Trichophyton benhamiae, un dermatofito zoofílico emergente en Argentina con reservorio en cobayos: descripción de 7 casos en un hospital de la Ciudad Autónoma de Buenos Aires / Trichophyton benhamiae, an emergent zoonotic pathogen in Argentina associated with Guinea pigs: Description of 7 cases in Buenos Aires

Resumen Trichophyton benhamiae es un dermatofito zoofílico. Puede causar tinea corporis, tinea faciei y tinea capitis. Se caracteriza por producir lesiones inflamatorias, sobre todo en niños. El objetivo de esta publicación es describir 7 casos clínicos de pacientes pediátricos atendidos entre julio del 2019 y enero del 2020 en nuestra institución. A los pacientes se les solicitó estudio micológico convencional, con posterior confirmación con MALDI-TOF MS y secuencia-ción del ADN ribosomal. Se aisló e identificó T. benhamiae como agente etiológico; el nexo epidemiológico fue el contacto con cobayos. Estas son las primeras descripciones de infecciones causadas por T. benhamiae en Argentina. Al realizar estudios micológicos convencionales, este agente puede confundirse con otros dermatofitos, por lo tanto, se requieren herramientas como MALDI-TOF MS o la secuenciación para llegar a un diagnóstico definitivo. Es importante contar con datos epidemiológicos, como el contacto con mascotas no tradicionales, para una presunción diagnóstica adecuada.

Trichophyton benhamiae is a zoonotic dermatophyte that can cause tinea corporis, tinea faciei and tinea capitis, producing inflammatory lesions, especially in children. In this publication, we describe 7clinical cases of pediatric patients that occurred in our institution between July 2019 and January 2020. All patients underwent a conventional mycological study. The identification of fungi isolates was confirmed by MALDI-TOF MS and sequencing of the ribosomal DNA. T. benhamiae was identified as the etiological agent, whose epidemiological link in all cases was the contact with Guinea pigs. This is the first description of infections caused by T. benhamiae in Argentina. This dermatophyte can be misidentified as other more frequent dermatophytes when performing conventional studies. Molecular technology should be used to reach a definitive diagnosis. It is important to have epidemiological data from patients such as contact with non-traditional pets, especially Guinea pigs, for an adequate presumptive diagnosis of this dermatophytosis.

Effectiveness of the National Quality Control Program in Mycology of Argentina and performance evaluation of participating laboratorios / Efectividad del Programa Nacional de Control de Calidad en Micología de Argentina y evaluación del desempeño de los laboratorios participantes

Abstract The National Quality Control Program in Mycology (PNCCM) of Argentina was establishedin 1996 to improve the quality of the mycological diagnosis, to help establish and to setup standardized procedures and continuous training of laboratory staff. The aim of this studywas to assess the effectiveness of the PNCCM in the 1996---2018 period. Data from the NationalMycology Laboratory Network (NMLN) and PNCCM database was used to estimate the increasein the number of controlled laboratories and jurisdictions, the percentage of participation, theimprovement in the quality of results and the adherence to the program. Satisfaction surveyswere performed to assess user satisfaction. The number of controlled laboratories increasedfrom 29 to 146; participation increased from 49% to 93% and general adherence was 72% inthe evaluated period (1996---2018). Improvement in the quality of the results was 15% for lowcomplexity samples; 7% for intermediate complexity samples and 14% for the identification ofhigh complexity strains. Up to 84% of the users consider the PNCCM to be ''very good'' and 16%''satisfactory''. These results show the importance of the PNCCM, which is widely accepted bymycological diagnostic laboratories from Argentina.

Resumen En 1996 se creó el Programa Nacional de Control de Calidad en Micología (PNCCM)de Argentina con el objetivo de mejorar la calidad del diagnóstico micológico, colaborar enel establecimiento de procedimientos estandarizados en aquellos laboratorios que carecen deellos y contribuir a la capacitación continua del personal.El objetivo de este estudio fue evaluar la efectividad del PNCCM en el período 1996-2018.Se utilizaron los datos de la base de la Red Nacional de Laboratorios de Micología (RNLM) ydel PNCCM para estimar el aumento en el número de laboratorios controlados y el porcentajede participación, la mejora de la calidad de los resultados y la adhesión al programa. Paraevaluar el grado de satisfacción de los usuarios, se analizaron las encuestas de satisfacción delos participantes. En el período evaluado, el número de laboratorios controlados aumentó de 29a 146, la participación aumentó de 49% a 93% y la adherencia general de los participantes fue del72%. La mejora de la calidad de los resultados de los laboratorios fue del 15% para muestras debaja complejidad, 7% para muestras de complejidad intermedia y 14% para la identificación decepas de alta complejidad. El 84% de los usuarios considera que el PNCCM es muy bueno y el 16%que es satisfactorio. Estos resultados evidencian la importancia del PNCCM, que es ampliamenteaceptado por los laboratorios que realizan diagnóstico micológico en nuestro país.

National production of certified reference fungal cultures / Producción nacional de cultivos fúngicos de referencia certificados

Reference fungal cultures (RFCs) are essential for the internal quality control of laboratories. The production of these cultures requires standardized procedures (IRAM 14950:2016 and ISO 17034:2016 standards) carried out by a recognized and accredited laboratory. The aim of this work was to produce RFC in paper disks of autochthonous strains, characterized by two, homogeneous and stable reference methods traceable at species level. RFC were produced using 14 regional species (7 yeasts and 7 filamentous fungi) from the fungal culture collection (DMic). Paper disks were impregnated with a culture suspension, dried and packed. Homogeneity, viability, identity and purity were verified. Short-and long-term stability at different temperatures and storage times were studied. Characterization of each strain allowed to confirm its identity and to ensure its traceability at international level. Produced batches were homogeneous and stable at -20 ±5 °C for 30 months. This method of production was adequate to produce homogeneous and stable RFC with phenotypic and genotypic characteristics correctly defined and internationally traceable. Standardized procedures were developed for the production of certified RFC that could be transferred to other microorganisms. Providing RFC that represent regional strains allows laboratories to produce more reliable results with a favorable impact on medical diagnosis, the environment or the food industry.

Los cultivos microbianos de referencia (CR) son imprescindibles para el control de calidad interno de los laboratorios. Asegurar su producción requiere de procedimientos estandarizados (IRAM 14950:2016 e ISO 17034:2016) realizados en un laboratorio reconocido y acreditado. El objetivo de este estudio fue producir cultivos fúngicos de referencia en discos de papel, a partir de un panel de cultivos autóctonos caracterizados por dos métodos de referencia, trazables a nivel taxonómico de especie, homogéneos y estables. Se produjeron CR de 14 especies circulantes en Argentina (7 de levaduras y 7 de hongos miceliales), depositadas en la colección de hongos de interés médico (DMic). Los discos de papel fueron embebidos con una suspensión del cultivo por producir, secados y envasados. Se verificó la homogeneidad, viabilidad, identidad y pureza de cada lote. Se evaluó la estabilidad a corto y largo plazo a distintas temperaturas y tiempos de almacenamiento. La caracterización de cada CR nos permitió confirmar su identidad y asegurar su trazabilidad a nivel internacional. Los lotes producidos fueron homogéneos y estables durante 30 meses conservados a -20 ±5 °C. Este método resultó adecuado para producir CR homogéneos y estables, con características fenotípicas y genotípicas correctamente definidas y trazables a nivel internacional. Los procedimientos estandarizados desarrollados en este trabajo pueden ser transferidos para producir CR certificados de otros microorganismos. La provisión de CR que represente cepas regionales permite a los laboratorios producir resultados más confiables con un impacto favorable en el diagnóstico médico, los estudios ambientales y la industria alimenticia.

Osteomielitis por mucorales (OMM) asociada a artroscopia de reparación de ligamento cruzado anterior: investigación epidemiológica y recomendaciones para su prevención / Mucor osteomyelitis after arthroscopic repair of ACL. Epidemiological investigation

OBJETIVO: Describir la investigación epidemiológica de osteomielitis por Mucorales (OMM) post reparación artroscópica de LCA (RA-LCA) en Argentina. MATERIAL Y MÉTODO: 1) Revisión de los casos; 2) Relevamiento de 3 instituciones; 3) Cultivo micológico de materiales quirúrgicos; 4) Encuesta a instrumentadoras; 5) Secuenciación de las cepas de Rhizopus y 6) Redacción de recomendaciones. RESULTADOS: Del 2005 al 2017 se identificaron 40 casos de OMM (Rhizopus sp.) post reparación artroscópica de LCA en pacientes inmunocompetentes de 12 jurisdicciones de Argentina. El diagnóstico fue por cultivo (22/31), y por anatomía patológica (9). La edad promedio fue 29 años. El 84% de 38 casos eran varones. Intervinieron 13 ortopedias. El implante fue importado en 8/20 casos y nacional en 12. En las 3 instituciones se observó: manejo inadecuado del aire de quirófano, variabilidad en la limpieza del artroscopio, en el taladro utilizado, y en el manejo de materiales que llegan de las ortopedias y falta de trazabilidad de los implantes. Los cultivos micológicos de los materiales fueron negativos. La encuesta a instrumentadores confirmó los hallazgos de los relevamientos. La secuenciación de las cepas de Rhizopus demostró predominio de policlonalidad. CONCLUSIÓN: La OMM es una complicación posible luego de la RA-LCA en instituciones privadas de Argentina. No se identificó un origen único. Se detectaron múltiples prácticas que favorecen la contaminación de la cirugía con hongos filamentosos (manejo del aire de quirófano, del artroscopio, de los materiales provenientes de ortopedia, etc.). En base a estos hallazgos la Asociación Argentina de Artroscopía sugiere medidas de prevención. Implicancia clínica: Prevención de osteomielitis por Mucorales post- cirugía artroscópica para ligamento cruzado anterior. Tipo de estudio: Serie de casos. Nivel de Evidencia: IV.

OBJECTIVE: To describe the epidemiological investigation of Mucor osteomyelitis (MO) after arthroscopic repair of ACL (ARACL) in Argentina. MATERIAL Y METHODS: 1) Review of cases; 2) Survey of 3 institutions; 3) Mycological culture of surgical materials; 4) Survey of instrumentists; 5) Sequencing of Rhizopus strains and 6) Writing of recommendations. RESULTS: From 2005 to 2017, 40 cases of MO (Rhizopus sp.) Post AR-ACL were identified in immunocompetent patients from 12 jurisdictions of Argentina. The diagnosis was made by culture (22/31), and by pathology (9). The average age was 29 years. 84% of 38 cases were male. Thirteen orthopedics intervened. The implant was imported in 8/20 cases and national in 12. In the 3 institutions it was observed: inadequate handling of the operating room air, variability in the cleaning of the arthroscope, in the drill used, and in the handling of materials that come from the orthopedics and lack of traceability of the implants. The mycological cultures of the materials were negative. The survey of instrumentists confirmed the findings of the surveys. The sequencing of Rhizopus strains showed a predominance of polyclonality. CONCLUSION: MO is a possible complication after AR-ACL in private institutions in Argentina. A unique origin was not identified. Multiple practices that favor the contamination of surgery with filamentous fungi (handling of operating room air, arthroscope, materials from orthopedics, etc.) were detected. Based on these findings, the Argentine Association of Arthroscopy suggests prevention measures. Clinical relevance: Prevention of Mucor osteomyelitis after arthroscopic surgery for anterior cruciate ligament. Type study: Cases series. Level of evidence: IV.

Population structure and diversity of the pathogenic fungus Aspergillus fumigatus isolated from different sources and geographic origins

Fifty-five clinical and environmental Aspergillus fumigatus isolates from Mexico, Argentina, France and Peru were analyzed to determine their genetic variability, reproductive system and level of differentiation using amplified fragment length polymorphism markers. The level of genetic variability was assessed by measuring the percentage of polymorphic loci, number of effective alleles, expected heterozygocity and by performing an association index test (I A). The degree of genetic differentiation and variation was determined using analysis of molecular variance at three levels. Using the paired genetic distances, a dendrogram was built to detect the genetic relationship among alleles. Finally, a network of haplotypes was constructed to determine the geographic relationship among them. The results indicate that the clinical isolates have greater genetic variability than the environmental isolates. The I A of the clinical and environmental isolates suggests a recombining population structure. The genetic differentiation among isolates and the dendrogram suggest that the groups of isolates are different. The network of haplotypes demonstrates that the majority of the isolates are grouped according to geographic origin.