Eficacia y seguridad de la combinación de nirmatrelvir y ritonavir (PaxlovidTM) contra la COVID-19 / Efficacy and safety of the combination of nirmatrelvir and ritonavir (PaxlovidTM) against COVID-19

ANTECEDENTES: Este informe se efectúa en atención a la solicitud la jefatura del Instituto Nacional de Salud (INS). En un comunicado de prensa (publicado el 5 de noviembre de 2021), Pfizer indicó que, a través de un análisis provisional de su ECA fase 2/3, su nuevo antiviral candidato a tratamiento contra la COVID-19 (Paxlovid™) reduce el riesgo de hospitalización o muerte en un 89%, en comparación de las personas que recibieron placebo, en adultos no hospitalizados con COVID-19 (1). El comunicado menciona también que Pfizer planea enviar los datos a la FDA para su uso de emergencia, tan pronto como sea posible. El 16 de diciembre de 2021, la EMA emite recomendaciones sobre el uso de Paxlovid™ para el tratamiento de la COVID-19 (2) y el 19 de noviembre la EMA solicitó una opinión científica sobre los datos preclínicos, clínicos y de calidad disponibles sobre el potencial uso de Paxlovid™ para el manejo de pacientes con COVID-19 (el reporte se publicó el 10 de enero) (3). El 22 de diciembre de 2021, la FDA comunicó que autorizó el uso de emergencia de la combinación de nirmatrelvir y ritonavir (Paxlovid™) contra los casos leves y moderados de COVID-19 en adultos y población pediátrica de 12 a más años (que pesen de 40 Kg a más) (4). El 28 de enero del 2022, la EMA otorgó autorización comercial condicional a Paxlovid™ (5). El objetivo es sintetizar la evidencia científica publicada respecto a la eficacia y seguridad de la combinación de nirmatrelvir y ritonavir (Paxlovid™) contra la COVID-19. MÉTODOS: Pregunta PICO: ¿En población con COVID-19, cuál es la eficacia y seguridad de la combinación de nirmatrelvir y ritonavir (Paxlovid™)? Criterios de elegibilidade: Los criterios de selección de los estudios fueron los siguientes: Ensayos clínicos aleatorizados o revisiones sistemáticas que reporten resultados para al menos uno de los desenlaces. En ausencia de resultados de eficacia para alguno de los desenlaces, se considerará los resultados de efectividad a partir de estudios de cohorte o test negativo. Estudios publicados en idioma inglés y español. Se excluyeron cartas al editor, revisiones narrativas, estudios preclínicos (estudios in vitro o en modelos animales), artículos de opinión y manuscritos no revisados por pares. Métodos para la búsqueda e identificación de la evidencia: Los ensayos clínicos fueron identificados desde las siguientes fuentes (búsqueda realizada en 26 de enero de 2022): Plataforma Living Overview of the Evidence (L·OVE) de la Fundación Epistemonikos (https://www.epistemonikos.org/en/). Bases de datos electrónicas: MEDLINE/Pubmed, Embase y Cochrane Library. Registro de Ensayos Clínicos de Estados Unidos (https://clinicaltrials.gov/ct2/home) y la Plataforma Internacional de Registro de Ensayos Clínicos de la OMS (https://trialsearch.who.int/). Páginas institucionales de la Food and Drug Administration (FDA) de Estados Unidos (https://www.fda.gov/) y la European Medicines Agency (EMA) (https://www.ema.europa.eu/en). RESULTADOS: En la búsqueda bibliográfica no se encontraron ECA o estudios observacionales publicados o en proceso de publicación (in press) o sin revisión por partes (preprint) que hayan evaluado la eficacia y seguridad de la combinación de nirmatrelvir y ritonavir (Paxlovid™) contra la COVID-19. En cambio, se encontraron 3 ECA en proceso, sin resultados preliminares publicados en Clinical Trials (Tabla 1). Se encontró 1 evaluación realizada por la EMA de los datos del ECA de Paxlovid™ (NCT04960202) (3). El ensayo clínico es de tipo aleatorizado, en fase 2/3, doble ciego, controlado con placebo en adultos con COVID-19 sintomáticos y no hospitalizados que se encuentran en riesgo incrementado de progresar a enfermedad severa. El objetivo del ECA fue determinar la eficacia, seguridad y tolerabilidad de la combinación de nirmatrelvir (PF-07321332) y ritonavir (Paxlovid™) comparado con placebo en pareamiento 1:1. Las características del ECA se resumen en la Tabla 2. Con un análisis provisional de datos, con 45% de los participantes que completaron el seguimiento al día 28, se reportó una reducción absoluta del 6.317% (CI95%: -9.041%, -3.593%; p<0.0001). La EMA mencionó que no está completamente claro en qué medida los subgrupos de pacientes con COVID-19 leve y moderado están representados y adecuadamente balanceados en ambos grupos. Asimismo, hay una pobre representación de los pacientes con factores de riesgo (enfermedad pulmonar crónica, enfermedades cardiovasculares, enfermedades inmunosupresivas, etc.). Además, la EMA indicó que la falta de información de la actividad de nirmatrelvir (FP-07321332) contra la variante Omicron in vitro puede ser una advertencia crítica. CONCLUSIONES: El objetivo de la nota técnica fue sintetizar la evidencia científica publicada respecto a la eficacia y seguridad de la combinación de nirmatrelvir y ritonavir (Paxlovid™) contra la COVID-19. No se encontraron ECA o estudios observacionales publicados o en proceso de publicación (in press) o sin revisión por partes (preprint) que hayan evaluado la eficacia y seguridad de la combinación de nirmatrelvir y ritonavir (Paxlovid™) contra la COVID-19. Se encontraron 3 ECA en proceso, sin resultados preliminares publicados en Clinical Trials. Se encontró una evaluación de la EMA a un ECA de Pfizer (NCT04960202) que tuvo como objetivo evaluar la eficacia y seguridad de la combinación de nirmatrelvir y ritonavir (Paxlovid™) contra la COVID-19. Con un análisis provisional de datos, con 45% de los participantes que completaron el seguimiento al día 28, se reportó una reducción absoluta de la proporción de hospitalizaciones relacionadas a COVID-19 o muertes por cualquier causa en 6.317% (CI95%: -9.041%, -3.593%; p<0.0001) respecto de placebo. Según la ficha técnica de la FDA de Paxlovid™ y la información de la EMA, las reacciones adversas más frecuentes son disgeusia, diarrea, hipertensión y mialgias. No se reportaron muertes en el grupo Paxlovid™. Los datos sobre la eficacia de la combinación de nirmatrelvir y ritonavir (Paxlovid™) deben tomarse con precaución. La EMA señaló que no está completamente claro la representatividad de los grupos según grado de severidad y presencia de factores de riesgo. Además, existe falta de información sobre la actividad del Paxlovid contra la variante Omicron in vitro.

Traditional Chinese medicine network pharmacology study on exploring the mechanism of Xuebijing Injection in the treatment of coronavirus disease 2019 / 中国天然药物

As a representative drug for the treatment of severe community-acquired pneumonia and sepsis, Xuebijing (XBJ) injection is also one of the recommended drugs for the prevention and treatment of coronavirus disease 2019 (COVID-19), but its treatment mechanism for COVID-19 is still unclear. Therefore, this study aims to explore the potential mechanism of XBJ injection in the treatment of COVID-19 employing network pharmacology and molecular docking methods. The corresponding target genes of 45 main active ingredients in XBJ injection and COVID-19 were obtained by using multiple database retrieval and literature mining. 102 overlapping targets of them were screened as the core targets for analysis. Then built the PPI network, TCM-compound-target-disease, and disease-target-pathway networks with the help of Cytoscape 3.6.1 software. After that, utilized DAVID to perform gene ontology (GO) function enrichment analysis and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway enrichment analysis to predict the action mechanism of overlapping targets. Finally, by applying molecular docking technology, all compounds were docked with COVID-19 3 CL protease(3CLpro), spike protein (S protein), and angiotensin-converting enzyme II (ACE2). The results indicated that quercetin, luteolin, apigenin and other compounds in XBJ injection could affect TNF, MAPK1, IL6 and other overlapping targets. Meanwhile, anhydrosafflor yellow B (AHSYB), salvianolic acid B (SAB), and rutin could combine with COVID-19 crucial proteins, and then played the role of anti-inflammatory, antiviral and immune response to treat COVID-19. This study revealed the multiple active components, multiple targets, and multiple pathways of XBJ injection in the treatment of COVID-19, which provided a new perspective for the study of the mechanism of traditional Chinese medicine (TCM) in the treatment of COVID-19.

Flavonoid glycosides and their putative human metabolites as potential inhibitors of the SARS-CoV-2 main protease (Mpro) and RNA-dependent RNA polymerase (RdRp)

BACKGROUND Since the World Health Organization (WHO) declared Coronavirus disease 2019 (COVID-19) to be a pandemic infection, important severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) non-structural proteins (nsp) have been analysed as promising targets in virtual screening approaches. Among these proteins, 3-chymotrypsin-like cysteine protease (3CLpro), also named main protease, and the RNA-dependent RNA polymerase (RdRp), have been identified as fundamental targets due to its importance in the viral replication stages. OBJECTIVES To investigate, in silico, two of the most abundant flavonoid glycosides from Dysphania ambrosioides; a medicinal plant found in many regions of the world, along with some of the putative derivatives of these flavonoid glycosides in the human organism as potential inhibitors of the SARS-CoV-2 3CLpro and RdRp. METHODS Using a molecular docking approach, the interactions and the binding affinity with SARS-CoV-2 3CLpro and RdRp were predicted for quercetin-3-O-rutinoside (rutin), kaempferol-3-O-rutinoside (nicotiflorin) and some of their glucuronide and sulfate derivatives. FINDINGS Docking analysis, based on the crystal structure of 3CLpro and RdRp, indicated rutin, nicotiflorin, and their glucuronide and sulfate derivatives as potential inhibitors for both proteins. Also, the importance of the hydrogen bond and π-based interactions was evidenced for the presumed active sites. MAIN CONCLUSIONS Overall, these results suggest that both flavonoid glycosides and their putative human metabolites can play a key role as inhibitors of the SARS-CoV-2 3CLpro and RdRp. Obviously, further researches, mainly in vitro and in vivo experiments, are necessary to certify the docking results reported here, as well as the adequate application of these substances. Furthermore, it is necessary to investigate the risks of D. ambrosioides as a phytomedicine for use against COVID-19.

Coagulation modifiers targeting SARS-CoV-2 main protease Mpro for COVID-19 treatment: an in silico approach

Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection depends on viral polyprotein processing, catalysed by the main proteinase (Mpro). The solution of the SARS-CoV-2 Mpro structure allowed the investigation of potential inhibitors. This work aims to provide first evidences of the applicability of commercially approved drugs to treat coronavirus disease-19 (COVID-19). We screened 4,334 compounds to found potential inhibitors of SARS-CoV-2 replication using an in silico approach. Our results evidenced the potential use of coagulation modifiers in COVID-19 treatment due to the structural similarity of SARS-CoV-2 Mpro and human coagulation factors thrombin and Factor Xa. Further in vitro and in vivo analysis are needed to corroborate these results.