Columbianadin ameliorates experimental acute reflux esophagitis in rats via suppression of NF-κB pathway

Purpose: Reflux esophagitis is a condition characterized by inflammation and irritation of the esophagus, resulting from the backflow of stomach acid and other gastric contents into the esophagus. Columbianadin is a coumarin derivative that exhibits anti-inflammatory and antioxidant effects. In this study, we tried to scrutinize the protective effect of Columbianadin against acute reflux esophagitis in rats. Methods: RAW 264.7 cells were utilized to assess cell viability and measure the production of inflammatory parameters. The rats received anesthesia, and reflux esophagitis was induced via ligation of pylorus and fore stomach and corpus junction. Rats received the oral administration of Columbianadin (25, 50 and 100 mg/kg) and omeprazole (20 mg/kg). The gastric secretion volume, acidity, and pH were measured. Additionally, the levels of oxidative stress parameters, cytokines, and inflammatory markers were determined. At the end of the study, mRNA expression was assessed. Results: Columbianadin remarkably suppressed the cell viability and production of tumor necrosis factor-α (TNF-α), interleukin (IL)-1ß, IL-6, cyclooxygenase-2 (COX-2), inducible nitric oxide synthase (iNOS), and prostaglandin (PGE2). Columbianadin treatment remarkably suppressed the secretion of gastric volume, total acidity and enhanced the pH level in the stomach. Columbianadin remarkably altered the level of hydrogen peroxidase, free iron, calcium, and plasma scavenging activity, sulfhydryl group; oxidative stress parameters like malonaldehyde, glutathione, superoxide dismutase, catalase, glutathione peroxidase; inflammatory cytokines viz., TNF-α, IL-6, IL-1ß, IL-10, IL-17, and monocyte chemoattractant protein-1; inflammatory parameters including PGE2, iNOS, COX-2, and nuclear kappa B factor (NF-κB). Columbianadin remarkably (P < 0.001) suppressed the mRNA expression TNF-α, IL-6, IL-1ß and plasminogen activator inhibitor-1. Conclusions: Columbianadin demonstrated a protective effect against acute reflux esophagitis via NF-κB pathway.

The Role of Mothers' Socioeconomic Class on their Children's Dental Health

ABSTRACT Objective: To assess the relationship between the mother's educational level and family income on the dental caries experience of their children. Material and Methods: A cross-sectional study was conducted at the Department of Pediatric Dentistry, University of Babylon, Iraq. The sample comprised 100 children aged 5-15 years. Data was collected in two parts: first, a self-administered questionnaire was obtained from mothers: Mother's age, level of education, family income, child age, and gender. Another part included the clinical examination of dental caries that was measured for mothers and their children using the DMFT/dmft index for permanent and primary dentition sequentially. The collected data were statistically analyzed using mean ± standard deviation (SD mean and standard deviation, t-test, and F-test. Results: The sample showed 60% were boys and 40% were girls, 86% with dental caries. Mothers with a high level of education and high monthly income have significantly lower dental caries experiences than their children (p<0.05). In contrast, there was a significant difference between the two age groups (p=0.000), a considerable difference between the level of family monthly income and dmft (p=0.01), and there was a correlation value between the caries index DMFT value of the children and their mother with mother's education level. Conclusion: Many dental caries were reported among Babylon City/Iraq children. Mothers with high educational levels and family monthly income were correlated to lower dental care for their children than those with low educational levels and economic status, so they need to focus on oral health knowledge and encourage prophylactic intervention and preventive measures for the population.

Combined administration of gallic acid and glibenclamide mitigate systemic complication and histological changes in the cornea of diabetic rats induced with streptozotocin

Purpose: To determine the effect of gallic acid or its combination with glibenclamide on some biochemical markers and histology of the cornea of streptozotocin (STZ) induced diabetic rats. Methods: Following induction of diabetes, 24 male albino rats were divided into four groups of six rats each. Groups 1 and 2 (control and diabetic) received rat pellets and distilled water; group 3 (gallic acid) received rat pellets and gallic acid (10 mg/kg, orally) dissolved in the distilled water; and group 4 (gallic acid + glibenclamide) received rat pellets, gallic acid (10 mg/kg, orally), and glibenclamide (5 mg/kg, orally) dissolved in the distilled water. The treatments were administered for three months after which the rats were sacrificed after an overnight fast. Blood and sera were collected for the determination of biochemical parameters, while their eyes were excised for histology. Results: STZ administration to the rats induced insulin resistance, hyperglycemia, microprotenuria, loss of weight, oxidative stress, inflammation, and alteration of their cornea histology, which was abolished following supplementation with gallic acid or its combination with glibenclamide. Conclusions: The study showed the potentials of gallic acid and glibenclamide in mitigating systemic complication and histological changes in the cornea of diabetic rats induced with STZ.

Adrenal morphology and cortical function in patients with extrapulmonary tuberculosis: response to antituberculosis treatment

ABSTRACT Objective: Enlargement of the adrenal glands and variable adrenocortical function have been reported in patients with pulmonary tuberculosis and, in a few studies, in patients with extrapulmonary tuberculosis (EPTB). However, none of the studies have evaluated the course of the adrenal morphology in these patients. Subjects and methods: Prospective study including 37 patients with EPTB and 37 healthy age- and sex-matched controls. The adrenal function was evaluated by measurement of cortisol levels at baseline and after stimulation with ACTH (Acton Prolongatum) before and 6 months after antituberculosis treatment. The size of both adrenal glands was evaluated using 64-slice computed tomography (CT) scanning before and 6 months after treatment. The findings were compared with those in a group of healthy matched controls. Results: Clinical and biochemical parameters were comparable between groups. The mean baseline serum cortisol level was significantly lower in the EPTB group (397.1 ± 184.9 nmol/L) compared with the control group (696.3 ± 101.8 nmol/L). Compared with controls, patients with EPTB had significantly lower mean cortisol levels at baseline and 1 hour after ACTH, both before (397 ± 184.9 nmol/L and 750.7 ± 176.8 nmol/L, respectively) and after (529.7 ± 100.4 nmol/L and 1017.2 ± 119.7 nmol/L, respectively) antituberculosis treatment. Both the length and thickness of the right and left adrenal glands were greater in patients with EPTB than in controls but became comparable to those in controls after treatment completion. Conclusions: Patients with EPTB have an enlarged adrenal size and low baseline and stimulated serum cortisol levels. After treatment completion, cortisol levels increased significantly, and the adrenal size normalized in these patients.

Forest yield prediction under different climate change scenarios using data intelligent models in Pakistan

Abstract This study aimed to develop and evaluate data driven models for prediction of forest yield under different climate change scenarios in the Gallies forest division of district Abbottabad, Pakistan. The Random Forest (RF) and Kernel Ridge Regression (KRR) models were developed and evaluated using yield data of two species (Blue pine and Silver fir) as an objective variable and climate data (temperature, humidity, rainfall and wind speed) as predictive variables. Prediction accuracy of both the models were assessed by means of root mean squared error (RMSE), mean absolute error (MAE), correlation coefficient (r), relative root mean squared error (RRMSE), Legates-McCabes (LM), Willmotts index (WI) and Nash-Sutcliffe (NSE) metrics. Overall, the RF model outperformed the KRR model due to its higher accuracy in forecasting of forest yield. The study strongly recommends that RF model should be applied in other regions of the country for prediction of forest growth and yield, which may help in the management and future planning of forest productivity in Pakistan.

Resumo Este estudo teve como objetivo desenvolver e avaliar modelos baseados em dados para previsão da produção florestal em diferentes cenários de mudanças climáticas na divisão florestal Gallies do distrito de Abbottabad, Paquistão. Os modelos Random Forest (RF) e Kernel Ridge Regression (KRR) foram desenvolvidos e avaliados usando dados de produção de duas espécies (pinheiro-azul e abeto-prateado) como uma variável objetiva e dados climáticos (temperatura, umidade, precipitação e velocidade do vento) como preditivos variáveis. A precisão da previsão de ambos os modelos foi avaliada por meio de erro quadrático médio (RMSE), erro absoluto médio (MAE), coeficiente de correlação (r), erro quadrático médio relativo (RRMSE), Legates-McCabes (LM), índice de Willmott (WI) e métricas Nash-Sutcliffe (NSE). No geral, o modelo RF superou o modelo KRR devido à sua maior precisão na previsão do rendimento florestal. O estudo recomenda fortemente que o modelo RF seja aplicado em outras regiões do país para previsão do crescimento e produtividade florestal, o que pode ajudar no manejo e planejamento futuro da produtividade florestal no Paquistão.

Development of chitosan based microencapsulated spray dried powder of tuna fish oil: oil load impact and oxidative stability

Abstract The impact of fish oil concentration on the oxidative stability of microcapsules through the spray drying process using chitosan and maltodextrin as wall material was studied. Emulsions were prepared with different Tuna fish oil (TFO) content (TFO-10%, TFO20%, TF030% TF0-40%) while wall material concentration was kept constant. Microencapsulated powder resulting from emulsion prepared with high fish oil load have high moisture content, wettability, total oil and low encapsulation efficiency, hygroscopicity and bulk tapped density. Oxidative stability was evaluated periodically by placing microcapsules at room temperature. Microcapsules prepared with TFO-10% presented high oxidative stability in terms of peroxide value (2.94±0.04) and anisidine value (1.54±0.02) after 30 days of storage. It was concluded that optimal amounts of fish oil for microencapsulation are 10% and 20% using chitosan and maltodextrin that extended its shelf life during study period.

Resumo Foi estudado o impacto da concentração de óleo de peixe na estabilidade oxidativa de microcápsulas por meio do processo de secagem por atomização, utilizando quitosana e maltodextrina como material de parede. As emulsões foram preparadas com diferentes teores de óleo de atum (TFO) (TFO-10%, TFO20%, TF030% TF0-40%), enquanto a concentração de material de parede foi mantida constante. O pó microencapsulado resultante da emulsão preparada com alta carga de óleo de peixe tem alto teor de umidade, molhabilidade e óleo total e baixa eficiência de encapsulação, higroscopicidade e densidade extraída a granel. A estabilidade oxidativa foi avaliada periodicamente colocando microcápsulas à temperatura ambiente. As microcápsulas preparadas com TFO-10% apresentaram alta estabilidade oxidativa em termos de valor de peróxido (2,94 ± 0,04) e valor de anisidina (1,54 ± 0,02) após 30 dias de armazenamento. Concluiu-se que as quantidades ideais de óleo de peixe para microencapsulação são de 10% e 20% usando quitosana e maltodextrina que prolongaram sua vida útil durante o período de estudo.

Isolation and characterization of bacteria associated with silkworm gut under antibiotic-treated larval feeding

Abstract The impact of antibiotics on growth, cocoon production was assessed in addition to isolation and characterization of bacteria associated with silkworm gut of infected larvae. Larval rearing was maintained at recommended conditions of temperature and humidity. Silkworm larvae showing abnormal symptoms were collected from the control group and dissected for gut collection. Bacteria were isolated from the gut content by spreading on agar plates and incubated at 37 °C for 48 hrs. Bacterial identification and phylogenetic analysis were carried out by 16S rRNA gene sequencing. The isolated bacteria were subjected to antimicrobial susceptibility test (disc diffusion methods) by using Penicillin (10 µg/mL), Tetracycline (30 µg/mL), Amoxicillin (25 µg/mL), Ampicillin (10 µg/mL), and Erythromycin (15 µg/mL). All isolated strains showed positive results for the catalase test. We isolated and identified bacterial strains (n = 06) from the gut of healthy and diseased silkworm larvae. Based on the 16S rRNA gene sequence, isolated bacteria showed close relation with Serratia, Bacillus, and Pseudomonas spp. Notably, 83.3% of strains were resistant to Penicillin, Tetracycline, Amoxicillin, Ampicillin, and Erythromycin but 16.6% showed antibiotic susceptibility to the above-mentioned commonly used antibiotics. Silkworm larvae fed on penicillin-treated leaves showed significant improvement in larval weight, larval length, and cocoon production. Significantly higher larval weight (6.88g), larval length (5.84cm), and cocoon weight (1.33g) were recorded for larvae fed on leaves treated with penicillin as compared to other antibiotics. Isolated bacterial strains showed close relation with Serratia spp., Bacillus spp. and Pseudomonas spp.

Resumo O impacto dos antibióticos no crescimento e na produção do casulo foi avaliado, além do isolamento e caracterização das bactérias associadas ao intestino de larvas infectadas do bicho-da-seda. A criação das larvas foi mantida nas condições recomendadas de temperatura e umidade. As larvas do bicho-da-seda com sintomas anormais foram coletadas do grupo controle e dissecadas para coleta do intestino. As bactérias foram isoladas do conteúdo intestinal por espalhamento em placas de ágar e incubadas a 37° C durante 48 horas. A identificação bacteriana e a análise filogenética foram realizadas pelo sequenciamento do gene 16S rRNA. As bactérias isoladas foram submetidas a teste de sensibilidade antimicrobiana (métodos de difusão em disco) com penicilina (10 µg / mL), tetraciclina (30 µg / mL), amoxicilina (25 µg / mL), ampicilina (10 µg / mL) e eritromicina (15 µg / mL). Todas as cepas isoladas apresentaram resultados positivos para o teste da catalase. Isolamos e identificamos cepas bacterianas (n = 06) do intestino de larvas de bicho-da-seda saudáveis e doentes. Com base na sequência do gene 16S rRNA, as bactérias isoladas mostraram estreita relação com Serratia, Bacillus e Pseudomonas spp. Notavelmente, 83,3% das cepas eram resistentes a penicilina, tetraciclina, amoxicilina, ampicilina e eritromicina, mas 16,6% mostraram suscetibilidade aos antibióticos comumente usados mencionados acima. As larvas do bicho-da-seda alimentadas com folhas tratadas com penicilina apresentaram melhora significativa no peso larval, comprimento larval e produção de casulo. Peso larval significativamente maior (6,88g), comprimento larval (5,84cm) e peso do casulo (1,33g) foram registrados para larvas alimentadas com folhas tratadas com penicilina, em comparação com outros antibióticos. Cepas bacterianas isoladas mostraram estreita relação com Serratia spp., Bacillus spp. e Pseudomonas spp.

Genetic variations and phylogenetic relationship of genus Uromastyx from Punjab Pakistan

Abstract During the present study, specimens were collected from selected sites of Cholistan desert and Kalabagh Game Reserve, Punjab province, Pakistan. Each captured specimen was tagged with voucher number and morphometric measurements were taken. The average snout to vent length was 172.559±1.40 mm and average weight was 92.1±1.30 g. The DNA of Uromastyx hardwickii was amplified and sequenced using 16S rRNA primer set. The obtained DNA sequence has shown reliable and clear species identification. After trimming ambiguous bases, the obtained 16S rRNA fragment was 520 bp while 16S rRNA fragments aligned with closely matched sequence from NCBI comprised of 510 bp. Closely matched sequences of genus Uromastyx were retrieved from NCBI in blast searches. Neighbour-joining tree of genus Uromastyx was constructed based on p-distance using MEGA X. The mean intraspecific variation was 0.095±0.01 while intraspecific variation was ranging from 0-1%. Similarly, interspecific variation of Uromastyx hardwikii with Saara asmussi, Uromastyx alfredschmidti, Uromastyx geyri, Uromastyx thomasi, Uromastyx alfredschmidti was 0-12%, 0-19%, 0-19%, 0-20%, 12-19% respectively. The newly produced DNA was submitted to NCBI and accession number was obtained (MW052563.1). Results of current study provided information about the molecular and morphological identification of Genus Uromastyx. In our recommendation, comprehensive molecular based identification of Pakistans reptiles is required to report any new or subspecies from country.

Resumo Durante o presente estudo, os espécimes foram coletados em locais selecionados do deserto do Cholistan e da Reserva de Caça de Kalabagh, província de Punjab, Paquistão. Cada espécime capturado foi etiquetado com o número do comprovante e medidas morfométricas foram realizadas. O comprimento médio do focinho à cloaca foi de 172,559 ± 1,40 mm, e o peso médio foi de 92,1 ± 1,30 g. O DNA de Uromastyx hardwickii foi amplificado e sequenciado usando o conjunto de primer 16S rRNA. A sequência de DNA obtida mostrou identificação de espécies confiável e clara. Após o corte de bases ambíguas, o fragmento de rRNA 16S obtido tinha 520 pb, enquanto os fragmentos de rRNA 16S alinhados com a sequência próxima do NCBI composta por 510 pb. Sequências semelhantes do gênero Uromastyx foram recuperadas do NCBI em pesquisas de explosão. A árvore de união de vizinhos do gênero Uromastyx foi construída com base na distância-p usando MEGA X. A variação intraespecífica média foi de 0,095 ± 0,01, enquanto a variação intraespecífica foi de 0-1%. Da mesma forma, a variação interespecífica de Uromastyx hardwikii com Saara asmussi, Uromastyx alfredschmidti, Uromastyx geyri, Uromastyx thomasi, Uromastyx alfredschmidti foi de 0-12%, 0-19%, 0-19%, 0-20%, 12-19%, respectivamente. O DNA recém-produzido foi submetido ao NCBI e o número de acesso foi obtido (MW052563.1). Os resultados do estudo atual forneceram informações sobre a identificação molecular e morfológica do Gênero Uromastyx. Em nossa recomendação, a identificação de base molecular abrangente de répteis do Paquistão é necessária para relatar qualquer nova ou subespécie do país.

Prevalence of parasites in selected captive bird species

Abstract Blood and fecal samples of chukar partridge (Alectoris chukar), albino pheasant (Phasianus colchicus), silver pheasant (Lophura nycthemera), rose-ringed parakeet (Psittacula krameri) and turkeys (Meleagris gallopavo) were analyzed to check parasitic prevalence. To record parasites these five avian species were placed kept in separate cages at Avian Conservation and Research Center, Department of Wildlife an Ecology, University of Veterinary and Animal Sciences, Lahore, Pakistan. 100 fecal and 100 blood samples for each bird species were inspected to analyze internal parasites. During present study, 17 species of endoparasites 14 from fecal samples and three from blood were examined. Two species of ectoparasites i.e. mite Dermanyssus gallinae 42% and fowl ticks Args persicus 41%were studied. Blood parasites included Plasmodium juxtanucleare 50%, Leucoctoyzoon simond having parasitic prevalence 40%, and Aegyptinella pullorum having parasitic prevalence of 40%. Parasitic species recorded from fecal samples included 6 species of nematodes viz. Allodpa suctoria 2%. Syngamus trachea with parasitic prevalence of 60%, Capillaria annulata 37.5%, Ascardia galli 24%, Capillaria anatis 40% and Heterakis gallinarum 28.3%. Similarly, two species of trematodes viz. Prosthogonimus ovatus having parasitic prevalence of 50% and Prosthogonimus macrorchis 21% were also documented from fecal avian samples . Single cestode species Raillietina echinobothrida having parasitic prevalence of 72% and 3 protozoan species i.e. Eimeria maxima having parasitic prevalence of 21%, Giardia lamblia 41% and Histomonas meleagridis 18% were documented during corpological analysis. In our recommendation, proper sanitation, medication and vaccination of birds enclousres are suggested to avoid parasites.

RESUMO Amostras de sangue e fezes de perdiz chukar (Alectoris chukar), faisão-albino (Phasianus colchicus), faisão-prateado (Lophura nycthemera), periquito-de-rosa (Psittacula krameri) e perus (Meleagris gallopavo) foram analisadas para verificar a prevalência de parasitas. Para registrar os parasitas, essas cinco espécies de aves foram colocadas em gaiolas separadas no Centro de Conservação e Pesquisa de Aves, Departamento de Vida Selvagem e Ecologia, Universidade de Veterinária e Ciências Animais, Lahore, Paquistão. Cem amostras fecais e 100 amostras de sangue para cada espécie de ave foram inspecionadas para analisar os parasitas internos. Durante o presente estudo, foram examinadas 17 espécies de endoparasitas, 14 de amostras fecais e 3 de sangue. Foram estudadas duas espécies de ectoparasitas, ou seja, o ácaro Dermanyssus gallinae 42% e o carrapato aviário Args persicus 41%. Os parasitas sanguíneos incluíram Plasmodium juxtanucleare 50%, Leucoctoyzoon simond com prevalência parasitária de 40% e Aegyptinella pullorum com prevalência parasitária de 40%. As espécies parasitas registradas em amostras fecais incluíram 6 espécies de nematoides viz. Allodpa suctoria 2%, Syngamus traqueia com prevalência parasitária de 60%, Capillaria annulata 37,5%, Ascardia galli 24%, Capillaria anatis 40% e Heterakis gallinarum 28,3%. Da mesma forma, duas espécies de trematódeos viz. Prosthogonimus ovatus com prevalência parasitária de 50% e Prosthogonimus macrorchis 21% também foram documentados em amostras fecais de aves. Espécies de cestoide único Raillietina echinobothrida com prevalência parasitária de 72% e 3 espécies de protozoários, isto é, Eimeria maxima com prevalência parasitária de 21%, Giardia lamblia 41% e Histomonas meleagridis 18% foram documentadas durante a análise corpológica. Em nossa recomendação, o saneamento adequado, medicação e vacinação de invólucros de pássaros são sugeridos para evitar parasitas.

Up-regulation of GINS1 highlighted a good diagnostic and prognostic potential of survival in three different subtypes of human cancer

Abstract Cancer is a fatal malignancy and its increasing worldwide prevalence demands the discovery of more sensitive and reliable molecular biomarkers. To investigate the GINS1 expression level and its prognostic value in distinct human cancers using a series of multi-layered in silico approach may help to establish it as a potential shared diagnostic and prognostic biomarker of different cancer subtypes. The GINS1 mRNA, protein expression, and promoter methylation were analyzed using UALCAN and Human Protein Atlas (HPA), while mRNA expression was further validated via GENT2. The potential prognostic values of GINS1 were evaluated through KM plotter. Then, cBioPortal was utilized to examine the GINS1-related genetic mutations and copy number variations (CNVs), while pathway enrichment analysis was performed using DAVID. Moreover, a correlational analysis between GINS1 expression and CD8+ T immune cells and a the construction of gene-drug interaction network was performed using TIMER, CDT, and Cytoscape. The GINS1 was found down-regulated in a single subtypes of human cancer while commonly up-regulated in 23 different other subtypes. The up-regulation of GINS1 was significantly correlated with the poor overall survival (OS) of Liver Hepatocellular Carcinoma (LIHC), Lung Adenocarcinoma (LUAD), and Kidney renal clear cell carcinoma (KIRC). The GINS1 was also found up-regulated in LIHC, LUAD, and KIRC patients of different clinicopathological features. Pathways enrichment analysis revealed the involvement of GINS1 in two diverse pathways, while few interesting correlations were also documented between GINS1 expression and its promoter methylation level, CD8+ T immune cells level, and CNVs. Moreover, we also predicted few drugs that could be used in the treatment of LIHC, LUAD, and KIRC by regulating the GINS1 expression. The expression profiling of GINS1 in the current study has suggested it a novel shared diagnostic and prognostic biomarker of LIHC, LUAD, and KIRC.

Resumo O câncer é uma doença maligna fatal e sua crescente prevalência mundial exige a descoberta de biomarcadores moleculares mais sensíveis e confiáveis. Investigar o nível de expressão de GINS1 e seu valor prognóstico em cânceres humanos distintos, usando uma série de abordagens in silico em várias camadas, pode ajudar a estabelecê-lo como um potencial biomarcador de diagnóstico e prognóstico compartilhado de diferentes subtipos de câncer. O mRNA de GINS1, a expressão da proteína e a metilação do promotor foram analisados usando UALCAN e Human Protein Atlas (HPA), enquanto a expressão de mRNA foi posteriormente validada via GENT2. Os valores prognósticos potenciais de GINS1 foram avaliados por meio do plotter KM. Em seguida, o cBioPortal foi utilizado para examinar as mutações genéticas relacionadas ao GINS1 e as variações do número de cópias (CNVs), enquanto a análise de enriquecimento da via foi realizada usando DAVID. Além disso, uma análise correlacional entre a expressão de GINS1 e células imunes T CD8 + e a construção de uma rede de interação gene-droga foi realizada usando TIMER, CDT e Cytoscape. O GINS1 foi encontrado regulado negativamente em um único subtipo de câncer humano, enquanto comumente regulado positivamente em 23 outros subtipos diferentes. A regulação positiva de GINS1 foi significativamente correlacionada com a sobrevida global pobre (OS) de Carcinoma Hepatocelular de Fígado (LIHC), Adenocarcinoma de Pulmão (LUAD) e Carcinoma de Células Claras Renais de Rim (KIRC). O GINS1 também foi encontrado regulado positivamente em pacientes LIHC, LUAD e KIRC de diferentes características clínico-patológicas. A análise de enriquecimento de vias revelou o envolvimento de GINS1 em duas vias diversas, enquanto poucas correlações interessantes também foram documentadas entre a expressão de GINS1 e seu nível de metilação do promotor, nível de células imunes T CD8 + e CNVs. Além disso, também previmos poucos medicamentos que poderiam ser usados no tratamento de LIHC, LUAD e KIRC, regulando a expressão de GINS1. O perfil de expressão de GINS1 no estudo atual sugeriu que é um novo biomarcador de diagnóstico e prognóstico compartilhado de LIHC, LUAD e KIRC.

Genetic variations among the isolates of Bipolaris Maydis based on phenotypic and molecular markers

Abstract Maydis leaf blight, caused by Bipolaris maydis, is an important disease of maize crop in Khyber Pakhtunkhwa (KP) Pakistan. Fifteen isolates of the pathogen, collected across KP, were studied for variability based on phenotypic and molecular markers. Significant variability among the isolates was observed when assessed using phenotypic traits such as radial growth, spore concentration, fungicide sensitivity and virulence. The isolates were classified into six culture groups based on colour, texture and margins of the colony. Conidial morphology was also variable. These were either straight or slightly curved and light to dark brown in colour. Fungicide test showed significant variation in the degree of sensitivity against Carbendazim. Isolate Bm8 exhibited maximum radial growth on carbendazim spiked plates. Conversely, isolate Bm15 showed the lowest radial growth. Variations in virulence pattern of the isolates were evident when a susceptible maize variety Azam was inoculated with spores of B. maydis. Genetic variability amongst the isolates was also estimated by RAPD as well as sequencing of ITS region. The RAPD dendrogram grouped all the isolates into two major clusters. Average genetic distance ranged from 0.6% to 100%, indicating a diverse genetic gap among the isolates. Maximum genetic distance was found between isolates Bm9 and Bm10 as well as Bm2 and Bm8. Conversely, isolates Bm13 and Bm15 were at minimum genetic distance. Phylogenetic dendrogram based on sequencing of ITS region grouped all the isolates into a single major cluster. The clusters in both the dendrogram neither correlate to the geographical distribution nor to the morphological characteristics.

Resumo A ferrugem das folhas de maydis, causada por Bipolaris maydis, é uma doença importante da cultura do milho em Khyber Pakhtunkhwa (KP), Paquistão. Quinze isolados do patógeno, coletados em KP, foram estudados quanto à variabilidade com base em marcadores fenotípicos e moleculares. Variabilidade significativa entre os isolados foi observada quando avaliada por meio de características fenotípicas, como crescimento radial, concentração de esporos, sensibilidade a fungicida e virulência. Os isolados foram classificados em seis grupos de cultura com base na cor, textura e margens da colônia. A morfologia dos conídios também foi variável. Estes eram retos ou ligeiramente curvos e de cor marrom-claro a escuro. O teste de fungicida mostrou variação significativa no grau de sensibilidade ao carbendazim. O isolado Bm8 exibiu crescimento radial máximo em placas com adição de carbendazim. Por outro lado, o isolado Bm15 apresentou o menor crescimento radial. As variações no padrão de virulência dos isolados foram evidentes quando uma variedade de milho suscetível Azam foi inoculada com esporos de B. maydis. A variabilidade genética entre os isolados também foi estimada por RAPD, bem como sequenciamento da região ITS. O dendrograma RAPD agrupou todos os isolados em dois grupos principais. A distância genética média variou de 0,6% a 100%, indicando uma lacuna genética diversa entre os isolados. A distância genética máxima foi encontrada entre os isolados Bm9 e Bm10 e também entre Bm2 e Bm8. Por outro lado, os isolados Bm13 e Bm15 estavam a uma distância genética mínima. O dendrograma filogenético baseado no sequenciamento da região ITS agrupou todos os isolados em um único aglomerado principal. Os agrupamentos em ambos os dendrogramas não se correlacionam com a distribuição geográfica nem com as características morfológicas.

Photosynthetic acclamatory response of Panicum antidotale Retz. populations to root zone desiccation stress

Abstract Growth of plants is severely reduced due to water stress by affecting photosynthesis including photosystem II (PSII) activity and electron transport. This study emphasised on comparative and priority targeted changes in PSII activity due to progressive drought in seven populations of Panicum antidotale (P. antidotale) collected from Cholistan Desert and non-Cholistan regions. Tillers of equal growth of seven populations of P. antidotale grown in plastic pots filled with soil were subjected progressive drought by withholding water irrigation for three weeks. Progressive drought reduced the soil moisture content, leaf relative water content, photosynthetic pigments and fresh and dry biomass of shoots in all seven populations. Populations from Dingarh Fort, Dingarh Grassland and Haiderwali had higher growth than those of other populations. Cholistani populations especially in Dingarh Grassland and Haiderwali had greater ability of osmotic adjustment as reflected by osmotic potential and greater accumulation of total soluble proteins. Maximum H2O2 under water stress was observed in populations from Muzaffargarh and Khanewal but these were intermediate in MDA content. Under water stress, populations from Muzaffargarh and Dingarh Fort had greater K+ accumulation in their leaves. During progressive drought, non-Cholistani populations showed complete leaf rolling after 23 days of drought, and these populations could not withstand with more water stress condition while Cholistani populations tolerated more water stress condition for 31 days. Moreover, progressive drought caused PSII damages after 19 days and it became severe after 23 days in non-Cholistani populations of P. antidotale than in Cholistani populations.

Resumo O crescimento das plantas é severamente reduzido devido ao estresse hídrico, afetando a fotossíntese, incluindo a atividade do fotossistema II (PSII) e o transporte de elétrons. Este estudo enfatizou as mudanças comparativas e prioritárias na atividade do PSII devido à seca progressiva em sete populações de Panicum antidotale (P. antidotale) coletadas no Deserto do Cholistão e regiões fora do Cholistão. Perfilhos de igual crescimento de sete populações de P. antidotale cultivadas em vasos de plástico cheios de solo foram submetidos à seca progressiva, retendo a irrigação com água por três semanas. A seca progressiva reduziu o teor de umidade do solo, teor de água relativo nas folhas, pigmentos fotossintéticos e biomassa fresca e seca dos brotos em todas as sete populações. Populações de Dingarh Fort, Dingarh Grassland e Haiderwali tiveram maior crescimento do que as de outras populações. As populações de Cholistani, especialmente em Dingarh Grassland e Haiderwali, apresentaram maior capacidade de ajuste osmótico, refletido pelo potencial osmótico e maior acúmulo de proteínas solúveis totais. H2O2 máximo sob estresse hídrico foi observado em populações de Muzaffargarh e Khanewal, mas estas foram intermediárias no conteúdo de MDA. Sob estresse hídrico, as populações de Muzaffargarh e Dingarh Fort tiveram maior acúmulo de K+ em suas folhas. Durante a seca progressiva, as populações não cholistanesas mostraram rolagem completa das folhas após 23 dias de seca, e essas populações não conseguiram suportar mais condições de estresse hídrico, enquanto as populações cholistani toleraram mais condições de estresse hídrico por 31 dias. Além disso, a seca progressiva causou danos ao PSII após 19 dias e tornou-se severa após 23 dias em populações não cholistanesas de P. antidotale do que em populações cholistanesas.

Effect of biosal®, deltamethrin and lambda-cyhalothrin on the activity of GOT, GPT and total protein contents in two fodder pests Hermolaus modestus and Hermolaus ocimumi

Abstract The assessment of the comparative effect of biosal (phytopesticide), deltamethrin, and lambda-cyhalothrin (pyrethroids) were made against two fodder pests, Hermolaus modestus and Hermolaus ocimumi by filter paper impregnation method. The activity of total protein contents, GPT (glutamic-pyruvic transaminase) and GOT (glutamic oxaloacetate transaminase) were affected in Hermolaus modestus and Hermolaus ocimumi against biosal, deltamethrin, and lambda cyhalothrin. The activity of total protein contents in H. modestus was 31.053%, 4.607%, and 24.575%, against biosal, deltamethrin, and lambda-cyhalothrin, respectively. The activity of total protein contents was observed as 24.202%, 15.25%, and 56.036% against deltamethrin, lambda-cyhalothrin, and biosal, respectively in H. ocimumi. The activity of GOT was observed as 98.675% for biosal 33.95% for deltamethrin and 83.619% for lambda-cyhalothrin in H. modestus. The GOT activity was estimated in H. ocimumi as 78.831%, 47.645%, and 71.287% against biosal, deltamethrin, and lambda-cyhalothrin, respectively. The efficacy of GPT enzyme against biosal, deltamethrin, and lambda-cyhalothrin was calculated as 89.26%, 73.07%, and 47.58%, respectively in H. modestus. The H. ocimumi showed GPT activity as 77.58% for biosal, 68.84% for deltamethrin, and 52.67% for lambda-cyhalothrin, respectively.

Resumo A avaliação do efeito comparativo do biosal (fitopesticida), deltametrina e lambda-cialotrina (piretróides) foi feita contra duas pragas forrageiras, Hermolaus modestus e Hermolaus ocimumi, pelo método de impregnação com papel de filtro. A atividade do conteúdo de proteína total, GPT (transaminase glutâmico-pirúvica) e GOT (oxaloacetato transaminase glutâmico) foram afetados em Hermolaus modestus e Hermolaus ocimumi contra biosal, deltametrina e lambda cialotrina. A atividade do conteúdo de proteína total em H. modestus foi 31.053%, 4.607% e 24.575%, contra biosal, deltametrina e lambda-cialotrina, respectivamente. A atividade do conteúdo de proteína total foi observada como 24.202%, 15.25% e 56,036% contra deltametrina, lambda-cialotrina e biosal, respectivamente em H. ocimumi. A atividade do GOT foi observada em 98.675% para o biosal, 33,95% para a deltametrina e 83.619% para a lambda-cialotrina em H. modestus. A atividade do GOT foi estimada em H. ocimumi como 78.831%, 47.645% e 71.287% contra biosal, deltametrina e lambda-cialotrina, respectivamente. A eficácia da enzima GPT contra biosal, deltametrina e lambda-cialotrina foi calculada como 89.26%, 73.07% e 47.58%, respectivamente em H. modestus. A H. ocimumi apresentou atividade GPT de 77.58% para biosal, 68.84% para deltametrina e 52.67% para lambda-cialotrina, respectivamente.

Environmental sustainability assessment of wooden furniture produced in Pakistan

Abstract Life cycle assessment was carried out for a conventional wooden furniture set produced in Mardan division of the Khyber Pakhtunkhwa province of Pakistan during 2018-19. Primary data regarding inputs and outputs were collected through questionnaire surveys from 100 conventional wooden furniture set manufacturers, 50 in district Mardan and 50 in district Swabi. In the present study, cradle-to-gate life cycle assessment approach was applied for a functional unit of one conventional wooden furniture set. Production weighted average data were modelled in the environmental impacts modelling software i.e., SimaPro v.8.5. The results showed that textile used in sofa set, wood preservative for polishing and preventing insects attack and petrol used in generator had the highest contribution to all the environmental impact categories evaluated. Total cumulative energy demand for wooden furniture set manufactured was 30,005 MJ with most of the energy acquired from non-renewable fossil fuel resources.

Resumo A abordagem de avaliação do ciclo de vida foi realizada para um conjunto de móveis de madeira convencional produzido na divisão Mardan da província de Khyber Pakhtunkhwa do Paquistão durante 2018-19. Os dados primários sobre entradas e saídas foram coletados por meio de pesquisas por questionário de 100 fabricantes de conjuntos de móveis de madeira convencionais, 50 no distrito de Mardan e 50 no distrito de Swabi. No presente estudo, a abordagem de avaliação do ciclo de vida do berço ao portão foi aplicada para uma unidade funcional de um conjunto de móveis de madeira convencional. Os dados da média ponderada da produção foram modelados no software de modelagem de impactos ambientais, isto é, SimaPro v.8.5. Os resultados mostraram que os têxteis usados no conjunto de sofás, o preservativo de madeira para polir e prevenir o ataque de insetos e a gasolina usada no gerador tiveram a maior contribuição em todas as categorias de impacto ambiental avaliadas. A demanda total acumulada de energia para o conjunto de móveis de madeira fabricado foi de 30.005 MJ, com a maior parte da energia adquirida de recursos de combustíveis fósseis não renováveis.

Effects of Se nanoparticles supplementation on growth performance, hematological parameters and nutrient digestibility of Labeo rohita fingerling fed sunflower meal based diet

Abstract The aim of the present study is to assess the effects of selenium nanoparticles on the growth, hematology and nutrients digestibility of Labeorohita fingerlings. Fingerlings were fed with seven isocaloric sunflower meal-based diet supplemented with different concentrations of nanoparticles naming T1 to T7 (0, 0.5, 1, 1.5, 2, 2.5, and 3 mg/kg), with 5% wet body weight while chromic oxide was used as an indigestible marker. After experimentation for 90 days T3 treated group (1mg/kg -1Se-nano level) showed the best result in hematological parameters (WBCs 7.97 ×103mm-3, RBCs 2.98 ×106 mm-3 and Platelet count 67), nutrient digestibility (crude protein: 74%, ether extract: 76%, gross energy: 70%) and growth performance (weight gain 13.24 g, weight gain% 198, feed conversion ratio 1.5, survival rate 100%) as compared to the other treatment groups. Specific growth rates were found significantly higher in T5 than in other groups. The present study indicated positive effect of 1 mg/kg Se-nanoparticles on growth advancement, hematological parameters, and nutrients digestibility of L. rohita fingerlings.

Resumo O objetivo do presente estudo é avaliar os efeitos das nanopartículas de selênio no crescimento, hematologia e digestibilidade dos nutrientes de alevinos de Labeo rohita. Os alevinos foram alimentados com sete dietas isocalóricas à base de farinha de girassol suplementada com diferentes concentrações de nanopartículas, nomeando T1 a T7 (0, 0,5, 1, 1,5, 2, 2,5 e 3 mg / kg), com 5% do peso corporal úmido enquanto o óxido crômico foi usado como um marcador indigesto. Após a experimentação por 90 dias, o grupo tratado com T3 (nível 1mg / kg -1Se-nano) mostrou o melhor resultado em parâmetros hematológicos (WBCs 7,97 × 103mm-3, RBCs 2,98 × 106mm-3 e contagem de plaquetas 67), digestibilidade dos nutrientes (proteína bruta: 74%, extrato de éter: 76%, energia bruta: 70%) e desempenho de crescimento (ganho de peso 13,24 g, ganho de peso % 198, taxa de conversão alimentar 1,5, taxa de sobrevivência 100%) em comparação com os outros grupos de tratamento. As taxas de crescimento específicas foram encontradas significativamente mais altas em T5 do que em outros grupos. O presente estudo indicou efeito positivo de 1 mg / kg de nanopartículas de Se no avanço do crescimento, parâmetros hematológicos e digestibilidade de nutrientes de alevinos de L. rohita.

Sublethal toxicity of carbofuran in cattle egret (Bubulcus ibis coromandus): hematological, biochemical, and histopathological alterations

Abstract This study was aimed to investigate Carbofuran (CF)-induced pathological changes in cattle egret. Two hundred cattle egrets were reared and equally divided into four groups and given different CF concentrations (0.03 mg/L, 0.02 mg/L, 0.01 mg/L and 0 mg/L (control group)). Hematology, serum biochemistry, histopathology, and immunological markers were studied. Our results confirm that CF induces anemic conditions, leukocytosis, elevated liver enzymatic activity, and alterations in renal biomarkers. Moreover, specific microscopic lesions such as multifocal necrosis, pyknotic nuclei, hemorrhages, congestion, and inflammatory cell proliferation were observed in the liver, kidney, spleen, and thymus. These findings suggest that CF can induce harmful effects, so the application of this pesticide in the field must be strictly monitored to mitigate the possibility of exposure to non-target species.

Resumo Este estudo teve como objetivo investigar as alterações patológicas induzidas por carbofurano (CF) em garças-vaqueiras. Duzentas dessas garças foram criadas e divididas igualmente em quatro grupos e receberam diferentes concentrações de CF: 0,03 mg/L; 0,02 mg/L; 0,01 mg/L; e 0 mg/L (grupo controle). Foram realizadas análises de hematologia, bioquímica sérica, histopatologia e marcadores imunológicos. Nossos resultados confirmaram que CF induz condições anêmicas, leucocitose, atividade enzimática hepática elevada e alterações nos biomarcadores renais. Além disso, lesões microscópicas específicas, como necrose multifocal, núcleos picnóticos, hemorragias, congestão e proliferação de células inflamatórias, foram observadas no fígado, rim, baço e timo. Esses achados sugerem que o CF pode causar efeitos nocivos, portanto a aplicação desse agrotóxico no campo deve ser rigorosamente monitorada para mitigar a possibilidade de exposição a espécies não alvo.

Association of blood groups/Rh and diabetes mellitus in Karachi city, Pakistan

Abstract The main purpose of this study was to find out a possible association between ABO blood groups or Rh and diabetes mellitus (DM) in the local population of eight (8) different towns of Karachi, Pakistan. For this purpose a survey was carried out in Karachi to have a practical observation of these towns during the period of 9 months from June 2019 to Feb. 2020. Out of eighteen (18) towns of Karachi, samples (N= 584) were collected from only eight (8) Towns of Karachi and gave a code-number to each town. Diabetic group sample was (n1=432) & pre-diabetes sample was (n2 =152). A standard Abbot Company Glucometer for Random Blood Sugar (RBS) and Fasting Blood Sugar (FBS) tests, standard blood anti sera were used for ABO/Rh blood type. Health assessment techniques were performed ethically by taking informed consent from all registered subjects. Finally data was analyzed by SPSS version 20.0. In our current study, the comparison of ABO blood groups frequencies between diabetic and pre-diabetic individuals were carried out. The percentage values of blood Group-B as given as: (32% in DM vs. 31% in pre-diabetics), followed by blood Group-O as: (18% in DM vs. 11% in pre-diabetics). Contrary to Group-B & O, blood Group-A and Group-AB were distribution percentage higher pre-diabetic as compared to DM patients, as given as: Group-A (32% in pre-diabetics vs. 26% in DM) & Group-AB (26% in pre-diabetics vs. 24% in diabetics patients). In addition, percentage distribution of Rh system was also calculated, in which Rh+ve Group was high and more common in DM patients as compared to pre-diabetics; numerically given as: Rh+ve Group (80% in DM vs. 72% in pre-diabetics). Different views and dimensions of the research topic were studied through literature support, some have found no any association and some established a positive association still some were not clear in making a solid conclusion. It is concluded that DM has a positive correlation with ABO blood groups, and people with Group-B have increased susceptibility to DM disease.

Resumo O objetivo principal deste estudo foi descobrir uma possível associação entre grupos sanguíneos ABO ou Rh e diabetes mellitus (DM) na população local de oito (8) diferentes cidades de Karachi, Paquistão. Para tanto, foi realizado um levantamento em Karachi para observação prática dessas cidades durante o período de 9 meses de junho de 2019 a fevereiro de 2020.De dezoito (18) cidades de Karachi, as amostras (N = 584) foram coletadas de apenas oito (8) cidades de Karachi e deram um número-código para cada cidade. A amostra do grupo de diabéticos foi (n1 = 432) e a amostra de pré-diabetes foi (n2 = 152). Um glicômetro padrão da Abbot Company para testes de açúcar no sangue aleatório (RBS) e açúcar no sangue em jejum (FBS), antissoros de sangue padrão foram usados para o tipo de sangue ABO / Rh. As técnicas de avaliação de saúde foram realizadas de forma ética, tomando o consentimento informado de todos os indivíduos registrados. Finalmente, os dados foram analisados pelo SPSS versão 20.0.No presente estudo, foi realizada a comparação das frequências dos grupos sanguíneos ABO entre diabéticos e pré-diabéticos. Os valores percentuais do sangue do Grupo-B são dados como: (32% em DM vs. 31% em pré-diabéticos), seguido pelo sangue do Grupo-O como: (18% em DM vs. 11% em pré-diabéticos). Ao contrário dos Grupos B e O, sangue do Grupo-A e Grupo-AB tiveram distribuição percentual maior de pré-diabéticos em comparação com pacientes com DM, dado como: Grupo-A (32% em pré-diabéticos vs. 26% em DM) e Grupo AB (26% em pré-diabéticos vs. 24% em pacientes diabéticos). Além disso, também foi calculada a distribuição percentual do sistema Rh, no qual o Grupo Rh + ve foi elevado e mais comum em pacientes com DM em comparação aos pré-diabéticos; dados numericamente como: Grupo Rh + ve (80% em DM vs. 72% em pré-diabéticos). Diferentes visões e dimensões do tema de pesquisa foram estudadas com o suporte da literatura, alguns não encontraram nenhuma associação e alguns estabeleceram uma associação positiva, embora alguns não estivessem claros em fazer uma conclusão sólida. Conclui-se que o DM tem correlação positiva com os grupos sanguíneos ABO, e as pessoas com o Grupo B têm maior suscetibilidade à doença DM.

Foliar application of triacontanol ameliorates heat stress through regulation of the antioxidant defense system and improves yield of eggplant

Abstract Transplanting time and genotype contribute to improving crop yield and quality of eggplant (Solanum melongena L.). A field experiment was conducted to investigate the impact of foliar applied of triacontanol (TRIA) and eggplant genotypes 25919, Nirala, 28389 and Pak-10927,transplanted on 1 March,15 March, and 1 April on exposure to high air temperature conditions. The experiment was performed according to Randomized Complete Block Design and the data was analyzed by using Tuckey,s test . The TRIA was applied at 10µM at flowering stage; distilled water was used as the control. Rate of photosynthesis and transpiration, stomatal conductance, water use efficiency, and effects on antioxidative enzymes (superoxide dismutase, catalase and peroxidase) were evaluated. The 10µM TRIA increased photosynthesis rate and water use efficiency and yield was improved in all genotypes transplanted at the different dates. Foliar application of 10µM TRIA increased antioxidative enzyme activities (SOD, POD & CAT) and improved physiological as well as biochemical attributes of eggplant genotypes exposed to high heat conditions. Highest activity of dismutase enzyme 5.41mg/1g FW was recorded in Nirala genotype in second transplantation. Whereas, lowest was noted in PAK-10927 (2.30mg/g FW). Maximum fruit yield was found in accession 25919 (1.725kg per plant) at 1st transplantation with Triacontanol, whereas accession PAK-10927 gave the lowest yield (0.285 kg per plant) at control treatment on 3rd transplantation. Genotype, transplanting date and application of TRIA improved growth, yield and quality attributes under of heat stress in eggplant.

Resumo O tempo de transplante e o genótipo contribuem para melhorar a produtividade e a qualidade da cultura da berinjela (Solanum melongena L.). Um experimento de campo foi conduzido para investigar o impacto da aplicação foliar de triacontanol (TRIA) e genótipos de berinjela 25919, Nirala, 28389 e Pak-10927, transplantados em 1 de março, 15 de março e 1 de abril de exposição a condições de alta temperatura do ar. O experimento foi realizado de acordo com o Randomized Complete Block Design e os dados foram analisados pelo teste de Tuckey. O TRIA foi aplicado a 10 µM na fase de floração; água destilada foi utilizada como controle. Taxa de fotossíntese e transpiração, condutância estomática, eficiência do uso da água e efeitos sobre as enzimas antioxidantes (superóxido dismutase, catalase e peroxidase) foram avaliados. O TRIA 10 µM aumentou a taxa de fotossíntese e a eficiência do uso da água e o rendimento foi melhorado em todos os genótipos transplantados nas diferentes datas. A aplicação foliar de TRIA 10µM aumentou as atividades das enzimas antioxidantes (SOD, POD e CAT) e melhorou os atributos fisiológicos e bioquímicos de genótipos de berinjela expostos a condições de alto calor. A atividade mais elevada da enzima dismutase 5,41mg / 1g FW foi registrada no genótipo Nirala no segundo transplante. Considerando que o mais baixo foi observado em PAK-10927 (2,30 mg / g FW). A produtividade máxima de frutos foi encontrada no acesso 25919 (1,725 kg por planta) no 1º transplante com Triacontanol, enquanto o acesso PAK-10927 deu a menor produção (0,285 kg por planta) no tratamento de controle no 3º transplante. Genótipo, data de transplante e aplicação de TRIA, melhoramento do crescimento, rendimento e atributos de qualidade sob estresse térmico em berinjela.

Variability in indigenous Pakistani tomato lines and worldwide reference collection for Tomato Mosaic Virus (ToMV) and Tomato Yellow Leaf Curl Virus (TYLCV) infection

Abstract Local and exotic germplasm of tomato remains a major source for genetic improvement. Assessment of such lines for biotic stresses particularly viral diseases are the most important criteria for selection in Pakistan, where Tomato Yellow Leaf Curl Virus (TYLCV) and Tomato Mosaic Virus (ToMV) are the major diseases/viruses. A set of 40 accessions (including indigenous Pakistani lines and exotic germplasm from Europe, the United States, and Asia) were evaluated for their resistance/infection response to ToMV with artificial inoculation under greenhouse conditions. Infection response was quantified through disease scoring and DAS-ELISA test (for ToMV). A subset of 24 lines, was further screened for TYLCV using disease scoring and TAS-ELISA. The tested lines showed significant variability for resistance to ToMV. Only one accession (Acc-17878) was resistant to the ToMV whereas seven accessions i.e. Acc-17890, AVR-261, CLN-312, AVR-321, EUR-333, CLN-352, and CLN-362 expressed resistance to TYLCV. Correlation between phenotypic evaluation was confirmed by the ELISA results in both diseases, although both tools complemented to assess the viral infection status. In future, tomato breeding programs must consider breeding for ToMV and TYLCV resistance (using identified germplasm in our study) so as to deliver virus resistant tomato varieties.

RESUMO O germoplasma local e exótico do tomate continua sendo uma importante fonte de melhoramento genético. A avaliação de linhagens para estresses bióticos, particularmente as doenças virais, é o critério mais importantes para seleção no Paquistão, onde o vírus da folha amarela do tomate (TYLCV) e o vírus do mosaico do tomateiro (ToMV) são as principais doenças/vírus. Um conjunto de 40 acessos (incluindo linhagens indígenas do Paquistão e germoplasma exótico da Europa, dos Estados Unidos e da Ásia) foi avaliado quanto à resistência/resposta à infecção ao ToMV com inoculação artificial em casa de vegetação. A resposta à infecção foi quantificada por meio de pontuação da doença e de teste DAS-ELISA (para ToMV). Um subconjunto de 24 linhas foi posteriormente rastreado para TYLCV usando pontuação de doença e TAS-ELISA. As linhas testadas apresentaram variabilidade significativa para resistência ao ToMV. Apenas um acesso (Acc-17878) foi resistente ao ToMV, enquanto sete acessos (Acc-17890, AVR-261, CLN-312, AVR-321, EUR-333, CLN-352 e CLN-362) expressaram resistência ao TYLCV. A correlação entre a avaliação fenotípica foi confirmada pelos resultados do ELISA nas duas doenças, embora ambas as ferramentas tenham se complementado para avaliar o estado da infecção viral. No futuro, os programas de melhoramento de tomate devem considerar aperfeiçoamentos para resistência ao ToMV e TYLCV (usando germoplasma identificado em nosso estudo) de modo a fornecer variedades de tomate resistentes a vírus.

Effects of tumor derived exosomes on T cells markers expression

Abstract Exosomes are 30-120nm bio particles transferred from donor to recipient cells leading to modification in their regulatory mechanisms depending upon the coded message in the form of loaded biomolecule. Cancer cells derived exosomes the true representatives of the parent cells have been found to modify the tumor surrounding/distinct regions and participate in metastasis, angiogenesis and immune suppression. Tis study was aimed to study the effects of tumor mice derived exosomes on the normal mice spleen isolated T cells by using co-culture experiments and flow cytometer analysis. We mainly focused on some of the T cells population and cytokines including IFN-, FOXP3+ regulatory T (Treg) cells and KI67 (proliferation marker). Overall results indicated random changes in different set of experiments, where the cancer derived exosomes reduced the IFN- expression in both CD4 and CD8 T cells, similarly the Treg cells were also found decreased in the presence of cancer exosomes. No significant changes were observed on the Ki67 marker expression. Such studies are helpful in understanding the role of cancer exosomes in immune cells suppression in tumor microenvironment. Cancer exosomes will need to be validated in vivo and in vitro on a molecular scale in detail for clinical applications.

Resumo Os exossomos são biopartículas de 30-120 nm transferidas de células doadoras para células receptoras, levando à modificação em seus mecanismos reguladores, dependendo da mensagem codificada na forma de biomolécula carregada. Verificou-se que exossomos derivados de células cancerosas os verdadeiros representantes das células-mãe modificam as regiões circundantes / distintas do tumor e participam da metástase, angiogênese e imunossupressão. Este estudo teve como objetivo estudar os efeitos de exossomos derivados de camundongos com tumor nas células T isoladas de baço de camundongos normais, usando experimentos de cocultura e análise de citômetro de fluxo. Concentrou-se, principalmente, em algumas populações de células T e citocinas, incluindo IFN-, células T reguladoras FOXP3 + (Treg) e KI67 (marcador de proliferação). Os resultados gerais indicaram mudanças aleatórias em diferentes conjuntos de experimentos, em que os exossomos derivados de câncer reduziram a expressão de IFN- em células T CD4 e CD8, da mesma forma que as células Treg também foram encontradas diminuídas na presença de exossomos de câncer. Nenhuma mudança significativa foi observada na expressão do marcador Ki67. Esses dados são úteis para a compreensão do papel dos exossomos do câncer na supressão de células do sistema imunológico no microambiente tumoral. Exossomos de câncer precisarão ser validados in vivo e in vitro em escala molecular com detalhes para aplicações clínicas.