Performance quantification of clustering algorithms for false positive removal in fMRI by ROC curves

Abstract Introduction Functional magnetic resonance imaging (fMRI) is a non-invasive technique that allows the detection of specific cerebral functions in humans based on hemodynamic changes. The contrast changes are about 5%, making visual inspection impossible. Thus, statistic strategies are applied to infer which brain region is engaged in a task. However, the traditional methods like general linear model and cross-correlation utilize voxel-wise calculation, introducing a lot of false-positive data. So, in this work we tested post-processing cluster algorithms to diminish the false-positives. Methods In this study, three clustering algorithms (the hierarchical cluster, k-means and self-organizing maps) were tested and compared for false-positive removal in the post-processing of cross-correlation analyses. Results Our results showed that the hierarchical cluster presented the best performance to remove the false positives in fMRI, being 2.3 times more accurate than k-means, and 1.9 times more accurate than self-organizing maps. Conclusion The hierarchical cluster presented the best performance in false-positive removal because it uses the inconsistency coefficient threshold, while k-means and self-organizing maps utilize a priori cluster number (centroids and neurons number); thus, the hierarchical cluster avoids clustering scattered voxels, as the inconsistency coefficient threshold allows only the voxels to be clustered that are at a minimum distance to some cluster.

A centralização do saber / Knowledge centralization

Na nossa sociedade atual, uma sociedade do conhecimento, há uma estreita relação entre desenvolvimento científico-tecnológico e bem-estar sócio-econômico. O presente artigo tem por objetivo mostrar que há uma centralização da produção científica. Esta centralização do saber ocorre em vários níveis: em nível mundial, o saber está sendo produzido, em sua maioria, em alguns poucos países, decorrente dos maciços investimentos em ciência e educação; num nível nacional, está centralizado no Estado de São Paulo, devido a um sistema equilibrado de financiamento à pesquisa; e, num nível institucional, é gerado, quase na totalidade, em universidades públicas, resultado do investimento unilateral em pesquisa, advindo somente do setor público. Por conseqüência, tal centralização tem gerado desigualdades, crises e tensões sócio-econômicas entre países, entre estados do Brasil, e mesmo entre universidades do país.

Estudo da atividade de contraçäo gástrica por susceptometria AC / Study of gastric contraction activity by AC susceptometry

A medida da atividade de contração gástrica é um importante parâmetro para análise clínica de diversas anomalias do trato gastrointestinal e pode fornecer importantes informações sobre a fisiologia deste órgão. Esta atividade foi medida com ótima performance através da técnica de susceptometria AC

Abstract -The gastric contraction activity measurements is an important parameter for clinical analysis of many gastrointestinal tract adnormalities and is able to give important informations about this organ phisiology. This activity was measured with a high performance though AC susceptometer technique

Estudo da funçäo de mistura do alimento no estômago avaliado por técnica biomagnética / Study of food mixture function in stomach evaluated by biomagnetic technique

Traçadores magnéticos podem ser monitorados dentro de órgãos humanos para fornecer informações não apenas quanto à quantidade e localização, mas também informações funcionais. Traçadores magnéticos foram monitorados no interior do estômago com a finalidade de estudar o grau de desordem e randomização destas partículas após serem previamente magnetizadas. Estes resultados fornecem informações sobre o tempo de mistura do alimento no estômago e apresenta uma nova alternativa da medida da atividade de contração gástrica

Abstract - Magnetic tracer can be monitored within human organs, giving information not only related to their quantity and location. but also functions informations. Magnetic tracer was monitored within of stomach to study their degree of order and randomization. Results supply informations about the mixing time of the food in the stomach and present a new alternative measure of the gastric adivity contraction