Rio Negro virophage: Sequencing of the near complete genome and transmission electron microscopy of viral factories and particles

ABSTRACT Rio Negro virophage (RNV) was co-isolated with a strain of mimivirus named sambavirus, from Brazilian Amazon. We report the near complete genome sequence of RNV, the first virophage isolated in Brazil. We also present new microscopical data demonstrating that RNV particles have similar dimensions to that described to sputnik virophages.

Chikungunya Outbreak in Pakistan

The Chikungunya outbreak reported from Pakistan [Please see weekly epidemiological monitor-issue no 01; volume-10; 01 January 2017] showed a slight peak in recent time with additional cases reported. A total of 2,267 cases were notified to WHO from 19 December 2016 to 05 May 2017. All the cases have been reported from Karachi, Sindh Province

Development and Evaluation of Indirect ELISA for Detection of Antibodies to Getah Virus in Horse Serum

Getah virus (GETV) is a member of the genus Alphavirus in the family Togaviridae. GETV infection can occur in a wide range of vertebrate species, and the virus has been known for a pathogen of horses and pigs. To rapidly and accurately diagnose GETV infection of a racehorse, an indirect ELISA (I-ELISA) was developed in the present study for detection of antibodies to GETV in serum samples. To evaluate the developed I-ELISA, a total of 240 serum samples from Thoroughbred racehorses raised in Korea were screened in parallel by a serum neutralization (SN) test. The developed I-ELISA exhibited an efficacy comparable to that of the SN test in terms of a high diagnostic sensitivity (86.3%) and specificity (94.5%) at a cut-off absorbance value of 0.25. In addition, our results showed that the developed I-ELISA had a significant correlation with the SN test (r = 0.91; p < 0.05). Taken together, our findings suggest that the I-ELISA developed in this study is a valuable diagnostic tool for the screening of horses suspected to be infected with GETV.

Chlkungunya in Somalia

During the month of May 2016, Somalia reported few sporadic cases of Chikungunya from its capital city–Mogadishu. At-least 11 blood samples were tested positive for chikungunya at the Kenya Medical Research Institute [KEMRI]. The tests were done using Real Time PCR as well as ELISA

A three-month follow up of musculoskeletal manifestions in chikungunya fever

BACKGROUND: Chikungunya virus (CHIKV) is a mosquito- borne  alphavirus  of  the  family  Togaviridae  transmitted  to humans by the Aedes spp. mosquitoes, causing Chikungunya   Fever  (CHIKF).OBJECTIVE: This study aims to describe the course and outcome of musculoskeletal (MSK) manifestations in patients  with  CHIKF  seen  over  a   three-month     period.DESIGN: This is a prospective descriptive  study.  Seventy  patients  with  fever,  rash,  and  arthritis  seen   at the University of the Philippines-Philippine General Hospital  and  private  arthritis  clinics  were  collected from August - December 2012.  Demographics  and course   of   arthritis   were  described.RESULTS:  Seventy   patients,   53   (68.6%)   female,   with  a mean age  of  39.2  ±13.50  were  diagnosed  with CHIKF. All cases were from the Metropolitan  Manila area. Of these, 15 (21.4%) had  family  members  affected. Twenty-four patients (34.3%) were either employed or students. The most common presenting symptoms were fever (94.3%), arthritis or athralgia  (98.6%), and rash (87.1%).  The  most  common  joint  areas involved were the ankles  (60.0%),  the  wrists (40.0%) and the small joints of the hand (51.4%). Twenty-seven (47.3%) had symmetric  arthritis.  Thirty- seven   cases   (52.9%)   had   arthralgia   or   arthritis    for at least  six  weeks.  By  the  end  of  the  follow-up  period, only four (5.7%) had persistent musculoskeletal symptoms. Age and  sex  were not  found to  be  factors in  determining  chronicity  of  arthritic  symptoms  (p   =   0.104   and   p=0.58  respectively). Of the seventy patients, 31 (44. 3%) were confirmed  cases  of  CHIKF--  29 had  (+)   CHIKV  IgM   by ELISA,  and  two   had   (+)   CHIKV   PCR.   Twenty-  one (67.7%) had  persistent  arthritis  of  at least  six  weeks. Treatment  consisted  of continuous  NSAIDs  for  at  least  two   weeks   and   some   received   steroids.  In this subgroup, age and sex were not shown to  correlate with chronic arthritis (p=0.47 and p=0.05 respectively).CONCLUSION: This report on a recent outbreak of CHIKF showed the classic triad of fever, rash,  and  arthritis.  There  was  no  correlation  between  age  and  chronicity of  arthritic  symptoms.  Sex,  likewise,  did  not  appear   to influence chronicity. The disease occurred in family clusters. Patients required continuous treatment with NSAIDs and  some  had  to  be given  steroids.  Most cases   resolved   by   12 weeks.

Zoonotic encephalitides caused by arboviruses: transmission and epidemiology of alphaviruses and flaviviruses

In this review, we mainly focus on zoonotic encephalitides caused by arthropod-borne viruses (arboviruses) of the families Flaviviridae (genus Flavivirus) and Togaviridae (genus Alphavirus) that are important in both humans and domestic animals. Specifically, we will focus on alphaviruses (Eastern equine encephalitis virus, Western equine encephalitis virus, Venezuelan equine encephalitis virus) and flaviviruses (Japanese encephalitis virus and West Nile virus). Most of these viruses were originally found in tropical regions such as Africa and South America or in some regions in Asia. However, they have dispersed widely and currently cause diseases around the world. Global warming, increasing urbanization and population size in tropical regions, faster transportation and rapid spread of arthropod vectors contribute in continuous spreading of arboviruses into new geographic areas causing reemerging or resurging diseases. Most of the reemerging arboviruses also have emerged as zoonotic disease agents and created major public health issues and disease epidemics.

UNA virus: first report of human infection in Argentina

Una virus (UNAV), Togaviridae family, is widely distributed in South America, where infections have been detected in mosquitoes and vertebrate hosts (humans, birds and horses). We analyzed human sera from Córdoba inhabitants aged 44 to 89 years and using a neutralization test, we found a prevalence of UNAV antibodies of 3.8 percent (3/79). The low titers detected suggest past infections probably acquired in rural areas of the Province of Córdoba (central Argentina). None sera were found positive for MAYV neutralizing antibodies. This is the first report of human infections by UNAV in Argentina

Vigilancia epidemiológica de la encefalitis equina venezolana / Vigilance epidemiological of the encephalic equine venezuelan

Los brotes ocurridos en 1998, permiten enfatizar la necesidad de mantener las actividades de vigilancia que derivan en una prevención y control de la enfermedad, donde la vacunación de la población ariesgo (équidos susceptibles) y la vigilancia entomológica de la fauna vectorial deben ser incluidas como una prioridad dentro de las políticas sanitarias en ejecución

Inquérito sorológico de rubéola na era pré-vacinaçäo, em creches, escolas e maternidades de Fortaleza / Serologic survey of rubella in the pre-vacine era in child-care centers, schools and maternity units of Fortaleza

Objetivo: identificar a prevalência de rubéola em diversas idades e grupos populacionais e a suscetibilidade de mulheres gestantes e puérpuras segundo idade, número de filhos e aborto espoatâneo. Métodos: Estudo transversal de tipo inquérito sorológico. Pré-escolares e escolare foram selecionados em creches e escolas públicas distribuídas por distritos sanitários de Fortaleza. As gestantes e puérperas saudáveis foram recrutadas em duas grandes maternidades e três ambulatórios públicos de pré-natal. Indivíduos previamente vacinados e portadores de doenças crônicas ou agudas foram excluídos. Foi obtido consentimento escrito de todos os participantes ou responsáveis. Para detecçäo qualitativa de IgG sérica anti-rubéola utilizou-se método Elisa-indireto. Resultados: As soroprevalências médias por idade de 999 amostras foram 2 a 5 anos=59 por cento (136/231); 6 a 9 anos=53 porcento (109/204); 10 a 19 anos=56 por cento (243/432); e 20 a 39 anos=80 por cento (106/132). A idade média de 187 gestantes e puérperas foi de 23 anos (10-39) com soroprevalência de 76 por cento (142/187), 62 por cento no grupo de 15-19 anos e 83 por cento no grupo de 26-39 anos. Uma maior soroprevalência esteve associada à maior idade materna (p<0,001), a história de aborto e espotâneo (p=0,03) e a 2 ou mais filhos (p=0,01). Conclusöes: A elevada soroprevalência em pré-escolares revela a intensa transmissäo do vírus nas creches. A alta uscetibilidade nos adolescentes (45 por cento), entre os quais a gravidez é freqüênte, enfatiza a necessidade de se introduzir a vacina precocemente e manter elevada cobertura nos jovens, visando erradicar a rubéola congênita. Igualmente, a vacinaçäo rotineira das puérperas nesse grupo etário é particularmente benéfica.

Importancia de la microscopía electrónica de transmisión en el diagnóstico de la epidemia de encefalitis equina venezolana de 1995 en la Guajira Venezolana / The importance of transmission electron microscopy in the diagnosis of venezuelan equine encephalitis during the epidemic of 1995 in the venezuelan Guajira

Se estudió con el microscopio electrónico de transmisión el cerebro de 25 ratones lactantes, inoculados intercerebralmente con el sobrenadante de células VERO cultivadas e infectadas con el virus de la EEV, como control positivo, con muestras de suero o líquido cefalorraquídeo de pacientes con síntomas y signos de encefalitis, con sueros de pacientes sanos, con sueros de equinos enfermos y con solución borato-salina de albúmina bovina, como control negativo. Las muestras se tomaron del brote epizoótico y epidémico en Octubre del año 1995 en la región de la Guajira Venezolana al norte del Estado Zulia. El estudio ultraestructural se hizo a ciegas, pero, confirmo la presencia de pacientes de Togavirus en el 100 por ciento de los casos examinados cuando correspondían a muestras virológicamente positivas. Se destaca la utilidad, precisión y la rapidez del método empleado

Alteraciones feto-placentarias inducidas en ratas por la cepa TC-83 del virus de la encefalitis equina venezolana / Fetal-placental alteration induced in rat by venezuelan equine encephalitis virus strain TC-83

El estudio macroscópico y microscópico de los fetos de ratas Sprague-Dawley inoculadas con el virus de la EEV, cepa Guajira y cepa atenuada TC-83 demostró, durante la primera semana de gestación, muerte y reabsorción de todos los fetos con cepa Guajira y una disminución considerable en el número de crías, cuando se inocularon con la cepa TC-83. El estudio histológico del sistema nervioso central de las crías nacidas vivas, no demostró lesiones. Ratas inoculadas al 4to y 7mo día de gestación con TC-83 y sacrificadas el día de la gestación mostraron lesiones placentarias, principalmente, en los vasos miometriales en los fetos de aspecto viable, así como fuerte necrosis de otros fetos. Se compara la patogenia de la infección con el virus de la EEV a las lesiones inducidas en humanos por el virus de la rubéola y con estudios previos sobre el efecto intrauterino de otros Togavirus, y se destaca la necesidad de examinar cuidadosamente a las mujeres embarazadas y a sus hijos en las áreas de riesgo epidémico así como proscribir el uso de la vacuna TC-83 durante la gestación

Efecto teratogénico del virus de la encefalitis equina venezolana: una revisión del problema / The teratogenic effect of venezuelan equine encephalitis virus: a review of the problem

Se describen las características clínicas de la encefalitis equina venezolana (EEV) y la capacidad teratogénica de diversos Togavirus. Se destaca la similitud entre las alteraciones intrauterinas inducidas por el virus de la EEV y el de la rubeola. Se señalan las observaciones descritas en 1967 por Wenger sobre necrosis cerebral masiva en fetos de mujeres que presumiblemente habían padecido de encefalitis y se describe el desarrollo de un modelo experimental en ratas a finales de la década de 1970-1980. La patogenia de la infección intrauterina parece relacionarse con alteraciones vasculares placentarias y del sistema nervioso central en ratas sobrevivientes a la infección viral; se destaca la similitud entre estos hallazgos y lesiones vasculares cerebrales descritas en niños con síndrome de rubeola congénita. Se hace énfasis en la necesidad de estudios multidisciplinarios en las áreas endémicas de EEV como una vía para detectar secuelas del efecto del virus in utero. Finalmente se proponen algunos modelos experimentales en animales para esclarecer diversos aspectos sobre el efecto intrauterino provocado por el virus de la EEV

Uso de células de Aedes albopictus C6/36 na propagaçäo e classificaçäo de arbovirus das famílias Togaviridae, Flaviviridae, Bunyaviridae e Rhabdoviridae / The use of Aedes albopictus C6/36 cells in the propagation and classification of arbovirus of the Togaviridae, Flaviviridae, Bunyaviridae and Rhabdoviridae families

Colônias de células de mosquito Aedes albopicus C6/36 foram infectadas com 23 arbovirus, sendo 19 destes existentes no Brasil, pertencentes às famílias Togavitidae, Flaviviridae, Bunyaviridae e Rhabdoviridae. A Replicaçäo viral foi detectada por imunofluorescência indireta com todos os vírus estudados enquanto que o efeito citopático foi observado durante a infecçäo por alguns deste. No teste de imunofluorescência indireta utilizou-se fluidos ascíticos imunes de camundongos, especificos para os vírus estudados. A replicaçäo viral caracterizada por grande produçäo de antígeno recomenda a utilizaçäo de células C6/36 na propagaçäo e em tentativas de isolamento desses arbovírus. A técnica de imunofluorescência ofereceu subsídios na classificaçäo e identificaçäo de vírus que replicam nestas células

O uso do teste imunoenzimático na vigilância epidemiologica de arboviroses / The use of enzyme-linked immunosolvent assay in the epidemiologic surveillance of arbovirus

Realizou-se revisäo bibliográfica sobre a utilizaçäo do teste imunoenzimático, ELISA na vigilância Epidemiológica de infecçöes causadas por arbovírus da família Flaviviridae, gênero Flavivirus e da Família Togaviridae, gênero Alphavirus. O teste tem sido empregado na pesquisa de anticorpos humanos, de anticorpos e antígenos em reservatórios näo humanos e na identificaçäo de antígenos e da fonte alimentar de mosquitos vetores. Analisou-se o desempenho de ELISA comparando-o a técnicas empregadas para identificaçäo de anticorpos e antígenos de arbovirus. O teste apresentou 100,0 por cento de sensibilidade e especificidade média de 84,5 por cento na identificaçäo de anticorpos anti-Alphavirus em humanos. Foi muito sensível para Flavivirus, com valor médio de 95,2 por cento e especificidade média de 77,6 por cento. Na identificaçäo de anticorpos anti-arbovirus em reservatórios näo humanos, ELISA mostrou sensibilidade de 100,0 por cento e especificidade de 97,4 por cento e na pesquisa de antígenos virais em mosquitos vetores, especificidade média de 93,6 por cento e sensibilidade média de 76,5 por cento. Apresentou alto valor preditivo positivo, observado no cálculo da média dos valores apresentados nos trabalhos em que esse parâmetro foi pesquisado e obteve-se um resultado de 89,0 por cento. No estudo da reprodutividade do teste, observou-se coeficiente de variaçäo de 3,0 a 14,0 por cento nos resultados

Propagacion del virus Pixuna en cultivos de embrion de raton. / Replication of Pixuna virus in mice embryo cells culture

Se estudio el comportamiento de cultivos de embrion de raton albino suizo, entre 11 y 18 dias de gestacion. infectados con el virus Pixuna. El cultivo de embrion de 11 dias resulto permisivo, dando una infeccion productiva y citocidica; el de 12 dias no mostro un efecto citopatico claro, y entre los 13 y los 18 dias, los cultivos resultaron ser permisivos, con una infeccion produtiva pero no citocidica. Se encontro que la fase de eclipse para el virus Pixuna en cultivo de embriones de 11 dias, estuvo entre los 15 y 90 min posteriores a la hora de adsorcion. La D-glucosamina no afecto el titulo infectivo del virus, usando embriones de 11 dias de edad como cultivo

Fracciones de cerebro de raton que inhiben inespecificamente la hemaglutinacion de algunos togavirus. / Mouse brain fractions of mice inhibiting inespecifically the hemagglutination of some togairridae

Se estudiaron fracciones obtenidas de cerebro de raton albino suizo de 10 dias de edad desde el punto de vista fisico, quimico y biologico. Se confirmo su constitucion predominantemente proteica; cuando la alfa-quimotripsina actua sobre ellas por un lapso de 120 segundos, se liberan aminoacidos y/o pequenos peptidos, perdiendose la propiedad biologica de inhibir la hemaglutinacion del virus de la encefalitis equina del este. Se demostro que la fraccion biologicamente activa contiene glico y lipoproteinas. El tratamiento con SDA destruyo las lipotroteinas y expuso grupos glicoproteicos. Las fracciones calentadas evidenciaron mas grupos neuraminicos, que reaccionan con la o-fenantrolina, absorbiendo mas al UV. Se comprobo la presencia de lipidos neutros que no fueron identificados. El punto isoionico dio un valor de 4,16 +/- 0,17, indicativo de la presencia de grupos acidos