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1.
São Paulo; s.n; 2023. 1-105 p. graf, map.
Thesis in Portuguese | LILACS, Coleciona SUS, Sec. Est. Saúde SP, SESSP-CTDPROD, Sec. Est. Saúde SP, SESSP-TESESESSP, Sec. Est. Saúde SP | ID: biblio-1537712

ABSTRACT

As hepatites virais são um grande problema de saúde pública no mundo. Dos vírus que causam hepatite, o vírus da hepatite delta (HDV), por ser defectivo, é o único que precisa da função auxiliar do vírus da hepatite B (HBV), para sua montagem e propagação, e assim conseguir infectar os hepatócitos. A coinfecção HBV/HDV é a forma mais grave de hepatite viral, pela possibilidade de causar doença hepática grave com um curso acelerado de progressão para cirrose e um risco aumentado de carcinoma hepatocelular. Considerando a necessidade de estudos clínicos e epidemiológicos para investigar a presença da infecção pelo HDV em áreas não endêmicas do Brasil, esse estudo teve como objetivo investigar a soroprevalência do vírus da hepatite delta nas regiões Centro-Oeste e Noroeste do estado de São Paulo, entre indivíduos portadores de Hepatite B. Para isso, os pacientes foram devidamente esclarecidos sobre os objetivos do projeto, e os que concordaram em participar assinaram o Termo de Consentimento Livre e Esclarecido (TCLE), coletaram amostra de sangue e posteriormente responderam ao questionário epidemiológico. As amostras foram coletadas no período de dezembro de 2014 a dezembro de 2021, e encaminhadas ao Centro de Laboratório Regional Instituto Adolfo Lutz de São José do Rio Preto, onde foram separadas e estocadas até a realização dos testes sorológicos de anti-HDV total. Por sua vez, as amostras reagentes foram submetidas ao ensaio de RT-qPCR in house. A presença do anticorpo anti-Delta como marcador sorológico de infecção prévia ou atual pelo HDV foi investigada em 1049 amostras de portadores crônicos do HBV, sendo que 13 foram reagentes para anticorpos anti-HDV totais, resultando em uma soroprevalência geral de infecção por HDV de 1,2%. A média de idade, para a população reagente, foi de 54,2 anos. O perfil encontrado foi de maior percentual de indivíduos do sexo feminino (69,2%), da raça/cor branca (38,5%), de solteiros (42,9%), com mais de 9 anos de estudo (71,4%), moradores principalmente em área urbana (85,7%); com renda pessoal de até 1 salário mínimo (42,9%). Quanto aos comportamentos de risco, os mais citados foram compartilhamento de material no uso de drogas ilícitas (100%), não usar preservativo nas relações sexuais (71,4%) e mais três parceiros ao longo da vida (71,4%). Das 13 amostras anti-HDV reagentes, 2 (15,4%) apresentaram HDV RNA detectável, indicando infecção ativa pelo HDV. Este conhecimento sobre a epidemiologia local contribui para viabilizar uma vigilância ativa e efetiva no manejo dos pacientes HBV/HDV, considerando os perfis epidemiológico e socioeconômico descritos...(AU)


Viral hepatitis is a major public health problem worldwide. Of the viruses that cause hepatitis, the hepatitis delta virus (HDV), being defective, is the only one that needs the auxiliary function of the hepatitis B virus (HBV), for its assembly and propagation, and thus manage to infect hepatocytes. HBV/HDV co- infection is the most severe form of viral hepatitis because of the possibility of causing severe liver disease with an accelerated course of progression to cirrhosis and an increased risk of hepatocellular carcinoma. Considering the need for clinical and epidemiological studies to investigate the presence of HDV infection in non-endemic areas of Brazil, this study aimed to investigate the prevalence of hepatitis delta in the Midwest and Northwest regions of the state of São Paulo, among individuals with Hepatitis B. For this, the patients were duly explained about the objectives of the project, and those who agreed to participate signed the Free and Informed Consent Form, collected a blood sample and subsequently answered the epidemiological questionnaire. The samples were collected from December 2014 to December 2021, and sent to the Institute Adolfo Lutz Regional Laboratory Center in São José do Rio Preto, where they were separated and stored until the serological tests for total anti- HDV were carried out. In turn, the reagent samples were submitted to the in- house RT-qPCR assay. The presence of anti-Delta antibody as a serological marker of previous or current HDV infection was investigated in 1049 samples from chronic HBV carriers, 13 of which were reactive for total anti-HDV antibodies, resulting in an overall prevalence of HDV infection of 1.2%. The mean age for the reagent population was 54.2 years. The profile found was of a higher percentage of female individuals (69.2%), white (38.5%), single (42.9%), with more than 9 years of study (71, 4%), living mainly in urban areas (85.7%); with personal income of up to 1 minimum wage (42.9%). As for risk behaviors, the most cited were sharing material in the use of illicit drugs (100%), not using condoms during sexual intercourse (71.4%) and three more partners throughout life (71.4%). Of the 13 anti-HDV reagent samples, 2 (15.4%) had detectable HDV RNA, indicating active HDV infection. This knowledge about local epidemiology contributes to enabling active and effective surveillance in the management of HBV/HDV patients, considering the epidemiological and...(AU)

2.
Article in English | MEDLINE | ID: mdl-34755817

ABSTRACT

In Brazil, few studies on the molecular aspects of hepatitis B virus (HBV) infection have been conducted in the interior regions of Sao Paulo State. This study aimed to identify HBV genotypes and evaluate strains with resistance mutations for nucleoside analogues in the Administrative Region (AR) of the municipality of Sao Jose do Rio Preto. We performed nested PCRs of 127 samples from the Health Care Services of the AR to amplify, sequence and analyze fragments of the HBV DNA, in order to identify genotypes and resistance mutations. The HBV S/Pol regions of 126 samples were successfully amplified and sequenced. Five different genotypes were found, and the main ones were A, D and F; a greater number of samples contained the subgenotypes A1 (n = 51; 40.5%), D3 (n = 36; 28.6%), A2 (n = 14; 11.1%) and F2a (n = 9; 7.1%). Resistance mutations (rtM204V/I/S) associated or not with compensatory mutations (rtL180M, rtV173L) were identified in 13.9% (5/36) of patients undergoing viral treatment and 1.1% (1/90) of naïve patients. The diversity of genotypes/subgenotypes found is probably due to the intense migration occurring in the region. These data can complement epidemiological and clinical surveillance, and can be used for a more effective management of chronic HBV patients.


Subject(s)
Hepatitis B, Chronic , Hepatitis B , Brazil , DNA, Viral/genetics , Drug Resistance, Viral/genetics , Genotype , Hepatitis B virus/genetics , Humans , Mutation , Sequence Analysis, DNA
3.
São Paulo; s.n; 2018. 79 p. ilus.
Thesis in Portuguese | Sec. Est. Saúde SP, Coleciona SUS, LILACS, SESSP-CTDPROD, Sec. Est. Saúde SP, SESSP-TESESESSP, Sec. Est. Saúde SP | ID: biblio-1531151

ABSTRACT

As Hepatites virais representam um grave problema de sa úde pública no mundo, pelo número de indivíduos atingidos , pela s formas graves e mortalidade. Aproximadamente um terç o da população mundial atual já se expôs ao vírus da hepatite B, e estima se que 248 milhões de pessoas estejam infectadas cronicamente. No Brasil, a região Sudeste apresenta o maior número de casos no tificados para essa enfermidade, com maiores taxas de n otificação no Estado de São Paulo. São José do Rio Preto, localizada no noroeste Paulista, está entre as três regiões com maiores taxas migratórias do estado com intensa circulação e flutuação da população, e possui muitos pacientes em tratamento da Hepati te B, de diversas localidades Considerando que nesta Região nenhum estudo sobre os aspectos epidemiológicos e moleculares dessa infecção viral foi realizado este estudo teve o objetivo de investigar os genótipos e subgenótipos do vírus da hepatite B circ ul antes , a l ém de avaliar a presença de mutações de resist ência aos análogos de núcleos(t)ídeos, e as características epidemiológicas dos pacientes. Foram incluídas no estudo 127 amostras de soro ou plasma de portadores do HBV , de diferentes Unidades de Saú de da Região Administrativa de São José do Rio Preto, coletadas no período de setembro de 2015 a janeiro de 2018. O DNA do HBV foi extra ído das amostras, amplificado por nested PCR (regiões S/ Pol), e o s fragmentos obtidos na amplificação foram sequenciados em sequenciador automático. A identificação dos genótipos/subgenótipos e a pesquisa de mutações foram realizadas com sucesso em 126 amostras, após análise das sequ ências obtidas. Os genótipos encontrados foram A (51,6%; 65/126), B (0,8%; 1/126), C (0,8%; 1/126), D (37,3%; 47/126), E (0 ,8%; 1/126), e F (8,7%; 11/126); com relação aos subgenótipos, uma grande diversidade foi observada: A1 (40,5%), A2 (11,1%), B1 (0,8%), C1 (0,8%), D1 (1,6%), D2 (5,6%), D3 (28,6%), D4 (1,6%), F2a (7,1%) e F4 ( Os genóti pos A e D foram predominantes, sendo os subgenótipos A1 e D3 os mais prevalentes. Entre os pacientes que fazem tratamento, cepas do HBV com mutações de resistência (rt M204V /I/S) associadas ou não a mutações compensatórias (rt L180M , rt V173L ) foram identific adas em 13,9% (5/36) das amostras analisadas; mutações de resistência parcial ao Entecavir (rt M204V /I/S) ou potencialmente associadas com resistência ao Adefovir (rt V214A , rt L217R , rt Q215S , rt N238T e rt P237H ) em 13,9% (5/36) e 19,4% (7/36) dos pacientes, r espectivamente. Já no grupo de pacientes não submetidos a tratamento, 1,1% (1/90) das amostras apresentou mutação de resistência (rtM204V) e resistência parcial ao Entecavir, além de mutação (rtA181T) que confere resistência parcial in vitro , mas que não i mplica em resistência in vivo ao Tenofovir; u ma amostra (1,1%) apresentou mutação compensatória

4.
São Paulo; s.n; 2018. 1-79 p. ilus, mapas, graf, tab.
Thesis in Portuguese | LILACS, Sec. Est. Saúde SP, CONASS, Coleciona SUS, SESSP-ACVSES, SESSP-TESESESSP, Sec. Est. Saúde SP | ID: biblio-1395649

ABSTRACT

As Hepatites virais representam um grave problema de sa úde pública no mundo, pelo número de indivíduos atingidos , pela s formas graves e mortalidade. Aproximadamente um terç o da população mundial atual já se expôs ao vírus da hepatite B, e estima se que 248 milhões de pessoas estejam infectadas cronicamente. No Brasil, a região Sudeste apresenta o maior número de casos no tificados para essa enfermidade, com maiores taxas de n otificação no Estado de São Paulo. São José do Rio Preto, localizada no noroeste Paulista, está entre as três regiões com maiores taxas migratórias do estado com intensa circulação e flutuação da população, e possui muitos pacientes em tratamento da Hepati te B, de diversas localidades Considerando que nesta Região nenhum estudo sobre os aspectos epidemiológicos e moleculares dessa infecção viral foi realizado este estudo teve o objetivo de investigar os genótipos e subgenótipos do vírus da hepatite B circ ul antes , a l ém de avaliar a presença de mutações de resistência aos análogos de núcleos(t)ídeos, e as características epidemiológicas dos pacientes. Foram incluídas no estudo 127 amostras de soro ou plasma de portadores do HBV , de diferentes Unidades de Saú de da Região Administrativa de São José do Rio Preto, coletadas no período de setembro de 2015 a janeiro de 2018. O DNA do HBV foi extra ído das amostras, amplificado por nested PCR (regiões S/ Pol), e o s fragmentos obtidos na amplificação foram sequenciados em sequenciador automático. A identificação dos genótipos/subgenótipos e a pesquisa de mutações foram realizadas com sucesso em 126 amostras, após análise das sequ ências obtidas. Os genótipos encontrados foram A (51,6%; 65/126), B (0,8%; 1/126), C (0,8%; 1/126), D (37,3%; 47/126), E (0 ,8%; 1/126), e F (8,7%; 11/126); com relação aos subgenótipos, uma grande diversidade foi observada: A1 (40,5%), A2 (11,1%), B1 (0,8%), C1 (0,8%), D1 (1,6%), D2 (5,6%), D3 (28,6%), D4 (1,6%), F2a (7,1%) e F4 ( Os genóti pos A e D foram predominantes, sendo os subgenótipos A1 e D3 os mais prevalentes...(AU)


Viral Hepatitis represents a serious public health problem in the world, due to the number of individuals affected, serious forms and mortality. Approximately one-third of the world's population has already been exposed to the hepatitis B virus, and it is estimated that 248 million people are chronically infected. In Brazil, the Southeast region has the highest number of cases reported for this disease, with the highest reporting rates in the State of São Paulo. São José do Rio Preto, located in northwest State, is among the three regions with the highest migratory rates of the state with intense circulation and population fluctuation, and has many patients under treatment of Hepatitis B, from several locations. Considering that in this Region no study on the epidemiological and molecular aspects of this viral infection was carried out, this study aimed to investigate circulating genotypes and subgenotypes of the hepatitis B virus, in addition to evaluating the presence of resistance mutations to nucleos(t)ides analogues, and the epidemiological characteristics of the patients. The study included 127 serum or plasma samples from HBV carriers from different Health Units of the Administrative Region of São José do Rio Preto collected from September 2015 to January 2018. HBV DNA was extracted from samples, amplified by nested PCR (S/Pol regions), and the fragments obtained in the amplification were sequenced in an automated sequencer. Identification of genotypes and subgenotypes and mutation screening were performed successfully in 126 samples after analysis of the sequences obtained. The genotypes were A (51.6%, 65/126), B (0.8%, 1/126), C (0.8%, 1/126), D (37.3%, 47/126 ), E (0.8%, 1/126), and F (8.7%, 11/126); with respect to the subgenotypes, a great diversity was observed: A1 (40.5%), A2 (11.1%), B1 (0.8%), C1 (0.8%), D1 (1.6%) , D2 (5.6%), D3 (28.6%), D4 (1.6%), F2a (7.1%) and F4 (1.6%). Genotypes A and D were predominant, with subgenotypes A1 and D3 being the most prevalent. Among the patients undergoing treatment, strains of HBV with resistance mutations (rtM204V/I/S) associated or not to compensatory mutations (rtL180M, rtV173L) were identified in 13.9% (5/36) of the analyzed samples; mutations of partial resistance to Entecavir (rtM204V / I / S) or potentially associated with Adefovir resistance (rtV214A, rtL217R, rtQ215S, rtN238T and rtP237H) in 13.9% (5/36) and 19.4% (7/36) of the patients, respectively. Already in the group of non-treated patients, 1.1% (1/90) of the samples presented resistance mutation (rtM204V) and partial resistance to Entecavir, in addition to a mutation (rtA181T) conferring partial resistance in vitro, but not implies in vivo resistance to Tenofovir; one sample (1.1%) presented compensatory mutation (rtV/F/L/M207I), which usually appears after other primary variants of resistance to Lamivudine; and 26.7% (24/90) of the samples showed mutations of potential resistance to Adefovir (rtV214A, rtL217R, rtP237H, rtN238T, rtQ215S, rtI233V). All the samples analyzed were chronic carriers of HBV, with cirrhosis present in 4.7% (6/127), and HIV and/or HCV coinfections in 12.6% (16/127). The great diversity of genotypes/subgenotypes observed reflects the intense migration that occurs in the studied region, due to its importance as a reference center in health. Among strains of HBV, with mutations of resistance to nucleos(t)ide analogs, the profile of mutations conferring potential resistance to adefovir seems to be the most widespread in this population, but total resistance to lamivudine and emtricitabine and partial resistance to entecavir were observed in half of the patients under treatment with resistance profile. All these data demonstrate the importance of Hepatitis B in the region of São José do Rio Preto and demonstrate the need for an active surveillance for the effective management of chronic HBV patients in order to reduce the mortality and morbidity associated with this viral infection. (AU)


Subject(s)
Drug Resistance , Hepatitis B virus , Genotype , Hepatitis B , Mutation
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