Do DNA extraction methods and Taq polimerase quality improve the double repetitive element (DRE) PCR typing method for Mycobacterium tuberculosis strains?

Double repetitive element (DRE) PCR amplification is a simple Mycobacterium tuberculosis typing method, however amplification failure or poor resolution of bands commit its efficacy. In order to verify if whether or not these features could be minimized by improving DNA extraction procedures or Taq polymerise quality, DRE-PCR was performed on 24 M. tuberculosis DNA samples extracted by heat-shock, mechanical and enzymatic methods applying conventional and hot start Taq pol. We demonstrated that when dealing with the Mycobacterium tuberculosis DRE-PCR typing method, Taq pol of better quality might be more important to improve amplification than the DNA extraction method.

Amplificação de duplo elemento repetido (DRE) por PCR é um método simples para tipagem de Mycobacterium tuberculosis, entretanto falha ou a baixa resolução das bandas na amplificação compromete a eficiência do método. Com o objetivo de verificar se estes problemas podem ou não ser minimizados pela utilização de diferentes procedimentos de extração de DNA ou de qualidades de Taq polimerase, DRE-PCR foi ensaiado em 24 amostras de DNA de M. tuberculosis extraídos pelos métodos de choque-térmico, - mecânico e enzimático utilizando Taq polimerase convencional e hot start Taq pol. Foi demonstrado que a qualidade da Taq pol utilizada talvez seja mais importante para uma melhor amplificação que o método de extração de DNA empregado.

Resistência aos medicamentos anti-tuberculose de cepas de Mycobacterium tuberculosis isoladas de pacientes atendidos em hospital geral de referência para tratamento de AIDS no Rio de Janeiro / Drug-resistant Mycobacterium tuberculosis strains isolated at an AIDS reference center general hospital in Rio de Janeiro

INTRODUÇAO: A tuberculose tem trazido importantes desafios ao setor de saúde. O Brasil tem alta prevalência da doença e o Estado do Rio de Janeiro possui as maiores taxas de incidência do país. O município do Rio de Janeiro é responsável pela maior notificação do estado e cerca de 30 por cento dos casos diagnosticados têm origem em hospitais. OBJETIVO: Estimar a prevalência de resistência inicial e adquirida e identificar fatores associados à ocorrência de resistência em hospital geral referência para tratamento de AIDS no Rio de Janeiro. MÉTODO: Foram analisadas cepas de Mycobacterium tuberculosis de 165 pacientes, entre agosto de 1.996 e fevereiro de 1.998. RESULTADOS: Vinte por cento (33/165) apresentaram resistência a pelo menos um medicamento: 13 por cento (22/165) à isoniazida, 1,8 por cento (3/165) à rifampicina e 3,6 por cento (6/165) a ambas. Entre pacientes infectados pelo HIV (52/165), 28,85 por cento (15/52) apresentaram resistência a pelo menos um fármaco. Resistência adquirida ocorreu em 12,5 por cento dos pacientes que referiram tratamento anterior (3/24), com associação significativa com imagem radiológica não cavitária (p = 0,05). Resistência inicial ocorreu em 18,4 por cento dos pacientes virgens de tratamento (26/141), com associação significativa com ser profissional de saúde (p = 0,004), desemprego (p = 0,03) e diarréia (p = 0,01) na análise bivariada. Na análise multivariada, ser profissional de saúde manteve-se fortemente associado com a ocorrência de resistência inicial (p = 0,002). CONCLUSAO: Taxas de resistência elevadas foram encontradas nesta série. Estes achados corroboram a necessidade de que atenção maior seja dada à tuberculose em ambiente hospitalar, em especial no que diz respeito à preocupante associação entre resistência nas cepas isoladas e profissionais de saúde.