First isolation of West Nile virus in Brazil

BACKGROUND Serological evidence of West Nile virus (WNV) infection has been reported in different regions of Brazil from equine and human hosts but the virus had never been isolated in the country. OBJECTIVES We sought to identify the viral etiology of equine encephalitis in Espírito Santo state. METHODS We performed viral culture in C6/36 cells, molecular detection of WNV genome, histopathology and immunohistochemistry from horse cerebral tissue. We also carried out sequencing, phylogenetic analysis and molecular clock. FINDINGS Histopathologic analysis from horse cerebral tissue showed injury related to encephalitis and WNV infection was confirmed by immunohistochemistry. The virus was detected by reverse transcription quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) from brain tissue and subsequently isolated in C6/36 cells. WNV full-length genome was sequenced showing the isolated strain belongs to lineage 1a. The molecular clock indicated that Brazilian WNV strain share the same common ancestor that were circulating in US during 2002-2005. MAIN CONCLUSIONS Here we report the first isolation of WNV in Brazil from a horse with neurologic disease, which was clustered into lineage 1a with others US WNV strains isolated in beginning of 2000's decade.

Prevalence of antibodies to equine alphaviruses in the State of Pará, Brazil / Prevalência de anticorpos para alphavirus em equinos do estado do Pará, Brasil

The State of Pará comprises 26% of Brazilian Amazon region, where a large diversity of arboviruses has been described. This study sought to assess the prevalence and distribution of hemagglutination inhibition (HI) antibodies against antigens of four alphaviruses (Togaviridae: Alphavirus ) from the species: Eastern equine encephalitis (EEEV), Western equine encephalitis (WEEV), Mayaro virus (MAYV), and Mucambo virus (MUCV) in 753 serum samples of horses in Pará State, Brazil. All investigated arboviruses were detected and indicate that horses are susceptible to these alphaviruses, and show evidences of their active circulation in farm animals in the Brazilian Amazon.(AU)

O estado do Pará corresponde a 26% da Amazônia brasileira, onde uma grande diversidade de arbovírus foi descrita. Este estudo procurou avaliar a prevalência e a distribuição de anticorpos inibidores da hemaglutinação (IH) contra antígenos de quatro alfavirus (Togaviridae: Alphavirus ), das espécies: Vírus da encefalite equina do leste (EEEV), Vírus da encefalite equina do oeste (WEEV), Vírus mayaro (MAYV) e Vírus mucambo (MUCV), de 753 amostras de soro de equinos no estado do Pará, Brasil. Todos os arbovirus pesquisados foram detectados, indicando que os equinos são suscetíveis a esses Alphavirus e mostrando evidências de sua circulação ativa em animais de fazenda na Amazônia brasileira.(AU)

Diagnosis of arboviruses using indirect sandwich IgG ELISA in horses from the Brazilian Amazon

The Amazon as a whole is the largest reservoir of arboviruses worldwide, while the Brazilian Amazon hosts the largest variety of arboviruses isolated to date. In this study, the results of an indirect sandwich IgG ELISA, standardized for 19 arbovirustypes circulating among horses in Brazilian Amazon, were compared to results of the hemagglutination inhibition test. A screening test assessed the conditional probability distribution and a Pearson linear correlation test determined the correlation strength among the absorbance values recorded for viruses from the same family.

Diagnosis of arboviruses using indirect sandwich IgG ELISA in horses from the Brazilian Amazon

The Amazon as a whole is the largest reservoir of arboviruses worldwide, while the Brazilian Amazon hosts the largest variety of arboviruses isolated to date. In this study, the results of an indirect sandwich IgG ELISA, standardized for 19 arbovirustypes circulating among horses in Brazilian Amazon, were compared to results of the hemagglutination inhibition test. A screening test assessed the conditional probability distribution and a Pearson linear correlation test determined the correlation strength among the absorbance values recorded for viruses from the same family.

Eco-epidemiologia dos arbovírus na área de influência da rodovia Cuiabá-Santarém (BR 163), Estado do Pará, Brasil / Arbovirus eco-epidemiology in the area affected by the Cuiabá-Santarém Highway (BR-163), Pará State, Brazil

O presente estudo descreve os aspectos eco-epidemiológicos sobre arbovírus nos Municípios de Novo Progresso e Trairão, Estado do Pará, Brasil, na área de influência da BR 163. Anticorpos IH foram detectados para diferentes arbovírus, com reações monotípicas para os VMAY e VORO, dois importantes arbovírus associados a epidemias na Amazônia. Anticorpos IgM para o VORO e VMAY foram detectados em soros humanos, sugerindo infecção recente por esses arbovírus. Duas cepas do VDEN-3 foram isoladas de pacientes febris residentes em Novo Progresso e identificadas como genótipo III. Em termos gerais, os dados obtidos sugerem uma área propícia para a circulação e manutenção de arbovírus e uma população pouco imunizada. Portanto, é importante um monitoramento dinâmico das populações locais e de imigrantes e de animais silvestres quanto à presença de anticorpos e isolamentos de arbovírus, o que permitirá um efetivo controle das infecções por esses agentes virais em residentes da área da rodovia dentro do território paraense.

The current study describes the eco-epidemiological aspects of arbovirus diseases in the municipalities (counties) of Novo Progresso and Trairão, Para State, Brazil, in the area affected by highway BR-163. Hemagglutination inhibition (HI) antibodies to different arboviruses were detected, with monotypic reactions to MAYV and OROV, two important arboviruses associated with epidemics in the Amazon. IgM antibodies to OROV and MAYV were found in human sera, suggesting recent infections by these viruses. Two DENV-3 strains were isolated from febrile patients in Novo Progresso and identified as genotype III strains. In general, the data suggest that the area displays ideal conditions for maintenance and circulation of arboviruses, plus a population with low immunization levels. Dynamic surveillance of local immigrants and wild animals is thus important, focusing on antibody prevalence and isolation of arboviruses, thereby allowing effective control of infections by these viral agents in the resident population along highway BR-163 in Pará State.

Vigilância sorológica para arbovírus em Juruti, Pará, Brasil / Serological survey for arboviruses in Juruti, Pará State, Brazil

O objetivo foi avaliar a prevalência de anticorpos para arbovírus na área de influência do Projeto Juruti antes da exploração mineral local. Foram examinados 1.597 soros humanos e 85 de animais silvestres. A pesquisa de anticorpos foi realizada pelo teste de inibição da hemaglutinação contra antígenos dos arbovírus mais prevalentes na Amazônia brasileira e IgM-ELISA para dengue e febre amarela. Soros humanos inibidores da hemaglutinação positivos para Mayaro e Oropouche foram também testados por IgM-ELISA. Anticorpos inibidores da hemaglutinação para alfavírus, orthobunyavirus e/ou flavivírus foram detectados, sendo 28,7 por cento reações monotípicas. Infecções recentes para Oropouche (n = 23), Mayaro (n = 5), e dengue (n = 20) foram confirmadas por IgM-ELISA. A prevalência de anticorpos inibidores da hemaglutinação em soros de animais silvestres foi de 8,2 por cento para flavivírus. Os resultados obtidos mostram que houve circulação ativa dos vírus Mayaro, Oropouche e dengue no período do estudo em humanos em Juruti, Pará, Brasil, e de diversos arbovírus em animais silvestres, indicando presença desses vírus em áreas do Município de Juruti.

This study aimed to measure the prevalence of antibodies to arboviruses in the area affected by the Juruti Project before local mining operations. A total of 1,597 human and 85 wild animal sera were examined, using the hemagglutination inhibition test against 19 antigens from the most prevalent arboviruses in the Brazilian Amazon and IgM-ELISA for dengue and yellow fever. Positive sera for Mayaro and Oropouche viruses were also tested by IgM-ELISA. Prevalence of hemagglutination inhibition antibodies to alphaviruses, flaviviruses, and orthobunyaviruses in humans was 28.7 percent, while for wild animals it was 8.2 percent for flaviviruses. Recent infections based on presence of IgM was confirmed for Mayaro (n = 5), Oropouche (n = 23), and dengue (n = 20). The results showed active circulation of the dengue, Mayaro, and Oropouche viruses in Juruti, as well as flaviviruses in wild animals, suggesting the circulation of these viruses in the Municipality of Juruti.

Epidemiologia molecular do vírus da raiva no estado do Pará no período de 2000 a 2005: emergência e transmissão por morcegos hematófagos (Desmodus rotundus) / Molecular epidemiology of rabies virus in Para state during 2000 to 2005: emergence and transmission by hematophagous bats (Desmodus rotundus)

A ocorrência recente de surtos de raiva humana transmitida por morcegos hematófagos Desmodus rotundus vem sendo registrada no Estado do Pará desde 2004. Neste artigo, é realizado um estudo retrospectivo de caracterização genética de 37 cepas do vírus rábico de diferentes mamíferos, incluindo o homem, isoladas de 2000 a 2005, de diferentes regiões paraenses. Foi obtido o sequenciamento nucleotídico parcial do gene N e construída árvore filogenética baseada no método Neighbor-joining. A análise filogenética determinou a formação de cinco clades principais e agrupou as cepas isoladas no Estado do Pará em três distintas clades: clade I, cepas da variante antigênica 3 (VAg3), comumente encontrada nos morcegos D. rotundus; clade II, cepa relacionada à VAg3, porém com topologia diferenciada isolada de morcego frugívoro Uroderma bilobatum; e clade IV, cepas da variante antigênica 2 (VAg2), comumente isoladas de cães domésticos. No Pará, no período estudado, circularam as variantes VAg2 e VAg3. A VAg3 da clade I se encontra subdividida em três linhagens virais (I-a, I-b, e I-c) associadas à distribuição geográfica: duas delas (I-a e I-b) circulam no continente nas regiões paraenses do Sudeste, Nordeste e Baixo Amazonas, enquanto a linhagem I-c restringe-se à ilha do Marajó. A associação dos dados genéticos com os ecológicos fornece uma melhor compreensão da epidemiologia molecular da raiva no Estado do Pará e sugere que duas distintas variantes antigênicas isoladas do vírus da raiva foram associadas com a transmissão da doença por morcegos hematófagos entre 2000 e 2005. Finalmente, foi demonstrado neste estudo a presença de pelo menos três distintas linhagens genéticas de VAg3 no estado, e a emergência de uma possível nova variante, que foi isolada de um morcego frugívoro U. bilobatum capturado na localidade de Ajará, município de Portel, durante o surto ocorrido em 2004.