Prediction of promiscuous multiepitope-based peptide vaccine against RdRp of rotavirus using immunoinformatics studies

ABSTRACT Rotavirus, a dsRNA virus in the Reoviridae family, shows a segmented genome. The VP1 gene encodes the RNA-dependent RNA polymerase (RdRp). This study aims to develop a multiepitope-based vaccine targeting RdRp using immunoinformatic approaches. In this study, 100 available nucleotide sequences of VP1-Rotavirus belonging to different strains across the world were retrieved from NCBI database. The selected sequences were aligned, and a global consensus sequence was developed by using CLC work bench. The study involved immunoinformatic approaches and molecular docking studies to reveal the promiscuous epitopes that can be eventually used as active vaccine candidates for Rotavirus. In total, 27 highly immunogenic, antigenic, and non-allergenic T-cell and B-cell epitopes were predicted for the Multiepitope vaccine (MEV) against rotavirus. It was also observed that MEV can prove to be effective worldwide due to its high population coverage, demonstrating the consistency of this vaccine. Moreover, there is a high docking interaction and immunological response with a binding score of −50.2 kcal/mol, suggesting the vaccine's efficacy. Toll-like receptors (TLRs) also suggest that the vaccine is physiologically and immunologically effective. Collectively, our data point to an effective MEV against rotavirus that can effectively reduce viral infections and improve the health status worldwide.

Avaliação de protocolos de irrigação ultrassônica passiva na remoção de detritos do canal radicular / Evaluation of passive ultrasonic irrigation protocols in the removal of root canal debris

Introdução: O objetivo deste estudo foi avaliar a eficácia de diferentes protocolos de Irrigação Ultrassônica Passiva (PUI) por meio de microscopia eletrônica de varredura (MEV). Métodos: Seis cavidades foram confeccionadas ao longo da seção vestibular de 20 canais radiculares de pré-molares inferiores humanos e preenchidas com detritos. 10 grupos foram criados de acordo com o protocolo final de irrigação: Grupo 1- controle positivo (sem detritos); Grupo 2- controle negativo (com detritos); Grupo 3 - irrigação convencional com hipoclorito de sódio a 2,5% (NaOCl); Grupo 4 - irrigação convencional com 17% de ácido etilenodiaminotetracético (EDTA) seguido de NaOCl; Grupo 5- PUI com 3 ciclos de 20 segundos (NaOCl-NaOCl-NaOCl); Grupo 6- PUI com 3 ciclos de 20 segundos (NaOCl-EDTA-NaOCl); Grupo 7- PUI com um ciclo de 60 segundos (NaOCl); Grupo 8 - PUI com ciclo de 180 segundos (NaOCl); Grupo 9 - PUI com 2 ciclos de 60 segundos (EDTA-NaOCl); Grupo 10 - PUI com 2 ciclos de 60 segundos (NaOCl-EDTA). Os espécimes foram observados em MEV para a análise da remoção dos detritos (scores 1 a 5) e exposição dos túbulos dentinários (score 1 ou 2) dentro das cavidades. O teste de Kruskal-Wallis foi realizado para a análise estatística, com significância de 5%. Resultados: Os grupos PUI apresentaram melhores resultados na limpeza de detritos do que os grupos de irrigação convencionais nas cavidades 1, 2 e 3. As cavidades 4, 5 e 6 foram limpas em todos os grupos experimentais. Em relação à exposição dos túbulos dentinários, os grupos PUI foram capazes de alcançar um resultado melhor do que os grupos de irrigação convencional. Conclusões: A PUI mostrou-se mais eficaz na remoção de detritos do que a irrigação convencional nas cavidades localizadas na região apical do canal radicular, e os grupos PUI promoveram maior exposição dos túbulos dentinários independentemente do uso de EDTA como agente quelante para tecidos inorgânicos(AU)

Introduction: The aim of this study was to evaluate the effectiveness of different Passive Ultrasonic Irrigation (PUI) protocols by means of scanning electron microscopy. Methods: Six hemispherical cavities were made along the buccal section of 20 root canals of human lower premolars and filled with debris. 10 groups was created according to the final irrigation protocol: Group 1- positive control (no debris); Group 2- negative control (with debris); Group 3- conventional irrigation with 2.5% sodium hypochlorite (NaOCl); Group 4- conventional irrigation with 17% ethylenediamine tetracetic acid (EDTA) followed by NaOCl; Group 5- PUI with 3 cycles of 20 seconds (NaOCl-NaOCl-NaOCl); Group 6- PUI with 3 cycles of 20 seconds (NaOCl-EDTANaOCl); Group 7- PUI with a 60 seconds cycle (NaOCl); Group 8- PUI with a 180 seconds cycle (NaOCl); Group 9- PUI with 2 cycles of 60 seconds (EDTA-NaOCl); Group 10- PUI with 2 cycles of 60 seconds (NaOCl-EDTA). Scores were given for the analysis of debris removal in SEM, as well as for the exposure of dentinal tubules within the cavities. Kruskal-Wallis test was performed for statistical analysis. Results: The PUI groups presented better results in cleaning of debris than the conventional irrigation groups in cavities 1, 2 and 3. Cavities 4, 5 and 6 were well cleansed in all experimental groups. Regarding the exposure of the dentinal tubules, the PUI groups were able to achieve a better result than the conventional irrigation groups. Conclusions: Passive ultrasonic irrigation proved to be more effective in the removal of debris than conventional irrigation in the cavities located in the apical region of the root canal, and the PUI groups promoted greater exposure of the dentinal tubules independently of the use of EDTA as a chelating agent for inorganic tissues(AU)

"In vitro" evaluation of the bacterivore potential of three Cladoceran species occurring in tropical and subtropical regions / Avaliação "in vitro" do potencial baterívoro de três espécies de Cladocera de ocorrência tropical e subtropical

Abstract Cladocerans occupy an important position among the bacterial consumers in freshwater food webs, being relatively non-selective filter feeders that can exert a strong impact on microbial populations. We evaluated the bacterivory potential of three cladocerans species of subtropical and tropical occurrence (Ceriodaphnia silvestrii, Daphnia gessneri and Ceriodaphnia cornuta) at different life stages, by scanning electron microscopy (SEM) and by the quantification of their bacterial consumption rates using fluorescently labeled bacteria (FLB). All species showed filter mesh sizes sufficiently narrow to retain bacteria. The largest distance between setules was found in primiparous C. cornuta, and the smallest in neonate D. gessneri. The lowest ingestion (IR) and removal (RR) rates were observed in primiparous C. silvestrii and the highest values were observed in adults of D. gessneri. We conclude that bacteria may be considered an important food supplement, particularly for neonates who presented smaller intersetular distances and higher filtration rates than the other life stages.

Resumo Dentre os diversos consumidores de bactérias nas teias alimentares de ambientes dulcícolas, os cladóceros ocupam uma posição relevante, sendo filtradores relativamente não seletivos que podem exercer forte impacto na redução populacional microbiana. Avaliamos o potencial bacterívoro de três espécies de cladóceros de ocorrência tropical e subtropical (Ceriodaphnia silvestrii, Ceriodaphnia cornuta e Daphnia gessneri) em diferentes fases de vida, através do estudo microscópico de suas estruturas filtradoras e da quantificação de suas taxas de ingestão em experimentos de bacterivoria utilizando-se bactérias marcadas fluorescentemente (FLB). As espécies estudadas mostraram ter uma rede de malhas filtradoras suficientemente estreitas para reter bactérias. A maior distância entre as sétulas foi encontrada em primíparas de C. cornuta, e a menor em neonatos de D. gessneri. As menores Taxas de Ingestão (TI) e Remoção (TR) foram observadas em primíparas de C. silvestrii e as maiores em adultas de D. gessneri. Concluímos que as bactérias podem ser consideradas um importante suplemento alimentar, principalmente para neonatos, que apresentaram pequenas distâncias intersetulares e altas taxas de ingestão comparadas aos outros estágios de vida.

Análise qualitativa da estrutura química de quatro marcas comerciais de implantes dentários brasileiros: Estudo-piloto / Qualitative analysis of the chemical composition of four Brazilian dental implant manufacturers: a pilot study

Objetivo: avaliar qualitativamente a estrutura química de quatro marcas comerciais de implantes dentários brasileiros. Material e métodos: 12 amostras de diferentes lotes foram fixadas em resina acrílica usando um processo padronizado, e cortes sagitais foram realizados. As amostras foram analisadas em dois microscópios eletrônicos de varredura (FEI Quanta 400, TM 3030 Plus Tablestop Microscope Hitachi). Resultados: a maioria apresentou na sua porção interna (8 das 12) diferentes níveis de níquel, variando de uma marca para outra. Entretanto, este metal não foi detectado na superfície externa. A presença de níquel talvez seja atribuída às matérias-primas e metodologia de produção, desde a sua extração até a comercialização. Conclusão: dentro dos limites desta investigação, há necessidade de mais estudos qualitativos, em todo o processo de fabricação de todos os implantes comercializados, assim como estudos quantitativos com relação ao elemento níquel nos implantes dentários.

Objective: to perform a qualitative evaluation of the chemical structure of four commercial dental implant Brazilian brands. Material and methods: 12 samples of different batches were embedded in acrylic resin according to a standardized process, and sagittal sections were made accordingly. All the samples were analyzed under two SEM devices (FEI Quanta 400, TM 3030 Plus Tablestop Microscope Hitachi). Results: most samples (8 of 12) revealed at their internal portions different levels of Nickel, from one manufacturer to the other. However, this metal was not detected at the external implant portion. The presence of Nickel maybe can be attributed to the raw materials and production process, from extraction to commercialization. Conclusion: within the limits of this investigation, more qualitative studies are necessary throughout the fabrication process of all investigated implants in the market, as well as quantitative evaluations regarding the presence of Nickel on dental implants.

Essential oils in the control of dry bubble disease in white button mushroom / Óleos essenciais no controle da doença bolha seca em champignon

ABSTRACT: Lecanicillium fungicola, which causes Dry bubble disease, induces infections and inflicts major losses in champignon production. The control can be managed through measures of hygiene and use of fungicides; however, in Brazil there are no registered products. This study aimed to estimate the influence of various essential oils extracted from Melissa officinalis, Thymus vulgaris, Origanum vulgare, Eucalyptus globulus, Cinnamomum zeylanicum and Syzygium aromaticum on the in vitro development and their uses. Therefore, analysis was performed of the L. fungicola isolates in vitro and the best oils were tested in vivo. Besides, the Agaricus bisporus - L. fungicola interaction was confirmed by scanning electron microscopy (SEM). Cinnamon and clove oils in concentrations of 0.4% and thyme oil of 0.8% were identified as good growth inhibitors of the pathogenic mycelium. Effective inhibition of the conidial germination was seen in all concentrations by cinnamon oil, and by clove and thyme oils only at 0.4% and 0.8%, respectively. When the essential oils were applied post-infestation in the in vivo experiments the incidence of the disease in the mushrooms was much lower. From the SEM it was clear that 19 hours after the inoculation of A. bisporus with L. fungicola, the spores had already completely germinated, revealing the presence of the infection. Therefore, the findings of this study indicated that the oil extracts of cinnamon, clove and thyme are potential and efficient alternatives in the control of dry bubble disease.

RESUMO: A doença bolha seca, causada pelo fungo Lecanicillium fungicola, provoca infecções graves que resultam em perdas significativas na produção de champignon. O controle se dá através de práticas sanitárias e do uso de fungicidas, porém no Brasil não há produtos registrados. Desta forma, este estudo objetivou avaliar o efeito de óleos essenciais extraídos de Melissa officinalis, Thymus vulgaris, Origanum vulgare, Eucalyptus globulus, Cinnamomum zeylanicum e Syzygium aromaticum sobre o desenvolvimento in vitro de isolados de L. fungicola e aplicação dos melhores óleos em teste in vivo. Além disso, a interação entre Agaricus bisporus e L. fungicola foi verificada por meio de microscopia eletrônica de varredura (MEV). Os óleos de canela e cravo a partir da concentração 0.4% e tomilho a 0.8% inibiram o crescimento micelial do patógeno. Já a germinação de conídios foi inibida pelo óleo de canela em todas as concentrações, bem como pelos óleos de cravo e tomilho, a 0.4% e 0.8%, respectivamente. No experimento in vivo, a aplicação dos óleos essenciais pós-infestação apresentou menor incidência da doença nos cogumelos produzidos. A MEV revelou que após 19 horas da inoculação de L. fungicola em A. bisporus, os esporos já estavam completamente germinados, o que indicava a ocorrência da infecção. Assim, os resultados deste trabalho sugerem que os óleos de canela, cravo e tomilho são alternativas potenciais para o controle da doença bolha seca.

Concentrations of PM2.5-10 and PM2.5 and metallic elements around the Schmidt Stream area, in the Sinos River Basin, southern Brazil / Concentrações de MP2,5-10 e MP2,5 e elementos metálicos junto à área do Arroio Schmidt, na bacia do Rio dos Sinos, sul do Brasil

This research aimed to evaluate the air quality, by determining the concentrations of PM2.5-10, PM2.5 and the metallic elements Al, Ba, Cd, Cr, Cu, Fe, Mn, Ni, Pb, Zn and Hg in the leaf part of ryegrass (Lolium multiflorum) in an area close to Schmidt Stream, at the lower section of Sinos River Basin (SRB), in a research campaign of six months, from October 2013 to March 2014. The particles collected in the PM sampling were analyzed by Scanning Electron Microscopy (SEM) combined with Energy Dispersive X-ray Spectrometry (EDS), in order to study their morphology and chemical composition. The mean concentration of PM2.5-10 was 9.1 µg m–3, with a range of 2.2 µg m–3 to 15.4 µg m–3 and the mean concentration of PM2.5was 4.7 µg m–3, with a range of 1.9 µg m–3 to 8.2 µg m–3. Concentrations of metallic elements, especially Pb, Cr and Zn, were classified as Class 4 (very high pollution levels), according to the classification proposed by Klumpp et al. (2004). Chemical and morphological analysis of PM revealed the presence of particles of biological origin, soot (Cr, Fe, Ni, Zn, Cd, Hg and Pb), salts (KCl) and soil resuspension (Al and Si). The integrated study methodology, employing environmental variables, such as PM and ryegrass, can be of help in the preparation of wide-ranging environmental diagnoses, in addition providing information needed to develop precautionary measures designed to minimize the effects of atmospheric pollution that takes into consideration the environment’s supportive capacity and environmental quality.

Resumo O objetivo desta pesquisa foi avaliar a qualidade do ar, por meio da determinação das concentrações do MP2,5-10, MP2,5 e dos elementos metálicos Al, Ba, Cd, Cr, Cu, Fe, Mn, Ni, Pb, Zn e Hg na folha do azevém (Lolium multiflorum) em uma área próxima ao Arroio Schmidt, no trecho inferior da Bacia do Rio dos Sinos (BRS), em uma campanha de seis meses de pesquisa, de outubro de 2013 a março de 2014. As partículas coletadas na amostragem do MP foram analisadas por Microscopia Eletrônica de Varredura (MEV), combinada com Espectrometria de Energia Dispersiva de Raios X (EDS), a fim de estudar sua morfologia e composição química. As concentrações médias de MP2,5-10 e MP2,5 foram de 9,1 µg m–3 e 4,7 µg m–3, respectivamente. As concentrações médias dos elementos metálicos Pb, Cr e Zn na parte foliar do azevém foram de 13,58 mg kg–1, 5,26 mg kg–1 e 88,80 mg kg–1, respectivamente, caracterizando a área como Classe 4 (nível muito elevado de poluição), conforme classificação proposta por Klumpp et al. (2004). A caracterização química e morfológica das partículas coletadas revelou a presença de fuligem (Cr, Fe, Ni, Zn, Cd, Hg e Pb), materiais biológicos, cristais salinos (KCl) e partículas ressuspensas de poeira do solo (Al e Si). Estudos integrados empregando variáveis ambientais como o MP e o biomonitoramento com azevém podem auxiliar na elaboração de diagnósticos ambientais robustos, além de fornecer informações para o desenvolvimento de medidas de precaução que considerem a capacidade de suporte do meio ambiente e que visem à minimização dos efeitos prejudiciais da poluição atmosférica.

Concentrations of PM2.5-10 and PM2.5 and metallic elements around the Schmidt Stream area, in the Sinos River Basin, southern Brazil

This research aimed to evaluate the air quality, by determining the concentrations of PM2.5-10, PM2.5 and the metallic elements Al, Ba, Cd, Cr, Cu, Fe, Mn, Ni, Pb, Zn and Hg in the leaf part of ryegrass (Lolium multiflorum) in an area close to Schmidt Stream, at the lower section of Sinos River Basin (SRB), in a research campaign of six months, from October 2013 to March 2014. The particles collected in the PM sampling were analyzed by Scanning Electron Microscopy (SEM) combined with Energy Dispersive X-ray Spectrometry (EDS), in order to study their morphology and chemical composition. The mean concentration of PM2.5-10 was 9.1 µg m3, with a range of 2.2 µg m3 to 15.4 µg m3 and the mean concentration of PM2.5was 4.7 µg m3, with a range of 1.9 µg m3 to 8.2 µg m3. Concentrations of metallic elements, especially Pb, Cr and Zn, were classified as Class 4 (very high pollution levels), according to the classification proposed by Klumpp et al. (2004). Chemical and morphological analysis of PM revealed the presence of particles of biological origin, soot (Cr, Fe, Ni, Zn, Cd, Hg and Pb), salts (KCl) and soil resuspension (Al and Si). The integrated study methodology, employing environmental variables, such as PM and ryegrass, can be of help in the preparation of wide-ranging environmental diagnoses, in addition providing information needed to develop precautionary measures designed to minimize the effects of atmospheric pollution that takes into consideration the environments supportive capacity and environmental quality.

Resumo O objetivo desta pesquisa foi avaliar a qualidade do ar, por meio da determinação das concentrações do MP2,5-10, MP2,5 e dos elementos metálicos Al, Ba, Cd, Cr, Cu, Fe, Mn, Ni, Pb, Zn e Hg na folha do azevém (Lolium multiflorum) em uma área próxima ao Arroio Schmidt, no trecho inferior da Bacia do Rio dos Sinos (BRS), em uma campanha de seis meses de pesquisa, de outubro de 2013 a março de 2014. As partículas coletadas na amostragem do MP foram analisadas por Microscopia Eletrônica de Varredura (MEV), combinada com Espectrometria de Energia Dispersiva de Raios X (EDS), a fim de estudar sua morfologia e composição química. As concentrações médias de MP2,5-10 e MP2,5 foram de 9,1 µg m3 e 4,7 µg m3, respectivamente. As concentrações médias dos elementos metálicos Pb, Cr e Zn na parte foliar do azevém foram de 13,58 mg kg1, 5,26 mg kg1 e 88,80 mg kg1, respectivamente, caracterizando a área como Classe 4 (nível muito elevado de poluição), conforme classificação proposta por Klumpp et al. (2004). A caracterização química e morfológica das partículas coletadas revelou a presença de fuligem (Cr, Fe, Ni, Zn, Cd, Hg e Pb), materiais biológicos, cristais salinos (KCl) e partículas ressuspensas de poeira do solo (Al e Si). Estudos integrados empregando variáveis ambientais como o MP e o biomonitoramento com azevém podem auxiliar na elaboração de diagnósticos ambientais robustos, além de fornecer informações para o desenvolvimento de medidas de precaução que considerem a capacidade de suporte do meio ambiente e que visem à minimização dos efeitos prejudiciais da poluição atmosférica.

Desadaptação entre implantes e pilares protéticos de zircônia, titânio e níquel-crômio: estudo por microscopia eletrônica de varredura / Marginal vertical misft at zirconia, titanium, and Ni-Cr prosthetic implant/abutment interfaces: a scanning electron microscopy study

Objetivo: avaliar, por meio da microscopia eletrônica de varredura, a desadaptação vertical entre análogos de implantes HE (hexágono externo) e diversos tipos de pilares protéticos. Material e métodos: quatro tipos de pilares foram usados: a) pilares pré-usinados de titânio; b) pilares personalizados de zircônia usinados pelo sistema CAD/CAM; c) pilares calcináveis com cinta metálica; e d) pilares calcináveis sem cinta metálica. Sete modelos de estudo foram confeccionados, cada um com quatro análogos 4,1 mm de diâmetro, conectados a um dos tipos de pilar mencionados anteriormente (28 corpos-de-prova). Os pilares de zircônia foram instalados com torque de 20 Ncm, e os metálicos com torque de 30 Ncm, conforme recomendação do fabricante. As imagens das interfaces análogos/pilares foram obtidas em MEV para geração de 144 medições das desadaptações mais 100 fotomicrografias dos corpos-de-prova. Resultados: as médias de desadaptação em micrômetros foram: a) 11,19 ± 5,54; b)2,62 ± 5,12; c) 11,31 ± 4,62; d) 18,04 ± 9,93. O teste Kruskal-Wallis mostrou diferença significativa entre os grupos analisados (p=0,005). O teste Student Newman-Keuls mostrou que pilares zircônia CAD/CAM apresentaram adaptação significativamente superior em relação aos demais tipos de pilares. Não houve diferença significativa quando foram utilizados os pilares calcináveis (com ou sem cinta metálica) ou os pilares pré-usinados em titânio. Conclusão: as imagens mostraram que existem diferenças significativas entre os pilares analisados. Apesar dos pilares zircônia CAD/CAM mostrarem os melhores resultados, excessos horizontais na base destes pilares foram detectados em relação à plataforma do análogo.

Objective: to perform a SEM evaluation of the vertical margin misfit at the implant/abutment interface of several prosthetic modalities. Material and methods: 4 abutment types were used: a) prefabricated titanium; b) CAD/CAM customized abutments; c) castable abutments with prefabricated metal collar, and d) castable abutments with no metallic collars. Seven models were fabricated, each one with 4.1 mm HE implant analogs (28 samples). The zirconia abutments were fastened with 20 Ncm torque and the metallic abutments with a 30 Ncm according to the manufacturer recommendations. The SEM images at the implant/abutment interfaces provided 144 measurements of margin misfit based on 100 electromicrographs. Results: the mean misfit values were (in micrometers): a) 11.19 ± 5.54; b) 2.62 ± 5.12; c) 11.31 ± 4.62; d) 18.04 ± 9.93. The Kruskal-Wallis test demonstrated a signifi cant difference among groups (p=0.005). The Student-Newman-Keuls test showed that the zirconia abutments were superior when compared among groups. No differences were seen for castable abutments (with/without metal collar) or for prefabricated titanium abutments. Conclusion: the images demonstrated significant differences among the analyzed abutment types. Although the zirconia CAD/CAM abutments had provided the best results, horizontal overhangs were also detected in relation to the analog platform.

Rosetas e concrescências cristalinas silicificadas em Piper (Piperaceae): registros inéditos de macropadrões / Silicified crystal concretions and rosettes in Piper (Piperaceae): unpublished reports on their macropatterns

Piper L. (Piperaceae) is monophyletic, with species of difficult taxonomic distinction, and thus tools that facilitate interspecific identification are needed. The aims of this study were to describe the macropatterns and characterize in situ the chemical composition of leaf and stem crystals of Piper arboreum Aubl. var. arboreum, P. callosum Ruiz & Pav. and P. tuberculatum Jacq., in order to evaluate the use of the crystals on interspecific distinction. Samples were submitted to analyses under light and scanning electron microscopies, energy-dispersive x-ray spectroscopic microanalyses, and histochemical tests. We observed cuneiform, tabular, cubic, and bipiramidal prismatic crystals; raphides; styloids; blocky crystal druses; styloid crystal rosettes; and crystal concretions. We described 15 crystal macropatterns, which were distributed along three categories. The crystals were chemically classified as: pure calcium oxalate; and mixtures of oxalates and sulfates, and of oxalates, sulfates and silica. Crystal rosettes, silicified crystal concretions, and 14 out of the 15 macropatterns described are unpublished reports on biomineral inclusions in Piper and Piperaceae. The stem and leaf crystal macropatterns observed are constitutive and useful for interspecific separation of the studied species. Moreover, the crystals present relevant functions for the autecology of the analyzed taxa from Piper.

Piper L. (Piperaceae) é monofilético, com espécies de difícil distinção taxonômica, sendo necessários ferramentas que auxiliem a identificação interespecífica. Os objetivos do trabalho foram descrever os macropadrões e caracterizar in situ a composição química dos cristais caulinares e foliares de Piper arboreum Aubl. var. arboreum, P. callosum Ruiz & Pav. e P. tuberculatum Jacq., visando avaliar o uso dos cristais para a separação interespecífica. Para tanto, amostras foram submetidas à análise em microscopias de luz e eletrônica de varredura, microanálises espectroscópicas de raios-X por dispersão de energia e testes histoquímicos. Foram observados cristais prismáticos cuneiformes, tabulares, cúbicos e bipiramidais; ráfides; estiloides; drusas de cristais em bloco; rosetas cristalinas de estiloides e concrescências cristalinas. Foram descritos 15 macropadrões cristalinos reunidos em três categorias. Os cristais foram classificados quimicamente como: puros de oxalato de cálcio e misturas entre oxalatos e sulfatos e entre oxalatos, sulfatos e sílica. Rosetas cristalinas, concrescências cristalinas silicificadas e 14 dos 15 macropadrões cristalinos descritos são registros inéditos para inclusões biominerais de Piper e Piperaceae. Os macropadrões cristalinos caulinares e foliares observados são constitutivos e úteis à separação interespecífica das espécies estudadas. Ademais, os cristais desempenham funções relevantes para a autoecologia dos taxa de Piper analisados.

Investigations in associated protozoa-bacterial infections of cyprinids from a fish farm situated on the Jijia river in N-E of Romania / Investigações sobre infecções protozoárias-bacterianas associadas a ciprinídeos da exploração piscícola no rio Jijia, situado no NE da Romênia

In autumn 2011 in cyprinid farms located in Iasi on the Jijia river, several infections with bacterial strains and macroscopical external cysts on the skin were diagnosedwhich developed as a result of the stress induced by biotic and abiotic factors. On the examination of the cyst contents the presence of numerous spores was observed, mostly of the Dermocystidium sp genusThe samples were taken from the common carp (Cyprinus carpio) and crucian carp (Carassius auratus gibelio) species from the fish farm as well as from the Jijia River. 35 fish were examined, all of them showing cysts, fragmentation of their dorsal fin and congestion of the gills. Histological examination of the skin showed a field of multiple dermal cysts with round light eosinophilic formations (14-16µm) containing a central refractable body similar to that reported for Dermocystidium sp. Gills samples were taken from the affected areas for the SEM examination with the purpose of evaluating not only aspects of normal morphology, but also aspects of some modifications of the affected areas as well as the presence of the etiologically incriminated bacteria Pseudomonas fluorescens. The isolates were identified through phenotypic methods. All the strains that showed mobility and oxidase-positivity were tested using API 20 NE strip. Consequently, they were taxonomically grouped into the species Pseudomonas fluorescens. The scanning electron microscope (SEM) was used for the first time in the characterization of the bacterial lesions produced by Pseudomonas strains on Cyprinus carpio and Carassius auratus gibelio gills. The diagnosis of septicemia with conditional pathogen species of Pseudomonas fluorescens was correlated with the results of the physico-chemical investigations of water and the data concerning the breeding conditions of the investigated livestock...

No outono de 2011, em fazendas de ciprinídeos localizadas em Iasi, no rio Jijia, diversas infecções bacterianas e cistos externos macroscópicos na pele se desenvolveram como resultado do estresse induzido por fatores bióticos e abióticos. No exame do conteúdo dos cistos, a presença de diversos esporos foi observada, a maioria do gênero Dermocystidium sp. As amostras foram colhidas das seguintes espécies: carpa comum (Cyprinus carpio) e carpa cruciana (Carassius auratus gibelio) de fazenda piscícola, além do rio Jijia. Assim sendo, 35 peixes foram examinados, todos demonstrando cistos, fragmentação da barbatana dorsal e congestão das guelras. O exame histológico da pele mostrou um campo de múltiplos cistos dérmicos com formações circulares claras eosinofílicas (14-16µm) contendo corpo central refratado similar ao relatado para Dermocystidium sp. Amostras de guelras foram retiradas das áreas afetadas para exame MEV, com o propósito de se avaliar não apenas os aspectos da morfologia normal, mas também os aspectos de algumas modificações das áreas afetadas, além da presença da bactéria etiologicamente incriminada: Pseudomonas fluorescens. Os isolados foram identificados por meio de métodos fenotípicos. Todas as amostras que mostraram mobilidade e positividade-oxidase foram testadas usando-se fita API 20 NE. Consequentemente, estas foram taxonomicamente agrupadas na espécie Pseudomonas fluorescens. O microscópio eletrônico de varredura (MEV) foi usado pela primeira vez na caracterização de lesões bacterianas produzidas por Pseudomonas nas guelras de Cyprinus carpio e Carassius auratus gibelio. O diagnóstico de septicemia com espécies condicionais de patogênico de Pseudomonas fluorescens foi correlacionado com os resultados das investigações físico-químicas da água e de dados sobre as condições de reprodução dos animais investigados...

Metabolic engineering of chloroplasts for artemisinic acid biosynthesis and impact on plant growth.

Chloroplasts offer high-level transgene expression and transgene containment due to maternal inheritance, and are ideal hosts for biopharmaceutical biosynthesis via multigene engineering. To exploit these advantages, we have expressed 12 enzymes in chloroplasts for the biosynthesis of artemisinic acid (precursor of artemisinin, antimalarial drug) in an alternative plant system. Integration of transgenes into the tobacco chloroplast genome via homologous recombination was confirmed by molecular analysis, and biosynthesis of artemisinic acid in plant leaf tissues was detected with the help of 13C NMR and ESI-mass spectrometry. The excess metabolic flux of isopentenyl pyrophosphate generated by an engineered mevalonate pathway was diverted for the biosynthesis of artemisinic acid. However, expression of megatransgenes impacted the growth of the transplastomic plantlets. By combining two exogenous pathways, artemisinic acid was produced in transplastomic plants, which can be improved further using better metabolic engineering strategies for commercially viable yield of desirable isoprenoid products.

Caracterização das superfícies de implantes dentais comerciais em MEV/EDS / Characterization of the surfaces of dental implants commercial in MEV/EDS

O objetivo foi caracterizar morfológica e quimicamente os diferentes sistemas de implantes. As amostras avaliadas apresentaram características de rugosidade superficial exceto para os implantes Externo Laser®, tendo os implantes Titamax® e Implant External Hex® apresentado características de rugosidade promovidas por jateamento de partículas, e o Osseotite®, Implant Revolution® e Máster Porous® apresentaram características porosas. Pode-se concluir que na análise das amostras houve um aumento de impurezas após modificações na superfície. Os elementos encontrados sugerem que os implantes apresentam deficiências considerando o processo de limpeza final antes da comercialização.

The purpose was to characterize the surfaces morphology and the superficial chemical composition of related osseointegrable implant systems. The evaluated samples presented characteristics of superficial roughness except for Externo Laser® implants, having Titamax® and Implant External Hex® implants presented roughness characteristics promoted by blasting of particles and the Osseotite®, Implant Revolution® and Máster Porous® implants presented porous characteristics.There are morphologic differences among implants of different companies.

Análise da resistência flexural e microdureza de dois sistemas de cerâmica aluminizada infiltrada por vidro / Analysis of flexural strength and microhardness of two alumina glass infiltrated ceramic systems

O estudo avaliou in vitro a resistência flexural e a microdureza de dois sistemas de cerâmica aluminizada infiltrada por vidro: In-Ceram Alumina (Vita) e Alglass (Celmat). Foram testados corpos de prova em forma de barra, conforme a ISO 6872-1998, foram testados em ensaios de resistência flexural de três pontos e microdureza Vickers, por indentação. Analisou- se a superfície de fratura dos corpos por MEV. In-Ceram Alumina apresentou maior resistência à flexão (441,7 ± 54,1 MPa) que o Alglass (287,8 ± 53,6 MPa). Os sistemas não apresentaram diferença estatística para microdureza: 1210,4 ± 90,0 HV e 1135,6 ± 117,5 HV, respectivamente. In-Ceram Alumina apresentou na superfície de fratura maior homogeneidade e menor número de poros que o Alglass. O Alglass, com custo reduzido comparado ao In-Ceram Alumina, atendeu à ISO 6872-1998 podendo ser empregado clinicamente

The aim of this work was to evaluate, in vitro, the microhardness, mechanical properties and fracture surface morphology of two different systems of glass infiltrated dental ceramic: In-Ceram Alumina (Vita) and Alglass (Celmat) systems. Both materials were used to prepare bar-shaped specimens according to ISO 6872-1998. Three point flexural strength and Vickers microhardness through indentation tests were used to evaluate the samples. The samples surface fracture was achieved through SEM. The Results showed that In-Ceram Alumina presented higher flexural strength values (441.7 ± 54.1 MPa) than Alglass (287.8 ± 53.6 MPa). There was no significant statistic difference in microhardness Vickers results (1210,4 ± 90,0 HV; 1135,6 ± 117,5 HV) between two groups, respectively. In-Ceram Alumina had more homogeneity and less pores at fracture surface than the Alglass. However, Alglass has reduced costs in relation to In-Ceram Alumina and reached the ISO 6872-1998 standard requirements, by this mean this material can be considered to be used clinically used

Indução, caracterização bioquímica e ultra-estrutural de calos de aroeira-do-sertão (Myracrodruon urundeuva Fr. All. ) / Induction, biochemical and ultrastructural characterization of the callus of "aroeira-do-sertão" (Myracrodruon urundeuva Fr. All. )

A aroeira-do-sertão (Myracrodruon urundeuva Fr. All.) é espécie arbórea que apresenta grande valor econômico devido às propriedades químicas da casca com elevado teor de taninos. Em decorrência da exploração predatória encontra-se inserida na lista oficial de espécies da flora brasileira ameaçadas de extinção na categoria vulnerável. A micropropagação vem sendo colocada como importante forma de multiplicação dessa espécie, na busca de alternativa para a exploração sustentável. Este trabalho foi realizado com o objetivo de induzir calos a partir de segmentos foliares usando 2,4-D e caracterizá-los quanto aos aspectos morfológicos e bioquímicos. Os resultados obtidos indicam que é possível induzir calos a partir de segmentos foliares de aroeira-do-sertão utilizando-se 2,4-diclorofenoxiacético (2,4-D). Os calos obtidos foram compactos e não-embriogênicos, apresentando valores médios de 43,32 mg g-1 de açúcares solúveis totais; 23,62 mg g-1 de açúcares redutores; 3,157 mg g-1 de proteína total; 3,147 mg g-1 de aminoácidos livres e 0,914 mg g-1 de compostos fenólicos totais na matéria fresca.

"Aroeira-do-sertão" (Myracrodruon urundeuva Fr. All.) is a tree species that has great economic value due to the chemical properties of its bark, which has high tannin content. On account of the predatory exploitation it has been placed in the official list of threatened species of the Brazilian flora, in the vulnerable category. Micropropagation has been considered an important form of multiplication of this species in the search for an alternative for its sustainable exploitation. This study was conducted with the aim of inducing callus from leaf segments using 2,4-D and characterizing them according to their morphological and biochemical aspects. The obtained results indicate that it is possible to induce callus from leaf segments of M. urundeuva using 2,4-dichlorophenoxyacetic (2,4-D). The obtained calluses were compact and non-embryogenic, with average values of 43.32 mg g-1 total soluble sugars, 23.62 mg g-1 reducing sugars, 3.157 mg g-1 total protein, 3.147 mg g-1 free-form amino acids and 0.914 mg g-1 phenolic compounds in the fresh matter.

Comparison of the interface dentin-endodontic sealer using two SEM magnifications / Comparação da interface dentina-cimento endodôntico usando dois aumentos de MEV

Purpose: The aim of this in vitro study was to compare the interface dentin-sealer of two sealers (RealSeal and AH Plus) using two magnifications under Scanning Electron Microscope (SEM).Methods: The coronal two thirds of eight extracted molars were removed and the dentin surfaces were grounded with the sequential use of #180 and #320 SIC paper under water cooling. The samples were divided into two groups of four in accordance to the sealer to be used. The dentin surfaces were treated with 17% EDTA followed by 5.25% NaOCl. Cylinders from polyethylene tubes were applied to the dentin surfaces and filled with freshly prepared sealers. Following 2h setting and storage at 37ºC at 100% humidity for a week, the teeth were cut perpendicularly to allow the visualization of the area containing the hole, thus the interface dentin-sealer. SEM analysis was done at three areas along the interface, at 150x and1000x.Results: The repeated measures ANOVA showed no significant differences between the magnifications. AH-Plus displayed significantly more gaps in the interface dentin-sealer than RealSeal. (p=0.002). The increase in magnification, from 150x to 1000x, did not allow any additional identification of gaps. Conclusion: RealSeal produced less gaps than AH Plus. It could be assumed that 150x is good enough to show defects in the interface dentin-sealer.

Objetivo: Este estudo teve por objetivo comparar a interface dentina-cimento endodôntico de dois cimentos (RealSeal e AH Plus) usando dois aumentos de Microscopia Eletrônica de Varredura (MEV). Metodologia: Os dois terços coronários de oito molares extraídos foram removidos e as superficies dentinárias foram desgastadas com o uso sequencial de lixas abrasivas 180 e 320, sob refrigeração a água. Os espécimes foram divididos em dois grupos com quatro espécimes cada de acordo com o cimento endodôntico a ser usado e as superfícies dentinárias foram tratadas com EDTA a 17%, sendo seguido por NaOCl a 5,25%. Cilindros obtidos a partir de tubos de polietileno foram colocados sobre as superfícies dentinárias e preenchidos com os cimentos preparados. Após 2 h de presa de armazenamento a 370 C em ambiente com 100% de umidade por uma semana, os dentes foram seccionados perpendicularmente para permitir a visualização da área contendo o orifício, ou seja, a interface dentina-cimento. A análise por MEV foi realizada em três áreas ao longo da interface com aumentos de 150x e 1000x. Resultados: O teste de ANOVA para medidas repetidas não mostrou diferenças significativas entre os aumentos de MEV. O cimento AH-Plus mostrou significantemente mais gaps na interface dentina-cimento que o material RealSeal. (P=0,002). A mudança de aumento de MEV de 150x para 1000x não resultou em identificação maior de gaps. Conclusão: O cimento RealSeal produziu menos gaps que o cimento AH Plus. Pode-se concluir que o aumento de 150x é suficiente para mostrar defeitos na interface dentina-cimento endodôntico.

Analysis of the microstructure of Xenodontinae snake scales associated with different habitat occupation strategies / Análise da microestrutura de escamas de serpentes Xenodontinae em associação à ocupação de diferentes microhabitats

The morphology of many organisms seems to be related to the environment they live in. Nonetheless, many snakes are so similar in their morphological patterns that it becomes quite difficult to distinguish any adaptive divergence that may exist. Many authors suggest that the microornamentations on the scales of reptiles have important functional value. Here, we examined variations on the micromorphology of the exposed oberhautchen surface of dorsal, lateral, and ventral scales from the mid-body region of Xenodontinae snakes: Sibynomorphus mikani (terricolous), Imantodes cenchoa (arboreal), Helicops modestus (aquatic) and Atractus pantostictus (fossorial). They were metallized and analyzed through scanning electron microscopy. All species displayed similar microstructures, such as small pits and spinules, which are often directed to the scale caudal region. On the other hand, there were some singular differences in scale shape and in the microstructural pattern of each species. S. mikani and I. cenchoa have larger spinules arranged in a row which overlap the following layers on the scale surface. Species with large serrate borders are expected to have more frictional resistance from the caudal-cranial direction. This can favor life in environments which require more friction, facilitating locomotion. In H. modestus, the spinules are smaller and farther away from the posterior rows, which should help reduce water resistance during swimming. The shallower small pits found in this species can retain impermeable substances, as in aquatic Colubridae snakes. The spinules adhering to the caudal scales of A. pantostictus seem to form a more regular surface, which probably aid their fossorial locomotion, reducing scale-ground friction. Our data appear to support the importance of functional microstructure, contributing to the idea of snake species adaptation to their preferential microhabitats.

A morfologia de muitos organismos parece estar relacionada ao ambiente em que eles vivem. No entanto, muitas serpentes são tão similares nos seus padrões morfológicos que se torna difícil distinguir qualquer divergência adaptativa existente. Muitos autores sugerem que as micro-ornamentações nas escamas de répteis possuem importante valor funcional. Neste trabalho, examinamos variações na micromorfologia da superfície oberhautchen exposta das escamas ventrais, laterais e dorsais da região medial de serpentes Xenodontinae: Sibynomorphus mikani (terrestre), Imantodes cenchoa (arbórea), Helicops modestus (aquática) e Atractus pantostictus (fossorial). Estas foram metalizadas e analisadas por microscopia eletrônica de varredura. Todas as espécies apresentaram microestruturas similares, tais como microcovas e espículas, que estão normalmente orientadas para a região caudal da escama. Por outro lado, houve algumas diferenças singulares em relação ao formato da escama e padrão microestrutural de cada espécie. S. mikani e I. cenchoa possuem espículas grandes arrumadas em linhas que sobrepõem as camadas seguintes da superfície da escama. Em espécies que possuem longas denticulações sobrepostas sobre as bordas posteriores das células, é esperado que haja uma maior resistência friccional da direção posterior para anterior das escamas. Isso pode favorecer a vida em ambientes que precisam de maior atrito, facilitando a locomoção. Em H. modestus, as espículas são menores e mais afastadas das linhas posteriores, o que pode reduzir o atrito com a água durante a natação. As microcovas mais rasas encontradas nesta espécie podem reter substâncias impermeáveis, como nas serpentes Colubridae aquáticas. As espículas que aderem às escamas caudais de A. pantostictus parecem formar uma superfície mais regular, o que provavelmente auxilia na locomoção fossorial, reduzindo o atrito com o solo. Nossos dados parecem corroborar a importância da microestrutura funcional, ...

Influência do pH na ação de alguns tipos de EDTA na forma gel nas paredes do canal radicular / Influence of pH in the action of some types of EDTA gels in the walls of the root canal

Este trabalho verificou a ação do EDTA nas paredes do canal radicular relacionando-a com o pH dos produtos utilizados. Vinte e cinco incisivos centrais superiores humanos foram tratados com diferentes tipos de EDTA e divididos em cinco grupos: Grupo 1-EDTA gel a 15%; Grupo 2 - EDTA gel a 17%; Grupo 3 - EDTA gel a 17%; Grupo 4 - EDTA gel a 24%; Grupo 5 - EDTA líquido a 17% (controle). Após o preparo químico-mecânico, os dentes foram analisados em Microscopia Eletrônica de Varredura (2000x) e foi observada a presença da smear layer nos grupos 1 a 4. Essas mesmas formulações foram submetidas à determinação de pH. Houve grande variação do pH entre as formulações de EDTA na forma gel, influenciando na liberação de EDTA e, consequentemente, na quelação.

SEM observations on seeds of some herbaceous Phyllanthus L. species (Phyllanthaceae) / Observações de sementes de algumas espécies herbáceas de Phyllanthus L. (Phyllanthaceae) em MEV

Six medicinal herbaceous Phyllanthus L. (Phyllanthaceae) species, P. tenellus Roxb., P. niruri L., P. stipulatus (Raf.) Webster, P. urinaria L., P. caroliniensis Walt., and P. amarus Schum. & Thonn. are difficult to distinguish. In order to solve this problem, the ornamentation of the seed surfaces was analyzed by SEM (scanning electron microscopy). Differences between lateral, dorsal and ventral surfaces were observed. The seeds were cut into sections at different angles, exposing testa sculptures. Three types of surface ornamentation patterns were observed and they showed to be avaluable diagnostic.

Seis espécies herbáceas de Phyllanthus L. (P. tenellus Roxb., P. niruri L., P. stipulatus (Raf.) Webster, P. urinaria L., P. caroliniensis Walt. e P. amarus Schum. & Thonn.) mencionadas como medicinais apresentam dificuldades na identificação. Com o objetivo de auxiliar neste problema e determinar diferenças entre as espécies, o padrão de ornamentação das sementes foi estudado utilizando técnicas de microscopia eletrônica de varredura (MEV). As sementes apresentaram ornamentação distinta, sendo observadas as superfícies laterais, dorsais e ventrais. As espécies puderam ser separadas em três tipos de ornamentação, que demonstraram importância como caractere diagnóstico para a sua separação.

Ultramorphology and histology of the larval salivary gland of Pachycondyla villosa (Fabricius) (Hymenoptera: Formicidae, Ponerinae) / Utramorfologia e histologia da glândula salivar larval de Pachycondyla villosa (Fabricius) (Hymenoptera: Formicidae, Ponerinae)

The salivary gland possesses a single anterior duct with a columnar epithelium, two lateral ducts with simple cubical epithelium, which becomes columnar in the proximal portion, and two thin-walled reservoirs, from which two secretory regions arise. The dorsal and ventral branches of the secretory regions are connected via transverse commissures and ends in a loop. The secretory region is uniform and consists on a simple cubical epithelium. This paper also presents a review on the morphology of the salivary glands in insects, mainly in Hymenoptera-Aculeata.

A glândula salivar apresenta-se com um duto anterior único, formado por um epitélio colunar, dois dutos laterais curtos, os quais apresentam-se com epitélio cúbico simples e que na sua porção mais proximal torna-se colunar. Posterior a estes, encontram-se os dois reservatórios, os quais possuem o epitélio bastante delgado e é neste reservatório que a região secretora da glândula se abre. Os ramos dorsal e ventral da região secretora da glândula conectam-se por meio de comissuras transversais, sendo que, posteriormente, a região secretora termina em forma de "alça". A região secretora é uniforme, não apresenta tipos celulares distintos e é formada por um epitélio cúbico simples. Neste trabalho é apresentada, também, a revisão sobre a morfologia da glândula salivar larval em insetos, principalmente com relação aos Hymenoptera-Aculeata.