Evaluation of VITEK 2 Compact and VITEK MS in the identification of coagulase-negative staphylococci isolated from blood cultures / Avaliação do VITEK 2 Compact e VITEK MS na identificação de estafilococos coagulase-negativos isolados de hemoculturas

ABSTRACT Introduction: In most clinical laboratories, coagulase-negative staphylococci (CNS) are classified through their biochemical characteristics using traditional and/or automated phenotypic methods. However, identification by phenotypic method is a great challenge despite the improvement in identification by automated systems in recent years. Objective: The main objective was to compare the identification of CNS between two automated methods: phenotypic (VITEK® 2 Compact, bioMérieux) and mass spectrometry (MALDI-TOF VITEK® MS, bioMérieux). Materials and method: 133 CNS isolates from whole blood samples from September 2015 to May 2016 were analyzed. Results: All the 133 isolates were identified by VITEK® 2 Compact as CNS, whereas VITEK MS did not identify seven, and there was uncertainty among three species in one isolate. The two devices had a concordance of 92.8% (117/126) of which: 56 Staphylococcus epidermidis, 34 Staphylococcus hominis ssp. hominis, 15 Staphylococcus haemolyticus, 10 Staphylococcus capitis, one Staphylococcus cohnii ssp. urealyticus and one Staphylococcus sciuri. There was disagreement in identification of S. lugdunensis and S. aureus. Conclusion: Through the analysis between the two devices and based on scientific articles comparing the methods involved in the study, it was possible to observe the great biochemical similarity among the coagulase-negative staphylococci species, this being the main limitation of the phenotypic method. The VITEK MS equipment showed high discrimination between species when compared to the gold standard method, besides being rapid and easy to use.

RESUMO Introdução: Estafilococos coagulase-negativos (ECN) estão entre os principais colonizantes de pele e mucosas, atuando como comensais. Apesar de apresentarem baixa virulência, podem causar infecções graves, principalmente quando são utilizados dispositivos invasivos, como cateteres. Como têm grande capacidade de formar biofilme, conseguem atingir rapidamente a corrente sanguínea, o que pode levar à septicemia. Objetivo: O objetivo principal foi comparar a identificação dos ECN entre duas metodologias automatizadas: fenotípica (VITEK® 2 Compact, bioMérieux) e espectrometria de massa (MALDI-TOF VITEK® MS, bioMérieux). Materiais e método: Foram analisados 133 isolados de ECN provenientes de amostras de hemoculturas, no período de setembro de 2015 a maio de 2016. Resultados: Todos os 133 isolados foram identificados no VITEK® 2 Compact como ECN, enquanto o VITEK MS não identificou sete amostras; houve incerteza entre três espécies em um isolado. Os dois equipamentos tiveram concordância de 92,8% (117/126), dos quais foram 56 Staphylococcus epidermidis, 34 Staphylococcus hominis ssp. hominis, 15 Staphylococcus haemolyticus, 10 Staphylococcus capitis, um Staphylococcus cohnii ssp. urealyticus e um Staphylococcus sciuri. Houve discordância em uma identificação de S. lugdunensis e S. aureus. Conclusão: Por meio da análise entre os dois equipamentos e com base em artigos científicos que comparam os métodos envolvidos neste estudo, foi possível observar a grande similaridade bioquímica entre as espécies de ECN, sendo esta a principal limitação do método fenotípico. O equipamento VITEK MS apresentou alta discriminação entre as espécies quando comparado com o método gold standard, além da facilidade e da agilidade da técnica.

Análise molecular de estirpes de Escherichia coli isoladas a partir de amostras de urina de pacientes ambulatoriais por RFLP da região intergência 16s-23s' / Molecular analysis based on intergenic 16s-23s RFLP of Escherichia coli strains obtained from urine samples of ambulatorial pacients

A análise de RFLP (Restriction Fragment Lenght Polymorphism) da região intergênica 16S-23S rDNA tem sido utilizada na diferenciação de estirpes de vários microrganismos. A digestão do produto de amplificação da região intergênica em isolados uropatogênicosde Escherichia coli com a enzima RsaI gerou dois padrões distintos, separando as estirpes em dois grupos: alfa e beta. Este trabalho teve como objetivo enquadrar dentro destes grupos 60 estirpes de E. coli isoladas a partir de urina de pacientes ambulatoriais no Laboratório Médico Santa Luzia (Florianópolis). Os produtos de amplificação foram digeridos com a enzima RsaI. Os fragmentos resultantes foram submetidos a análise eletroforética em gel de agarose 2% e as estirpes com padrões de restrição condizentes foram agrupadas. Através destas análises foi possível estabelecer correlações entre o perfil molecular e outros dados de análise bioquímicae de resistência a antibióticos.

RFLP analysis of 16S-23S rDNA intergenic region have been used in differentiation of many microorganisms strains. The digestion of the product of intergenic region amplification in uropathogenic strains of Escherichia coli with RsaI generated two distintpatterns: alpha and beta. This project had the aim of classify 60 Escherichia coli strains obtained from ambulatorial patients urine of the Laboratório Médico Santa Luzia (Florianópolis). The amplification products were digested with RsaI enzyme. The fragments weresubmitted to eletrophoretic analysis in 2% agarosis gel. Strains with the same restriction pattern were identified. This analysis allowed the correlation between molecular profile and biochemical and antibiotical resistence data.

Prevalência da colonização pelo estreptococo do grupo B em gestantes atendidas em ambulatório de pré-natal / Prevalence of group B Streptococcus in pregnant women from a prenatal care center

OBJETIVO: verificar a prevalência de estreptococo do grupo B (EGB) em gestantes no terceiro trimestre da gravidez e explorar os fatores potencialmente associados à colonização. MÉTODOS: uma amostra de 273 gestantes no terceiro trimestre da gravidez, provenientes do ambulatório de pré-natal do Hospital Universitário do Sul do Brasil, foi investigada. Culturas de amostra vaginal e anorretal foram obtidas e inoculadas em meio seletivo de Todd-Hewitt suplementado com 10 æg/ml de colistina e 15 æg/ml de ácido nalidíxico e posteriormente subcultivadas em ágar sangue de carneiro desfibrinado. Todas as colônias suspeitas foram submetidas ao teste de aglutinação para detecção do antígeno específico do grupo B. O teste de Camp foi utilizado para identificação do EGB das variedades não hemolíticas. Analisaram-se também os dados demográficos, socioeconômicos, reprodutivos e clínico-obstétricos. A razão de prevalência (RP) foi utilizada como medida de risco. Considerou-se como significante o intervalo de confiança no nível de 95 por cento (alfa=0,05). RESULTADOS: a prevalência de colonização pelo EGB foi de 21,6 por cento (59), sendo que 9,9 por cento (27) das gestantes tiveram positividade em ambos os sítios, 6,95 por cento (19) foram positivas somente no sítio vaginal e 4,75 por cento (13) da amostra tiveram positividade apenas no sítio anal. A prevalência de EGB foi ligeiramente mais alta nas gestantes com idade inferior a 20 anos, naquelas com menor escolaridade e nas gestantes primíparas, e o dobro entre aquelas que não relataram aborto espontâneo, porém sem significância estatística. Não foi encontrada diferença na prevalência de EGB de acordo com história de doenças sexualmente transmissíveis e tabagismo. Quando os dados foram analisados conjuntamente, os fatores detectados como potencialmente associados à colonização pelo EGB foram: primíparas com mais de 30 anos (RP=1,55) e mulheres com mais de um parceiro sexual e freqüência de atividade sexual aumentada (55,6 vs 20,5 por cento; p<0,05). CONCLUSÃO: confirma-se a necessidade rotineira de cultura para EGB em ambos os sítios (vaginal e anal) de todas as gestantes no terceiro trimestre de gestação.

Infecções do trato respiratório: principais agentes bacterianos e padrões de resistência Dados brasileiros do estudo internacional PROTEKT / Respiratory tract infections: major bacterial pathogens and patterns of resistance. Brazilian results from PROTEKT surveillance study

As infecções da trato respiratório (ITR) são responsáveis por significativa morbidade e mortalidade. Devido a sua diversificada etiologia e dificuldades diagnósticas, muitas vezes, o tratamento destas infecções é iniciado empiricamente.

Resistência a agentes antimicrobianos de amostras de Neisseria gonorrhoeae isoladas em Florianópolis (SC) / Resistance to antimicrobial agents of Neisseria gonorrhoeae strains isolated at Florianópolis, Santa Catarina

Em abril de 1988 e maio de 1990 foram isoladas 81 amostras de Neisseria gonorrhoeae de pacientes atendidos em laboratórios públicos e privados. Dentre os isolados, 54.32 por cento foram resistentes à penicilina, 43.21 por cento à ampicilina, 7.41 por cento à gentamicina e 69.14 por cento à tetraciclina. Três amostras produziram ß-lactamase, representando uma ocorrência de 3.7 por cento de Neisseria gonorrhoeae produtora de penicilinase na população estudada.

Infeccao gonococica disseminada: relato de um caso / Gonococcal infection disseminated: a report of a case

Esta nota relata um caso clinico de artrite septica por "Neisseria gonorrhoeae". O microrganismo foi isolado a partir do liquido sinovial e a sensibilidade a antimicrobianos foi verificada pelo metodo de difusao em agar. O gonococo isolado foi sensivel aos beta-lactamicos, aos aminoglicosideos, a eritromicina, a rifampicina e resistente ao sulfametaxazol-trimetoprim e a tetraciclina.