Melhoramento genético de peixes: revisão de literatura / Genetic improvement of fish: literature review

A implantação de programas de melhoramento genéticos bem delineados permite ganhos financeiros por meio da maximização de lucros através da geração de animais mais produtivos. Esse resultado é alcançado através de controle sistemático sobre a produção, proporcionando ganhos por geração, maior facilidade de manejo e otimização do espaço produtivo. É evidente o impacto dos programas desenvolvidos em espécies piscícolas, porém, espera-se maior expansão das ferramentas de melhoramento genético, principalmente em espécies nativas como o tambaqui, pintado e chácara, tornando indispensáveis mais estudos para o aperfeiçoamento e difusão de tais técnicas, considerando o grande potencial brasileiro para a produção aquícola.

The implementation of well-designed genetic improvement programs allows financial gains by maximizing profits through the generation of more productive animals. This result is achieved through systematic control over production, providing gains per generation, greater ease of handling and optimization of production space. The impact of the programs developed in fish species is evident, however, a greater expansion of genetic improvement tools is expected, especially in native species such as tambaqui, painted and farm, making more studies indispensable for the improvement and dissemination of such techniques, considering the great Brazilian potential for aquaculture production.

Comparison of random regression models, traditional animal model and with the inclusion of molecular markers in the estimation of genetic parameters in Colombian Holstein cattle / Comparação entre modelos de regressão aleatória, modelo animal tradicional e com a inclusão de marcadores moleculares na estimativa de parâmetros genéticos em bovinos da raça Holandesa Colombiana

The use of molecular markers to identify desirable genes in animal production is known as marker-assisted selection. The traditional genetic evaluation model uses the BLUP methodology; when genetic markers are included in the evaluation model, the methodology is known as M-BLUP. In contrast, random regression models (RRM), unlike the models based on production at 305 days, consider factors that change for each animal from one test to another. The objective of this study was to compare variance components, genetic parameters and breeding values for milk production, protein percentage and somatic cell score in Colombian Holstein cattle using BLUP, M-BLUP and RRM. For the estimation of genetic parameters and values, 2003 lactations corresponding to 1417 cows in 55 herds were used, and effects of the order of delivery, herd, and contemporary group were included. The three traits presented greater heritability under the MBLUP model: 0.44 for protein percentage, 0.27 for milk production and 0.28 for somatic cell score. This was because the genetic variance was greater when M-BLUP was used, which allowed a greater accuracy of the breeding value estimation in the three traits. Therefore, the model that includes information on molecular markers is more suitable for genetic evaluation in Colombian Holstein cattle.(AU)

O uso de marcadores moleculares para identificar genes desejáveis na produção animal é conhecido como seleção assistida por marcadores. O modelo tradicional de avaliação genética utiliza a metodologia BLUP, e quando os marcadores genéticos são incluídos no modelo de avaliação, a metodologia é conhecida como M-BLUP. Por outro lado, os modelos de regressão aleatória (RRM), ao contrário dos modelos baseados em produções a 305 dias, consideram fatores que mudam para cada indivíduo de um controle para outro. O objetivo deste estudo foi comparar componentes de variância, parâmetros e valores genéticos para produção de leite, percentagem de proteína e escore de células somáticas em gado holandês de Colômbia utilizando BLUP, M-BLUP e RRM. Para a estimativa de parâmetros e valores genéticos, foram utilizadas 2.003 lactações correspondentes a 1.417 vacas de 55 rebanhos e efeitos da ordem de parto, rebanho e grupo contemporâneo. Os três traços apresentaram maior hereditariedade no modelo MBLUP, 0,44 para percentagem de proteína, 0,27 para produção de leite e 0,28 para escore de células somáticas. Isso por causa da variância genética foi maior quando o M-BLUP foi utilizado, o que permitiu estimar maior precisão do valor genético nos três traços, portanto, o modelo que inclui informações sobre marcadores moleculares é mais adequado para avaliação genética em gado holandês colombiano.(AU)

Identification and phenotypic characterization of genetic groups of the Girolando breed in dairy herds of the state of Roraima / Identificação e caracterização fenotípica dos grupos genéticos da raça Girolando nos rebanhos leiteiros do estado de Roraima

Dairy farming in the state of Roraima, Brazil, is majorly supported by Holstein x Gir crossbred cattle, which are more adapted to the tropical climate and traditional production systems. However, there is a need to adapt the genetic groups to production systems and raise awareness of the importance of using visual phenotypic assessments as an auxiliary tool in obtaining and selecting animals. This study proposes to identify the frequency and characterize the phenotype of the » Hol + ¾ Gir; ⅜ Hol + ⅝ Gir; ½ Hol + ½ Gir; ⅝Hol + ⅜ Gir; ¾ Hol + » Gir; and ⅞ Hol + ⅛ Gir genetic groups of the Girolando breed in herds in the state of Roraima. Data were obtained from visual morphological evaluations to identify the genetic groups and characterize the phenotype of the animals from August 2016 to February 2017. According to the evaluations, the frequency distribution of the genetic groups was as follows: 210 (21.26%) of the » Hol + ¾ Gir group; 145 (14.68%) of the ⅜ Hol + ⅝ Gir group; 249 (25.20%) of the ½ Hol ½ Gir group; 166 (16.80%) of the ⅝ Hol + ⅜ Gir group; 126 (12.75%) of the ¾ Hol + » Gir group; and 92 (9.3%) of the ⅞ Hol + ⅛ Gir group. In the phenotypic evaluations, statistically significant differences (p<0.05) were detected in the ¾ Hol + » Gir genetic group for overall appearance (OA); in ⅝ Hol + ⅜ Gir and ⅞ Hol + ⅛ Gir for Body Capacity (BC); in ½ Hol + ½ Gir for Dairy Traits (DT); and in ¾ Hol + » Gir and ⅞ Hol + ⅛ Gir for Reproductive System and Feet-Leg Structure (RS/FL). The ½ Hol + ½ Gir genetic group was superior for BC, DT and RS/FL, being best classified as to the Girolando breed type and revealing better characterization and uniformity per selection process.(AU)

A pecuária leiteira do Estado de Roraima é sustentada por bovinos mestiços Holandês x Gir, animais mais adaptados ao clima tropical e aos sistemas de produção tradicionais. No entanto, existe a necessidade de adequação dos grupos genéticos aos sistemas de produção e de sensibilizar quanto à importância do uso de avaliações visuais fenotípicas como ferramenta de auxilio na obtenção e seleção dos animais. Os objetivos da pesquisa consistiram em identificar a frequência e caracterizar o fenótipo dos grupos genéticos » Hol + ¾ Gir, ⅜ Hol + ⅝ Gir, ½ Hol + ½ Gir, ⅝ Hol + ⅜ Gir, ¾ Hol + » Gir e ⅞ Hol + ⅛ Gir da raça Girolando nos rebanhos do Estado de Roraima. Os dados foram obtidos a partir de avaliações visuais morfológicas para identificar os grupos genéticos e caracterizar o fenótipo dos animais no período de agosto de 2016 a fevereiro de 2017. A distribuição da frequência dos grupos genéticos de acordo com as avaliações foi de: 210 (21,26%) do grupo » Hol + ¾ Gir; 145 (14,68%) do grupo ⅜ Hol + ⅝ Gir; 249 (25,20%) do grupo ½ Hol ½ Gir; 166 (16,80%) do grupo ⅝ Hol + ⅜ Gir; 126 (12,75%) do grupo ¾ Hol + » Gir e 92 (9,3%) do grupo ⅞ Hol + ⅛ Gir. Nas avaliações fenotípicas foram observadas diferenças estaticamente significativas (p<0,05) no grupo genético ¾ Hol + » Gir para Aparência Geral (AG), nos grupos genéticos ⅝ Hol + ⅜ Gir e ⅞ Hol + ⅛ Gir para Capacidade Corporal (CC), nogrupo ½ Hol + ½ Gir para Características Leiteiras (CL) e nos grupos ¾ Hol + » Gir e ⅞ Hol + ⅛ Gir para Aparelho Reprodutor e Aprumos (AR/A). O grupo genético ½ Hol + ½ Gir foi superior nas características Capacidade Corporal (CC), Características Leiteiras (CL) e Aparelho Reprodutor e Aprumos (AR/A), sendo melhores classificados quanto ao tipo da raça Girolando demonstrando melhor caracterização e uniformização por processo seletivo.(AU)

Identification and phenotypic characterization of genetic groups of the Girolando breed in dairy herds of the state of Roraima / Identificação e caracterização fenotípica dos grupos genéticos da raça Girolando nos rebanhos leiteiros do estado de Roraima

Dairy farming in the state of Roraima, Brazil, is majorly supported by Holstein x Gir crossbred cattle, which are more adapted to the tropical climate and traditional production systems. However, there is a need to adapt the genetic groups to production systems and raise awareness of the importance of using visual phenotypic assessments as an auxiliary tool in obtaining and selecting animals. This study proposes to identify the frequency and characterize the phenotype of the » Hol + ¾ Gir; ⅜ Hol + ⅝ Gir; ½ Hol + ½ Gir; ⅝Hol + ⅜ Gir; ¾ Hol + » Gir; and ⅞ Hol + ⅛ Gir genetic groups of the Girolando breed in herds in the state of Roraima. Data were obtained from visual morphological evaluations to identify the genetic groups and characterize the phenotype of the animals from August 2016 to February 2017. According to the evaluations, the frequency distribution of the genetic groups was as follows: 210 (21.26%) of the » Hol + ¾ Gir group; 145 (14.68%) of the ⅜ Hol + ⅝ Gir group; 249 (25.20%) of the ½ Hol ½ Gir group; 166 (16.80%) of the ⅝ Hol + ⅜ Gir group; 126 (12.75%) of the ¾ Hol + » Gir group; and 92 (9.3%) of the ⅞ Hol + ⅛ Gir group. In the phenotypic evaluations, statistically significant differences (p<0.05) were detected in the ¾ Hol + » Gir genetic group for overall appearance (OA); in ⅝ Hol + ⅜ Gir and ⅞ Hol + ⅛ Gir for Body Capacity (BC); in ½ Hol + ½ Gir for Dairy Traits (DT); and in ¾ Hol + » Gir and ⅞ Hol + ⅛ Gir for Reproductive System and Feet-Leg Structure (RS/FL). The ½ Hol + ½ Gir genetic group was superior for BC, DT and RS/FL, being best classified as to the Girolando breed type and revealing better characterization and uniformity per selection process.

A pecuária leiteira do Estado de Roraima é sustentada por bovinos mestiços Holandês x Gir, animais mais adaptados ao clima tropical e aos sistemas de produção tradicionais. No entanto, existe a necessidade de adequação dos grupos genéticos aos sistemas de produção e de sensibilizar quanto à importância do uso de avaliações visuais fenotípicas como ferramenta de auxilio na obtenção e seleção dos animais. Os objetivos da pesquisa consistiram em identificar a frequência e caracterizar o fenótipo dos grupos genéticos » Hol + ¾ Gir, ⅜ Hol + ⅝ Gir, ½ Hol + ½ Gir, ⅝ Hol + ⅜ Gir, ¾ Hol + » Gir e ⅞ Hol + ⅛ Gir da raça Girolando nos rebanhos do Estado de Roraima. Os dados foram obtidos a partir de avaliações visuais morfológicas para identificar os grupos genéticos e caracterizar o fenótipo dos animais no período de agosto de 2016 a fevereiro de 2017. A distribuição da frequência dos grupos genéticos de acordo com as avaliações foi de: 210 (21,26%) do grupo » Hol + ¾ Gir; 145 (14,68%) do grupo ⅜ Hol + ⅝ Gir; 249 (25,20%) do grupo ½ Hol ½ Gir; 166 (16,80%) do grupo ⅝ Hol + ⅜ Gir; 126 (12,75%) do grupo ¾ Hol + » Gir e 92 (9,3%) do grupo ⅞ Hol + ⅛ Gir. Nas avaliações fenotípicas foram observadas diferenças estaticamente significativas (p<0,05) no grupo genético ¾ Hol + » Gir para Aparência Geral (AG), nos grupos genéticos ⅝ Hol + ⅜ Gir e ⅞ Hol + ⅛ Gir para Capacidade Corporal (CC), nogrupo ½ Hol + ½ Gir para Características Leiteiras (CL) e nos grupos ¾ Hol + » Gir e ⅞ Hol + ⅛ Gir para Aparelho Reprodutor e Aprumos (AR/A). O grupo genético ½ Hol + ½ Gir foi superior nas características Capacidade Corporal (CC), Características Leiteiras (CL) e Aparelho Reprodutor e Aprumos (AR/A), sendo melhores classificados quanto ao tipo da raça Girolando demonstrando melhor caracterização e uniformização por processo seletivo.

Canonical correlation analysis applied to production and reproduction traits of meat type quails / Análise de correlações canônicas aplicada em características de produção e reprodução em codorna de corte

ABSTRACT: Data from 629 meat type quails were used to study association between two different sets of traits: egg production and reproduction. Traits related to reproduction were: body weight at 42 days (W42), average egg weight (AEW), age at sexual maturity (ASM); and production traits: number of eggs produced from 42 until 182th day considering intervals of 35 days each period (P1, P2, P3 and P4). Canonical correlations were used to describe the association between these two sets of traits. The canonical coefficients indicated that egg production and reproductive traits were moderately related (0.3475). The first partial period of production (P1) and age at sexual maturity were the most relevant traits among the analyzed variables. Results show that selecting animals with lower age at sexual maturity might lead to an increase on number of eggs produced until 77 days, although it might also lead to a decrease on egg weight. Breeding programs aiming to improve quails production should consider selection strategies to decrease age at sexual maturity and then, as correlated response, increased egg production might be observed.

RESUMO: Dados de 629 matrizes de codornas de corte foram utilizados para estudar a associação entre características de reprodução e produção de ovos. As características analisadas foram: peso corporal aos 42 dias (W42), peso médio de ovos (AEW) e idade à maturidade sexual (ASM), que compôs as características reprodutivas; e números de ovos produzidos a partir do 42o dia, divididos em intervalos de 35 dias cada (P1, P2, P3 e P4), que integrou o grupo de características de produção. Para análise de associação, foi utilizada a análise de correlação canônica entre os dois conjuntos de características. Os coeficientes canônicos indicaram que os conjuntos de características de produção de ovos e reprodutivas são dependentes, correlacionando-se moderadamente (0,3475). Entre as variáveis avaliadas, o primeiro período parcial de produção de ovos e a idade à maturidade sexual foram as mais importantes. Os resultados indicam que a seleção para menor idade à maturidade sexual resultaria em aumento no número de ovos produzidos até 77 dias de idade, embora essa seleção possa resultar em diminuição do peso de ovo. Conclui-se que a seleção de aves deve ser efetuada para menor maturidade sexual, pois, assim, estará selecionando também aves para maior produção de ovos.

Canonical correlation analysis applied to production and reproduction traits of meat type quails / Análise de correlações canônicas aplicada em características de produção e reprodução em codorna de corte

Data from 629 meat type quails were used to study association between two different sets of traits: egg production and reproduction. Traits related to reproduction were: body weight at 42 days (W42), average egg weight (AEW), age at sexual maturity (ASM); and production traits: number of eggs produced from 42 until 182th day considering intervals of 35 days each period (P1, P2, P3 and P4). Canonical correlations were used to describe the association between these two sets of traits. The canonical coefficients indicated that egg production and reproductive traits were moderately related (0.3475). The first partial period of production (P1) and age at sexual maturity were the most relevant traits among the analyzed variables. Results show that selecting animals with lower age at sexual maturity might lead to an increase on number of eggs produced until 77 days, although it might also lead to a decrease on egg weight. Breeding programs aiming to improve quails production should consider selection strategies to decrease age at sexual maturity and then, as correlated response, increased egg production might be observed.(AU)

Dados de 629 matrizes de codornas de corte foram utilizados para estudar a associação entre características de reprodução e produção de ovos. As características analisadas foram: peso corporal aos 42 dias (W42), peso médio de ovos (AEW) e idade à maturidade sexual (ASM), que compôs as características reprodutivas; e números de ovos produzidos a partir do 42o dia, divididos em intervalos de 35 dias cada (P1, P2, P3 e P4), que integrou o grupo de características de produção. Para análise de associação, foi utilizada a análise de correlação canônica entre os dois conjuntos de características. Os coeficientes canônicos indicaram que os conjuntos de características de produção de ovos e reprodutivas são dependentes, correlacionando-se moderadamente (0,3475). Entre as variáveis avaliadas, o primeiro período parcial de produção de ovos e a idade à maturidade sexual foram as mais importantes. Os resultados indicam que a seleção para menor idade à maturidade sexual resultaria em aumento no número de ovos produzidos até 77 dias de idade, embora essa seleção possa resultar em diminuição do peso de ovo. Conclui-se que a seleção de aves deve ser efetuada para menor maturidade sexual, pois, assim, estará selecionando também aves para maior produção de ovos.(AU)

Guaiaca a software tool for supporting the use of scientific applications designed for data analysis part I: execution assistant / Guaiaca uma ferramenta de apoio ao uso de aplicativos científicos destinados a análises de dados parte I: assistente de execução

The aim of this work is to develop a software tool that provides a user-friendly graphical interface of generic and configurable design in order to ease the researchers tasks in data manipulation and analysis. Two primary targets have influenced the design: data preparation for analysis in animal breeding programs and usability increase for those applications that perform important analysis methods, but interact with users only through text files and command lines. The Guaiaca tool was designed as a utility belt in the form of two integrated assistants, and it can be combined with multiple analysis applications. This tool offers facilities to: (a) collect, manipulate, and reorganize data; (b) organize, register, and retrieve analyses through descriptors; and (c) prepare and activate analysis processes. Guaiacas Execution Assistant module is described in this paper, where is also emphasized the parameters to configure, the main data structures to maintain, and the form of the relationship between its generic interface and combined analysis applications. The generic interface has been customized and validated for the peculiarities of two applications, WOMBAT (mixed models) and INTERGEN (Bayesian models). Several data analyses were performed with the interface support to prove its generality and ease of installation, configuration and operation. Data sets from 5,726 quails in

O objetivo deste trabalho foi desenvolver uma ferramenta de software com interface gráfica amigável, genérica e configurável, para facilitar pesquisadores na organização e gerenciamento das atividades de manipulação e análises de dados. A concepção foi baseada nas características de dois focos principais: a preparação de dados para análises em pesquisas de melhoramento genético de animais e o incremento da usabilidade para aplicativos que implementam importantes métodos de análises, mas interagem com o usuário via arquivos de texto e linha de comando. A ferramenta Guaiaca foi modelada como um cinto de utilidades e desenvolvida na forma de dois assistentes integrados. Pode ser combinada com múltiplos aplicativos executores de análises. Oferece facilidades para: coleta, manipulação e reorganização de dados; organização, catalogação e recuperação de análises via descritores; ativação de processos de análise. Apresenta-se uma descrição sobre o Assistente de Execução destacando os parâmetros configuráveis, as estruturas de dados mantidas e a forma de relacionamento entre a interface genérica e os aplicativos de análise combinados. A personalização de sua interface foi testada para peculiaridades dos aplicativos WOMBAT (modelos mistos) e INTERGEN (modelos bayesianos). Foram realizadas diversas análises para comprovar sua generalidade e facilidade de instalação, configuração e opera

Guaiaca a software tool for supporting the use of scientific applications designed for data analysis part I: execution assistant / Guaiaca uma ferramenta de apoio ao uso de aplicativos científicos destinados a análises de dados parte I: assistente de execução

The aim of this work is to develop a software tool that provides a user-friendly graphical interface of generic and configurable design in order to ease the researchers tasks in data manipulation and analysis. Two primary targets have influenced the design: data preparation for analysis in animal breeding programs and usability increase for those applications that perform important analysis methods, but interact with users only through text files and command lines. The Guaiaca tool was designed as a utility belt in the form of two integrated assistants, and it can be combined with multiple analysis applications. This tool offers facilities to: (a) collect, manipulate, and reorganize data; (b) organize, register, and retrieve analyses through descriptors; and (c) prepare and activate analysis processes. Guaiacas Execution Assistant module is described in this paper, where is also emphasized the parameters to configure, the main data structures to maintain, and the form of the relationship between its generic interface and combined analysis applications. The generic interface has been customized and validated for the peculiarities of two applications, WOMBAT (mixed models) and INTERGEN (Bayesian models). Several data analyses were performed with the interface support to prove its generality and ease of installation, configuration and operation. Data sets from 5,726 quails in

O objetivo deste trabalho foi desenvolver uma ferramenta de software com interface gráfica amigável, genérica e configurável, para facilitar pesquisadores na organização e gerenciamento das atividades de manipulação e análises de dados. A concepção foi baseada nas características de dois focos principais: a preparação de dados para análises em pesquisas de melhoramento genético de animais e o incremento da usabilidade para aplicativos que implementam importantes métodos de análises, mas interagem com o usuário via arquivos de texto e linha de comando. A ferramenta Guaiaca foi modelada como um cinto de utilidades e desenvolvida na forma de dois assistentes integrados. Pode ser combinada com múltiplos aplicativos executores de análises. Oferece facilidades para: coleta, manipulação e reorganização de dados; organização, catalogação e recuperação de análises via descritores; ativação de processos de análise. Apresenta-se uma descrição sobre o Assistente de Execução destacando os parâmetros configuráveis, as estruturas de dados mantidas e a forma de relacionamento entre a interface genérica e os aplicativos de análise combinados. A personalização de sua interface foi testada para peculiaridades dos aplicativos WOMBAT (modelos mistos) e INTERGEN (modelos bayesianos). Foram realizadas diversas análises para comprovar sua generalidade e facilidade de instalação, configuração e opera

Perfil genético das linhagens de touros leiteiros Holandês e Jersey disponíveis no Brasil / Genetic profile of Holstein and Jersey dairy bull lines available in Brazil

As raças de bovinos de leite Holandesa e Jersey estão entre as mais prevalentes no Brasil. Para avaliar as diferenças entre as PTAs (habilidades de transmissão preditas) destas raças e suas linhagens, foram coletadas informações de 385 touros Holandês e 82 touros Jersey disponibilizados por nove empresas comercializadoras de sêmen no Brasil. Três diferentes linhagens de cada raça foram encontradas. O método dos modelos lineares generalizados foi utilizado para a comparação entre linhagens e entre raças. As duas linhagens da raça Holandesa mais prevalentes apresentaram as maiores PTAs médias para produção de leite (1.061,04 libras e 975,32 libras) e as menores PTAs para a porcentagem de sólidos no leite (de -0,05% a -0,0003%)

The Holstein and Jersey dairy cattle breeds are among the most prevalent in Brazil. To evaluate differences among the PTAs (predicted transmitting abilities) of these breeds and their lines, data were collected on 385 Holstein bulls and 82 Jersey sires with semen commercially available from nine Brazilian companies. Three different sire lines for each breed were found. The general linear models method was used for the comparison among lines and between breeds. The two most prevalent lines of Holstein breed presented higher average PTAs for milk yield (1,061.04 pounds and 975.32 pounds) and lower PTAs for percentage of milk solids (from -0.05% to -0.0003%)

Estimativas de parâmetros genéticos em características de crescimento de bovinos da raça Nelore na região centro-oeste do Brasil / Estimates of genetic parameters of growth traits of Nellore cattle in the Midwest region of Brazil

Registros de peso ao nascer (PN) e pesos padronizados para 210 (P210); 365 (P365) e 550 (P550) dias de idade na raça Nelore foram usados com o objetivo de estimar componentes de variância dos efeitos genéticos e predição de valores genéticos dos reprodutores. O modelo incluiu os efeitos fixos de grupo contemporâneo e idade da vaca ao parto, como covariável, além dos efeitos aleatórios genético aditivo direto e genético materno, de ambiente permanente materno e ambiente temporário. As estimativas das médias e desvios-padrão para PN; P210; P365 e P550 foram iguais a 32,76 ± 3,74; 184,30 ± 29,02; 240,31 ± 41,85 e 322,12 ± 60,77, respectivamente. Em todos os pesos, verificou-se considerável variabilidade genética aditiva. A variância de ambiente permanente materno apresentou maior relevância sobre o peso a desmama, sendo praticamente inexistente após o desmame. Para a variância genética materna, a estimativa para o peso ao nascer foi mais significativa quando comparada com o peso a desmama. Os valores estimados de herdabilidade para PN; P210; P365 e P550 foram iguais a 0,37 ± 0,02; 0,36 ± 0,03; 031 ± 0,01 e 0,38 ± 0,02, respectivamente. As correlações genéticas entre peso ao nascer e outros pesos foram de baixa magnitude, com altos valores dos pesos em outras idades.

Records of birth weight (BW) and weights standardized to 210 (W210); 365 (W365) and 550 (W550) of age in the Nellore breed were used to estimate variance components of genetic effects and predict genetic values of sires. The model included the fixed effects of contemporary group and cow age at calving as co-variable, and the additive and maternal genetic, permanent maternal environmental, and temporary environmental random effects. Estimates of means and standard deviations for BW, W210; W365 and W550 were 32.76 ± 3.74; 184.30 ± 29.02; 240.31 ± 41.85 and 322.12 ± 60.77, respectively. A significant additive genetic variability was detected for all weights. The permanent maternal environmental variance showed greater relevance on weaning weight, and it was practically inexistent after weaning. For the maternal genetic variance, the estimate for birth weight was more significant as compared with weaning weight. The estimated heritability values for BW, W210; W365 and W550 were 0.37 ± 0.02; 0.36 ± 0.03; 031 ± 0.01 and 0.38 ± 0.02, respectively. Genetic correlations between birth weight and other weights were of low magnitude, with high values of weights at other ages.

Estimates of genetic parameters of growth traits of Nellore cattle in the Midwest region of Brazil

Records of birth weight (BW) and weights standardized to 210 (W210); 365 (W365) and 550 (W550) of age in the Nellore breed were used to estimate variance components of genetic effects and predict genetic values of sires. The model included the fixed effects of contemporary group and cow age at calving as co-variable, and the additive and maternal genetic, permanent maternal environmental, and temporary environmental random effects. Estimates of means and standard deviations for BW, W210; W365 and W550 were 32.76 ± 3.74; 184.30 ± 29.02; 240.31 ± 41.85 and 322.12 ± 60.77, respectively. A significant additive genetic variability was detected for all weights. The permanent maternal environmental variance showed greater relevance on weaning weight, and it was practically inexistent after weaning. For the maternal genetic variance, the estimate for birth weight was more significant as compared with weaning weight. The estimated heritability values for BW, W210; W365 and W550 were 0.37 ± 0.02; 0.36 ± 0.03; 031 ± 0.01 and 0.38 ± 0.02, respectively. Genetic correlations between birth weight and other weights were of low magnitude, with high values of weights at other ages. The use of sires of higher genetic value for total maternal effect makes it possible to use sires that are more positive for weaning weight and also for year and yearling weight.

Registros de peso ao nascer (PN) e pesos padronizados para 210 (P210); 365 (P365) e 550 (P550) dias de idade na raça Nelore foram usados com o objetivo de estimar componentes de variância dos efeitos genéticos e predição de valores genéticos dos reprodutores. O modelo incluiu os efeitos fixos de grupo contemporâneo e idade da vaca ao parto, como covariável, além dos efeitos aleatórios genético aditivo direto e genético materno, de ambiente permanente materno e ambiente temporário. As estimativas das médias e desvios-padrão para PN; P210; P365 e P550 foram iguais a 32,76 ± 3,74; 184,30 ± 29,02; 240,31 ± 41,85 e 322,12 ± 60,77, respectivamente. Em todos os pesos, verificou-se considerável variabilidade genética aditiva. A variância de ambiente permanente materno apresentou maior relevância sobre o peso a desmama, sendo praticamente inexistente após o desmame. Para a variância genética materna, a estimativa para o peso ao nascer foi mais significativa quando comparada com o peso a desmama. Os valores estimados de herdabilidade para PN; P210; P365 e P550 foram iguais a 0,37 ± 0,02; 0,36 ± 0,03; 031 ± 0,01 e 0,38 ± 0,02, respectivamente. As correlações genéticas entre peso ao nascer e outros pesos foram de baixa magnitude, com altos valores dos pesos em outras idades. O uso de reprodutores de maior valor genético para o efeito materno total permite utilizar reprodutores mais positivos para peso ao desmame e também para o ano e peso ao sobreano.

Genetic profile of Holstein and Jersey dairy bull lines available in Brazil

The Holstein and Jersey dairy cattle breeds are among the most prevalent in Brazil. To evaluate differences among the PTAs (predicted transmitting abilities) of these breeds and their lines, data were collected on 385 Holstein bulls and 82 Jersey sires with semen commercially available from nine Brazilian companies. Three different sire lines for each breed were found. The general linear models method was used for the comparison among lines and between breeds. The two most prevalent lines of Holstein breed presented higher average PTAs for milk yield (1,061.04 pounds and 975.32 pounds) and lower PTAs for percentage of milk solids (from -0.05% to -0.0003%) (P 0.05). These results indicate the supply of sires that mostly increase the milk yield in the Brazilian market. The Jersey breed presented a higher inbreeding coefficient (6.62%) than the Holstein breed (5.14%) (P 0.05). Although the Holstein breed presented higher PTAs for milk yield and lower PTAs for percentage of milk solids (P 0.05), the productive life of the Jersey breed (1.17 months) was longer than it was in the Holstein breed (0.40 months) (P 0.05). We identified the existence of an important variability of the available genetic profiles, what allows the Brazilian producers to choose the most adequate semen for their production system. It is necessary to consider the genetic profiles of sires' lines offered for artificial insemination in Brazil to understand and direct the genetic pattern of Brazilian dairy cattle.

As raças de bovinos de leite Holandesa e Jersey estão entre as mais prevalentes no Brasil. Para avaliar as diferenças entre as PTAs (habilidades de transmissão preditas) destas raças e suas linhagens, foram coletadas informações de 385 touros Holandês e 82 touros Jersey disponibilizados por nove empresas comercializadoras de sêmen no Brasil. Três diferentes linhagens de cada raça foram encontradas. O método dos modelos lineares generalizados foi utilizado para a comparação entre linhagens e entre raças. As duas linhagens da raça Holandesa mais prevalentes apresentaram as maiores PTAs médias para produção de leite (1.061,04 libras e 975,32 libras) e as menores PTAs para a porcentagem de sólidos no leite (de -0,05% a -0,0003%) (P 0.05). Estes resultados sugerem a oferta de touros no mercado nacional que são capazes principalmente de aumentar a produção de leite. A raça Jersey apresentou um coeficiente de endogamia mais elevado (6,62%) que o da raça Holandesa (5,14%) (P 0.05). Embora a raça Holandesa tenha apresentado maiores PTAs para produção de leite e as menores PTAs para a porcentagem de sólidos no leite, a vida produtiva da raça Jersey apresentou-se mais longa (1,17 meses) (P 0.05) que a da raça Holandesa (0,40 meses). Houve uma importante variabilidade do material genético disponível, permitindo a escolha do sêmen mais adequado para cada sistema de produção. Faz-se necessário conhecer o perfil genético dos touros disponibilizados para inseminação artificial no Brasil, com vistas ao conhecimento e direcionamento do padrão genético dos bovinos leiteiros no país.

Perfil genético das linhagens de touros leiteiros Holandês e Jersey disponíveis no Brasil / Genetic profile of Holstein and Jersey dairy bull lines available in Brazil

As raças de bovinos de leite Holandesa e Jersey estão entre as mais prevalentes no Brasil. Para avaliar as diferenças entre as PTAs (habilidades de transmissão preditas) destas raças e suas linhagens, foram coletadas informações de 385 touros Holandês e 82 touros Jersey disponibilizados por nove empresas comercializadoras de sêmen no Brasil. Três diferentes linhagens de cada raça foram encontradas. O método dos modelos lineares generalizados foi utilizado para a comparação entre linhagens e entre raças. As duas linhagens da raça Holandesa mais prevalentes apresentaram as maiores PTAs médias para produção de leite (1.061,04 libras e 975,32 libras) e as menores PTAs para a porcentagem de sólidos no leite (de -0,05% a -0,0003%)(AU)

The Holstein and Jersey dairy cattle breeds are among the most prevalent in Brazil. To evaluate differences among the PTAs (predicted transmitting abilities) of these breeds and their lines, data were collected on 385 Holstein bulls and 82 Jersey sires with semen commercially available from nine Brazilian companies. Three different sire lines for each breed were found. The general linear models method was used for the comparison among lines and between breeds. The two most prevalent lines of Holstein breed presented higher average PTAs for milk yield (1,061.04 pounds and 975.32 pounds) and lower PTAs for percentage of milk solids (from -0.05% to -0.0003%)(AU)

Estimativas de parâmetros genéticos em características de crescimento de bovinos da raça Nelore na região centro-oeste do Brasil / Estimates of genetic parameters of growth traits of Nellore cattle in the Midwest region of Brazil

Registros de peso ao nascer (PN) e pesos padronizados para 210 (P210); 365 (P365) e 550 (P550) dias de idade na raça Nelore foram usados com o objetivo de estimar componentes de variância dos efeitos genéticos e predição de valores genéticos dos reprodutores. O modelo incluiu os efeitos fixos de grupo contemporâneo e idade da vaca ao parto, como covariável, além dos efeitos aleatórios genético aditivo direto e genético materno, de ambiente permanente materno e ambiente temporário. As estimativas das médias e desvios-padrão para PN; P210; P365 e P550 foram iguais a 32,76 ± 3,74; 184,30 ± 29,02; 240,31 ± 41,85 e 322,12 ± 60,77, respectivamente. Em todos os pesos, verificou-se considerável variabilidade genética aditiva. A variância de ambiente permanente materno apresentou maior relevância sobre o peso a desmama, sendo praticamente inexistente após o desmame. Para a variância genética materna, a estimativa para o peso ao nascer foi mais significativa quando comparada com o peso a desmama. Os valores estimados de herdabilidade para PN; P210; P365 e P550 foram iguais a 0,37 ± 0,02; 0,36 ± 0,03; 031 ± 0,01 e 0,38 ± 0,02, respectivamente. As correlações genéticas entre peso ao nascer e outros pesos foram de baixa magnitude, com altos valores dos pesos em outras idades.(AU)

Records of birth weight (BW) and weights standardized to 210 (W210); 365 (W365) and 550 (W550) of age in the Nellore breed were used to estimate variance components of genetic effects and predict genetic values of sires. The model included the fixed effects of contemporary group and cow age at calving as co-variable, and the additive and maternal genetic, permanent maternal environmental, and temporary environmental random effects. Estimates of means and standard deviations for BW, W210; W365 and W550 were 32.76 ± 3.74; 184.30 ± 29.02; 240.31 ± 41.85 and 322.12 ± 60.77, respectively. A significant additive genetic variability was detected for all weights. The permanent maternal environmental variance showed greater relevance on weaning weight, and it was practically inexistent after weaning. For the maternal genetic variance, the estimate for birth weight was more significant as compared with weaning weight. The estimated heritability values for BW, W210; W365 and W550 were 0.37 ± 0.02; 0.36 ± 0.03; 031 ± 0.01 and 0.38 ± 0.02, respectively. Genetic correlations between birth weight and other weights were of low magnitude, with high values of weights at other ages.(AU)

Classificação de características produtivas fenotípicas de diferentes raças de poedeiras através da mineração de dados / Phenotypic production characteristics from different breeds of laying hens through data mining

O estudo foi realizado com o banco de dados do Programa de Melhoramento Genético de Poedeiras de Ovos Marrons do Laboratório de Avicultura (LAVIC) do Departamento de Zootecnia da Universidade Federal de Santa Maria (UFSM), onde são utilizadas aves das raças Plymouth Rock White (PRW), Plymouth Rock Barred (PRB) e Rhode Island Red (RIR). Os dados utilizados foram referentes a duas gerações das três raças durante o primeiro ciclo de produção, dos anos de 2009 e 2010. Os parâmetros avaliados foram: taxa de postura semanal, peso dos ovos e peso corporal. O estudo foi dividido em duas abordagens de análise, a primeira análise foi realizada com os dados produtivos com o objetivo de identificar pontos críticos de seleção fenotípica, relacionados à caracterização zootécnica, e a segunda abordagem consistiu na associação dos mesmos parâmetros produtivos, com os dados climáticos de Santa Maria - RS. Os dados foram analisados pela técnica de Mineração de Dados, sendo utilizada a tarefa de classificação com a construção de árvore de decisão pelo algoritmo J48. A mineração dos dados indicou a taxa de postura média na 25ª semana de idade e posteriormente o peso médio dos ovos na 33ª semana de idade como as principais variáveis relacionadas com a diferenciação das raças estudadas, (precisão de 0,833). Na segunda abordagem, as árvores de classificação obtidas apresentaram precisão entre 0,88 e 0,91, sugerindo uma forte associação entre as variáveis ambientais e o desempenho produtivo das aves. Poedeiras PRW são mais sensíveis ao calor que as RIR e PRB e apresentam, na fase de pré-pico, uma maior taxa de postura. A Mineração de Dados permite classificar a produtividade das raças de poedeiras de ovos marrons, podendo indicar as influências ambientais sobre o fenótipo das diferentes raças estudadas.

The study was conducted with the database obtained from the Breeding Program of Brown Egg Laying Hens of the Poultry Laboratory (LAVIC) of the Department of Animal Science of the Federal University of Santa Maria (UFSM), where it is used poultry breeds such as White Plymouth Rock (PRW), Barred Plymouth Rock (PRB) e Red Rhode Island (RIR). The data used referred to two generations of these three breeds during the first production cycle of 2009 and 2010. The parameters evaluated were: weekly rate of egg laying, egg weight and body weight. The research was divided into two approaches of analysis, the first being performed with the production data, aiming to identify critical points of phenotypic selections related to zootechnical characterization, and the second approach consisted in the association of the same production parameters together with the weather data of Santa Maria - RS. The data was analyzed using the Data Mining technique, using the classification task by building the decision tree with the J48 algorithm. The data mining indicated the average rate of egg laying at 25 weeks of age and the average weight of eggs at 33 weeks of age, and pointed these as the main variables related to the differentiation of breeds studied, (accuracy of 83.3%). On the second approach, the decision trees obtained showed accuracy between 88% and 91%, suggesting a strong association between the environmental variables and the production performance of the birds. The PRW breed is more sensitive to heat than the RIR and the PRB breed and they showed a higher rate of production during the pre-peak phase. The data mining allowed to classify the productivity of the brown egg laying hens, which may indicate environmental influences on the phenotype of the different breeds studied.

Classificação de características produtivas fenotípicas de diferentes raças de poedeiras através da mineração de dados

The study was conducted with the database obtained from the Breeding Program of Brown Egg Laying Hens of the Poultry Laboratory (LAVIC) of the Department of Animal Science of the Federal University of Santa Maria (UFSM), where it is used poultry breeds such as White Plymouth Rock (PRW), Barred Plymouth Rock (PRB) e Red Rhode Island (RIR). The data used referred to two generations of these three breeds during the first production cycle of 2009 and 2010. The parameters evaluated were: weekly rate of egg laying, egg weight and body weight. The research was divided into two approaches of analysis, the first being performed with the production data, aiming to identify critical points of phenotypic selections related to zootechnical characterization, and the second approach consisted in the association of the same production parameters together with the weather data of Santa Maria - RS. The data was analyzed using the Data Mining technique, using the classification task by building the decision tree with the J48 algorithm. The data mining indicated the average rate of egg laying at 25 weeks of age and the average weight of eggs at 33 weeks of age, and pointed these as the main variables related to the differentiation of breeds studied, (accuracy of 83.3%). On the second approach, the decision trees obtained showed accuracy between 88% and 91%, suggesting a strong association between the environmental variables and the production performance of the birds. The PRW breed is more sensitive to heat than the RIR and the PRB breed and they showed a higher rate of production during the pre-peak phase. The data mining allowed to classify the productivity of the brown egg laying hens, which may indicate environmental influences on the phenotype of the different breeds studied.

O estudo foi realizado com o banco de dados do Programa de Melhoramento Genético de Poedeiras de Ovos Marrons do Laboratório de Avicultura (LAVIC) do Departamento de Zootecnia da Universidade Federal de Santa Maria (UFSM), onde são utilizadas aves das raças Plymouth Rock White (PRW), Plymouth Rock Barred (PRB) e Rhode Island Red (RIR). Os dados utilizados foram referentes a duas gerações das três raças durante o primeiro ciclo de produção, dos anos de 2009 e 2010. Os parâmetros avaliados foram: taxa de postura semanal, peso dos ovos e peso corporal. O estudo foi dividido em duas abordagens de análise, a primeira análise foi realizada com os dados produtivos com o objetivo de identificar pontos críticos de seleção fenotípica, relacionados à caracterização zootécnica, e a segunda abordagem consistiu na associação dos mesmos parâmetros produtivos, com os dados climáticos de Santa Maria - RS. Os dados foram analisados pela técnica de Mineração de Dados, sendo utilizada a tarefa de classificação com a construção de árvore de decisão pelo algoritmo J48. A mineração dos dados indicou a taxa de postura média na 25ª semana de idade e posteriormente o peso médio dos ovos na 33ª semana de idade como as principais variáveis relacionadas com a diferenciação das raças estudadas, (precisão de 0,833). Na segunda abordagem, as árvores de classificação obtidas apresentaram precisão entre 0,88 e 0,91, sugerindo uma forte associação entre as variáveis ambientais e o desempenho produtivo das aves. Poedeiras PRW são mais sensíveis ao calor que as RIR e PRB e apresentam, na fase de pré-pico, uma maior taxa de postura. A Mineração de Dados permite classificar a produtividade das raças de poedeiras de ovos marrons, podendo indicar as influências ambientais sobre o fenótipo das diferentes raças estudadas.

Classificação de características produtivas fenotípicas de diferentes raças de poedeiras através da mineração de dados

The study was conducted with the database obtained from the Breeding Program of Brown Egg Laying Hens of the Poultry Laboratory (LAVIC) of the Department of Animal Science of the Federal University of Santa Maria (UFSM), where it is used poultry breeds such as White Plymouth Rock (PRW), Barred Plymouth Rock (PRB) e Red Rhode Island (RIR). The data used referred to two generations of these three breeds during the first production cycle of 2009 and 2010. The parameters evaluated were: weekly rate of egg laying, egg weight and body weight. The research was divided into two approaches of analysis, the first being performed with the production data, aiming to identify critical points of phenotypic selections related to zootechnical characterization, and the second approach consisted in the association of the same production parameters together with the weather data of Santa Maria - RS. The data was analyzed using the Data Mining technique, using the classification task by building the decision tree with the J48 algorithm. The data mining indicated the average rate of egg laying at 25 weeks of age and the average weight of eggs at 33 weeks of age, and pointed these as the main variables related to the differentiation of breeds studied, (accuracy of 83.3%). On the second approach, the decision trees obtained showed accuracy between 88% and 91%, suggesting a strong association between the environmental variables and the production performance of the birds. The PRW breed is more sensitive to heat than the RIR and the PRB breed and they showed a higher rate of production during the pre-peak phase. The data mining allowed to classify the productivity of the brown egg laying hens, which may indicate environmental influences on the phenotype of the different breeds studied.

O estudo foi realizado com o banco de dados do Programa de Melhoramento Genético de Poedeiras de Ovos Marrons do Laboratório de Avicultura (LAVIC) do Departamento de Zootecnia da Universidade Federal de Santa Maria (UFSM), onde são utilizadas aves das raças Plymouth Rock White (PRW), Plymouth Rock Barred (PRB) e Rhode Island Red (RIR). Os dados utilizados foram referentes a duas gerações das três raças durante o primeiro ciclo de produção, dos anos de 2009 e 2010. Os parâmetros avaliados foram: taxa de postura semanal, peso dos ovos e peso corporal. O estudo foi dividido em duas abordagens de análise, a primeira análise foi realizada com os dados produtivos com o objetivo de identificar pontos críticos de seleção fenotípica, relacionados à caracterização zootécnica, e a segunda abordagem consistiu na associação dos mesmos parâmetros produtivos, com os dados climáticos de Santa Maria - RS. Os dados foram analisados pela técnica de Mineração de Dados, sendo utilizada a tarefa de classificação com a construção de árvore de decisão pelo algoritmo J48. A mineração dos dados indicou a taxa de postura média na 25ª semana de idade e posteriormente o peso médio dos ovos na 33ª semana de idade como as principais variáveis relacionadas com a diferenciação das raças estudadas, (precisão de 0,833). Na segunda abordagem, as árvores de classificação obtidas apresentaram precisão entre 0,88 e 0,91, sugerindo uma forte associação entre as variáveis ambientais e o desempenho produtivo das aves. Poedeiras PRW são mais sensíveis ao calor que as RIR e PRB e apresentam, na fase de pré-pico, uma maior taxa de postura. A Mineração de Dados permite classificar a produtividade das raças de poedeiras de ovos marrons, podendo indicar as influências ambientais sobre o fenótipo das diferentes raças estudadas.

Classificação de características produtivas fenotípicas de diferentes raças de poedeiras através da mineração de dados

The study was conducted with the database obtained from the Breeding Program of Brown Egg Laying Hens of the Poultry Laboratory (LAVIC) of the Department of Animal Science of the Federal University of Santa Maria (UFSM), where it is used poultry breeds such as White Plymouth Rock (PRW), Barred Plymouth Rock (PRB) e Red Rhode Island (RIR). The data used referred to two generations of these three breeds during the first production cycle of 2009 and 2010. The parameters evaluated were: weekly rate of egg laying, egg weight and body weight. The research was divided into two approaches of analysis, the first being performed with the production data, aiming to identify critical points of phenotypic selections related to zootechnical characterization, and the second approach consisted in the association of the same production parameters together with the weather data of Santa Maria - RS. The data was analyzed using the Data Mining technique, using the classification task by building the decision tree with the J48 algorithm. The data mining indicated the average rate of egg laying at 25 weeks of age and the average weight of eggs at 33 weeks of age, and pointed these as the main variables related to the differentiation of breeds studied, (accuracy of 83.3%). On the second approach, the decision trees obtained showed accuracy between 88% and 91%, suggesting a strong association between the environmental variables and the production performance of the birds. The PRW breed is more sensitive to heat than the RIR and the PRB breed and they showed a higher rate of production during the pre-peak phase. The data mining allowed to classify the productivity of the brown egg laying hens, which may indicate environmental influences on the phenotype of the different breeds studied.

O estudo foi realizado com o banco de dados do Programa de Melhoramento Genético de Poedeiras de Ovos Marrons do Laboratório de Avicultura (LAVIC) do Departamento de Zootecnia da Universidade Federal de Santa Maria (UFSM), onde são utilizadas aves das raças Plymouth Rock White (PRW), Plymouth Rock Barred (PRB) e Rhode Island Red (RIR). Os dados utilizados foram referentes a duas gerações das três raças durante o primeiro ciclo de produção, dos anos de 2009 e 2010. Os parâmetros avaliados foram: taxa de postura semanal, peso dos ovos e peso corporal. O estudo foi dividido em duas abordagens de análise, a primeira análise foi realizada com os dados produtivos com o objetivo de identificar pontos críticos de seleção fenotípica, relacionados à caracterização zootécnica, e a segunda abordagem consistiu na associação dos mesmos parâmetros produtivos, com os dados climáticos de Santa Maria - RS. Os dados foram analisados pela técnica de Mineração de Dados, sendo utilizada a tarefa de classificação com a construção de árvore de decisão pelo algoritmo J48. A mineração dos dados indicou a taxa de postura média na 25ª semana de idade e posteriormente o peso médio dos ovos na 33ª semana de idade como as principais variáveis relacionadas com a diferenciação das raças estudadas, (precisão de 0,833). Na segunda abordagem, as árvores de classificação obtidas apresentaram precisão entre 0,88 e 0,91, sugerindo uma forte associação entre as variáveis ambientais e o desempenho produtivo das aves. Poedeiras PRW são mais sensíveis ao calor que as RIR e PRB e apresentam, na fase de pré-pico, uma maior taxa de postura. A Mineração de Dados permite classificar a produtividade das raças de poedeiras de ovos marrons, podendo indicar as influências ambientais sobre o fenótipo das diferentes raças estudadas.

Marcadores moleculares aplicados no melhoramento genético de bovinos / Marcadores moleculares aplicados al mejoramiento genético de bovinos / Molecular markers applied to cattle breeding

O recente desenvolvimento da biologia molecular tem aberto a possibilidade de identificar genes importantes e utilizar a variação genômica no melhoramento genético. Os marcadores moleculares baseados em DNA atuam como ferramentas versáteis e podem ser utilizados em diferentes estudos. Desde o seu desenvolvimento, os marcadores moleculares estão sendo modificados constantemente para melhorar sua empregabilidade e trazer a possibilidade de automação do processo em análises genômicas. A descoberta da reação em cadeia da polimerase (PCR) foi um marco nesse esforço e diversos marcadores surgiram a partir do desenvolvimento da PCR. Nessa revisão, diferentes marcadores moleculares baseados em DNA desenvolvidos durante as últimas décadas foram abordados, no qual auxiliará na compreenssão das diferentes classes de marcadores genéticos existentes e suas aplicações na seleção de genótipos superiores nos programas de melhoramento genético de bovinos.

The recent development in molecular biology has opened the possibility of identifying major genes and using genomic variation in breeding programs. DNA-based molecular markers have acted as versatile tools and can be used in different studies. Since their development, molecular markers are constantly being modified to improve their employment and bring the possibility of process automation in genomic analysis. The discovery of polymerase chain reaction (PCR) was a milestone in this effort and several markers have emerged from this technique. In this review, different DNA-based molecular markers developed during the last decades have been approached, which shall aid in the understanding of the different classes of genetic markers available and their application in the selection of superior genotypes in breeding cattle.

El reciente desarrollo de la biología molecular ha abierto la posibilidad de identificar genes importantes y utilizar la variación genómica en el mejoramiento genético. Los marcadores moleculares basados en ADN actúan como herramientas versátiles y pueden ser utilizados en diferentes estudios. Desde su desarrollo, los marcadores moleculares están siendo modificados constantemente para mejorar su empleabilidad y traer la posibilidad de automatización del proceso en análisis genómicas. El descubrimiento de la reacción en cadena de polimerasa (PCR) fue un hito en ese esfuerzo y diversos marcadores han surgido a partir del desarrollo de la PCR. En esa revisión, diferentes marcadores moleculares basados en ADN desarrollados durante las últimas décadas han sido abordados, lo que ayudará en la comprensión de las distintas clases de marcadores genéticos existentes y sus aplicaciones en la selección de genotipos superiores en los programas de mejoramiento genético de bovinos.

Spatialization of climate, physical and socioeconomic factors that affect the dairy goat production in Brazil and their impact on animal breeding decisions / Espacialização de fatores climáticos, físicos e socioeconômicos que afetam a produção de caprinos leiteiros no Brasil e seu impacto sobre as decisões em melhoramento animal

Brazil has high climate, soil and environmental diversity, as well as distinct socioeconomic and political realities, what results in differences among the political administrative regions of the country. The objective of this study was to determine spatial distribution of the physical, climatic and socioeconomic aspects that best characterize the production of dairy goats in Brazil. Production indices of milk per goat, goat production, milk production, as well as temperature range, mean temperature, precipitation, normalized difference vegetation index, relative humidity, altitude, agricultural farms; farms with native pasture, farms with good quality pasture, farms with water resources, farms that receive technical guidance, family farming properties, non-familiar farms and the human development index were evaluated. The multivariate analyses were carried out to spatialize climatic, physical and socioeconomic variables and so differenciate the Brazilian States and Regions. The highest yields of milk and goat production were observed in the Northeast. The Southeast Region had the second highest production of milk, followed by the South, Midwest and North. Multivariate analysis revealed distinctions between clusters of political-administrative regions of Brazil. The climatic variables were most important to discriminate between regions of Brazil. Therefore, it is necessary to implement animal breeding programs to meet the needs of each region.

O Brasil possui diversidade edafoclimática e realidades socioeconômicas e políticas distintas. Isto contribui para diferenciar as regiões político administrativas do país. Objetivou-se espacializar os fatores físicos, climáticos e socioeconômicos que melhor discriminam a produção de caprinos leiteiros no Brasil. Foram analisados índice de produção de leite por cabra; índice de produção de caprinos; índice de produção de leite, amplitude da temperatura; temperatura média; precipitação; índice normalizado de diferença vegetativa; umidade relativa do ar; altitude; estabelecimentos agropecuários; estabelecimentos com pastagem nativa; estabelecimentos com pastagens de boa qualidade; estabelecimentos com recursos hídricos; estabelecimentos que recebem orientação técnica; estabelecimentos de agricultura familiar; estabelecimentos de agricultura não familiar e índice de desenvolvimento humano. Foram realizadas análises multivariadas para espacializar as variáveis climáticas, físicas e socioeconômicas e, assim, discriminar os Estados e Regiões brasileiras. As maiores produções de caprinos e de leite foram observadas na região Nordeste. A região Sudeste apresentou segunda maior produção de leite, seguido pelo Sul, Centro-Oeste e Norte. As médias para produtividade mostraram que as regiões Centro-Oeste e Sudeste apresentaram animais mais especializados a produção de leite. As análises multivariadas evidenciaram distinções entre clusters das regiões político-administrativas do Brasil. As variáveis climáticas foram as mais importantes para discriminar entre as regiões brasileiras. A heterogeneidade dos componentes climáticos, físicos e socioeconômicos evidenciou peculiaridades em cada região. Portanto, é preciso implementar programas de melhoramento genético animal que atendam as necessidades de cada região.