Analysis of the adaptability of black bean cultivars by means of quantile regression / Análise da adaptabilidade de cultivares de feijão preto por meio de regressão quantílica

ABSTRACT: The aim of this study was to use quantile regression (QR) to characterize the effect of the adaptability parameter throughout the distribution of the productivity variable on black bean cultivars launched by different national research institutes (research centers) over the last 50 years. For this purpose, 40 cultivars developed by Brazilian genetic improvement programs between 1959 and 2013 were used. Initially, QR models were adjusted considering three quantiles (τ = 0.2, 0.5 and 0.8). Subsequently, with the confidence intervals, quantile models τ = 0.2 and 0.8 (QR0.2 and QR0.8) showed differences regarding the parameter of adaptability and average productivity. Finally, by grouping the cultivars into one of the two groups defined from QR0.2 and QR0.8, it was reported that the younger cultivars were associated to the quantile τ = 0.8, i.e., those with higher yields and more responsive conditions indicating that genetic improvement over the last 50 years resulted in an increase in both the productivity and the adaptability of cultivars.

RESUMO: Neste estudo objetivou-se utilizar a regressão quantílica (RQ) para caracterizar o efeito do parâmetro de adaptabilidade ao longo de toda a distribuição da variável produtividade em cultivares de feijão preto lançadas por diferentes instituições nacionais de pesquisa nos últimos 50 anos. Para tanto utilizou-se 40 cultivares desenvolvidas pelos programas brasileiros de melhoramento genético entre os anos de 1959 a 2013. Inicialmente foram ajustados modelos de RQ considerando três quantis (τ=0,2, 0,5, 0,8). Posteriormente, com os intervalos de confiança verificou-se que os modelos quantílicos τ=0,2 e 0,8 (RQ0,2 e RQ0,8) apresentaram diferenças quanto ao parâmetro de adaptabilidade e produtividade média. Finalmente, por meio do agrupamento das cultivares em um dos dois grupos definidos a partir de RQ0,2 e RQ0,8, constatou-se que as cultivares mais novas foram associadas ao quantil τ = 0,8, ou seja, aquelas com maiores produtividades e mais responsivas as condições ambientais indicando que o melhoramento ao longo dos últimos 50 anos possibilitou o incremento tanto na produtividade quanto na adaptabilidade das cultivares.

Fatores de risco associados à intervenção com injeção intravítrea de anti-VEGF em pacientes com edema macular diabético / Risk factors related to the intervention with intravitreal anti-VEGF injection in patients with diabetic macular edema

Resumo Objetivo: Propor um modelo de regressão logística para auxiliar na decisão de realização da injeção intravítrea (IIV) de anti-VEGF, a partir da quantificação e hierarquização dos fatores de risco que compõem o perfil dos indivíduos diabéticos. Métodos: Trata-se de estudo transversal, observacional e inferencial, realizado em três instituições da Paraíba, de julho de 2015 a setembro de 2016. O modelo de regressão logística foi utilizado para obtenção do modelo preditivo e os dados foram analisados no software R®. Resultados: Foram avaliados 80 pacientes com diabetes tipo 1 ou 2, maiores de 18 anos, dos quais 57,5% não tiveram indicação de IIV e 42,5% receberam indicação deste tratamento. No grupo com edema macular diabético (EMD), a média de idade foi de 60,65 anos, sendo 52,94% do sexo feminino. Ainda nesse grupo, a maioria apresentou retinopatia diabética não-proliferativa severa ou retinopatia proliferativa (79,41%). Foram identificados como fatores de risco para EMD: o indivíduo ser aposentado (OR=5,22; p-valor 0,05), ter histórico pessoal de retinopatia diabética (OR=20,27; p-valor 0,006) e de tratamento prévio com anti-VEGF (OR=23,23; p-valor 0,002). Conclusão: Os resultados da pesquisa evidenciaram que um indivíduo diabético com baixa visual e apresentando esses três fatores deve ser encaminhado o quanto antes ao especialista, pois possui, com 91,17% de acerto, risco de apresentar EMD com necessidade de IIV de anti-VEGF. Essa ferramenta pode servir como coadjuvante na tomada de decisão, sobretudo do não-retinólogo, a fim de encaminhar para diagnóstico e tratamento precoces os indivíduos com EMD, o que pode ser decisivo na prevenção da perda visual irreversível nesses pacientes.

Abstract Purpose: To propose a predictive model to aid in the decision to perform the intravitreal anti-VEGF injection, based on the risk factors quantification and hierarchy presented by diabetic patients. Methods: It is a cross-sectional, observational and inferential study carried out in three institutions in Paraíba from July 2015 to September 2016. The logistic regression model was used to obtain the predictive model and data were analyzed in R(r) software. Results: Eighty patients with type 1 or 2 diabetes, over 18 years of age, were included, 57.5% of whom had no indication of IIV and 42.5% received an indication of this treatment. In the group with diabetic macular edema (DME), the mean age was 60.65 years, of which 52.94% were female. In this group, the majority presented severe non-proliferative diabetic retinopathy or proliferative retinopathy (79.41%). The main risk factors for DME were: be retired (OR = 5.22, p-value0.05), had a personal history of diabetic retinopathy (OR = 20.27, p-value 0.006), and previous treatment with anti-VEGF (OR = 23.23, p-value 0.002). Conclusion: The results of the research showed that a diabetic patient with low visual acuity and presenting these three factors should be referred as soon as possible to the specialist, since he presents a risk of presenting DME with need for anti-VEGF IIV, with 91.17% of accuracy. This tool can serve as an adjunct to decision making, especially the nonretinologist, in order to refer individuals with EMD to early diagnosis and treatment, which may be crucial in preventing irreversible visual loss in these patients.

Positioning and number of nutritional levels in dose-response trials to estimate the optimal-level and the adjustment of the models / Posição e número de níveis nutricionais em experimentos dose-resposta na estimativa do nível-ótimo e ajuste dos modelos

The aim of this research was to evaluate the influence of the number and position of nutrient levels used in dose-response trials in the estimation of the optimal-level (OL) and the goodness of fit on the models: quadratic polynomial (QP), exponential (EXP), linear response plateau (LRP) and quadratic response plateau (QRP). It was used data from dose-response trials realized in FCAV-Unesp Jaboticabal considering the homogeneity of variances and normal distribution. The fit of the models were evaluated considered the following statistics: adjusted coefficient of determination (R²adj), coefficient of variation (CV) and the sum of the squares of deviations (SSD).It was verified in QP and EXP models that small changes on the placement and distribution of the levels caused great changes in the estimation of the OL. The LRP model was deeply influenced by the absence or presence of the level between the response and stabilization phases (change in the straight to plateau). The QRP needed more levels on the response phase and the last level on stabilization phase to estimate correctly the plateau. It was concluded that the OL and the adjust of the models are dependent on the positioning and the number of the levels and the specific characteristics of each model, but levels defined near to the true requirement and not so spaced are better to estimate the OL.

O objetivo deste trabalho foi avaliar a influência do número e posição de níveis nutricionais utilizados em ensaios dose-resposta na estimativa do nível-ótimo (OL) e ajuste dos modelos polinomial quadrático (QP), exponencial (EXP), linear response plateau (LRP) e quadratic respose plateau (QRP). Utilizaram-se dados provenientes de ensaios dose-resposta realizados na FCAV-Unesp Jaboticabal, atendendo as pressuposições de homocedasticidade e normalidade. O ajuste dos modelos foi avaliado considerando as seguintes estatísticas: coeficiente de determinação ajustado (R²adj), coeficiente de variação (CV) e soma dos quadrados dos desvios (SSD).Verificou-se que, nos modelos QP e EXP, pequenas mudanças na localização e distribuição dos níveis ocasionam grandes alterações na estimativa do OL. O modelo LRP foi influenciado pela ausência ou presença do nível intermediário às fases de resposta e estabilização (mudança da reta crescente para platô). O modelo QRP precisou de um número maior de níveis na fase de resposta e o último nível da fase de estabilização para estimar corretamente o platô. Pôde-se concluir que a determinação do OL e o ajuste dos modelos dependem da posição e quantidade de níveis, além das características específicas de cada modelo, mas níveis definidos próximos do verdadeiro requerimento e não muito espaçados são melhores para estimar corretamente o OL.

Estimation of genetic parameters for test-day milk yield in first calving buffaloes / Estimación de parámetros genéticos para producción de leche en el día de control en búfalas de primer parto / Estimação de parâmetros genéticos para produção do leite no dia do controle em búfalas de primeiro parto

Background: the milk yield records measured along lactation provide an example of repeated measures; the random regression models are an appealing approach to model repeated measures and to estimate genetic parameters. Objective: to estimate the genetic parameters by modeling the additive genetic and the residual variance for test-day milk yield in first calving buffaloes. Methods: 3,986 test-day data from 1,246 first lactations of crossbred buffalo daughters of 23 sires and 391 dams between 1997 and 2008 from five farms were used. The model included the genetic and permanent environment additive as the random effect and the contemporary group (year, month of test-day) and age at calving as covariable (linear) fixed effects. The fixed (third order) and random (third to ninth order) regressions were obtained by Legendre polynomials. The residual variances were modeled with a homogeneous structure and various heterogeneous classes. The variance components were estimated using the WOMBAT statistical program (Meyer, 2006). Results: according to the likelihood ratio test, the best model included four variance classes, considering Legendre polynomials of the fourth order for permanent environment and additive genetic effects. The heritabilities estimates were low, varying from 0.0 to 0.14. The estimates of genetic correlations were high and positive among PDC1 and PDC8, except for PCD9, which was negative. This indicates that for any of the selection criteria adopted, the indirect genetic gain is expected for all lactation curves, except for PCD9. Conclusion: heterogeneity of residual variances should be considered in models whose goal is to examine the alterations of variances according to day of lactation.

Antecedentes: los registros de producción de leche medidos a lo largo de la lactancia son un ejemplo de medidas repetidas, los modelos de regresión aleatoria presentan un enfoque atractivo para modelar medidas repetidas y para estimar parámetros genéticos. Objetivo: estimar parámetros genéticos a través de la modelación de la varianza genética y residual para producción de leche en el día de control en búfalas de primer parto. Métodos: fueron analizados 3986 controles de producción de leche en la primera lactancia de 1246 búfalas, hijas de 391 hembras y 23 toros, durante los años 1997 hasta 2008 en 5 fincas. El modelo incluyó como efectos aleatorios genético aditivo y de ambiente permanente, como efectos fijos grupo contemporáneo compuesto por mes, año de control y la covariable de la edad de la búfala al parto (lineal). Las regresiones fijas (3er orden) y aleatorias (3er a 9no orden) fueron obtenidas mediante polinomios de Legendre. Las varianzas residuales fueron modeladas con una estructura homogénea y varias clases heterogéneas. Los componentes de varianza fueron estimados utilizando el programa WOMBAT. Resultados: de acuerdo con la prueba de la razón de verosimilitud, el mejor modelo fue con 4 clases de varianzas residuales, siendo considerado un polinomio de Legendre de cuarto orden para el efecto de ambiente permanente y genético aditivo. Las heredabilidades fueron bajas, variando desde 0,00 hasta 0,14. Las correlaciones genéticas fueron altas y positivas entre los PDC1 a PDC8, excepto en el PDC9 que fue negativo con respecto a los demás controles. Conclusiones: es necesario considerar la heterogeneidad de varianzas residuales en los modelos estudiados, con el fin de modelar los cambios en las variaciones respecto a los días en lactancia.

Antecedentes: os registros da produção do leite medidos ao longo da lactação, apresentam um exemplo de medidas repetidas. Os modelos de regressão aleatória apresentam abordagem atraente para modelar medidas repetidas e estimar parâmetros genéticos. Objetivo: estimar parámetros genéticos mediante a modelação das variâncias genéticas e residual da produção do leite no dia do controle em búfalas de primeiro parto. Métodos: foram analisados 3986 controles de produção de leite em primeiras lactações de 1246 búfalas, filhas de 391 fêmeas e 23 touros, entre 1997 e 2008 em 5 fazendas. No modelo foram incluídos como efeitos aleatórios o genético aditivo e ambiente permanente, e como fixos o grupo contemporâneo (mês e ano de controle) e a covariável a idade da búfala ao parto (Lineal). As regressões fixas (3° ordem) e aleatórias (3° a 9° ordem) foram obtidas mediante polinômios ortogonais de Legendre. As variâncias residuais foram modeladas mediante estruturas homogêneas e diferentes classes heterogêneas. Os componentes de variância foram estimadas mediante o software WOMBAT. Resultados: de acordo com a prova da máxima verossimilhança, o melhor modelo foi com 4 classes de variâncias residuais, sendo considerado polinômios de Legendre de quarto ordem para o efeito de ambiente permanente e genético aditivo. As herdabilidades foram baixas, variando desde 0,00 até 0,14. As correlações genéticas foram altas e positivas entre o PDC1 e PDC8, a exceção do PDC9 que apresentou valores negativos com respeito aos outros controles. Conclusões:é necessário considerar heterogeneidade de variâncias nos modelos estudados, tentando modelar as mudanças nas variações respeito aos dias em lactação.

Spatial regression methods to evaluate beekeeping production in the state of Rio de Janeiro / Métodos de regressão espacial para avaliação da produção apícola do estado do Rio de Janeiro

Brazilian beekeeping has been developed from the africanization of the honeybees and its high performance launches Brazil as one of the world´s largest honey producer. The Southeastern region has an expressive position in this market (45%), but the state of Rio de Janeiro is the smallest producer, despite presenting large areas of wild vegetation for honey production. In order to analyze the honey productivity in the state of Rio de Janeiro, this research used classic and spatial regression approaches. The data used in this study comprised the responses regarding beekeeping from 1418 beekeepers distributed throughout 72 counties of this state. The best statistical fit was a semiparametric spatial model. The proposed model could be used to estimate the annual honey yield per hive in regions and to detect production factors more related to beekeeping. Honey productivity was associated with the number of hives, wild swarm collection and losses in the apiaries. This paper highlights that the beekeeping sector needs support and help to elucidate the problems plaguing beekeepers, and the inclusion of spatial effects in the regression models is a useful tool in geographical data.

A apicultura brasileira se desenvolveu a partir da africanização das abelhas melíferas, e seu bom desempenho permitiu lançar o Brasil como um dos maiores produtores mundiais de mel. A região Sudeste ocupa uma posição significativa no mercado, mas o estado do Rio de Janeiro é o menor produtor, apesar de apresentar áreas expressivas de vegetação silvestre para a produção de mel. Para analisar a produtividade de mel no estado do Rio de Janeiro, esta pesquisa estudou diversos métodos de regressão clássica e espacial. Os dados analisados compreenderam respostas sobre apicultura de 1418 apicultores distribuídos em 72 municípios do Rio de Janeiro. O melhor ajuste estatístico utilizado foi um modelo semiparamétrico espacial. A utilidade do modelo proposto é estimar a produção anual de mel por colmeia nas diversas regiões e identificar os fatores de produção mais relacionados à apicultura. A produtividade de mel mostrou-se mais associada com o número de colmeias, a coleta de enxame silvestre e as perdas em apiários. Este trabalho destacou que o segmento apícola necessita de apoio para auxiliar na identificação dos problemas que afetam os apicultores. A utilização de efeitos espaciais em modelos de regressão são ferramentas úteis quando são utilizados dados geograficamente referenciados.

Predição da neutralização do efeito coagulante da peçonha de Bothrops pauloensis pelo extrato aquoso de Hedychium coronarium (Zingerberaceae) através de modelos de regressão / Prediction of neutralization of clotting effect of venom bothrops pauloensis by aqueous extract of hedychium coronarium (zingeberaceae) through of regression models

Envenenamentos com serpentes do gênero Bothrops podem causar sequelas no local da picada, que não são revertidas mesmo após o tratamento com soro antiofídico. A incubação do extrato aquoso de Hedychium coronarium (Zingeberaceae) com a peçonha da serpente Bothrops pauloensis em diferentes concentrações foi capaz de inibir a atividade coagulante. No presente trabalho ajustou-se um modelo de regressão entre níveis de concentração de extrato e tempo de coagulação (segundos). O modelo ajustado conseguiu captar cerca 96 % da variação total do tempo de coagulação.

Envenomations with snakes Bothrops genus can cause dependency at the sting site, which are not reversed even after treatment with snake antivenoms. Incubation of the aqueous extract of Hedychium coronarium (Zingeberaceae) with snake venom Bothrops pauloensis in different concentrations was able to inhibit some enzymatic activities. This work has set a model of regression between concentrations of extract and clotting time (seconds). The adjusted model has captured about 96% of the total variation of clotting time

Fatores associados à mortalidade hospitalar na rede SUS do Rio Grande do Sul, em 2005: aplicação de modelo multinível / Factors associated with hospital mortality in Rio Grande do Sul SUS network in 2005: application of a Multilevel Model

OBJETIVO: Avaliar a mortalidade hospitalar por meio de análise multinível utilizando dados disponíveis no Sistema de Informações Hospitalares do Sistema Único de Saúde. MÉTODOS: Estudo transversal com dados de internações obtidas das Autorizações de Internação Hospitalar do Rio Grande do Sul no ano de 2005. A modelagem foi realizada por meio de regressão logística multinível, utilizando variáveis do nível individual (internações) e do nível contextual (hospitais). Analisou-se a variabilidade causada por variáreis individuais no nível hospitalar, bem como a participação do perfil dos hospitais na taxa de mortalidade hospitalar. RESULTADOS: A taxa bruta de mortalidade calculada para o conjunto de hospitais foi de 6,3 por cento. As variáveis uso de Unidade de Terapia Intensiva e idade foram os principais preditores para óbito hospitalar no nível individual. As variáveis de contexto que se relacionaram mais intensamente com o óbito hospitalar foram: porte do hospital, natureza jurídica e média de permanência. A chance de óbito em hospital de grande porte é 1,85 vezes a chance do hospital de pequeno porte e no hospital de médio porte é 1,69 vezes a chance do hospital de pequeno porte. Os hospitais públicos apresentam 67 por cento mais chances de óbito hospitalar do que os privados. CONCLUSÕES: O perfil hospitalar tem papel importante na mortalidade hospitalar do Sistema de Informações Hospitalares do Sistema Único de Saúde. A análise multinível deve ser empregada para a estimação da contribuição do perfil dos hospitais na mortalidade hospitalar.

OBJECTIVE: To use a multilevel analysis methodology to evaluate hospital mortality from the data available in the Hospital Information System of the National Unified Health System. METHODS: Cross-sectional study with data obtained from Authorization Forms for Hospital Admissions in Rio Grande do Sul, Brazil in 2005. The modeling was performed using multilevel logistic regression, with variables from the individual level (hospital admissions) and the context level (hospital profile). The variability originated from individual variables was analyzed as well as the participation of the profile of hospitals in the rate of hospital mortality. RESULTS: The crude death rate calculated for all hospitals was 6.3 percent. The variables "Use of Intensive Care Unit" followed by "Patient Age" were the main predictors for hospital death at the individual level. The context variables that were related most closely to hospital death (outcome) were: size of hospital, legal nature, and average length of stay. The OR for deaths at large hospitals was 1.85 times the odds for small hospitals and the OR for medium hospitals was 1.69 times the odds for small ones. The chance of deaths in public hospitals was 67 percent higher than in private ones. CONCLUSIONS: The hospital profile has an important role in hospital mortality in the Hospital Information System of the National Unified Health System. Multilevel analysis should be used to estimate the contribution of the profile of mortality in hospitals.

A expectativa do professor e o desempenho dos alunos / Teacher's expectation and students' performance

Este trabalho enfoca dois aspectos fundamentais na interação professor-aluno: a sintonia entre o professor e sua turma, e a expectativa do professor quanto ao desempenho dos alunos. Cruzando-se informações de diferentes instrumentos contextuais, aplicados aos professores e alunos, com os resultados dos testes cognitivos dos alunos, pôde-se identificar os fatores que distorcem a percepção do professor acerca da turma e influenciam sua expectativa. Constatou-se que a expectativa do professor é influenciada por suas percepções em relação ao ambiente escolar e pelas características sociodemográficas dos alunos. Observou-se que a expectativa do professor provoca um impacto positivo na proficiência do aluno, mesmo considerando-se o efeito de variáveis sociodemográficas tradicionalmente associadas ao desempenho. Essas conclusões foram obtidas a partir da construção de modelos hierárquicos.

This work focus on two basic aspects on teacher-student interaction: the tune between teacher and their class, and teacher's expectation with regard to students' performance. When cross analyzing the information of different contextual instruments, applied to teachers and students, with results of the students' cognitive tests, it was possible to identify the factors that distort the teacher's perception about the class and influence his/her expectation. It was noticed that the teacher's expectation is influenced by his/her perceptions in relation to the school environment and the students' social-demographic characteristics. It was observed that the teacher's expectation provokes a positive impact on the student's proficiency, even when it is considered the effect of social-demographic variables, which are traditionally associated to the performance. All these conclusions were obtained by constructing hierarchical models.