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1.
Actual. Sida Infectol. (En linea) ; 32(114): 26-35, 20240000. tab, fig
Artículo en Español | LILACS, BINACIS | ID: biblio-1551947

RESUMEN

La infección por Neisseria gonorrhoeae (NG) es considerada de alta prioridad en salud pública, por su capacidad para desarrollar resistencia a la mayoría de los antibióticos empleados para tratarla. La presentación anorrectal suele ser asintomática y frecuente en hombres que tienen sexo con hombres (HSH). En Argentina, se recomienda terapia antibiótica dual (ceftriaxona+azitromicina/doxiciclina) como primera línea empírica. Este estudio observacional y retrospectivo se realizó para evaluar el porcentaje de positividad de NG anorrectal, el perfil de sensibilidad a penicilina, tetraciclina, ciprofloxacina, ceftriaxona, cefixima y azitromicina, así como los aspectos clínicos-epidemiológicos de los pacientes atendidos entre 20/10/2015 y 20/03/2020 en consultorios coloproctológicos de un hospital público. Se detectaron 55/436 hisopados rectales positivos para NG (13%). El 95% era HSH y 71%, VIH+. En 18/55 NG fue la única infección. Las co-infecciones más frecuentes: HPV (38%) y C. trachomatis (35%). La sensibilidad a cefalosporinas de espectro extendido (CEE) y a azitromicina fueron 100% y 98%, respectivamente. Se observó la emergencia local de los primeros cinco aislamientos de NG anorrectal con sensibilidad reducida (SR) a CEE, el primer aislamiento con categoría no-sensible a azitromicina y otro con SR a azitromicina concomitantemente con SR a CEE. Aunque el uso de terapia empírica dual sigue siendo adecuado para nuestra institución, se observó la emergencia de aislamientos con SR y NS a las drogas de primera línea, evidenciando la importancia de la vigilancia epidemiológica a nivel local para definir los tratamientos empíricos.


Neisseria gonorrhoeae (NG) infection is considered a high public health priority because of its ability to develop resistance to most of the antibiotics used to treat it.The anorectal presentation is generally asymptomatic and frequent in men who have sex with men (MSM). In Argentina, dual therapy (ceftriaxone+azithromycin/doxycycline) is recommended as first line empiric therapy.This observational and retrospective study was conducted to evaluate the percentage of anorectal NG positivity, the susceptibility profile to penicillin, tetracycline, ciprofloxacin, ceftriaxone, cefixime and azithromycin, as well as the clinical-epidemiological aspects of patients attended between 20/10/2015 and 20/03/2020 in coloproctology of a public hospital.We detected 55/436 positive rectal swabs for NG (13%). 95% were MSM and 71% were PLHIV. In 18/55 NG was the only infection. The most frequent co-infections: HPV (38%) and C. trachomatis (35%).Susceptibility to extended-spectrum cephalosporins (ESCs) and azithromycin was 100% and 98%, respectively. Local emergence of the first five anorectal NG isolates with decreased susceptibility (DS) to ESCs, the first isolate with nonsusceptible category to azithromycin and another with DS to azithromycin concomitantly with DS to ESCs were observed.Although the use of dual empirical therapy continues to be adequate for our institution, the emergence of isolates with DS and NS to first-line drugs was observed, evidencing the importance of epidemiological surveillance at the local level to define empirical treatments


Asunto(s)
Humanos , Masculino , Femenino , Proctitis/patología , Farmacorresistencia Microbiana , Gonorrea/terapia , Enfermedades de Transmisión Sexual/terapia , Minorías Sexuales y de Género , Conducta Sexual
2.
Artículo en Inglés | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1569350

RESUMEN

The objective of this study is to communicate the findings of the first whole genome sequencing of a colistin-resistant Escherichia coli isolate harboring mcr-1 gene obtained from a pig in Argentina. Genomic DNA was sequenced using the MinION Oxford Nanopore platform. The libraries were prepared using a SQK-RBK110-96 protocol. The sequencing process was conducted on a MinION Mk1C MIN 101-C, utilizing a FLO-MIN106 flow cell. The quality of the reads was evaluated using NanoPlot. De novo assembly was conducted using Canu 1.6 and the quality of contigs was evaluated using QUAST. Annotation was performed using Prokka. The CBC20 strain exhibited a colistin MIC of 4 µg/mL. The genome size was 5178653 bp with a GC content of 50,31%. The N50 value was 133,250, while the L50 value was 21. A total of 11,620 genes, 11,518 coding sequences, 77 transfer RNAs and 24 ribosomal RNAs were identified. A serotype O9:H37 with sequence type ST-297 was observed. A total of seven antimicrobial resistance genes were identified, including mcr-1.5, bla TEM-1B, bla EC-18, bla TEM-70, aph(3')-Ia, mph(A) and sul3. The presence of punctual mutations was observed in the genes encoding the proteins GyrA (S83L, D87N) and ParC (S80I). Five distinct plasmid replicon types were identified, including IncFII, IncY, IncFIB, IncX1 and Col440II. Our findings may assist in the comprehension of the mechanisms of antimicrobial resistance, genomic epidemiology and dissemination of mcr-1 gene among animals and environment, which could potentially impact human health.


El objetivo de este estudio es comunicar la primera secuenciación de genoma completo de un aislamiento de Escherichia coli resistente a colistina mediada por el gen mcr-1 obtenido de un cerdo en Argentina. El ADN genómico se secuenció utilizando la plataforma MinION Oxford Nanopore. Las bibliotecas se prepararon utilizando un protocolo SQK-RBK110-96. El proceso de secuenciación se realizó en un MinION Mk1C MIN 101-C, utilizando una flow cell FLO-MIN106. La calidad de las lecturas se evaluó mediante NanoPlot. El ensamblaje de novo se realizó utilizando Canu 1.6 y la calidad de los contigs se evaluó utilizando QUAST. La anotación se realizó utilizando Prokka. CBC20 exhibió una CIM de colistina de 4 µg/mL. El tamaño del genoma fue de 5.178.653 pb con un contenido de GC del 50.31 %. El valor N50 fue 133.250, mientras que el valor L50 fue 21. Se identificaron un total de 11.620 genes, 11.518 secuencias codificantes, 77 ARN de transferencia y 24 ARN ribosómicos. Se observó el serotipo O9:H37 con un secuenciotipo ST-297. Se identificaron siete genes de resistencia, incluyendo mcr-1.5, bla TEM-1B, bla EC-18, bla TEM-70, aph(3')-Ia, mph(A) y sul3. Se observó la presencia de mutaciones puntuales en los genes que codifican las proteínas GyrA (S83L, D87N) y ParC (S80I). Se identificaron cinco tipos distintos de plásmidos, incluidos IncFII, IncY, IncFIB, IncX1 y Col440II. Nuestros hallazgos podrían ayudar a comprender los mecanismos de resistencia antimicrobiana, la epidemiología genómica y la diseminación del gen mcr-1 entre animales y el medio ambiente, lo que potencialmente podría afectar la salud humana.

3.
Actual. SIDA. infectol ; 31(112): 36-43, 20230000. graf, tab
Artículo en Español | BINACIS, LILACS | ID: biblio-1451840

RESUMEN

Introducción: La incidencia de Enterobacterales resistentes a carbapenemes (ERC) se elevó en la última década, y en especial durante la pandemia de COVID-19. Objetivo: Conocer el perfil de resistencia antimicrobiana, así como la frecuencia y tipo de carbapenemasas presen-tes en los aislamientos de ERC en un hospital regional.Materiales y métodos: Estudio epidemiológico, observa-cional y retrospectivo. Incluyó ERC aislados en muestras clínicas durante 2021 en un hospital regional de Santa Fe, Argentina. El cálculo de la incidencia (aislamientos/pacien-tes-día) e intervalo de confianza 95% (IC 95%), y las pruebas estadísticas se realizaron con OpenEpi.Resultados: 348 ERC aislados (11,9 aislamientos/1000 pacientes-día; IC95% 10,7-13,2). La incidencia se correla-cionó con los casos de COVID-19 (rho=0,874, p<0,001) y fue a expensas de la Unidad de Cuidados Intensivos (76,4%). El principal ERC aislado fue Klebsiella pneumoniae (71,4%, n=260). KPC fue el principal mecanismo de resistencia (61,2%). Se aislaron dos doble productores de carbapene-masas. La tasa global de resistencia a los antibióticos no betalactámicos evaluados fue superior en Klebsiella pneu-moniae que en el resto de los aislamientos resistentes a carbapenemes (60,6% vs. 38,5%, p<0,001). En KPC hubo mayor resistencia a colistin (44,6% vs. 23,9%, p=0,001) y menor a amikacina (23,9% vs. 72,6%, p<0,001).Conclusión: Frente a las escasas opciones terapéuticas en infecciones por ERC se destaca la importancia de conocer los mecanismos de resistencia implicados y la epidemiología local


Introduction: The incidence of carbapenem-resistant Enterobacterales (CRE) rose in the last decade, and especially during the COVID-19 pandemic.Objective: To identify the antimicrobial resistance profile, as well as the frequency and type of carbapenems that were present in CRE isolations in a tertiary care hospital.Materials and methods: Epidemiological, observational and retrospective study. It included CRE isolated in clinical samples during 2021 in a tertiary care hospital in Argentina. Incidences (isolations/patients-day), confidence intervals of 95% (CI 95%) and statistical comparisons were made with OpenEpi.Results: 348 CRE were isolated (11.9 isolations/1,000 patients-day, IC95% 10.7-13.2). Incidence correlated to COVID-19 cases (rho=0.874, p<0.001). Most isolations were from the Intensive Care Unit (76.4%) and the from respiratory samples (27.6%, n=96) and blood cultures (24.4%, n=92). The main isolated CRE was Klebsiella pneumoniae (71.4%, n=260), with a general carbapenem resistance of 53.4%. KPC was the main resistance mechanism (61.2%). Two double carbapenemase-producing Enterobacterales were isolated. Klebsiella pneumoniae presented a higher overall resistance rate to non-betalactam antibiotics (60.6% vs 38.5%, p<0.001). Among CRE, a higher colistin resistance rate was found in KPC isolations (44.6% vs 23.9%, p=0.001) and lower resistance to amikacin (23.9% vs 72.6%, p<0.001).Conclusion: The difficulty in the selection of antibiotic regimens for CRE forces the treating physicians to put emphasis on the knowledge of resistance mechanisms to optimize them


Asunto(s)
Humanos , Masculino , Femenino , Farmacorresistencia Microbiana , Epidemiología , Enterobacteriaceae Resistentes a los Carbapenémicos/aislamiento & purificación , Hospitales Públicos
4.
Rev. Soc. Colomb. Oftalmol ; 56(1): 16-22, 2023. graf
Artículo en Español | LILACS, COLNAL | ID: biblio-1444859

RESUMEN

Introducción: Las infecciones oculares son patologías frecuentes asociadas a secuelas graves como la ceguera y se convierten en un potencial problema en salud pública. Su perfil epidemiológico, en cuanto a su etiología, es conocido a nivel mundial, pero los perfiles locales son desconocidos, limitando los esfuerzos terapéuticos dirigidos para compartir dicho problema. Objetivo: Caracterizar los principales gérmenes encontrados en los cultivos tomados de la córnea y la secreción conjuntival de pacientes de un centro de referencia oftalmológica de Medellín. Método: Estudio descriptivo, observacional y retrospectivo a partir de los resultados de cultivos, realizando un análisis en función de variables categóricas emitiendo porcentajes y frecuencias. Resultados: Se obtuvieron 176 cultivos en total: el 61.4% fue de córnea y el 34.1% de conjuntiva; los gérmenes más frecuentemente aislados fueron Pseudomonas en un 25%, Staphylococcus aureus con un 20% y Fusarium con un 15%. Conclusión: Los gérmenes más frecuentes que encontramos en este estudio coinciden con los que habitualmente se reportan en la literatura


Background: Eye infections are frequent pathologies associated with serious sequelae such as blindness and they become a potential public health problem. Its epidemiological profile, in terms of its etiology, is known worldwide, but the local profiles are unknown, limiting targeted therapeutic efforts to share this problem. Objective: To characterize the main germs found in cultures taken from the cornea and conjunctival secretion of patients at an ophthalmological reference center in Medellín. Method: Descriptive, observational, and retrospective study based on the results of cultures, carrying out an analysis based on categorical variables, issuing percentages and frequencies. Results: A total of 176 cultures were obtained: 61.4% were from the cornea and 34.1% from the conjunctiva; the most frequently isolated germs were Pseudomonas in 25%, Staphylococcus aureus with 20% and Fusarium with 15%. Conclusion: The most frequent germs that we found in this study coincide with those that are usually reported in the literature


Asunto(s)
Humanos
5.
Rev.chil.ortop.traumatol. ; 63(2): 87-92, ago.2022. tab
Artículo en Español | LILACS | ID: biblio-1436086

RESUMEN

INTRODUCCIÓN La infección periprotésica (IPP) es una de las complicaciones más serias en una artroplastia total de rodilla (ATR). Pese a esto, existe poca literatura chilena respecto de esta patología. OBJETIVOS Determinar la incidencia, las comorbilidades, los microorganismos aislados y su susceptibilidad antibiótica, y la morbimortalidad en pacientes con IPP. MATERIALES Y MÉTODOS Estudio descriptivo y retrospectivo en pacientes operados entre 2001 y 2020 por gonartrosis, con una ATR primaria, en un mismo centro de salud, con al menos 1 año de seguimiento. Se excluyeron pacientes operados en otros centros o con registros clínicos incompletos. Se registraron las comorbilidades, los microorganismos aislados, la susceptibilidad antibiótica, y la sobrevida por medio de una búsqueda sistemática de las fichas clínicas de los pacientes con IPP. Se utilizó estadística descriptiva para presentar los datos. RESULTADOS Se incluyeron 544 ATRs, de las cuales 8 (1,47%) presentaron IPP, y los pacientes tenían una edad promedio de presentación de 66 (±5,7) años, e índice de masa corporal (IMC) promedio de 30,3 (±4,5) kg/m2. La mediana de tiempo de presentación de la IPP fue de 411 (±1.034) días. Las principales comorbilidades registradas fueron hipertensión arterial en 5 (62,5%), tabaquismo en 4 (50%) casos, y dislipidemia in 4 (50%) casos. En total, 5 (62,5%) pacientes presentaron etiología polimicrobiana, y en 3 (37,5%) se aisló un solo microorganismo. Los principales agentes aislados fueron Staphylococcus aureus y Staphylococcus coagulasa negativo, ambos multirresistentes, en 6 (75%) y 3 (37,5%) pacientes respectivamente. Todos los pacientes recibieron tres dosis de cefazolina como profilaxis quirúrgica. Se describe una sensibilidad del 100% frente a vancomicina y rifampicina (12/12 cultivos), y una resistencia del 83,4% al ciprofloxacino (4/9 cultivos). Un total de 2 (25%) pacientes fallecieron después de 3 años de la ATR por causas no relacionadas con la IPP. No hubo casos de recidiva infecciosa tras la revisión. CONCLUSIÓN Se encontró una incidencia de 1,47% (8 casos) de IPP. Todos los pacientes con IPP presentaron alguna comorbilidad prequirúrgica. Los principales agentes microbiológicos identificados fueron multirresistentes y susceptibles a vancomicina y rifampicina.


INTRODUCTION Periprosthetic infection (PPI) is one of the most serious complications in total knee arthroplasty (TKA). Despite this, there is little Chilean literature regarding this pathology. OBJETIVES To determine the incidence, comorbidities, isolated microorganisms and their antibiotic susceptibility, morbidity, and mortality in patients with PPI. MATERIALS AND METHODS A descriptive and retrospective study in patients operated between 2001 and 2020 for gonarthrosis, with a primary TKA, in the same health center, with at least 1 year of follow-up. Patients operated on in other centers or with incomplete clinical records were excluded. Comorbidities, isolated microorganisms, antibiotic susceptibility, and survival were recorded through a systematic search of the clinical records of patients with PPI. Descriptive statistics were used to present the data. RESULTS We included 544 TKAs, 8 (1.47%) of which presented PPI, and the patients had an average age at presentation of 66 years ( 5.7 years) and an average body mass index (BMI) of 30.3 ( 4, 5) kg/m2 . The median time of presentation of the PPI was of 411 ( 1,034) days. The main comorbidities recorded were arterial hypertension in 5 (62.5%), smoking in 4 (50%) cases, and dyslipidemia in 4 (50%) cases. In total, 5 (62.5%) patients presented polymicrobial etiology, and in 3 (37.5%), a single microorganism was isolated. The main isolated agents were Staphylococcus aureus and coagulasenegative Staphylococcus, both multidrug-resistant, in 6 (75%) and 3 (37.5%) patients respectively. All patients received three doses of cefazolin as surgical prophylaxis. A sensitivity of 100% to vancomycin and rifampicin (12/12 cultures), and a resistance of 83.4% to ciprofloxacin (4/9 cultures) were described. Overall, 2 (25%) patients died 3 years after the TKA, due to causes unrelated to PPI. There were no cases of infectious relapse after the review. CONCLUSION An incidence of 1.47% (8 cases) of PPI was found. All patients with PPI presented some presurgical comorbidity. The main microbiological agents identified were multidrug-resistant and susceptible to vancomycin and rifampicin


Asunto(s)
Humanos , Masculino , Femenino , Tabaquismo/epidemiología , Infecciones Relacionadas con Prótesis/epidemiología , Artroplastia de Reemplazo de Rodilla/efectos adversos , Diabetes Mellitus/epidemiología , Hipertensión/epidemiología , Staphylococcus aureus/aislamiento & purificación , Comorbilidad , Cefazolina/uso terapéutico , Chile/epidemiología , Epidemiología Descriptiva , Incidencia , Infecciones Relacionadas con Prótesis/tratamiento farmacológico , Antibacterianos/uso terapéutico
6.
Rev. gastroenterol. Peru ; 42(3)jul. 2022.
Artículo en Español | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1423936

RESUMEN

La infección por Helicobacter pylori es bastante común a nivel mundial, y tiene asociación con el adenocarcinoma gástrico. Las altas tasas de resistencia encontradas en países latinoamericanos justifican la investigación de tasas de resistencia local, lo que podría mejorar el enfoque terapéutico y las tasas de erradicación. El objetivo es evaluar la prevalencia de la resistencia de Helicobacter pylori a los antibióticos de uso común en Perú. Se incluyeron todos los estudios en población peruana que revelaron tasas de resistencia antibiótica de Helicobacter pylori. Se realizó una búsqueda sistemática de la literatura hasta enero del 2021, utilizando PubMed y otras bases de datos. Para el grupo de estudios de pacientes con punto de corte EUCAST, la resistencia fue la siguiente: Amoxicilina 14% (IC 95%: 6-25), Claritromicina 43% (IC 95%: 30-57), Metronidazol 58% (IC 95%: 22-90) y Quinolonas 51% (IC 95%: 38-64). Para el grupo de estudios de muestras con punto de corte EUCAST, los siguientes: Amoxicilina 57% (IC del 95%: 51-63), Claritromicina 35% (IC 95% 30-41), Metronidazol 67% (IC 95%: 62-72) y Tetraciclina 4% (IC 95%: 2-7). Se encontró una alta resistencia antibiótica de Helicobacter pylori en la mayoría de los grupos estudiados, aunque con heterogeneidad entre los estudios. La tasa de resistencia a tetraciclinas fue baja y los estudios mostraron ser homogéneos.


Helicobacter pylori infection is quite common worldwide and is associated with gastric adenocarcinoma. The high rates of resistance found in Latin American countries justify the investigation of local resistance rates, which could improve the therapeutic approach and eradication rates. The objective is to evaluate the prevalence of resistance in Peru of Helicobacter pylori to commonly used antibiotics. All studies in the Peruvian population that revealed rates of antibiotic resistance of Helicobacter pylori were included. A systematic literature search was conducted up to January 2021, using PubMed and other databases. For the group of patient studies with the EUCAST cut-off point, the resistance was as follows: Amoxicillin 14% (95% CI: 6-25), Clarithromycin 43% (95% CI: 30-57), Metronidazole 58% (95% CI: 22-90) and 51% Quinolones (95% CI: 38-64). For the EUCAST cut-off group of sample studies, the following: Amoxicillin 57% (95% CI: 51-63), Clarithromycin 35% (95% CI 30-41), Metronidazole 67% (95% CI: 62-72) and 4% Tetracycline (95% CI: 2-7). A high antibiotic resistance of Helicobacter pylori was found in most of the groups studied, although with heterogeneity between the studies. The rate of resistance to tetracyclines was low and the studies were shown to be homogeneous.

7.
Artículo en Español | LILACS, UY-BNMED, BNUY | ID: biblio-1383551

RESUMEN

Las infecciones intrahospitalarias (IIH) son causa de elevada morbimortalidad y representan un problema sanitario importante. El personal de salud es reservorio y potencial transmisor de los agentes etiológicos de las mismas. S. aureus es uno de los microorganismos implicados, por lo tanto es importante conocer la frecuencia de portación en el personal de salud y establecer el perfil de susceptibilidad antimicrobiana para contribuir con la elaboración de medidas de prevención incluyendo actividades educativas. Objetivo: Conocer la frecuencia de portación de S. aureus, distribución y antibiotipos de las cepas presentes en el personal sanitario del Hospital Pediátrico de Referencia (HPR). Materiales y métodos: Se realizó un estudio descriptivo durante el periodo julio-setiembre del año 2018. Se incluyeron muestras de hisopados nasales de trabajadores de la salud de distintas áreas de internación que consintieron participar en el estudio. Se excluyeron aquellos que recibieron antibióticos dentro de los 3 meses previos al estudio. Las muestras fueron sembradas en agar sangre ovina al 5% (ASO) y se incubaron a 35-37ºC en aerobiosis por 24-48 horas. La identificación de las colonias sospechosas de Staphylococcus aureus por métodos convencionales y MALDI-TOF. El patrón de resistencia antimicrobiana de S. aureus se detectó por disco-difusión. En los cultivos resistentes a meticilina (SAMR) se determinó la presencia del gen mecA y se realizó la tipificación del SCCmec por pruebas de reacción en cadena de polimerasa. Resultados: Se obtuvieron 225 hisopados a partir de 225 trabajadores, presentaron desarrollo 212. En 49 se recuperaron cultivos de S. aureus. Correspondieron a SAMR 11 de las 49 cepas, todas portaban el gen mecA. Hubo predominio en el personal de enfermería (7/11), en los servicios de hemato-oncología (3/11) y cuidados intensivos neonatales (4/11). Asociaron resistencia a macrólidos y clindamicina 8 de 11 aislamientos SAMR, a gentamicina 2 y a mupirocina uno. El SCCmec más frecuentemente identificado fue el tipo IV (7/11). Conclusiones: Los resultados muestran la presencia de cepas SAMR entre el personal de salud del CHPR y aportan información complementaria para efectuar prevención y control de las IIH, actuando sobre todo en el personal de salud encargado de la atención de pacientes susceptibles.


Hospital-acquired infections (IIH) are a cause of high morbidity and mortality and represent a major health problem. Health personnel are reservoirs and potential transmitters of their etiological agents. S. aureus is one of the microorganisms involved, therefore it is important to know the frequency of carriage in health personnel and establish the antimicrobial susceptibility profile to contribute to the development of prevention measures, including educational activities. Objective: To know the frequency of carriage of S. aureus, distribution and antibiotypes of the strains present in the health personnel of the Reference Pediatric Hospital (HPR). Materials and methods: A descriptive study was carried out during the period July-September 2018. Nasal swab samples from health workers from different hospitalization areas who agreed to participate in the study were included. Those who received antibiotics within 3 months prior to the study were excluded. The samples were seeded in 5% sheep blood agar (ASO) and incubated at 35-37ºC in aerobiosis for 24-48 hours. Identification of suspicious Staphylococcus aureus colonies by conventional methods and MALDI-TOF. The antimicrobial resistance pattern of S. aureus was detected by disc diffusion. In methicillin-resistant cultures (MRSA), the presence of the mecA gene was determined and SCCmec was typified by polymerase chain reaction tests. Results: 225 swabs were obtained from 225 workers, 212 showed development. S. aureus cultures were recovered from 49. 11 of the 49 strains corresponded to MRSA, all of them carried the mecA gene. There was a predominance in the nursing staff (7/11), in the hematology-oncology services (3/11) and neonatal intensive care (4/11). They associated resistance to macrolides and clindamycin in 8 of 11 MRSA isolates, 2 to gentamicin, and 1 to mupirocin. The most frequently identified SCCmec was type IV (7/11). Conclusions: The results show the presence of MRSA strains among the health personnel of the CHPR and provide complementary information to carry out prevention and control of IIH, acting especially on the health personnel in charge of the care of susceptible patients.


As infecções hospitalares (HII) são causa de alta morbidade e mortalidade e representam um importante problema de saúde. Os profissionais de saúde são reservatórios e potenciais transmissores de seus agentes etiológicos. O S. aureus é um dos micro-organismos envolvidos, por isso é importante conhecer a frequência de portadores em profissionais de saúde e estabelecer o perfil de suscetibilidade antimicrobiana para contribuir no desenvolvimento de medidas de prevenção incluindo atividades educativas. Objetivo: Conhecer a frequência de portadores de S. aureus, distribuição e antibiótipos das cepas presentes no pessoal de saúde do Hospital Pediátrico de Referência (HPR). Materiais e métodos: Foi realizado um estudo descritivo durante o período de julho a setembro de 2018. Foram incluídas amostras de swab nasal de profissionais de saúde de diferentes áreas de internação que concordaram em participar do estudo. Aqueles que receberam antibióticos nos 3 meses anteriores ao estudo foram excluídos. As amostras foram semeadas em 5% de ágar sangue de carneiro (ASO) e incubadas a 35-37ºC em aerobiose por 24-48 horas. Identificação de colônias suspeitas de Staphylococcus aureus por métodos convencionais e MALDI-TOF. O padrão de resistência antimicrobiana de S. aureus foi detectado por difusão em disco. Em culturas resistentes à meticilina (MRSA), a presença do gene mecA foi determinada e SCCmec foi tipificado por testes de reação em cadeia da polimerase. Resultados: 225 swabs foram obtidos de 225 trabalhadores, 212 apresentaram desenvolvimento. Culturas de S. aureus foram recuperadas de 49. 11 das 49 cepas correspondiam a MRSA, todas carregavam o gene mecA. Houve predominância na equipe de enfermagem (7/11), nos serviços de hematologia-oncologia (3/11) e de terapia intensiva neonatal (4/11). Eles associaram resistência a macrolídeos e clindamicina em 8 de 11 isolados de MRSA, 2 à gentamicina e 1 à mupirocina. O SCCmec mais frequentemente identificado foi o tipo IV (7/11). Conclusões: Os resultados mostram a presença de cepas de MRSA entre os profissionais de saúde do CHPR e fornecem informações complementares para realizar a prevenção e controle da HII, atuando principalmente sobre os profissionais de saúde responsáveis ​​pelo atendimento de pacientes suscetíveis.


Asunto(s)
Humanos , Médicos/estadística & datos numéricos , Staphylococcus aureus/aislamiento & purificación , Portador Sano/epidemiología , Staphylococcus aureus Resistente a Meticilina/aislamiento & purificación , Servicio de Limpieza en Hospital/estadística & datos numéricos , Enfermeras y Enfermeros/estadística & datos numéricos , Uruguay/epidemiología , Farmacorresistencia Microbiana/genética , Epidemiología Descriptiva , Estudios Transversales , Hospitales Pediátricos/estadística & datos numéricos , Cavidad Nasal/microbiología
8.
Vive (El Alto) ; 5(13): 22-34, abr. 2022.
Artículo en Español | LILACS | ID: biblio-1410324

RESUMEN

Staphylococcus aureus es un microorganismo que posee características particulares de virulencia y resistencia a los antibióticos. Las infecciones que produce, ocurren mayormente en personas inmunodeprimidas que podrían presentar severas consecuencias, a pesar de la terapia antimicrobiana. Objetivo. Determinar la resistencia de Staphylococcus aureus aislados en ambientes nosocomiales mediante métodos convencionales y moleculares. Materiales y métodos. el estudio presenta un enfoque cuantitativo, investigación de campo, observacional de corte transversal. Se analizó 200 muestras de aislados de ambientes nosocomiales mediante métodos fenotípicos (antibiograma por la técnica de Kirby Bauer) y genotípicos (genes de resistencia blaZ, mecA, y vanA por PCR punto final). Resultados. Los resultados de las pruebas de susceptibilidad antibiótica mostraron que el 100% de las cepas de S. aureus aisladas, fueron resistentes a oxacilina y penicilina g; y sensibles a vancomicina. Conclusiones. los resultados obtenidos en este estudio evidenciaron la presencia de SARM en las diferentes áreas hospitalarias, constituyéndose en un factor de riesgo de transmisión horizontal entre el personal sanitario y los pacientes, razón por la cual es de gran importancia evaluar su prevalencia y establecer medidas rigurosas de prevención y control de su diseminación, para disminuir el riesgo de nuevas infecciones.


Staphylococcus aureus is a microorganism with particular characteristics of virulence and resistance to antibiotics. The infections it produces occur mostly in immunocompromised individuals who may present severe consequences, despite antimicrobial therapy. Objective. To determine the resistance of Staphylococcus aureus isolated in nosocomial environments by conventional and molecular methods. Materials and methods. The study presents a quantitative, field research, observational, cross-sectional approach. Two hundred samples of isolates from nosocomial environments were analyzed by phenotypic (antibiogram by Kirby Bauer technique) and genotypic (resistance genes blaZ, mecA, and vanA by endpoint PCR) methods. Results. The results of the antibiotic susceptibility tests showed that 100% of the S. aureus strains isolated were resistant to oxacillin and penicillin g; and sensitive to vancomycin. Conclusions. the results obtained in this study showed the presence of MRSA in the different hospital areas, constituting a risk factor for horizontal transmission between health personnel and patients, which is why it is of great importance to evaluate its prevalence and establish rigorous measures for the prevention and control of its dissemination, in order to reduce the risk of new infections.


O Staphylococcus aureus é um microorganismo com características particulares de virulência e resistência a antibióticos. As infecções ocorrem principalmente em indivíduos imunocomprometidos que podem ter conseqüências graves, apesar da terapia antimicrobiana. Objetivo. Para determinar a resistência de Staphylococcus aureus isolado em ambientes nosocomiais usando métodos convencionais e moleculares. Materiais e métodos. O estudo apresenta uma abordagem quantitativa, pesquisa de campo, observacional, transversal. Duzentas amostras de isolados de ambientes nosocomiais foram analisadas pelos métodos fenotípico (antibiograma pela técnica de Kirby Bauer) e genotípico (genes de resistência blaZ, mecA, e vanA pelo método de PCR de ponto final). Resultados. Os resultados dos testes de suscetibilidade aos antibióticos mostraram que 100% das cepas de S. aureus isoladas eram resistentes à oxacilina e penicilina g; e sensíveis à vancomicina. Conclusões. Os resultados obtidos neste estudo mostraram a presença de MRSA nas diferentes áreas hospitalares, constituindo um fator de risco para a transmissão horizontal entre o pessoal de saúde e os pacientes, razão pela qual é de grande importância avaliar sua prevalência e estabelecer medidas rigorosas para a prevenção e controle de sua disseminação, a fim de reduzir o risco de novas infecções.


Asunto(s)
Staphylococcus aureus
9.
Rev. colomb. ciencias quim. farm ; 50(3)Sep.-Dec. 2021.
Artículo en Inglés | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1535796

RESUMEN

SUMMARY Introduction: The capacity of resistance to ß-lactam among enterobacteriales is notable, mainly into water environment. Herein, many species of this family have the ability to carrier and produce ß-lactamases enzymes, such as extended-spectrum ß-lactamases (ESBLs) and carbapenemases. However, contrary to clinical settings, where the distribution of resistant bacteria is well documented, the evidence of resistant pathogens in the domestic sewage has been little explored, especially in Brazil. Thus, we aimed to investigate the occurrence of ESBL and carbapenemases between ampicillin-resistant enterobacteriales recovered from a municipal raw sewage in Minas Gerais, Brazil. Methods: Enterobacteriales were isolated from sewage samples on MacConkey agar supplemented with ampicillin. Species identification was performed by biochemical and morphological methods and the resistance profile determined by the Kirby-Bauer test. The production of ESBL and carbapenemase was investigated in all isolates by phenotypic tests. Results and discussion: A total of 45 species of enterobacteriales resistant to ampicillin were recovered (37 Escherichia coli, four Klebsiella pneumoniae, and one Klebsiella oxytoca, Citrobacter freundii and Pantoea agglomerans). Most isolates showed a high ß-lactam susceptibility profile (14/45, 31.1 %), however E. coli with decreased susceptibility to imipenem was detected (2/37; 2.7 %). ESBL-positive isolates were mostly identified as E. coli (10/45; 22.2 %), but no isolates were positive carbapenemase. Conclusion: Domestic sewage is an important source of ß-lactams resistant determinants in Brazil.


Introdução: a capacidade de resistência aos beta-lactâmicos entre enterobacteriales é notável, principalmente no ambiente aquático. Nessa direção, muitas espécies desta família têm a capacidade de transportar e produzir enzimas ß-lactamases, especialmente a ß-lactamases de espectro estendido (ESBL) e as carbapenemases. Porém, ao contrário do cenário clínico, onde a distribuição de bactérias resistentes é bem documentada, as evidências de patógenos resistentes no esgoto doméstico têm sido pouco exploradas, principalmente no Brasil. Assim, objetivamos investigar a ocorrência de ESBL e carbapenemases entre enterobacteriales resistentes à ampicilina recuperadas de um esgoto bruto municipal em Minas Gerais, Brasil. Métodos: enterobacteriales foram isoladas de amostras de esgoto em ágar MacConkey suplementado com ampicilina. A identificação das espécies foi realizada por métodos bioquímicos e morfológicos e o perfil de resistência determinado pelo teste de Kirby-Bauer. A produção de ESBL e carbapenemase foi investigada em todos os isolados por testes fenotípicos. Resultados e discussão: foram recuperadas 45 isolados de enterobacteriales resistentes à ampicilina (37 Escherichia coli, quatro Klebsiella pneumoniae e uma Klebsiella oxytoca, Citrobacter freundii e Pantoea agglomerans). A maioria dos isolados apresentou um perfil de alta susceptibilidade aos ß-lactâmicos (14/45, 31,1 %), porém E. coli com susceptibilidade diminuída ao imipenem foi detectada (2/37; 2,7 %). Os isolados ESBL-positivos foram identificados principalmente como E. coli (10/45; 22,2 %), mas nenhum isolado foi positivo para a carbapenemase. Conclusão: o esgoto doméstico é uma importante fonte de determinantes de resistência aos ß-lactâmicos no Brasil.


Introducción: la capacidad de resistencia a betalactámicos entre enterobacteriales es notable, principalmente en el medio acuático. En este sentido, muchas especies de esta familia tienen la capacidad de transportar y producir enzimas ß-lactamasas, especialmente ß-lactamasas de espectro extendido (BLEE) y carbapenemasas. Sin embargo, en contraste con el escenario clínico, donde la distribución de bacterias resistentes está bien documentada, la evidencia de patógenos resistentes en las aguas residuales domésticas ha sido poco explorada, especialmente en Brasil. Por lo tanto, nuestro objetivo es investigar la ocurrencia de BLEE y carbapenemasas entre enterobacteriales resistentes a ampicilina recuperadas de un alcantarillado municipal sin tratar en Minas Gerais, Brasil. Métodos: se aislaron enterobacteriales de muestras de aguas residuales en agar MacConkey suplementado con ampicilina. La identificación de las especies se realizó mediante métodos bioquímicos y morfológicos y el perfil de resistencia se determinó mediante la prueba de Kirby-Bauer. La producción de BLEE y carbapenemasa se investigó en todos los aislamientos mediante pruebas fenotípicas. Resultados y discusión: se recuperaron 45 aislamientos de enterobacteriales resistentes a ampicilina (37 Escherichia coli, cuatro Klebsiella pneumoniae y una Klebsiella oxytoca, Citrobacter freundii y Pantoea agglomerans). La mayoría de los aislamientos tenían un perfil de susceptibilidad alto a los (3-lactámicos (14/45, 31,1 %), pero se detectó E. coli con susceptibilidad reducida al imipenem (2/37; 2,7 %). Los aislamientos positivos para BLEE se identificaron principalmente como E. coli (10/45; 22,2 %), pero ningún aislado fue positivo para carbapenemasa. Conclusión: las aguas residuales domésticas son una fuente importante de determinantes de la resistencia a los ß-lactámicos en Brasil.

10.
Vive (El Alto) ; 4(12): 484-499, dic. 2021.
Artículo en Español | LILACS | ID: biblio-1390553

RESUMEN

La Pseudomona aeruginosa es un patógeno nosocomial por excelencia; la aparición de cepas multidrogoresistentes (MDR) y extremodrogoresistentes (XDR) cada vez es más frecuente y genera gran preocupación; el uso indiscriminado de antibióticos ha ocasionado esta situación. El objetivo de este estudio fue conocer los diferentes perfiles de resistencia que presentan los aislados objetos de estudio según su procedencia, ya sea a nivel intrahospitalario o de origen comunitario además de caracterizar los principales mecanismos de resistencia y antibiotipos. La presente investigación fue de tipo documental, descriptiva, de corte transversal, para lo cual se utilizó los datos acumulados de susceptibilidad reportados por el departamento de microbiología del Hospital General Docente durante el enero de 2015 hasta diciembre de 2019. Se encontró que en este hospital existe una mayor prevalencia de resistencia a aminoglucósidos (20-25%), fluoroquinolonas (22-25%) y carbapenémicos (19-21%); siendo P. aeruginosa la especie más prevalente. Respecto al tipo de carbapenemasas que son las de interés clínico por su limitante opción terapéutica, se identificó una cepa con fenotipo compatible con metalobetalamasa, se presume que el mecanismo de resistencia predominante fue impermeabilidad. No se identificaron cepas PDR, pero el 21,6% se mostraron con un perfil MDR, aisladas principalmente en los servicios hospitalarios al igual que las cepas XDR.


Pseudomonas aeruginosa is a nosocomial pathogen par excellence; the appearance of multidrug resistant (MDR) and extreme drug resistant (XDR) strains is becoming more frequent and is causing great concern; the indiscriminate use of antibiotics has caused this situation. The objective of this study was to know the different resistance profiles presented by the isolated objects of study according to their origin, either at the intrahospital level or of community origin, in addition to characterizing the main resistance mechanisms and antibiotypes. The present investigation was of a documentary, descriptive, cross-sectional type, for which the accumulated susceptibility data reported by the microbiology department of the General Teaching Hospital from January 2015 to December 2019 was used. It was found that in this hospital there is a higher prevalence of resistance to aminoglycosides (20-25%), fluoroquinolones (22-25%) and carbapenems (19-21%); being P. aeruginosa the most prevalent species. Regarding the type of carbapenemases that are of clinical interest due to their limiting therapeutic option, a strain with a phenotype compatible with metallobetalamase was identified, it is presumed that the predominant resistance mechanism was impermeability. No PDR strains were identified, but 21.6% were shown with an MDR profile, isolated mainly in hospital services as well as the XDR strains.


Pseudomonas aeruginosa é um patógeno nosocomial por excelência; o aparecimento de cepas multirresistentes (MDR) e extremamente resistentes aos medicamentos (XDR) está se tornando mais frequente e causando grande preocupação; o uso indiscriminado de antibióticos tem causado essa situação. O objetivo deste estudo foi conhecer os diferentes perfis de resistência apresentados pelos objetos isolados de estudo de acordo com sua origem, seja em nível intra-hospitalar ou de origem comunitária, além de caracterizar os principais mecanismos de resistência e antibióticos. A presente investigação foi do tipo documental, descritiva, transversal, para a qual foram utilizados os dados de suscetibilidade acumulada reportados pelo departamento de microbiologia do Hospital Geral Universitário no período de janeiro de 2015 a dezembro de 2019. Verificou-se que neste hospital há maior prevalência de resistência aos aminoglicosídeos (20-25%), fluoroquinolonas (22-25%) e carbapenêmicos (19-21%); sendo P. aeruginosa a espécie mais prevalente. Em relação aos tipos de carbapenemases de interesse clínico devido à sua opção terapêutica limitante, foi identificada uma cepa com fenótipo compatível com metalobetalamase, presume-se que o mecanismo de resistência predominante foi a impermeabilidade. Nenhuma cepa PDR foi identificada, mas 21,6% mostraram ter um perfil MDR, isolado principalmente em serviços hospitalares, bem como as cepas XDR.


Asunto(s)
Antibacterianos , Pseudomonas , Servicios Técnicos en Hospital
11.
Medicina UPB ; 40(2): 33-40, 13 oct. 2021. tab
Artículo en Español | LILACS, COLNAL | ID: biblio-1342178

RESUMEN

Objetivo: caracterizar desde el punto de vista microbiológico las infecciones periprotesicas (IP) de los pacientes sometidos a remplazo articular de rodilla o cadera, en la IPS universitaria Clínica León XIII, y evidenciar los patrones más comunes de resistencia a los antibióticos, en el periodo 2015-2018. Metodología: se recolectó información de 25 pacientes llevados a remplazo articular de rodilla o cadera en la IPS universitaria, sede Clínica León XIII, durante el periodo de 2015-2018, que desarrollaron IP. Se obtuvo información sobre características demográfica, clínicas y patrones de resistencia (según antibiograma), y sobre los criterios usados para diagnosticarla. Los datos se registraron, según la naturaleza y distribución de la variable, en medias o medianas para las variables cuantitativas, y en frecuencias para las cualitativas. Resultados: entre 2015 y 2018 se realizaron 541 remplazos articulares, la incidencia de infección periprotésica fue de 4.6% (25 pacientes), 22 casos (88%) con crecimiento microbiológico. El germen más frecuente fue el S. aureus, con patrón alto de resistencia para meticilina (SAMR), en el 44%. Seguido por K. pneumoniae, con un patrón de resistencia por producción de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) de 83%. Ninguno tuvo resistencia a los carbapenémicos. Conclusiones: los resultados son similares a los reportados en la literatura internacional. Sigue siendo el S. aureus el principal causante de la infección periprotésica, seguido de los gérmenes gram negativos.


Objective: to microbiologically characterize the periprosthetic infections (PI) of patients undergoing knee or hip joint replacement at IPS Universitaria Clínica León XXIIIin the period 2015-2018, and to demonstrate the most common antibiotic resistance patterns. Methodology: the information was collected from 25 patients undergoing knee or hip joint replacement at IPS Universitaria Clínica León XXIII during the period 2015-2018 who developed PI. Data was obtained on demographic, clinical characteristics, and antibiotic resistance patterns (according to antibiograms), as well as on the diagnostic criteria used to diagnose it. The data was recorded, according to the nature and distribution of the variable, in means or medians for the quantitative variables, and in frequencies for the qualitative variables.Results:between 2015-2018, 541 joint replacements were performed. There was an incidence of periprosthetic infection in 25 patients (4.6%), 22 of whom (88%) had micro-biological growth. The most frequent germ was S. aureus, which had a high resistance pattern for methicillin-resistant S. aureus (MRSA) in 44%, followed by K. pneumoniaewith a positive extended spectrum beta-lactamase (ESBL) in 83%. None of them showed resistance to carbapenems.Conclusions: the results found are similar to those reported in the international lite-rature. This investigation evidenced that S. aureus continues to be the main cause of periprosthetic infection, followed by gram-negative germs.


Objetivo: caracterizar do ponto de vista microbiológico as infecções periprotéticas (IP) dos pacientes submetidos à artroplastia articular do joelho ou do quadril, na IPS universitário, Clínica León XIII, e demonstrar os padrões mais comuns de resistência aos antibióticos, em o período 2015-2018.Metodologia: foram coletadas informações de 25 pacientes encaminhados para prótese de joelho ou quadril no IPS universitário, sede da Clínica León XIII, no período 2015-2018, que desenvolveram IP. Foram obtidas informações sobre as características demográfi-cas, clínicas e padrões de resistência (de acordo com antibiograma) e sobre os critérios usados para diagnosticá-la. Os dados foram registrados, de acordo com a natureza e distribuição da variável, em médias ou medianas para as variáveis quantitativas e em frequências para as qualitativas.Resultados: entre 2015 e 2018, foram realizadas 541 substituições articulares, a incidência de infecção periprotética foi de 4,6% (25 pacientes), 22 casos (88%) com crescimento microbiológico. O germe mais frequente foi S. aureus, com alto padrão de resistência à meticilina (MRSA), em 44%. Seguido por K. pneumoniae, com padrão de resistência devido à produção de beta-lactamase de espectro estendido (ESBL) de 83%. Nenhum apresentou resistência aos carbapenêmicos.Conclusões: os resultados são semelhantes aos relatados na literatura internacional. S. aureus continua a ser a principal causa de infecção periprotética, seguido por germes gram-negativos.


Asunto(s)
Humanos , Prótesis e Implantes , Farmacorresistencia Microbiana , Staphylococcus aureus Resistente a Meticilina , Articulación de la Cadera , Infecciones , Articulaciones , Rodilla , Antibacterianos
12.
Braz. dent. sci ; 24(3): 1-6, 2021. tab
Artículo en Inglés | LILACS, BBO | ID: biblio-1281111

RESUMEN

Objective: Antibiotic resistance is one of the most threatening public health problems of 20th century. Along with physicians, dental practitioners also routinely prescribe medications for oral and dental infections. However, previous studies have shown that dental surgeons often prescribe antibiotics where new evidence have suggested other treatment measures. Since students in their clinical year prescribe antibiotics under supervision, it is important to understand if they are aware of severity of antibiotic resistance and its impact. Hence, the study aimed to assess awareness of antibiotic use and resistance amongst dental students. Material and Methods: Cross-sectional survey was conducted amongst 3rd and 4th year dental students of 4 colleges of Pakistan. A validated questionnaire was adopted from WHO and PHE (Public Health England). It included true or false and Likert scale questions relating to knowledge and attitude of antibiotic use and antibiotic resistance. Results:Out of 396 responses, majority students were not aware of the terms superbugs (69.7%) and AMR (79%). 89.6% thought that humans can become resistant to antibiotics. 88.6% agreed that antibiotic resistance is a major threat. 61.4% thought they couldn't do much to stop antibiotic resistance. 87.6% agreed that doctors should only prescribe antibiotics when needed. Conclusion: Overall dental students were aware of antibiotic use and importance of antibiotic resistance although their knowledge associated with antibiotic resistance was not satisfactory. It is vital that students must be taught about mechanism of antibiotic resistance and good prescription practices. (AU)


Objetivo: A resistência antibiótica é um dos problemas de saúde pública mais ameaçadores do século 20. Assim como os médicos, os profissionais de odontologia também prescrevem rotineiramente medicamentos para infecções bucais e dentárias. No entanto, estudos prévios apontam que cirurgiões-dentistas prescrevem antibióticos para casos nos quais, as mais recentes evidências, indicam outros tipos de intervenção. Considerando que os estudantes prescrevem antibióticos durante estágios clínicos, sob supervisão, torna-se pertinente averiguar se os mesmos estão cientes da severidade da resistência antibiótica e as suas implicações. Assim, o objetivo deste estudo foi investigar o grau de conscientização quanto ao uso e a resistancia antibiótica entre os estudantes de odontologia. Material e Métodos: Pesquisa transversal foi conduzida entre os estudantes do 3o e 4o ano em 4 universidades do Paquistão. Foram utilizados questionários validados pela Organização mundial de Saúde e Saúde pública da Inglaterra. Estes incluíram perguntas de verdadeiro ou falso e escala relacionadas ao conhecimento e aplicação de antibióticos e resistência à estes. Resultados: Dentre as 396 respostas, a maioria dos estudantes não conhecia o termo superbactéria (69.7%) e AMR (79%). 89,6% pensaram que humanos podem se tornar resistentes à antibióticos. 88,6% concordaram que a resistência à antibióticos é uma grande ameaça. 61,4% pensaram que eles não havia muito o que eles pudessem fazer para combater a resistência antibiótica. 87.,6% concordaram que médicos devem prescrever antibióticos apenas quando estritamente necessário. Conclusão: No geral, estudantes de Odontologia estão cientes do uso de antibióticos e a importância da resistência antimicrobiana embora o seu conhecimento a cerca do assunto não seja satisfatório. É vital que os estudantes sejam orientados sobre os mecanismos de resistência antibiótica e as práticas adequadas de prescrição desses medicamentos (AU)


Asunto(s)
Humanos , Estudiantes de Odontología , Farmacorresistencia Microbiana , Conocimiento
13.
Rev. argent. microbiol ; Rev. argent. microbiol;52(3): 21-30, Sept. 2020. graf
Artículo en Inglés | LILACS | ID: biblio-1340901

RESUMEN

Abstract Cystic fibrosis patients with Burkholderia cepacia complex pulmonary infections have high morbidity and mortality. Worldwide, this disease is undergoing substantial epidemiological changes. Advances in the diagnosis and treatment have conditioned an increase in child sur-vival as well as in the proportion of affected adults. In order to know our reality, we refer to an epidemiological study in 64 CF patients during 11 years of surveillance, focusing on infections caused by Burkholderia species. Conventional and automated phenotypic tests, restriction fragment length polymorphism-recA, recA gene sequencing, and matrix-assisted laser desorp-tion ionization-time of flight (MALDI-TOF) mass spectrometry were applied. Bacterial isolates were also tested for antimicrobial susceptibility patterns. The prevalence of Burkholderia cepacia complex was 9.4%. Based on recA gene sequencing, the most common species identified were Burkholderia cenocepacia (67.3%) and Burkholderia vietnamiensis (20.3%). Ceftazidime and meropenem were the most active, inhibiting 53% and 46% of isolates, respectively. This report represents the first systematic study of Burkholderia infections in our CF population since beginning of monitoring and treatment and highlights the importance of continued longitudinal studies.


Resumen Los pacientes con fibrosis quística (FQ) con infecciones pulmonares causadas por especies del complejo Burkholderia cepacia tienen una alta morbimortalidad. En todo el mundo, esta enfermedad está experimentando cambios epidemiológicos sustanciales. Los avances en el diagnóstico y el tratamiento han condicionado un aumento en la supervivencia infantil, así como en la proporción de adultos afectados. Para conocer nuestra realidad, nos referimos a un estudio epidemiológico en 64 pacientes con FQ durante 11 años de vigilancia, focalizando las infecciones causadas por especies del género Burkholderia. Se aplicaron pruebas fenotípicas convencionales y automatizadas, polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción-recA, secuenciación del gen recA y espectrometría de masa MALDI-TOF. Los aislados bacterianos también se analizaron para determinar los patrones de susceptibilidad antimicrobiana. La prevalencia de complejo B. cepacia fue del 9,4%. Con base en la secuenciación del gen recA, las especies más comunes identificadas fueron Burkholderia cenocepacia (67,3%) y Burkholderia vietnamiensis (20,3%). Ceftazidima y meropenem fueron los antibióticos más activos e inhibieron el 53 y el 46% de los aislamientos, respectivamente. Este informe representa el primer estudio sistemático de las infecciones por Burkholderia en nuestra población desde el comienzo de la monitorización y el tratamiento, y resalta la importancia de continuar los estudios de vigilancia longitudinales.


Asunto(s)
Adulto , Niño , Humanos , Fibrosis Quística , Complejo Burkholderia cepacia , Argentina/epidemiología , Espectrometría de Masa por Láser de Matriz Asistida de Ionización Desorción , Burkholderia , Fibrosis Quística/complicaciones , Complejo Burkholderia cepacia/genética
14.
Rev. cienc. salud (Bogotá) ; 18(2): 1-11, mayo-ago. 2020. tab
Artículo en Inglés | LILACS, COLNAL | ID: biblio-1126242

RESUMEN

Abstract Introduction: Urinary tract infections (UTIS) are the second most frequent reason for healthcare visits, and antibiotic resistance among gram-negative bacteria of the Enterobacteriaceae family has increased significantly worldwide. The emergence of microorganisms that produce extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) is especially problematic. This study aims to identify factors associated with the presence of UTI caused by ESBL-producing pathogens. Material and methods: An analytical cross-sectional study was conducted, and the urine culture database from a private healthcare clinic was analyzed. Factors possibly associated with the appearance of UTIS due to ESBL-producing pathogens were analyzed, including sex, age, number of hospitalizations, and previous UTIS. Results: A total of 1405 positive urine cultures were studied, 85.48% of which belonged to women. The mean age of the subjects was 39.98 ± 24.51 years, 24.13% of whom were over 60 years old. Of these, 55.56% had been attended on an outpatient basis. Almost half (49.18%) of the cultures tested positive for ESBL-related UTI, 96.58% of which had not presented with a previous UTI. A statistically significant association was found between sex and the development of UTI caused by ESBL-producing microorganisms (p = 0.007), with the male sex having the highest association (prevalence ratio, 1.224; 95% confidence interval: 1.035-1.448). In addition, age, number of previous hospitalizations, and prior intensive care unit admissions also showed associations with UTI development. No association was found with the presence of previous UTIS. Conclusion: A high frequency of UTIS were ESBL-related, and the factors associated with ESBL-related UTIS were male sex, age >60, and previous hospitalizations.


Resumen Introducción: las infecciones del tracto urinario (ITU) son el segundo motivo más frecuente de atención médica, y la resistencia a los antibióticos entre las enterobacterias gramnegativas ha aumentado de manera importante en todo el mundo, dada la aparición de organismos productores de betalactamasa de espectro extendido (BLEE). Se busca identificar factores asociados a la presencia de ITU por patógeno productor de BLEE. Materiales y métodos: se realizó un estudio trasversal analítico, un análisis de la base de datos de urocultivos de una clínica privada y una evaluación de los factores posiblemente asociados a la presentación de ITU por el microorganismo BLEE, como el sexo, la edad, el número de hospitalizaciones e ITU previas. Resultados: se estudiaron 1405 urocultivos positivos y se encontró que el 85.48 % fueron de sexo femenino. La edad media de la población fue de 39.98 ± 24.51 años, el 24.13 % de edad mayor a 60 años, y el 55.56 % habían sido atendidos ambulatoriamente. El 49.18 % de los cultivos fue positivo para ITU BLEE, de los cuales el 96,58 % no habían presentado una ITU previa. Se encontró que existe una asociación estadísticamente significativa (0,007; p < 0,05) entre el sexo y el desarrollo de ITU por microorganismo productor de BLEE. El masculino es el de mayor asociación (OR 1,224; IC95 %: 1,035-1,448). También se encontró una asociación con la edad, el número de hospitalizaciones previas y haber estado en UCI. No se encontró ninguna asociación entre la presencia de ITU previas. Conclusiones: existe una elevada frecuencia de ITU BLEE, y los factores asociados a dicha infección fueron tener sexo masculino, una edad mayor a 60 años y hospitalizaciones previas.


Resumo Introdugao: as infeções do trato urinário (ITU) são o segundo motivo mais frequente de atenção médica e a resistência aos antibióticos entre as enterobactérias gram-negativas tem aumentado de maneira importante no mundo todo; destacado pela aparição de organismos produtores de betalactamase de espectro estendido (BLEE). Busca-se identificar fatores associados á presenta de ITU por patógeno produtor de BLEE. Materiais e métodos: se realizou estudo transversal analítico, analisando a base de dados de urocultura de uma clínica privada, avaliando fatores possivelmente associados á apresentação de ITU por microrganismo BLEE, como o sexo, a idade, o número de hospitalizar es e ITU prévias. Resultados: estudaram-se 1405 uroculturas positivas, encontrado que o 85,48% foram de sexo feminino. A idade média da populacho foi de 39.98 ± 24.51 anos, 24.13% de idade maior a 60 anos, 55.56% tinham sido atendidos ambulatoriamente. O 49.18% dos cultivos foi positivo para ITU BLEE, dos quais 96.58% não tinham apresentado uma ITU prévia. Se encontrou que existe associação estatisticamente significativa (0.007; p < 0.05) entre o sexo e o desenvolvimento de ITU por microrganismo produtor de BLEE, sendo o masculino o de maior associação (OR 1,224; IC 95%: 1,035-1,448). Além disso, tanto a idade quanto o número de hospitalizares prévias, e ter estado em UCI também mostraram associação. Não se encontrou associação entre a presença de ITU prévias. Conclusoes: existe uma elevada frequência de ITU BLEE e os fatores associados a infecto por ITU BLEE foram o sexo masculino, idade > 60 anos e hospitalização prévias.


Asunto(s)
Humanos , Enfermedades Urológicas , beta-Lactamasas , Farmacorresistencia Microbiana
15.
Kasmera ; 48(2): e48232378, jul-dic. 2020.
Artículo en Español | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1145314

RESUMEN

La resistencia de K. pneumoniae a los antibióticos ß-lactámicos es un problema de salud pública. El objetivo fue caracterizar por epidemiología molecular aislados de K. pneumoniae resistentes a los antibióticos ß-lactámicos en cuatro Centros Asistenciales del Estado Aragua y establecer asociaciones entre los genotipos con la resistencia y las variables epidemiológicas. Se procesaron 72 cepas de K. pneumoniae y su resistencia a ß-lactámicos se realizó según las directrices del CLSI. Para la detección fenotípica de ß-lactamasa de Espectro Extendido (BLEE) se usó la sinergia de doble disco, mientras que para detectar metalobetalactamasa (MBLs), carbapemenasas (KPC) y AmpC inducible se utilizaron las combinaciones de discos de EDTA/imipenem/meropenem, ácido fenilborónico/meropenem/imipenem y piperacilina tazobactam/ceftazidima/Imipenem/cefoxitin respectivamente. La tipificación molecular se realizó por la reacción en cadena de la polimerasa de las secuencias repetitivas extragénicas palindrómicas. Solo 35 cepas (48,6%) fueron resistentes a todos los ß-lactámicos. El 34,29%; 31,43% y 31,43% resultaron ser productoras de BLEE, KPC y MBLs respectivamente, y 2,86% AmpC inducible. Se identificaron siete genotipos, donde el tipo B agrupó 23 cepas idénticas que se diseminan clonalmente. Se encontró una relación estadísticamente significativa entre el genotipo, la edad y el género. En conclusión, K. pneumoniae es altamente resistente a los antibióticos ß-lactámicos


K. pneumoniae resistance to ß-lactam antibiotics is a public health problem. The objective was to characterize by molecular epidemiology isolates of K. pneumoniae resistant to ß-lactams in four Health Centers of the Aragua State and establish the association between genotypes with resistance and epidemiological variables. 72 strains of K. pneumoniae were processed and their resistance to ß-lactams was performed according to the CLSI guidelines. Double disc synergy was used for phenotypic detection of Extended Spectrum ß-lactamase or ESBL. Combinations of EDTA/imipenem/meropenem; phenylboronic acid/meropenem/imipenem and piperacillin tazobactam/ ceftazidime/Imipenem/cefoxitin were used to detect metallo-beta-lactamase or MBLs, carbapenemases (KPC) and inducible AmpC respectively. Molecular typing was performed by polymerase chain reaction of palindromic extragenic repetitive sequences. Only 35 strains (48.6%) were resistant to all ß-lactams. 34.29%; 31.43% and 31.43% turned out to be ESBL, KPC and MBLs respectively, and 2.86% inducible AmpC. Seven genotypes were identified, where type B grouped 23 genetically identical strains and clonally spreaded. A statistically significant relationship was found between genotype, age and gender. In conclusion, K. pneumoniae is highly resistant to ß-lactams

16.
Salud UNINORTE ; 36(1): 298-324, ene.-abr. 2020. tab, graf
Artículo en Español | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1252133

RESUMEN

RESUMEN Los microorganismos, especialmente las bacterias, están distribuidos por todo el mundo, desde el suelo, los mares y los ríos hasta el sistema digestivo de los animales y los seres humanos; por lo tanto, las bacterias mantienen una interacción constante con los compuestos utilizados por los seres humanos y los animales como los antibióticos, y con otros microorganismos que pueden ser de la misma especie o de diferentes géneros taxonómicos; esta interacción podría dar lugar a una presión selectiva sobre las bacterias en el medio ambiente y promover el intercambio de material genético, lo que llevaría a una propagación global de la resistencia a los antibióticos y a una afectación mundial de la salud. En este contexto, esta revisión tiene por objeto ofrecer una visión general del papel de los seres humanos, los animales y el medio ambiente en la resistencia bacteriana, con énfasis en los procesos en el suelo y los medios acuáticos y los efectos sobre la salud humana.


ABSTRACT Microorganisms, especially bacteria, are distributed throughout the world, from the soil, seas and rivers to the digestive system of animals and humans. Therefore, the bacteria maintain a constant interaction with compounds used by humans and animals, such as antibiotics, and with other microorganisms that may be of the same species or of different taxonomic genera. In addition, this interaction could lead to selective pressure on bacteria in the environment and promote the exchange of genetic material, which would allow to a global spread of antibiotic resistance and thus a worldwide affectation on health. In this context, the present review aims to provide an overview of the role of humans, animals and the environment in bacterial resistance, with emphasis on soil and aquatic processes and effects on human health.

17.
J. pediatr. (Rio J.) ; J. pediatr. (Rio J.);96(supl.1): 111-119, Mar.-Apr. 2020.
Artículo en Inglés | LILACS | ID: biblio-1098351

RESUMEN

Abstract Objective To analyze the main cause of the irresponsible use of antibiotics at the pediatric level in a very frequent, usually self-limited, and typically viral condition: upper airway respiratory infections. Sources Different databases were searched using specific terms related to resistance to antibiotics, upper airway respiratory infections, and pediatrics patients. Summary of the findings Effectiveness varies depending on the place, the form of intervention, and the resources used. Multiple interventions appear to be more effective. The foundations of treatment are training in technical aspects and in communication skills for the prescribers, and having enough time for each patient; and training through the health clinic and the media for patients/parents. Deferred prescription and the use of rapid diagnostic tests in the primary care setting have been shown to be effective. A fluid relationship based on trust between clinicians and parents/guardians is one of the keystones. Conclusions Any project that seeks to be totally effective must include a health authority, which in addition to helping implement these measures, has the firm intention of drastically reducing the use of antibiotics in animals and in the environment, as well as favoring research into new antimicrobials.


Resumo Objetivo Analisar a principal causa do uso irresponsável de antibióticos em nível pediátrico de doenças muito frequentes, normalmente autolimitadas e virais: infecções respiratórias das vias aéreas superiores. Fontes Diferentes bases de dados foram pesquisadas com termos específicos relacionados à resistência a antibióticos, infecções respiratórias das vias aéreas superiores e pacientes de pediatria. Resumo dos achados A eficácia varia, depende do local, da forma e dos recursos usados. As formas de múltiplas intervenções parecem mais eficazes. O treinamento em aspectos técnicos e habilidades de comunicação para médicos e tempo suficiente para cada paciente, além do treinamento por meio da clínica e da mídia para pacientes/pais, são a base da eficácia. Prescrições de uso posterior e testes de diagnóstico rápido no ambiente de cuidado primário mostraram ser eficazes. Uma relação de confiança entre médicos e pais ou responsáveis é uma das pedras angulares. Conclusões Qualquer projeto que busque ser completamente eficaz deve incluir uma autoridade em saúde, que, além de ajudar a implantar as medidas nos pacientes, tem a sólida intenção de reduzir drasticamente o uso de antibióticos em animais e no meio ambiente, além de favorecer a pesquisa sobre novos antimicrobianos.


Asunto(s)
Humanos , Niño , Infecciones del Sistema Respiratorio/tratamiento farmacológico , Antibacterianos/uso terapéutico , Padres , Atención Primaria de Salud
18.
Rev. cuba. med. trop ; 71(1): e315, ene.-abr. 2019. tab
Artículo en Inglés | LILACS, CUMED | ID: biblio-1093550

RESUMEN

According to the World Health Organization, diarrheal infections cause 525 000 deaths of children under five years of age every year, and shigellosis. Shigellosis is a relevant cause of dysentery, which increases the morbidity and mortality in pediatric patients. Therefore, emergingthe emergence of antimicrobial resistant strains of Shigella is a concerningworrisome problem worldwide. We report the case of a 7-year-old patient with acute dysentery caused by CTX-M Type ESBL Producing Shigella flexneri, being. This was the first case treated in the Specialties Hospital of Specialties of the Armed Forces N°1, in Quito, Ecuador. The antibiogram demonstrated sensibilityshowed sensitivity to ampicillin-sulbactam. As a result, after five days of microbiologically directed treatment, the patient improved his condition without relapse. Proper clinical diagnoses and accurate laboratory studies like stool culture and antibiogram are crucial to givingindicate an appropriate therapy in infections caused by Shigella and other enteric bacilli(AU)


Según la Organización Mundial de la Salud, las infecciones diarreicas provocan 525 000 muertes de niños menores de cinco años de edad cada año. La shigelosis es una causa importante de disentería que aumenta la morbilidad y mortalidad de los pacientes pediátricos. Es por eso que el surgimiento de cepas de Shigella resistentes a los antibióticos es un preocupante problema a nivel mundial. Presentamos el caso de un paciente de 7 años de edad con disentería aguda provocada por Shigella flexneri productora de BLEE tipo CTX-M. Se trata del primer caso tratado en el Hospital de Especialidades de las Fuerzas Armadas Nº 1, en Quito, Ecuador. El antibiograma mostró sensibilidad a la combinación ampicilina/sulbactam. Al cabo de cinco días de tratamiento microbiológico, el paciente mejoró su estado y no se produjeron recaídas. Un diagnóstico clínico correcto, así como estudios precisos de laboratorio como los cultivos de heces y los antibiogramas, son vitales para indicar una terapia apropiada en las infecciones causadas por Shigella y otros bacilos entéricos(AU)


Asunto(s)
Humanos , Masculino , Niño , Diagnóstico Clínico , Disentería/prevención & control , Disentería Bacilar/tratamiento farmacológico , Pruebas de Sensibilidad Microbiana/métodos
19.
Rev. argent. microbiol ; Rev. argent. microbiol;51(1): 26-31, mar. 2019. tab
Artículo en Español | LILACS | ID: biblio-1003277

RESUMEN

Los estreptococos del grupo viridans (EGV) son agentes causales de infecciones localizadas e invasivas. Dada la gravedad de las infecciones producidas por EGV sumada a las escasas comunicaciones actuales en nuestro país, los objetivos de este trabajo fueron la identificación y el estudio de la sensibilidad a los antibióticos de aislados caracterizados como EGV, recuperados de pacientes internados, para actualizar el conocimiento sobre el perfil de resistencia y la epidemiología de las infecciones ocasionadas por EGV. Se recuperaron 132 aislados de EGV en el Hospital de Clínicas «José de San Martín¼ en el período 2011-2015. La identificación se realizó mediante pruebas convencionales y espectrometría de masas (Matrix Assisted Laser Desorption Ionization - Time of Flight Mass Spectrometry). El grupo Streptococcus anginosus fue el más frecuente (42%) seguido por el grupo Streptococcus mitis (33%). Dentro del grupo S. mitis se excluyó a Streptococcus pneumoniae. El 100% de los aislados fue sensible a ertapenem, linezolid y vancomicina; el 96,9% a cef-triaxona y cefepima. Se encontró un 25,8% de resistencia a penicilina (I+R) fundamentalmente en aislados de grupo S. mitis. La resistencia a tetraciclina fue del 27,2% y solo 2/132 aislados fueron resistentes a levofloxacina. Los valores de CIM de gentamicina oscilaron entre 0,5 y 32 -og/ml. El 17,4% de los aislados presentó resistencia a eritromicina sin diferencia significativa en la distribución de fenotipos M y MLS. Los resultados muestran la importancia de la vigilancia continua de las infecciones producidas por estos microorganismos con el fin de generar aportes para la elección de la terapia antibiótica adecuada.


Members of the viridans group streptococci (VGS) are the cause of local and invasive infections. Due to the severity of these infections and taking into account that reports regarding epidemiological aspects are scarce, the aims of this work were the identification and the study of the antibiotic susceptibility profiles of the isolates recovered from patients that were hospitalized in order to find out about the resistance level and the epidemiology of infections in which VGS are involved. A hundred and thirty two isolates identified as VGS were isolated at Hospital de Clínicas «José de San Martín¼ during the period 2011-2015. The identification was performed by biochemical test and mass spectrometry by Matrix Assisted Laser Desorption Ionization -Time of Flight Mass Spectrometry. Streptococcus anginosus group was prevalent (42%) followed by Streptococcus mitis group (33%). In the latter, isolates of Streptococcus pneumoniae were excluded. All the VGS isolates were susceptible to ertapenem, meropenem, linezolid and vancomycin; 25.8% were resistant (I+R) to penicillin, being prevalent in the S. mitis group. Regarding ceftriaxone and cefepime 96.9% of the isolates were susceptible. Only two isolates were resistant to levofloxacin, 27.2% to tetracycline and it was not found high level resistance to gentamycin (MIC range 0.5-32 µg/ml). Resistance to erythromycin was 17.4% with no significant difference between M and MLS phenotypes. The most active antibiotics were in addition to ceftriaxone and cefepime, vancomycin, ertapenem, meropenem and linezolid. These results highlight the importance of the continuous surveillance of the infections caused by VGS in order to predict a correct antibiotic therapy.


Asunto(s)
Estreptococos Viridans/aislamiento & purificación , Estreptococos Viridans/efectos de los fármacos , Antibacterianos/uso terapéutico , Infecciones Estreptocócicas/epidemiología , Farmacorresistencia Bacteriana/efectos de los fármacos
20.
Gastroenterol. latinoam ; 30(supl.1): S18-S25, 2019. ilus, tab, graf
Artículo en Español | LILACS | ID: biblio-1116305

RESUMEN

Helicobacter pylori (H. pylori) is a gram negative bacteria that survives in the gastric acid environment. The infection is acquired mainly during childhood. Fifty to 70% of adult population has the infection. However, in the last 10 year, a decrease in the prevalence of this infection has been observed in all age groups, in particular in pediatric population and elderly patients over 60 years old. The evolution of the infection depends on bacterial factors (virulence and toxins) and host immune response. People infected mainly develop gastrointestinal diseases such as gastritis, peptic ulcer and MALT lymphoma. H. pylori infection is the main risk factor of gastric cancer and for that reason, the eradication is recommended if H. pylori has been detected through invasive or non-invasive tests. Among children, eradication is not recommended unless there is a clinical manifestation that merits. H. pylori eradication is recommended in symptomatic adults and there is a controversy about massive eradication in asymptomatic population due to the risk of development of antibiotic resistance. Treatment is based on the use of proton pump inhibitors (PPI) associated to antibiotics, that should be chosen taking into account the increasing antibiotic resistance, and local availability. Clarithromycin (CLA) and levofloxacin resistance is increasingly high, and CLA-free quadruple therapy schemes are currently recommended for first-line therapy. H. pylori eradication must be confirmed with invasive or non-invasive tests. Second-line therapy based on antibiotics not previously used, PPI high doses and bismuth is recommended.


Helicobacter pylori (H. pylori) es una bacteria gramnegativa que sobrevive en el medio ácido gástrico. La infección se adquiere principalmente en la niñez. Un 50 a 70% de la población adulta es portadora, pero en los últimos 10 años, se ha observado una disminución en la prevalencia de infección en todos los grupos etarios, en particular en población pediátrica y mayores de 60 años. La evolución de la infección depende de factores propios de la bacteria (virulencia, toxinas) y de la respuesta inmune del huésped. Los individuos infectados desarrollan principalmente patologías gastrointestinales como gastritis, úlcera péptica y linfoma MALT. La infección por H. pylori es el principal factor de riesgo del cáncer gástrico por lo que se recomienda su erradicación en caso de haberse detectado mediante test invasivo o no invasivo. En niños, no es recomendable la erradicación a menos que exista una manifestación clínica que lo amerite. Se recomienda su erradicación en adultos sintomáticos y existe controversia respecto a la erradicación masiva en población asintomática debido al riesgo de desarrollar resistencia antibiótica. El tratamiento se basa en el uso de inhibidores de la bomba de protones asociado a antibióticos, los cuales deben ser escogidos teniendo en cuenta la tasa de resistencia antimicrobiana y disponibilidad local. La resistencia a claritromicina (CLA) y levofloxacino es creciente, por lo que se recomienda el uso de esquemas de cuadriterapia libre de CLA en esquemas de primera línea. Se recomienda confirmar su erradicación con test no invasivos y retratar con esquema de segunda línea con antibióticos no utilizados previamente, asociado a dosis altas de inhibidores de bomba de protones y sales de bismuto.


Asunto(s)
Humanos , Niño , Adulto , Infecciones por Helicobacter/tratamiento farmacológico , Inducción de Remisión , Helicobacter pylori/efectos de los fármacos , Helicobacter pylori/patogenicidad , Infecciones por Helicobacter/diagnóstico , Infecciones por Helicobacter/fisiopatología , Factores de Edad , Claritromicina/uso terapéutico , Farmacorresistencia Bacteriana/efectos de los fármacos , Quimioterapia Combinada , Inhibidores de la Bomba de Protones/uso terapéutico , Levofloxacino/uso terapéutico
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