Senecavirus A (SVA) in finishing swine: diagnosis and viral isolation / Senecavirus A (SVA) em suínos de terminação: diagnóstico e isolamento viral

ABSTRACT: Senecavirus A (SVA) has been a problem in Brazil since the end of 2014. The infections caused by SVA have disrupted the productive chain in Brazil, as it can be confused with foot-and-mouth disease. Although, the virus has remained endemic in the country, an increase in the number of cases of the disease was observed in 2018. The aim of the present study was to conduct the differential diagnosis of foot-and-mouth disease in an outbreak of vesicular disease in finishing swine. Animals (160-170 days old) were kept on a farm with 6000 pigs in Minas Gerais State, Brazil. The morbidity and mortality rates were 20% and 2.2%, respectively. The diagnosis was performed by RT-PCR, using primers that determine the amplification of an internal region of the 3D gene. Furthermore, samples were inoculated into BHK-21 cell culture for viral isolation. In the first passage under cultivation, a cytopathogenic effect compatible with SVA replication (rounding and detachment of the cell monolayer) was observed. The viral identity was confirmed using two additional assays: indirect immunofluorescence assay (IFA) and nucleotide sequencing. Both tests confirmed that the infection was caused by SVA. In summary, we described a method for the diagnosis and viral isolation of SVA, a virus that arrived in Brazil in 2014 and has become endemic in the country.

RESUMO: Senecavírus A (SVA) é um problema no Brasil desde o final de 2014. As infecções causadas pelo SVA têm causado problemas para a cadeia produtiva no Brasil, pois podem ser confundidas com febre aftosa. Embora o vírus permaneça endêmico no país, foi observado um aumento no número de casos em 2018. O objetivo do presente estudo foi realizar o diagnostico diferencial de febre aftosa em um surto de doença vesicular em suínos de terminação. Os animais (160 a 170 dias de idade) eram mantidos em uma granja com 6.000 suínos no estado de Minas Gerais, Brasil. As taxas de morbidade e mortalidade foram de 20% e 2,2%, respectivamente. O diagnostico foi realizado por RT-PCR, utilizando primers que determinam a amplificação de uma região interna do gene 3D. Além disso, as amostras foram inoculadas na cultura de células BHK-21 para isolamento viral. Na primeira passagem em cultivo, foi observado efeito citopatogênico compatível com a replicação do SVA (arredondamento e descolamento da monocamada celular). A identidade viral foi confirmada usando duas técnicas adicionais: ensaio de imunofluorescência indireta (IFA) e sequenciamento de nucleotídeos. Ambos os testes confirmaram que a infecção foi causada por SVA. Em resumo, descrevemos um método para o diagnóstico e isolamento viral do SVA, um vírus que chegou ao Brasil em 2014 e se tornou endêmico no país.

Como o desmatamento influencia a ocorrência de leishmaniose visceral? Uma abordagem contrafactual / How deforestation influence tha occurrence of Visceral Leishmaniasis? A counterfactual approach

A leishmaniose visceral (LV) é uma doença sistêmica de transmissão vetorial. No Brasil, ela é causada pelo protozoário Leishmania infantum e é transmitida por flebotomíneos do gênero Lutzomyia, tendo os cães como a principal fonte de infecção em áreas urbanas. Historicamente a LV era conhecida como uma doença endêmica rural, porém desde a década de 1980, ela atingiu proporções endêmicas e epidêmicas em grandes cidades brasileiras. Desde então vários fatores são considerados como norteadores da expansão da LV, como variáveis socioeconômicas, climáticas e ambientais. Mais especificamente sobre o efeito do desmatamento e perturbações antrópicas no ambiente, a maioria do que se encontra na literatura tem natureza qualitativa ou utiliza de abordagens reducionistas, sem considerar a complexidade da dinâmica de uma doença infecciosa de transmissão vetorial e de caráter zoonóticos. Na presente dissertação, investigamos o efeito do desmatamento na ocorrência de Lutzomyia longipalpis (Lu. longipalpis), leishmaniose visceral canina (LVC) e leishmaniose visceral humana (LVH), tomando como exemplo o estado de São Paulo. Para isso, utilizamos uma abordagem contrafactual para estimar os efeitos (geral, direto e indireto) do desmatamento na ocorrência do Lu. longipalpis/LVC/LVH. Isso foi feito em dois passos, primeiro estimamos os parâmetros por meio de um algoritmo de Metropolis-Hastings duplo e, por fim, estimamos os efeitos causais através de um amostrador de Gibbs, por meio do pacote autognet no R.Vimos que municípios desmatados apresentam 2.63, 2.07 e 3.18 maiores chances de apresentar o vetor, LVC e LVH, respectivamente quando comparados com os municípios que não apresentaram desmatamento. Foi observada também uma forte influência da presença do vetor, LVC e LVH dos municípios vizinhos na ocorrência dos mesmos em municípios previamente livres dos desfechos (6.67, 4.26 e 4.27). Já sob mudanças hipotéticas de prevalência do desmatamento de 50% para 0% no estado, são esperadas quedas na prevalência do vetor, LVC e LVH de 11%, 6.67% e 29.87% respectivamente. O desmatamento influi na ocorrência do vetor, doença em cães e humanos por duas principais vias, (i) alterando o funcionamento do ecossistema e estrutura da comunidade, permitindo a reprodução e colonização do vetor; e (ii) promovendo uma aproximação entre todos os componentes do ciclo da LV. De tal modo, para correto controle da LV e doenças infecciosas como um todo, é imprescindível um desenvolvimento ecologicamente correto com soluções viáveis para as compensações entre a agricultura, urbanização e conservação. urbanização e conservação.

Visceral leishmaniasis (VL) is a systemic vector-borne disease. In Brazil, it caused by the protozoan Leishmania infantum and is transmitted by sandflies of the genus Lutzomyia, with dogs as the principal source of infection in urban areas. Historically, VL was known as a rural endemic disease, since the 80's it has become endemic and epidemic in large Brazilian cities. Since then, many factors were hypothesised as driving VL expansion, as socioeconomic, climatic and environmental variables. More specifically, concerning deforestation and human-made actions in the environment, most studies tend to be qualitative in nature or use traditional reductionist approaches, ignoring the complexities that are inherent of vector-borne zoonotic infectious diseases. The present study aimed to investigate the effect of deforestation in the occurrence of Lutzomyia longipalpis, canine visceral leishmaniasis (CVL), and human visceral leishmaniasis (HVL), taking as a motivating example the São Paulo state (Brazil). To this end, we chose a counterfactual approach to estimate the effects (overall, direct and indirect) of deforestation in the occurrence of vector/CVL/HVL. We did it in two steps; first, we estimated the parameters through a double Metropolis-Hastings algorithm and, finally, we estimated the causal effects through a Gibbs sampler, using the autognet package in R. We observe that deforested cities show 2.63, 2.07, and 3.18 higher odds of vector/CVL/HVL occurrence, respectively, when compared to non-deforested municipalities. We also see a significant influence of vector, CVL, and HVL presence in the neighbours in its appearance in previous naive cities, 6.67, 4.26, 4,27 respectively. Lastly, under hypothetical changes in deforestation's prevalence from 50% to 0% in the whole state, is expected a decrease in its prevalence of the vector, LVC and LVH of 11%, 6.67% and 29.87% respectively. Deforestation in the occurrence of infectious diseases and, more specifically, VL importance, is two-folded: (i) changing's the ecosystem equilibrium and community structure, allowing its vector to reproduce and colonise; (ii) promoting a close contact through the VL cycle components. In such a way, for correct control of VL and infectious disease as a whole, it is essential an eco-friendly development with viable solutions for trade-offs between agriculture, urbanization and conservation.

Experimental Frog Virus 3 infection using Brazilian strain: amphibians susceptibility / Infecção experimental utilizando estirpe brasileira de Frog Virus 3: suceptibilidade de anfíbios

An alarming number of global warnings concerning amphibian mortality outbreaks have been released in recent years. Emerging diseases stand out as the main potential causes. Ranavirus is a worldwide-spread highly infectious disease capable of affecting even other ectothermic animals such as fish and reptiles. One major issue regarding this pathology is the lack of clinical signs before it leads up to death. Aiming at having a better understanding of anurans susceptibility, this study analyzed bullfrog (Lithobates catesbeianus) survival rate, when challenged with three doses of a Brazilian strain of Frog Virus 3 (FV3). The qPCR analysis indicated a low infectivity rate in these animals both as larvae and as adults. To elucidate the results, the following hypothesis was performed: 1) The amount of inoculum used on the frogs was insufficient to trigger an infection; 2) For the FV3 to produce clinical signs in this species, there is the need for a cofactor; 3) The animals did undergo FV3 infection but recovered in the course of the experiment, and 4) The inoculum utilized might have been low-virulence. Finally, the presence of actual clinical signs of ranavirus is discussed, with the more likely hypothesis.(AU)

Um número alarmante de notificações globais sobre surtos de mortalidade de anfíbios tem sido realizado nos últimos anos. As doenças emergentes destacam-se como as principais causas potenciais. O ranavírus é uma doença altamente infecciosa disseminada em todo o mundo, capaz de afetar até outros animais ectotérmicos como peixes e répteis. Uma questão importante em relação a essa patologia é a falta de sinais clínicos antes de levar à morte. Com o objetivo de compreender melhor a suscetibilidade dos anuros, o presente trabalho analisou a taxa de sobrevivência de rãs-touro (Lithobates catesbeianus), desafiadas com três doses de uma estirpe brasileira do Frog virus 3 (FV3). A análise de qPCR indicou baixa taxa de infectividade nesses animais, tanto como larvas quanto como adultos. Procurando esclarecer os resultados, foram formuladas as seguintes hipóteses: 1) A quantidade de inóculo aplicada nas rãs foi insuficiente para desencadear uma infecção; 2) Para que o FV3 dê sinais clínicos nesta espécie, é necessário um cofator; 3) Os animais sofreram infecção por FV3, mas se recuperaram no decorrer do experimento, e 4) O inóculo utilizado pode ter sido de baixa virulência. Finalmente, foi discutida a presença de sinais clínicos reais de ranavírus e levantada a hipótese mais provável(AU)

Conquistas do SUS no enfrentamento das doenças transmissíveis / The achievements of the SUS in tackling the communicable diseases

Resumo Apresenta-se a evolução da situação epidemiológica de algumas das principais Doenças transmissíveis (DT) no Brasil, assinalando as intervenções proporcionadas pelo SUS e outras políticas sociais. Dados e informações foram levantados do Datasus e Boletins epidemiológicos do Ministério da Saúde e de artigos científicos sobre o tema. A universalização, a descentralização e a ampliação das ações de vigilância, controle e prevenção de DT produziram impacto sobre a morbimortalidade dessas doenças, principalmente das imunopreveníveis. A emergência e reemergência de três arboviroses, para as quais não se dispõe de instrumentos de controle efetivos, interromperam a evolução decrescente no perfil de morbidade das DT no Brasil. Outros programas sociais e econômicos, voltados para a população brasileira mais carente, também contribuíram para a melhoria dos indicadores de saúde analisados. Contudo, a universalização do acesso aos serviços de atenção à saúde, ao lado do aperfeiçoamento do escopo de atuação da vigilância sobre doenças e riscos à saúde, vem desempenhando papel fundamental na melhoria das condições de saúde e qualidade de vida da população, bem como contribuindo para o processo de democratização do país.

Abstract This article presents the development of the epidemiological situation of some of the major communicable diseases (CD) in Brazil, with emphasis on the interventions by the SUS and other social policies. The data and information were collected from Datasus, epidemiological newsletters from the Brazilian Ministry of Health, and scientific articles on the issue. The universalization, decentralization and expansion of the surveillance, control and prevention of CD has produced an impact on the morbidity and mortality of these diseases, mainly those which are vaccine-preventable. The emergence and re-emergence of three arboviruses, for which there are no effective control instruments, interrupted the downward trend in the morbidity profile of CD in Brazil. Other social and economic programs, which are geared to the needier sectors of the Brazilian population, have also contributed to the improvement of the analyzed health indicators. However, the universalization of access to healthcare services, as well as improvements in the scope of the surveillance of diseases and health risks, has played a key role in improving the health and quality of life of the population, as well as contributing to the process of the democratization of Brazil.

Biossegurança, Proteção Ambiental e Saúde: compondo o mosaico / Biosafety, Environmental Protection and Health: completing the puzzle

O presente trabalho faz uma reflexão sobre a construção do campo da Biossegurança, apresenta sua abrangência, os complexos temas tratados e sua perspectiva interdisciplinar. O objetivo desse campo é propor ações capazes de prevenir e controlar riscos de agravos à saúde ambiental e humana, respondendo aos desafios teóricos e práticos impostos pelas constantes mudanças no mundo, decorrentes das intervenções humanas sobre a natureza, mediadas pelos avanços científicos e tecnológicos. São abordadas questões que inserem a Biossegurança como ferramenta na busca de um modelo de desenvolvimento sustentável, resgatando a relação entre degradação ambiental, condições precárias de saúde e controle do surgimento e ressurgimento de doenças nas populações.

This work reflects on the development of the field of Biosafety. The scope of this field is presented, as well as its complex themes and its interdisciplinary perspective. The scope of this field is to propose actions capable of preventing and controlling the risk of worsening human and environmental health. This is done in order to provide alternatives to the theoretical and practical challenges posed by the rapid changes in the world, resulting from human intervention in nature and mediated by scientific and technological advances. We address questions that place Biosafety as a tool in the search for a model of sustainable development, establishing the relationship between environmental degradation, precarious health conditions, and control of the emergence and reemergence of diseases in populations.

Síndrome pulmonar e cardiovascular por hantavírus: aspectos clínicos de uma doença emergente no sudeste brasileiro / Pulmonary and cardiovascular syndrome due to hantavirus: clinical aspects of an emerging disease in southeastern Brazil

A síndrome pulmonar e cardiovascular por hantavírus é doença causada pela aspiração de aerossóis dos dejetos de roedores silvestres contaminados por vírus da família Bunyaviridae. Estudamos manifestações clínicas e laboratoriais de 70 casos ocorridos de 1998 a 2007 na região de Ribeirão Preto, SP. A freqüência de sintomas foi dispnéia (87 por cento), febre (81 por cento), tosse (44 por cento), cefaléia (34 por cento), taquicardia (81 por cento), hipotensão arterial (56 por cento), hipóxia (49 por cento), acidose metabólica (57 por cento), linfocitopenia (51 por cento), hematócrito >45 por cento (70 por cento), leucocitose com desvio à esquerda (67 por cento), creatinina (51 por cento) e uréia (42 por cento) séricas elevadas. A letalidade (54,3 por cento) ocorreu principalmente no 4o dia. Insuficiência respiratória, hipotensão arterial e choque ocorreu 24-48 horas; o hematócrito elevado e a plaquetopenia são sinais fortemente sugestivos da doença. A hipótese diagnóstica de pneumonia atípica associada a bom prognóstico (p:0,0136); a infusão hídrica >2.000ml e hipotensão arterial associadas a mau prognóstico (p:0,0286 e p:0,0453).

Pulmonary and cardiovascular syndrome due to hantavirus is a disease caused by inhalation of aerosols from the excreta of wild rodents contaminated by viruses of the Bunyaviridae family. We studied the clinical and laboratory manifestations of 70 cases that occurred in the region of Ribeirão Preto, SP, Brazil, between 1998 and 2007. The frequency of symptoms was as follows: dyspnea (87 percent), fever (81 percent), coughing (44 percent), headache (34 percent), tachycardia (81 percent), low arterial blood pressure (56 percent), metabolic acidosis (57 percent), lymphocytopenia (51 percent), hematocrit > 45 percent (70 percent), leukocytosis with left deviation (67 percent), creatinine (51 percent) and urea (42 percent). Mortality (54.3 percent) occurred mainly on the fourth day. Respiratory insufficiency, low arterial blood pressure and shock occurred after 24 to 48 hours. High hematocrit and decreased platelet levels were signs strongly suggestive of the disease. The diagnostic hypothesis of atypical pneumonia was associated with a good prognosis (p = 0.0136). Fluid infusion greater than 2,000 ml and arterial hypotension were associated with a poor prognosis (p = 0.0286 and p = 0.0453).

Fase aguda da doença de Chagas na Amazônia brasileira: estudo de 233 casos do Pará, Amapá e Maranhão observados entre 1988 e 2005 / Acute phase of Chagas disease in the Brazilian Amazon region: study of 233 cases from Pará, Amapá and Maranhão observed between 1988 and 2005

Foram estudados 233 casos de fase aguda da doença de Chagas, oriundos do Pará, Amapá e Maranhão, observados no período de 1988 a 2005, cento e sessenta deles retrospectivamente de 1988 a 2002 e setenta e três prospectivamente de 2003 a 2005. Entre os casos estudados 78,5 por cento (183/233) faziam parte de surtos provavelmente por transmissão oral, acometendo em média 4 pessoas e 21,5 por cento (50/233) eram casos isolados. Foram considerados casos agudos aqueles que apresentaram exames parasitológicos diretos (a fresco, gota espessa ou Quantitative Buffy Coat - QBC) e/ou IgM anti-Trypanosoma cruzi positivos. Foram feitos ainda xenodiagnósticos em 224 pacientes e hemoculturas em 213. Todos foram avaliados clinica e epidemiologicamente. As manifestações clínicas mais freqüentes foram febre (100 por cento), cefaléia (92,3 por cento), mialgia (84,1 por cento), palidez (67 por cento), dispnéia (58,4 por cento), edema de membros inferiores (57,9 por cento), edema de face (57,5 por cento) dor abdominal (44,2 por cento), miocardite (39,9 por cento) e exantema (27 por cento). O eletrocardiograma mostrou alterações de repolarização ventricular em 38,5 por cento dos casos, baixa voltagem de QRS em 15,4 por cento e desvio de SAQRS em 11,5 por cento, extra-sístoles ventriculares em 5,8 por cento, bradicardia em 5,8 por cento e taquicardia em 5,8 por cento, bloqueio de ramo direito em 4,8 por cento e fibrilação atrial em 4,8 por cento. A alteração mais freqüente vista no ecocardiograma foi o derrame pericárdico em 46,2 por cento dos casos. Treze (5,6 por cento) pacientes evoluíram para o óbito, 10 (76,9 por cento) dos quais por comprometimento cardiovascular, dois por complicações de origem digestiva e um de causa mal definida.

Two hundred and thirty-three cases of the acute phase of Chagas disease, from Pará, Amapá and Maranhão, were observed between 1988 and 2005. One hundred and sixty were studied retrospectively from 1988 to 2002 and seventy-three were prospectively followed up from 2003 to 2005. Among the cases studied, 78.5 percent (183/233) formed part of outbreaks, probably due to oral transmission (affecting a mean of 4 individuals), and 21.5 percent (50/233) were isolated cases. Cases were taken to be acute if they presented positive direct parasitological tests (fresh blood, thick drop or Quantitative Buffy Coat, QBC) and/or positive anti Trypanosoma cruzi IgM. Xenodiagnosis was also performed on 224 patients and blood culturing on 213. All the patients had clinical and epidemiological evaluations. The most frequent clinical manifestations were fever (100 percent), headache (92.3 percent), myalgia (84.1 percent), pallor (67 percent), dyspnea (58.4 percent), swelling of the legs (57.9 percent), facial edema (57.5 percent), abdominal pain (44.3 percent), myocarditis (39.9 percent) and exanthema (27 percent). The electrocardiogram showed abnormalities of ventricular repolarization in 38.5 percent, low QRS voltage in 15.4 percent, left-axis deviation in 11.5 percent, ventricular ectopic beats in 5.8 percent, bradycardia in 5.8 percent, tachycardia in 5.8 percent, right branch block in 4.8 percent and atrial fibrillation in 4.8 percent. The most frequently observed abnormality on the echocardiogram was pericardial effusion, in 46.2 percent of the cases. Thirteen (5.6 percent) patients died: ten (76.9 percent) of them due to cardiovascular involvement, two due to digestive complications and one due to indeterminate causes.

Emergências de saúde pública: conceito, caracterização, preparação e resposta / Public health emergencies: the concept, characterization, preparation and response

Nos últimos anos, tem havido uma maior preocupação internacional com a disseminação ou propagação de agentes etiológicos e doenças, de natureza infecciosa, química e radionuclear. Visando adequar os conceitos e as medidas para evitar ou reduzir o risco dessa disseminação, foi adotado pelos países o novo conceito de emergência de saúde pública de importância internacional, no âmbito do RSI (2005), e implementadas novas estratégias para preparação e resposta a essas emergências. Com base em análise de risco contextualizada sobre eventos de saúde que podem se disseminar internacionalmente, busca-se contar com instrumentos mais oportunos que permitam a identificação e a atuação precoce sobre esses eventos. A adaptação desse conceito, para o propósito da vigilância em saúde e rede de atenção dos serviços de saúde nacional, tem permitido um melhor gerenciamento dos eventos de saúde que constituem risco de disseminação ou propagação de doenças ou agravos dentro do território nacional, além de oferecer uma resposta mais oportuna. A análise sobre esses eventos, realizada no presente trabalho, indica que a ocorrência de desastres ambientais, em número mais reduzido quando comparada com os eventos de natureza infecciosa, coloca em situação de risco a população ou gera danos à saúde em um contingente populacional maior. Por sua vez, os eventos de natureza infecciosa, que em sua maioria ocorrem sob a forma de surtos ou epidemias, acometem um maior número de municípios e apresentam maior letalidade. As medidas adotadas no país para aperfeiçoar o sistema de vigilância em saúde na detecção, preparação e resposta às emergências de saúde pública são descritas neste artigo e são destacados os principais desafios colocados pelos níveis de gestão do sistema.

As novas facetas e a ameaça da gripe aviária no mundo globalizado / New aspects and the threat of an avian flu epidemic in a globalized world

A influenza ou, como é conhecida comumente, a gripe, é uma doença infecciosa aguda causada por um grupo de vírus (com mesmo nome) que acomete várias espécies de animais, desde felinos até aves, passando por humanos. Há cerca de 10 anos têm sido descritos, inicialmente em Hong Kong, surtos de gripe causados por vírus aviários em populações humanas. A seguir, foram descritos surtos na Holanda e no Canadá. Portanto, indaga-se: o mundo corre o risco de um novo surto semelhante ao de 1918, porém com uma população mundial quatro a cinco vezes maior? Qual a velocidade de disseminação desse vírus, visto que as viagens internacionais já não são feitas em navios lentos, mas sim em jatos supersônicos que dão a volta ao mundo em algumas horas? Antes de tudo, o que torna esse vírus tão problemático? Para nós, profissionais de laboratório, é preocupante a questão do diagnóstico etiológico dessas infecções. Como ressaltamos, os quadros de gripe podem ser causados por vários agentes. Portanto, o diagnostico etiológico, básico para intervenções terapêuticas e para que se defina a ocorrência da epidemia, passa a ter relevância ainda maior.

Influenza, or as it is best known, "flu", is an acute respiratory infection caused by a virus that affects many different animal species from felines to birds, including humans.Ten years ago, initialy in Hong Kong and after that in Holand and Canada, outbreaks of avian flu have been increasingly reported in human beings. The question is innevitable: are we in the surge of a new flu pandemic like the one we had in 1918? The perspective is even worse now that we have five times the world population and the international travels are no longer made in slow-going ships but instead in super fast jet planes. For us, laboratory professionals, the question of the laboratory diagnosis is crucial. Considering that so many different viruses are associated with respiratory infections and therapeutic measures depend on this definition, this subject assumes an even greater interest.

O desafio das doenças emergentes e a revalorização da epidemiologia descritiva / The defy of emergent diseases and epidemiological descriptive revalorization

Este artigo trata das doenças emergentes e re-emergentes apresentando seu conceito, as pincipais ocorrências nos últimos 25 anos, e os determinantes dessas ocorências.Trta também da epidemiologia descritiva e sua utilizacão na investigação desses problemas de saúde apontando a importância de sua recuperação pelos epidemiologistas. Finalmente, são mencionados os desafios que as doenças emergentes colocam para a prática em Saúde Coletiva e também para o desenvolvimento metodológico da epidemiologia descritiva

This paper focuses on emergent and re-emergent diseases, presenting their definition, patterns of ocurrence during the last 25 years, and the determinants of this ocurrence. It also emphasizes the importance of descriptive epidemiology and its use in the investigation of these health problems, especially in view of epidemiologists' tendency to give less attention to it. Finally, it mentions the challenges that emergent diseases bring to the practice of Public Health and also for the methodological development of descriptive epidemiology. These challenges are considered in three fields: biosecurity, surveillance systems and descriptive epidemiology techniques.