Phenotypic characterization of mycobacteria isolates from tuberculosis patients in Kaduna State, Nigeria

Background: Tuberculosis (TB) remains one of the leading public health challenges in Nigeria and the burden is still high. There is hence a need for continuous characterization of mycobacteria to obtain current data that will aid the ongoing TB prevention and control programme. The aim of this study was to phenotypically characterize mycobacteria isolates recovered from clinical specimens of patients with tuberculosis in Kaduna State, Nigeria. Methods: Two thousand, two hundred and twelve (2212) sputum samples were collected from patients clinically suspected to have TB in three different zones of Kaduna State, Nigeria, between May 2017 and October, 2018. Samples were processed by decontaminating with NaOH-Citrate N-acetyl-L-Cystein method for Ziehl Neelsen (ZN) AFB microscopy and culture on Lowenstein Jensen (LJ) slants which were incubated at 37ᵒC for 8 weeks. Positive LJ cultures were further analyzed with a rapid TB antigen assay (SD-Bioline) to differentiate Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) from Non Tuberculous Mycobacteria (NTM). Results: Out of the 2212 patients with suspected TB, 300 (13.6%) were positive for AFB by microscopy with Zone A (Kaduna North) having the highest AFB positive cases of 169 (15.2%). Of the 300 AFB positive samples, 272 (91.0%) were culture positive on LJ medium, 18 (6.0%) were culture negative and 10 (3.0%) were culture contaminated. Result of the distribution of mycobacteria among infected patients within the study area revealed that 219 (80.5%) were infected with MTBC, 42 (15.4%) with NTM and 11 (4.0%) with both MTBC and NTM. Conclusion: A relatively high number of TB in the study area was caused by NTM. There is need for advanced diagnostic tools that can differentiate MTBC and NTM strains among TB patients in all TB Reference Laboratories in Nigeria

Improved sensitivity, safety and laboratory turn around time in the diagnosis of pulmonary tuberculosis by use of bleach sedimentation

Background: Inadequate diagnostic processes and human resources in laboratories contribute to a high burden of tuberculosis (TB) in low- and middle-income countries. Direct smear microscopy is relied on for TB diagnosis; however; sensitivity rates vary. To improve sensitivity of direct microscopy; the researchers employed several approaches; including sputum digestion and concentration of acid-fast bacilli (AFB); a technique which uses commercial bleach. Objectives: This study compared methods used to diagnose active Mycobacterium tuberculosis infections. Methods: Three sputum specimens were collected from each of 340 participants in Abuja; Nigeria; over two consecutive days. Direct microscopy was performed on all specimens; following microscopy; one specimen from each patient was selected randomly for bleach sedimentation and one for Lowenstein-Jensen culture.Results: Direct microscopy produced 28.8% AFB-positive results; whilst bleach sedimentation resulted in 30.3%. When compared with the cultures; 26.5% were AFB true positive using direct microscopy and 27.1% using bleach sedimentation. Whilst the specificity rate between these two methods was not statistically significant (P = 0.548); the sensitivity rate was significant (P = 0.004).Conclusion: Based on these results; bleach increases the sensitivity of microscopy compared with direct smear and has similar specificity. When diagnosing new cases of pulmonary TB; one bleach-digested smear is as sensitive as three direct smears; reducing waiting times for patients and ensuring the safety of laboratory technicians

Evaluation de la sensibilite aux antibiotiques des mycobacteries a croissance rapide

La sensibilite aux antibiotiques des Mycobacteries a Croissance Rapide (MCR) par la methode de microdilution en milieu liquide; et la mesure de la repetabilite des CMI ont ete evaluees sur 15 souches cliniques de mycobacteries a croissance rapide (4 Mycobacterium chelonae; 6 Mycobacteriun abscessus; 3 Mycobacteriun fortuitum; et 2 Mycobacterium peregrinum). Les souches de reference Staphylococcus aureus ATCC 29213 et Mycobacterium peregrinum ATCC 700686 ont ete utilisees pour le controle de qualite. Les resultats ont montre que le controle de qualite etaitacceptable car les valeurs obtenues etaient comprises dans la gamme de Concentrations Minimales Inhibitrices (CMI) proposee par le Clinical and Laboratory Standard Institute (CLSI). Une repetabilite des valeurs de CMI a ete observee. L'amikacine et la clarithromycine etaient les antibiotiques les plus actifs sur presque toutes les MCR etudiees. La tobramycine etait active exclusivement sur M. chelonae (100sensibles) et les fluoroquinolones (Ciprofloxacine et moxifloxacine) sur M. fortuitum (100de sensibilite). Il n'a pas ete observe de correlation entre la methode de microdilution en milieu liquide et celle de Canetti

A 20-Year Clinicopathological Analysis of Tuberculous Mastitis in Nigerians

Background: Tuberculosis is a global problem with high incidence in endemic areas such as Nigeria. A resurgence of tuberculosis attributed to an increase in the incidence of AIDS was observed in many countries in the last decade. A corresponding increase in the incidence of extrapulmonary tuberculosis including tuberculous mastitis was also documented in tuberculous endemic areas Aim: To present the experience of tuberculous mastitis from the Department of Pathology; University of Benin Teaching Hospital; Benin City; Nigeria. 1987 to 2006. Methods: A retrospective study of cases of tuberculosis of the breast from 1987 to 2006 as found in the records of the Pathology Department was done. Results: Twenty-four cases of tuberculosis of breast were seen during the 20 year period of study. All patients were females. They presented with a lump; mostly in the right breast (70.8). All cases were histologically confirmed. Five (20.8) patients were lactating at the time of presentation. Only 3 (12.5) of the 24 cases were suspected clinically as tuberculous mastitis. There was co-existing fibrocystic disease; fibroadenoma and carcinoma in 3 (12.5); 2 (8.3); and 1 (4.2) patient respectively. All patients had satisfactory results on antituberculosis treatment. Co-existing fibroadenoma and carcinoma were treated by excision biopsy and simple mastectomy respectively. Conclusion: Although the incidence of the tuberculous mastitis is low; it is often misdiagnosed. There is need for a high index of suspicion in making the diagnosis in young women with breast lumps in whom malignancy has been excluded

Aspects épidémiologiques de la tuberculose pulmonaire à bacilloscopie positive au Mali à la décennie 1995-2004

Dans le but de decrire l'epidemiologie de la tuberculose pulmonaire a bacilloscopie positive (TPM+) au Mali; une etude retrospective sur dix ans du 1er janvier 1995 au 31 decembre 2004; a ete menee au Programme National de Lutte contre la Tuberculose (TB) sis a la direction nationale de la Sante. Toutes les donnees de l'etendue du pays sont centralisees au niveau de ce programme. Durant cette periode de dix ans; 33 000 cas de TB toutes formes confondues ont ete notifies sur le territoire de la republique du Mali; soit 2750 cas de TB en moyenne par an ; et 22.275 cas (67;5) avaient une microscopie positive des crachats pour le BAAR soit 1856 cas de TPM+ en moyenne par an. Cette prevalence annuelle de TPM+ par rapport a la population nationale represente 185 cas pour 100.000 habitants par an. Au total pendant la periode d'etude 13.638 TPM+ sur 22275 cas au total (soit 61;22) ont ete soumis au traitement antituberculeux. Parmi ces patients sous traitements antituberculeux 2371 cas (17;38) ont ete perdus de vue pendant le suivi; 5851 ont ete declares gueris (42;90) ;161(1;18) en situation d'echec therapeutique et 523 (3;93) cas de deces. Avec un sex-ratio de 3;57 les adultes jeunes etaient majoritairement represente.La TPM+ reste la pierre angulaire de tout programme national de lutte anti-tuberculeux tant pour le traitement que la prevention

Etude des appellations et des representations attachees a l'infection a Mycobacterium ulcerans dans differents pays endemiques d'Afrique

L'objectif de ce travail est de presenter les appellations de l'infection a Mycobacterium ulcerans (ulcere de Buruli) dans les langues africaines et leurs significations. Il vise egalement a explorer les representations attachees a la maladie dans differents pays endemiques d'Afrique. La methodologie utilisee implique l'analyse d' entretiens indivi- duels et de publications scientifiques. Les entretiens individuels ont ete menes aupres de differents chefs de programme et responsables de structures de prise en charge de cette maladie. Les resultats de notre analyse montrent que dans les pays d'Afrique ou l'ulcere de Buruli est endemique (Benin; Cameroun; Congo-Brazzaville; Cote d'Ivoire; Ghana; Ouganda; Republique Democratique du Congo; Sud Soudan et Togo); les appellations de cette maladie peuvent etre classees en trois categories; suivant qu'elles evoquent les origines geographiques de la maladie; les caracteristiques des lesions observees; ou les aspects d'incurabilite et de mystere; en lien avec la sorcellerie. Les representations de cette maladie dans les langues africaines apparaissent identiques et semblent traduire une connaissance relativement bonne de la maladie dans les pays ou l'ulcere de Buruli sevit. L'impact de ces representations influence egalement les types de recours aux soins

Traitement chirurgical des formes evolutives de l'Ulcere de Buruli

Il s'agit d'une etude retrospective et prospective qui s'est deroulee a l'institut Raout Follereau de Cote d'ivoire (Adzope) situe a 110 Km au nord d'Abidjan. Elle s'etend sur une periode allant de Janvier 19954 Janvier 2004 -Elle a pris en compte les malades porteurs de lesions evolutives de l'ulcere de Buruli; quel que soit leur age ou leur sexe. Deux cent sept (207) malades ont ete retenus pour notre etude. Ils ont ete pris en charge chirurgicalement a l'institut Raout Follereau de Cote d'Ivoire (Adzope). Nous avons voulu au terme de cette etude presenter l'interet de la chirurgie dans le traitement des formes evolutives de l'ulcere de Buruli. A cet effet nous nous sommes fixes comme objectif principal : Ameliorer la prise en charge chirurgicale des formes evolutives de l'ulcere de Buruli. Et comme objectifs specifiques: -Decrire les differentes techniques chirurgicales utilisees dans k traitement des formes evolutives de l'ulcere de Buruli ; -Exposer les indications des differentes techniques chirurgicales dans le traitement de l'ulcere de Buruli ; -Elaborer une strategie chirurgicale standardisee pour la prise en charge des formes evolutives de l'ulcere de Buruli ; -Evaluer l'importance d'un traitement chirurgical adequat dans la prevention des sequelles et des recidives. Au cours de cette periode; 497 interventions ont ete realisees pour le traitement des formes evolutives de l'ulcere de Buruli dominees par les ulcerations (86;8pour cent); les lesions pre-ulceratives representant 13;4 pour cent. Ces lesions sont plus frequentes chez les enfants de O a 15 ans representant 42;5 0pour cent des malades de notre etude. Les lesions evolutives sont representees par: Le nodule; le placard; l'oedeme; l'ulceration. Nous avons retrouve ces lesions sur plusieurs parties du corps dont 54 pour cent aux membres inferieurs. L'anemie est la complication la plus frequente. Pour la prise en charge des lesions evolutives; nous avons fait appel a l'excision associee secondairement si necessaire a la greffe dermo epidermique. Quant aux atteintes osteo-articulaires; elles ont necessite une excision osseuse avec curetage; une arthrotomie avec lavage drainage ou une sequestrectomie. Les complications tardives sont dominees par les sequelles qui surviennent du fait du retard a la prise en charge precoce. Trois (3) raisons peuvent justifier ce retard : - L'absence de sensibilisation de la population ; - Le manque de centres de prise en charge ; - Le personnel medical et paramedical non forme a la prise en charge. L'interet doit donc etre mis sur la formation de personnel qualifie; la sensibilisation de la population pour une consultation precoce et une prise en charge de proximite des malades dans les structures sanitaires habituelles

Optimisation du diagnostic des ulcerations cutanees a mycobacterium ulcerans par la detection de la sequence d'insertion IS 2404 dans une etude experimentale a Manikro

Durant la periode du 18 Juin au 1er Aout 2000; nous avons procede a un recensement de malades suspects cliniquement d'ulcere de Buruli a l'institut Raoul Follereau de Manikro dans le District Sanitaire et Social de Bouake. L'objectif principal de cette etude etait de valider l'utilisation de la detection de la Sequence d'insertion IS2404 pour le Diagnostic de Mycobacterium ulcerans a partir des exsudats et des biopsies cutanees. Les objectifs specifiques etaient d'estimer le taux de positivite de la detection de la sequence IS2404 dans les exsudats d'une part et dans les biopsies d'autre part; de mesurer le gain relatif de la PCR par rapport a la microscopie et a la culture pour le Diagnostic de l'ulcere de Buruli. Nous avons recense 54 patients et procede au prelevement de produits biologiques qui se repartissaient comme suit : 54 exsudats; 8 biopsies de peau; 1 pus de nodule. Au plan epidemio-clinique; les patients dont l'age variait entre 04 et 65 ans; provenaient de 10 regions de Cote d'Ivoire avec 39pour cent d'agriculteurs; 35 pour cent d'eleves et 26 pour cent de personnes exercant des activites diverses. Ils presentaient tous des lesions cutanees evoluant depuis 2 mois au moins et 12 mois au plus. Les trois tests de diagnostic biologique appliques dans cette etude nous ont donne les taux de positivite suivants : PCR : exsudats : 31 pour cent; biopsies : 88 pour cent; Coloration de Ziehl : exsudats : 20 pour cent; biopsies : 63 pour cent; Culture sur L.J : une seule positivite. L'etude a permis de confirmer biologiquement la presence effective de l'infection a M u sur la majeure partie du territoire national ivoirien. Devant cette ampleur; nous devons davantage nous inquieter et chercher a renforcer les moyens et les actions du Programme National de Lutte contre l'Ulcere de Buruli. Ainsi nous pourrons faire reculer cette affection invalidante hors des frontieres de la Cote d'Ivoire

Detection de mycobacterium ulcerans par la technique de polymerase chain reaction (PCR) et relations avec l'etude histopathologique chez des patients porteurs d'ulcerations cutanees chroniques (ulcere de buruli)

"Ce travail est une etude transversale qui avait pour objectif d'etablir les relations entre la detection de Mycobacterium ulcerans par la technique de polymerase Chain reaction (PCR) et l'etude histopathologique chez 33 patients porteurs d'ulcerations cutanees chroniques evoquant cliniquement un ulcere de Buruli. Les methodes d'etude utilisees ont ete pour la biologie moleculaire la technique de ""Single PCR."" par amplification de la sequence d'insertion IS 2404 specifique de Mycobacterium ulcerans et les techniques d'inclusion et coupe en paraffine suivies des colorations a l'hemateine-eosine et au Ziehl-Neelsen pour l'etude histopathologique. Nos resultats ont ete les suivants: *Le taux de positivite de la PCR effectuee sur les fragments biopsiques etait de 90;90pour cent; *Il existait 3 formes histopathologiques: forme necrosante (39;4pour cent); forme mixte (42;4pour cent); forme granulomateuse (18;2pour cent) ; *La comparaison entre les 2 tests diagnostiques a montre que: -Dans la forme necrosante; la PCR et l'histopathologie avaient le meme rendement diagnostique avec un niveau de concordance de 100pour cent. -Dans la forme mixte le niveau de concordance entre les 2 methodes diagnostiques etait de 92;8.6pour cent. -et de 66;67pour cent dans la forme granulomateuse. En conclusion; ces resultats indiquent d'une part un taux de positivite eleve de la PCR realisee sur des fragments tissulaires et d'autre part la fiabilite de l'etude histopathologique pour la confirmation biologique du diagnostic d'ulcere de Buruli dans ses formes necrosante et mixte. En revanche elle devra etre couplee a la PCR pour plus de fiabilite dans les formes granulomateuses."