levels associated to presence of polymorphous allele. Conclusions: in present group of Cuban population the above mentioned polymorphous variants are not involved in etiology of type 2 diabetes mellitus(AU)

Marcadores de inflamação na morbidade da malária por Plasmodium vivax: contribuição de micropartículas, ácidos nucléicos circulantes e polimorfismos genéticos do hospedeiro vertebrado

Os estudos sobre os mecanismos patogênicos que levam à malária grave foram durante muitos anos restritos basicamente ao Plasmodium falciparum. Entretanto, o número de casos de P. vivax vem aumentando em todo o mundo, incluindo aqueles de malária grave. Evidências recentes sugerem que a infecção pelo P. vivax induz uma resposta imune inflamatória mais intensa que aquela induzida pelo P. falciparum. Diante disso, os objetivos deste trabalho foram: (i) investigar mediadores plasmáticos relacionados à inflamação que poderiam ser utilizados como marcadores de morbidade da malária por P. vivax; (ii) identificar indivíduos geneticamente susceptíveis e/ou resistentes à malária clínica. Na busca de biomarcadores, a hipótese investigada foi a de que as micropartículas (MPs) – vesículas resultantes da ativação e/ou apoptose celular – e os ácidos nucléicos circulantes (CNAs) estariam associados à infecção pelo P. vivax

Em pacientes bem caracterizados clinicamente foi possível demonstrar que as MPs, de diferentes origens, estavam significativamente aumentadas na malária por P. vivax, sendo as MPs de origem plaquetária associadas à sintomatologia da doença. Os níveis de CNAs plasmáticos estavam aumentados nos pacientes infectados pelo P. vivax sendo estes níveis associados ao espectro clínico da doença. Um achado interessante no presente trabalho foi que os níveis de CNAs também correlacionaram- se com a trombocitopenia. Um resultado de grande importância foi que os níveis de MPs e CNAs no plasma retornaram aos valores basais após o tratamento antimalárico específico, o que sugere que ambos os fatores podem ser bons marcadores de morbidade por P. vivax.Na segunda parte do estudo, buscou- se a associação entre os polimorfismos genéticos de citocinas (MIF, TNF-α, IL-10 e TGF-β) e de glicoproteínas plaquetárias (GPIa/IIa e GPIIb/IIIa) com as complicações clínicas e hematológicas da infecção pelo P. vivax. Os resultados obtidos evidenciaram associações entre os polimorfismos dos genes GPIa/IIa, TNF-α, MIF e IL-10 e alterações clínicas e hematológicas na malária causada pelo P. vivax. Em resumo, os dados apresentados reforçam a influência de múltiplos genes do hospedeiro vertebrado na malária por P. vivax. Espera-se que os resultados observados no presente trabalho possam contribuir no esclarecimento dos mecanismos envolvidos na patogenia do P. vivax

Marcadores de inflamação na morbidade da malária por Plasmodium vivax: contribuição de micropartículas, ácidos nucléicos circulantes e polimorfismos genéticos do hospedeiro vertebrado / Markers of inflammation in the morbidity of Plasmodium vivax malaria: contribution of microparticles circulating nucleic acids and genetic polymorphisms of the vertebrate host

Os estudos sobre os mecanismos patogênicos que levam à malária grave foram durante muitos anos restritos basicamente ao Plasmodium falciparum. Entretanto, o número de casos de P. vivax vem aumentando em todo o mundo, incluindo aqueles de malária grave. Evidências recentes sugerem que a infecção pelo P. vivax induz uma resposta imune inflamatória mais intensa que aquela induzida pelo P. falciparum. Diante disso, os objetivos deste trabalho foram: (i) investigar mediadores plasmáticos relacionados à inflamação que poderiam ser utilizados como marcadores de morbidade da malária por P. vivax; (ii) identificar indivíduos geneticamente susceptíveis e/ou resistentes à malária clínica. Na busca de biomarcadores, a hipótese investigada foi a de que as micropartículas (MPs) – vesículas resultantes da ativação e/ou apoptose celular – e os ácidos nucléicos circulantes (CNAs) estariam associados à infecção pelo P. vivax. Em pacientes bem caracterizados clinicamente foi possível demonstrar que as MPs, de diferentes origens, estavam significativamente aumentadas na malária por P. vivax, sendo as MPs de origem plaquetária associadas à sintomatologia da doença. Os níveis de CNAs plasmáticos estavam aumentados nos pacientes infectados pelo P. vivax sendo estes níveis associados ao espectro clínico da doença. Um achado interessante no presente trabalho foi que os níveis de CNAs também correlacionaram- se com a trombocitopenia. Um resultado de grande importância foi que os níveis de MPs e CNAs no plasma retornaram aos valores basais após o tratamento antimalárico específico, o que sugere que ambos os fatores podem ser bons marcadores de morbidade por P. vivax.Na segunda parte do estudo, buscou- se a associação entre os polimorfismos genéticos de citocinas (MIF, TNF-α, IL-10 e TGF-β) e de glicoproteínas plaquetárias (GPIa/IIa e GPIIb/IIIa) com as complicações clínicas e hematológicas da infecção pelo P. vivax. Os resultados obtidos evidenciaram associações entre os polimorfismos dos genes GPIa/IIa, TNF-α, MIF e IL-10 e alterações clínicas e hematológicas na malária causada pelo P. vivax. Em resumo, os dados apresentados reforçam a influência de múltiplos genes do hospedeiro vertebrado na malária por P. vivax. Espera-se que os resultados observados no presente trabalho possam contribuir no esclarecimento dos mecanismos envolvidos na patogenia do P. vivax.

Infección por Trypanosoma cruzi y polimorfismo del Citocromo B del ADN mitocondrial en Triatoma maculata de Anzoategui y Portuguesa, Venezuela / Trypanosoma cruzi infection and cytochrome b polimorphism of mitochondrial dna in Triatoma maculata of Anzoátegui and Portuguesa states, Venezuela

Con el fin de entender la dinámica poblacional de Triatoma maculata, se analizó el polimorfismo genético y los índices de infección con Trypanosoma cruzi, utilizando triatominos provenientes de ecotopos y regiones geográficas diferentes. El índice de infección parasitaria para T. maculata, fue de 29.8% a través de la observación directa al microscopio y 40.3% utilizando el método de reacción en cadena de la polimerasa. Los niveles de infección encontrados incrementan la importancia de T. maculata como vector involucrado en el ciclo de transmisión de T. cruzi. El análisis del polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción de una región del gen Cyt B, permitió establecer en forma preliminar, diferencias en los patrones de bandas de este gen, según el origen geográfico de cada población. Esto puede asociarse a cambios relacionados con procesos adaptativos involucrados en la colonización de nuevos hábitats. No se observó variación genética para vectores capturados en diferentes ecotopos de una misma localidad. Sin embargo es evidente la participación del vector en el ciclo de transmisión, mostrando que la presencia de T. maculata en las casas no puede ser ignorada

In order to understand more about the populational dynamics of Triatoma maculata, the genetic polimorphism and the infection indexes of Trypanosoma cruzi were analysed, using triatomine obtained from different ecotopes and geographical regions. The parasitic infection index of T. maculata was 29.8% using the microscope direct observation, and 40.3% by the polymerase chain reaction method. Both methods were important for epidemiological screening of the vectors with low potential of infection. The amplification of one region the Cyt B gene of these organisms, followed by a restriction fragments length polymorphism analysis, allowed us to establish different patterns of bands according to the geographic origin of each population, which indicates the lack of migration between individuals of Portuguesa and Anzoátegui states. These genetic differences may be associated with changes in adaptative events involved in the colonization of new habitats. The lack of polymorphism among vectors collected in different habitats of the same region showed an important genetic flow which has epidemiological implications in the risk of transmission of the disease, showing that the presence of T. maculata in houses cannot be ignored

Estudio de diversidad de accesiones de guayabo (psidium guajava L) mediante el marcador molecular ISTR / Studying the diversity of guava (psidium guajava L) accessions using ISTR molecular markers

Los estudios de variabilidad genética resultan útiles para el manejo racional del material, tanto para su conservación como para el mejoramiento. La Repetición de Secuencias Inversas Marcadas (ISTR) es una técnica basada en la PCR que permite el estudio de la diversidad genética de individuos y poblaciones; identificación de cultivares, entre otras aplicaciones. En este sentido, el objetivo del presente trabajo fue estudiar la diversidad de accesiones de guayabo empleando este marcador molecular. Para el análisis de los datos se generó una matriz de ausencia-presencia de las bandas polimórficas, a partir de la cual se desarrolló un análisis de agrupamiento basado en el coeficiente de Jaccard y el método UPGMA para la construcción del dendrograma con el programa NTSYS-pc. La evaluación de los genotipos de guayabo con el marcador ISTR generó un total de 52 bandas polimórficas, las cuales permitieron diferenciar todos los materiales evaluados, corroborando la utilidad de esta técnica para la identificación de accesiones en la especie. El análisis de agrupamiento permitió evidenciar la formación de cuatro grupos de diversidad definidos y la presencia de cuatro accesiones externas. Las diferencias encontradas en el agrupamiento de las accesiones por ISTR respecto a las obtenidas previamente por AFLP y SSR sugieren que el elegir la técnica más apropiada para determinados estudios puede resultar un proceso difícil. Los resultados discutidos en este trabajo indican la necesidad de realizar estudios integrados en el banco de germoplasma de este cultivo para lograr un manejo más racional de la base genética del mismo.

Studies about genetic variability can be useful for material rational management, as much as for conservation and breeding. The Inverse Sequence Tagged Repeats (ISTR) is a technique based on PCR, which permit the study of genetic diversity for individuals and populations; cultivars identification, within other applications. In this sense, the objective of the present work was to study guava accessions diversity using this molecular marker. For data analysis, an absence-presence matrix for polymorphic bands was generated, from which a cluster analysis was developed, based on Jaccard coefficient and UPGMA method for dendrogram construction using NTSYS-pc program. Guava genotypes evaluation with ISTR marker generated a total of 52 polymorphic bands, which permitted to differentiated all the materials evaluated, corroborating the utility of this technique for accessions identification in the specie. Cluster analysis permitted to evidence the formation of four defined diversity groups and the presence of four external accessions. The differences encountered for accessions clustering with ISTR respected to the ones obtained previously for AFLP and SSR suggest that the election of the most appropriated technique for determinate studies can result a difficult process. The results discussed in this work indicate the necessity to made integrated studies on the germplasm bank of this crop to obtain a more adequate management.

Imunogenética das uveítes / Imunogenetics in the uveítes

Citocinas são moléculas envolvidas na comunicação intercelular nas respostas inflamatória e imune, desempenhando papel relevante nas uveítes. Polimorfismos dos genes responsáveis pela produção de determinadas citocinas têm sido relacionados com a ocorrência e a gravidade de algumas uveítes. Portanto, o presente trabalho tem como objetivo relatar essas possíveis associações, salientando o aspecto individual genético no prognóstico das uveítes.

Cytokines are molecules involved in intercellular communication in immune and inflammatory responses, playing an important role in uveitis. Genetic polymorphisms responsible for the production of certain cytokines have been associated with the occurrence and the severity of uveitis. Therefore, the present study has the purpose of describing these possible associations, pointing out the individual genetic background in the prognosis of uveitis.

Anemia falciforme: polimorfismos gênios em moléculas de adesão (VCAM-1 e ICAM-1), TNF-ALFA-, IL-8 e alterações fonotípicas / Sickle cell anemia: polymorphisms geniuses in molecules of accession (VCAM-1 and ICAM-1), TNF-ALPHA-, IL-8 and amendments fonotípicas

A hemoglobina S é resultado da mutação pontual A>T no sexto códon do gene beta da globina, conduzindo à substituição do ácido glutâmico pela valina na cadeia da globina beta. A anemia falciforme apresenta heterogeneidade clinica, com a gravidade variável atribuída ao pleiotropismo gênico dos pacientes. Logo, alguns pacientes apresentam alterações gênicas variadas que podem refletir na melhora ou não do fenótipo apresentado. O estudo investigou polimorfismos gênicos em moléculas de adesão (VCAM-1 e ICAM-1) e citocinas (TNF-alfa e IL-8) correlacionando-os aos níveis séricos das citocinas, parâmetros hematológicos e manifestações clinicas apresentadas em um grupo de pacientes pediátricos com anemia falciforme em Salvador-Bahia. No estudo foram investigados 125 pacientes pediátricos com anemia falciforme e 212 indivíduos sadios da população de Salvador. Os polimorfismos gênicos foram investigados por PCR-RFLP. Os níveis séricos das citocinas foram avaliados por ELlSA. As análises estatísticas foram realizadas pelo programa EPI-INFO versão 6.04 e a significância foi estabelecida para p < 0,05. Do total de 125 pacientes analisados, 27 (22 por cento) foram heterozigotos para o polimorfismo -833 na região promotora do gene da VCAM-1; 15 (12 por cento) foram heterozigotos para o polimorfismo 1238 no gene da VCAM-1; 50 (40 por cento) foram heterozigotos e oito (2 por cento) homozigotos para o polimorfismo 469 no gene da ICAM-1; 30 (24 por cento) foram heterozigotos e dois (2 por cento) homozigotos para o polimorfismo -308 na região promotora do gene do TNF-alfa; 66(53 por cento) foram heterozigotos e 43 (34 por cento) homozigotos para o polimorfismo -251 na região promotora do gene da IL-8. Nossos resultados demonstraram que não houve associação estatística entre os polimorfismos -308 na região promotora do gene do TNF-alfa e -251 na região promotora do gene da IL-8 e os níveis séricos das citocinas...

Serum paraoxonase 1 level and genetic polymorphisms in chronic hepatitis patients

Paraoxonase [PON] is an ester hydrolase that catalyzes the hydrolysis of organophosphorus compounds, unsaturated aliphatic esters and carbamates. PON gene family contains three members: PON1, PON2 and PON3. PON I is tightly bound to HDL in serum to confer protection for LDL against oxidation. The liver plays a key role in PON1 synthesis as PON1 gene expression was only observed in the liver. The aim of this work was to investigate the relationship between serum PON1 level and the degree of liver damage in patients with chronic hepatitis, to study the genetic variability of serum PON1 and to evaluate the efficiency of serum PON1 assay in comparison with standard liver function tests in the assessment of liver damage. Thirty seven chronic hepatitis patients were included in this study. They were classified into; Group I: chronic hepatitis patients without cirrhosis [n = 21] and Group II: chronic hepatitis patients with cirrhosis [n = 16] and their results were compared to those of 15 healthy controls. Serum PON1 assay and PON1 genotyping for transitions at 192 and 54 positions were done for all subjects in addition to standard liver function tests including : total protein [TP], serum albumin [sAlb.], aspartate aminotransferase [AST], alanine aminotransferase [ALT], alkaline phosphatase [ALP], total bilirubin [T bil.] and direct bilirubin [D bil.]. PON1 serum levels were significantly decreased in Group I compared to controls [p < 0.01, 52.5% decrease] and such decrease was even exaggerated in Group II when compared to controls [p < 0.01, 67% decrease]. Moreover, serum PON1 had significant positive correlations with TP and sAlb. and significant negative correlations with AST, ALT, ALP, T bil. and D bil. in patients' group [Group I and II together]. Regarding genotypes and allele frequencies for PONl enzyme at two polymorphic positions PONl[192] and PONl[54] in patients' and control groups, there were no significant differences in genotype or allele frequencies between patients and controls for either polymorphic site. Moreover the mean percent change of PONl level in different genotypes compared to controls in liver disease patients when reclassified according to genotypes was similar to percent decrease of PONl level independent of genotypes compared to controls [-52% in PONl in relation to 192 transition and -55% in PONl level in relation to 54 transition]. Moreover, different PONl genotypes [QQ, QR and RR for PONl[192] and LL, LM and MM for PON[154]] had significant positive correlations with TP and sAlb. and significant negative correlations with AST, ALT, ALP, T bil. and D bil. in patients' group. Stepwise multiregression analysis was performed in this study which revealed that serum PONl, AST and serum albumin constitute the best panel which can predict the presence of liver disease [F = 42.6, p < 0.01]. Moreover, diagnostic reliability for serum PONl and standard liver function tests were done at various cut off levels, Receiver Operator Characteristic Curve [ROC] was illustrated and area under the curve [AUC] was calculated for each parameter. In Group I, serum PONl had the best performance at 208 micro g/ml [80% sensitivity, 95% specificity and AUC = 0.89] followed by AST at 48 IU/L [72% sensitivity, 90% specificity and AUC - 0.85] and AUC for both parameters were significantly higher than AUC for the remaining parameters [p < 0.05]. In Group II, serum PONl performance was even better at cut off 139 micro g/ml [85% sensitivity, 95% specificity and AUC = 0.96] and its AUC was significantly higher than other parameters [p < 0.05]. There was a significant decrease of serum PONl level in chronic hepatitis patients [Group I and Group II] related to the degree of hepatic dysfunction irrespective of allele or genotype differences at positions 192 and 54 amino acids. Moreover, serum PONl, AST and sAlb. were found to be the best panel to predict the presence of chronic liver disease. Supporting this issue, the diagnostic performance of serum PONl followed closely by AST was the best in Group I, while the performance of serum PONl was far superior to that of other tests in Group II indicating a better over all performance for PONl for diagnosis of chronic liver disease specially severe forms [liver cirrhosis]. Hence, the addition of serum PONl assay to the current battery of liver function tests may improve the evaluation of chronic hepatitis patients

Modulación de los niveles de lípidos y lipoproteinas por el polimorfismo de la apolipoproteina E en individuos sanos de Bogota / Modulation of the lipids levels and lipoproteins for the polymorphism of the apolipoprotein E in healthy individuals from Bogotá

El objetivo del presente trabajo fue estudiar el efecto del polimorfismo genético de la Apolipoproteína E ApoE) sobre los niveles plasmáticos de lípidos y lipoproteínas en una cohorte de 200 individuos adultos sanos (20-65 años) residentes en Bogotá D.C. La frecuencia de los alelos de la Apo E fue 0.05 para el alelo e2; 0.87 para el e3 y 0.08 para el alelo e4. Los individuos se clasificaron de acuerdo al genotipo de la ApoE en:E3/2, E3/3, E4/3, E4/4 y E4/2, el genotipo de mayor frecuencia fue el E3/3 (77.1)porciento Al comparar lacolesterolemia entre los sujetos E3/2, E3/3 y E4/3 se observaron niveles incrementados significativamente(p<0.05) en el grupo E4/3 (172.1±16.9) comparados con los del grupo E3/2 (148.7±32.1). Los niveles detriglicéridos presentaron una tendencia hacia niveles más altos en los individuos con genotipo Apo E4/3 alcómpralos con E3/3 y E3/2. En la población estudiada, el polimorfismo de la ApoE es un importante determinante genético de los niveles plasmáticos de lípidos y lipoproteínas, es así como la presencia del alelo e4 dela Apo E puede influir en el incremento de los niveles de colesterol total, colesterol-LDL y triglicéridos siendo un factor de riesgo de enfermedad cardiovascular

Doença granulomatosa crônica da infância: novos polimorfismos no gene NCF2 / Chronic granulomatous disease of childhood: new polymorphisms in NCF2 gene

Objetivos: Mutações no gene NCF2 resultam na forma autossônica recessiva da doença granulomatosa crônica da infância. Além de mutações conhecidas, descreveu-se em pacientes com doença granulomatosa crônica da infância duas novas substituições no gene NCF2. O objetivo deste estudo foi investigar se estas substituições constituem polimorfismos do gene NCF2. Métodos: Investigamos a freqüência de duas substituições na seqüência do gene NCF2 em 214 doadores sadios. A primeira é uma transição de C T na posição -23 da região 5' reguladora. A segunda é uma transição de A G na posição -21 da região 3' terminal do íntron 10. Extraímos DNA genômico de células do sangue periférico. O DNA foi amplificado por meio de PCR com primers específicos para o gene NCF2, analisado quanto à presença de polimorfismos conformacionais de cadeias simples, digerido com endonucleases específicas e sequenciado. O cálculo das freqüências genotípicas e alélicas seguiu a lei de Hardy e Weinberg. Resultados: Cem indivíduos foram avaliados quanto à presença da transição C T na posição -23 da região 5' reguladora; sendo 67 porcento homozigotos para o alelo c, 32 porcento heterozigotos, e apenas 1 porcento homozigoto para T. Cento e quatorze indivíduos foram analisados quanto à presença da transição A G na posição -21 da região 3' terminal do íntron 10; dos quais 36 porcento foram homozigotos para A, 43 porcento heterozigotos e 21 porcento homozigotos para G. Conclusão: Considerando as freqüências alélicas, concluímos que essas variantes correspondem a polimorfismos do gene NCF2. Suas possíveis implicações na expressão do gene NCF2 constituem objeto de pesquisa atual em nosso laboratório.

Genetics and colorectal cancer (HNPCC) in adolescence: a case report

Os autores relatam um caso de cancer do colon em uma doente com 17 anos de idade sem polipose ou historia familiar previa. Por tratar-se do primeiro caso desta familia, foi aventada a hipotese de um caso de HNPCC. A reacao da cadeia de polimerase (PCR) do tumor demonstrou alteracoes em quatro regioes polimorficas. A analise de duas destas regioes revelou a perda de material genetico evidenciando-se a presenca de instabilidade, sugerindo HNPCC. Submetida a ileo-retoanastomose e quimioterapia adjuvante com boa evolucao. Os autores discutem a importancia da historia familiar, do estudo genetico, da imuno-histoquimica e da instabilidade de microssatelites em pacientes jovens com cancer colorretal

Aplicación del polimorfismo enzimático en el transplante de médula osea alogenico / Enzymatic polymorphism study in homologous bone marrow transplantation

A 6 donantes y receptores de trasplante de médula ósea (TMO) se les realizó el estudio del polimorfismo enzimático eritrocitario (hemoglobina, haptoglobina, glucosa 6 fosfato deshidrogenasa, glyoxalasa I, estearasa D, fosfoglucomutasa y fosfatasa ácida). En 5 casos (83,3 por ciento ) se encontraron alelos diferentes al menos en una enzima. En uno de estos TMO se encontraron diferencias en 4 marcadores. La detección de los alelos del donante en el receptor en los 5 casos se observó en las primeras semanas posteriores a la realización del TMO. Estos resultados demuestran la utilidad de este estudio para establecer el diagnóstico precoz de implantación del transplante y sugieren la posibilidad de su empleo en el seguimiento evolutivo del paciente trasplantado