Microbiological characteristics of infections in a group of colombian patients with oncological diagnosis, 2014 - 2016 / Características microbiológicas de infecciones en un grupo de colombianos con diagnóstico oncológico, 2014 - 2016

Objective: We aimed to describe the microbiological characteristics of infections in patients from an oncological center during 2.014-2.016. Methods: In this cross-sectional descriptive study, a total of 7.837 cultures corresponding to 1.216 patients were included. Microbiological and sociodemographic data were taken from cancer diagnosed patients admitted to Oncólogos de Occidente S.A. in Pereira, Armenia, Manizales and Cartago from January 2.014 to December 2.016. The bacterial resistance profiles were defined according to the CLSI guideline. Culture foci were blood, urine, tissue biopsies, skin and soft tissues, mucous membranes and feces. Results: The culture-positive rate was 27,94%. Amongst 2.190 isolates, Escherichia coli (22,42%) was the most frequent, followed by Klebsiella pneumonia (21,27%), Pseudomona aeruginosa (13,83%) and Staphylococcus aureus (5,11%). The most common mechanisms of antimicrobial resistance in Gram-negatives were Extended-Spectrum β-Lactamase (45,45%) and AmpC-type β-lactamases (37,71%). Discussion: Up to nearly one-third of our participants' cultures were positive and a vast majority were gram-negatives, provided with ESBLs or AmpCs which in oncological patients it is a catastrophic outcome. We recommend to establish antibiotic dispensing policies thus achieving a microbiological risk control and improve the epidemiological surveillance. Empirical use of beta-lactams with extended spectrum or cephalosporins of 1 to 3 generation is not recommended due to the high resistance found.

Objetivo: Describir las características microbiológicas de las infecciones en pacientes de un centro oncológico durante 2.014-2.016 Métodos: Estudio descriptivo, transversal. Incluyó 7.837 cultivos de 1.216 pacientes. Se recolectaron variables microbiológicas y sociodemográficas de pacientes diagnosticados con cáncer en las sedes de Pereira, Armenia, Manizales y Cartago de Oncólogos de Occidente S.A. durante 2.014 hasta 2.016. Los perfiles de resistencia bacteriana se definieron de acuerdo con la guía CLSI. Los focos de cultivo fueron sangre, orina, biopsias de tejidos, piel y tejidos blandos, membranas mucosas y heces. Resultados: La tasa de cultivo positivo fue del 27,94%. De 2.190 aislamientos, E. coli (22,42%) fue el más frecuente, seguido de K. pneumoniae (21,27%), P. aeruginosa (13,83%) y S. aureus (5,11%). Los principales mecanismos de resistencia identificados en Gram negativos fueron β-lactamasas de espectro extendido (45,45%) y β-lactamasa de tipo AmpC (37,71%). Discusión: Cerca de un tercio de los cultivos de los participantes fueron positivos y una vasta mayoría fueron gram negativos, provistos con ESBL o AmpC, lo que en pacientes oncológicos es un desenlace catastrófico. Recomendamos establecer políticas de dispensación de antibióticos, logrando así un control de riesgo microbiológico y mejorar la vigilancia epidemiológica. No se recomienda el uso empírico de betalactámicos con espectro extendido o cefalosporinas de 1 a 3 generación debido a la alta tasa de resistencia encontrada.

Serosurveillance for vaccine-preventable diseases: A look inside the pertussis experience / Serovigilancia de enfermedades prevenibles por vacunación: una mirada desde la experiencia con la tosferina

Abstract Introduction: Serological surveillance (serosurveillance) provides the most direct measure of herd immunity of vaccine-preventable diseases. Little is known about the opportunities and challenges of serosurveillance experiences, particularly pertussis. Objective: To describe the process of serosurveillance for vaccine-preventable diseases with an emphasis on the experience of pertussis in the metropolitan area of Antioquia (Valle de Aburrá) in 2015 and 2016 and analyze the contributions and challenges for its sustainability. Materials and methods: We described the planning and conduction of serosurveillance of pertussis antibodies of mothers and in the umbilical cord at the time of delivery in eight hospitals based on random sampling and their capacity to advance the serosurveillance periodically. We compared the contributions and the challenges of this experience with other probabilistic and non-probabilistic programs. Results: We achieved the participation of hospitals and mothers respecting the delivery care process. We established a serum bank following ethical and technical guidelines. This program based on the random selection of hospitals and mothers has enabled the estimation of antibodies prevalence in mothers and in the umbilical cord, which has been possible given the high coverage of hospital care during childbirth at a lower cost and fewer risks than a population-based survey in conflictive areas. The main challenges for the sustainability of this program are the creation of stable jobs and access to funding and legal and methodological long-term frameworks. Conclusions: Hospital serosurveillance as described is an option to monitor the impact of vaccination on the population. Our experience could be reproduced in other regions under similar conditions if the above-mentioned challenges are solved.

Resumen Introducción. La vigilancia serológica es la forma más directa de medir la inmunidad de rebaño frente a las enfermedades prevenibles por vacunación. Poco se sabe acerca de las oportunidades y los desafíos de las experiencias de serovigilancia, en general y, específicamente, la de la tosferina. Objetivo. Describir el proceso de serovigilancia de enfermedades prevenibles por vacunación con énfasis en la experiencia en el caso de la tosferina en el área metropolitana de Antioquia (Valle de Aburrá) en el 2015 y el 2016 y analizar lo que dicha experiencia ha aportado y los desafíos que persisten para su sostenibilidad. Materiales y métodos. Se describió el proceso de planeación y el desarrollo de la serovigilancia de tosferina en el momento del parto en ocho hospitales seleccionados al azar, así como la capacidad para adelantar el programa de manera periódica. Se compararon los aportes y los desafíos en el curso de esta experiencia con los de otros programas poblacionales probabilistas e institucionales no probabilistas. Resultados. Se logró la participación de los hospitales y de las madres con pleno respeto del proceso de atención del parto, y se conformó un banco de sueros siguiendo lineamientos éticos y técnicos. El programa permitió estimar la prevalencia de anticuerpos en la madre y en el cordón umbilical, lo que se facilitó por la alta cobertura de atención hospitalaria del parto, a un menor costo y menos riesgos que los programas poblacionales en zonas conflictivas. Los principales desafíos para la sostenibilidad del programa son la estabilidad laboral del personal de salud, así como normas y una financiación de largo plazo. Conclusiones. La serovigilancia hospitalaria es una opción para monitorizar el impacto poblacional de la vacunación. Esta experiencia se podría extender a otras regiones en condiciones similares si se resuelven los retos mencionados.

Enfermedad de pompe: descripción de las características clínicas y de laboratorio de una familia colombiana / Pompe disease: clinical presentation in a colombian family

La enfermedad de Pompe (EP) es debida a la deficiencia de la enzima lisosomal maltasa ácida o alfa glucosidasa ácida (AGA) y se manifiesta clínicamente como una miopatía. La cantidad y calidad de la enzima determinan la variedad de presentación. A continuación se presentan las formas de debut, características clínicas, hallazgos de laboratorio y evolución de dos casos evaluados con EP.