RESUMO
Tubulin with bound [5-3H]dolastatin 10 was exposed to ultraviolet light, and 8-10% of the bound drug cross-linked to the protein, most of it specifically. The primary cross-link was to the peptide spanning amino acid residues 2-31 of beta-tubulin, but the specific amino acid could not be identified. Indirect studies indicated that cross-link formation occurred between cysteine 12 and the thiazole moiety of dolastatin 10. An equipotent analog of dolastatin 10, lacking the thiazole ring, did not form an ultraviolet light-induced cross-link to beta-tubulin. Preillumination of tubulin with ultraviolet light, known to induce cross-link formation between cysteine 12 and exchangeable site nucleotide, inhibited the binding of [5-3H]dolastatin 10 and cross-link formation more potently than it inhibited the binding of colchicine or vinblastine to tubulin. Conversely, binding of dolastatin 10 to tubulin inhibited formation of the cross-link between cysteine 12 and the exchangeable site nucleotide. Dithiothreitol inhibited formation of the beta-tubulin/dolastatin 10 cross-link but not the beta-tubulin/exchangeable site nucleotide cross-link. Modeling studies revealed a highly favored binding site for dolastatin 10 at the + end of beta-tubulin in proximity to the exchangeable site GDP. Computational docking of an energy-minimized dolastatin 10 conformation at this site placed the thiazole ring of dolastatin 10 8-9 A from the sulfur atom of cysteine 12. Dolastatin 15 and cryptophycin 1 could also be docked into positions that overlapped more extensively with the docked dolastatin 10 than with each other. This result was consistent with the observed binding properties of these peptides.
Assuntos
Cisteína/química , Oligopeptídeos/química , Peptídeos Cíclicos/química , Marcadores de Fotoafinidade/farmacologia , Tubulina (Proteína)/química , Animais , Antineoplásicos/farmacologia , Sítios de Ligação , Encéfalo/metabolismo , Bovinos , Simulação por Computador , Depsipeptídeos , Ditiotreitol/farmacologia , Eletroforese em Gel de Poliacrilamida , Guanosina Difosfato/química , Cinética , Ligantes , Luz , Modelos Químicos , Modelos Moleculares , Peptídeos/química , Marcadores de Fotoafinidade/química , Ligação Proteica , Conformação Proteica , Estrutura Terciária de Proteína , Tiazóis/química , Fatores de Tempo , Raios UltravioletaRESUMO
Foi otimizado um método de extração de DNA de coágulo sangüíneo. Amostras de sangue total colhidas em EDTA e de coágulo foram obtidas de 10 indivíduos não aparentados. Os coágulos foram homogeneizados (sistema Potter-Elvelyn NSE-11R). O DNA foi extraído pelo método de precipitação salina modificado (Clin.Chem.42-S298,1996). A quantificação e a pureza do DNA foram realizadas por espectrofotometria em 260 e 280 nm, sendo a sua integridade verificada por eletroforese em gel de agarose. A qualidade do DNA foi avaliada por amplificação da região polimórfica Ava II do gene do receptor da LDL, por PCR. A quantidade de DNA de coágulo foi semelhante a de sangue total (61,5 ± 11,9 e 60,6 ± 12,6 mg/ml de sangue, respectivamente). A pureza do DNA de coágulo foi semelhante a de sangue total (A260/280=1,87 ± 0,19 e 1,96 ± 0,17, respectivamente). As amostras de DNA apresentaram-se intactas no gel de agarose e sem contaminação com RNA. O rendimento do DNA obtido por este método dói maior que o dos descritos em outros estudos e mostrou-se adequado para análise do polimorfismo genético do receptor da LDL. Portanto, o procedimento de extração de DNA, otimizado em nosso laboratório, é simples, rápido e aplicável para obtenção de DNA de alta qualidade de amostras de coágulo sangüíneo, sendo útil em estudos de genotipagem.
