Full characterization of plasmids from Achromobacter ruhlandii isolates recovered from a single patient with cystic fibrosis (CF) / Caracterización completa de plásmidos provenientes de aislamientos de Achromobacter ruhlandii recuperados de un único paciente con fibrosis quística

Abstract In the last decade Achromobacter spp. has been associated with chronic colonizationin patients with cystic fibrosis (CF). Although Achromobacter xylosoxidans is the most frequentspecies recovered within this genus, other species such as A. ruhlandii have also been reportedin these patients. Descriptions of mobile elements are scarce in Achromobacter and none ofthem have been originated in A. ruhlandii. The aim of this study was to report the full char-acterization of a plasmid which was maintained in four clonally related A. ruhlandii isolates.Between 2013 and 2015, nine A. ruhlandii isolates were recovered from a pediatric patientwith CF at a hospital in Buenos Aires. Four selected clonally related isolates were sequencedby Illumina MiSeq, annotated using RAST and manually curated. The presence of a unique plas-mid of 34096-bp and 50 CDS was observed in the four isolates, displaying only 1 nucleotidesubstitution translated into one amino acid change among them. These plasmids have a class 1integron containing the aac-(6)-Ib gene, a mercury resistance operon region and the relE/stbEtoxin/antitoxin system. Plasmids showed 79% similarity and 99% identity with pmatvim-7 fromPseudomonas aeruginosa. This is the first full description and characterization of a plasmid fromA. ruhlandii which was maintained over time.

Resumen Durante la última década, Achromobacter spp. han sido asociadas con la colonización crónica en pacientes con fibrosis quística. Si bien Achromobacter xylosoxidans es la especie más frecuentemente recuperada, otras especies como Achromobacter ruhlandii también fueron reportadas en nuestra región. Sin embargo, pocos reportes se han centrado en la descripción de elementos móviles, y ninguno de ellos los documenta en A. ruhlandii. El objetivo de este estudio fue reportar la caracterización completa de un plásmido conservado en 4 aislamientos clonalmente relacionados de A. ruhlandii. Se recuperaron 9 aislamientos de A. ruhlandii entre 2013 y 2015 de un único paciente con fibrosis quística proveniente de un hospital pediátrico de Buenos Aires, Argentina. Se realizó la secuenciación completa del genoma de los 4 aislamientos seleccionados según el perfil de resistencia antibiótica en un equipo Illumina MiSeq. Estos fueron anotados mediante RAST y curados manualmente. Se detectó la presencia de un solo plásmido de 34.096 pb y 50CDS en los 4 aislamientos, observándose únicamente un cambio nucleotídico traducido en un cambio aminoacídico en un aislamiento. Los plásmidos ensamblados se caracterizaron por presentar un integrón de clase 1 que contenía el gen aac-(6')-Ib, un operón de resistencia a mercurio y el sistema de toxina-antitoxina relE/stbE. Cabe destacar que estos plásmidos poseen un 79% de similitud y un 99% de identidad con el plásmido pmatvim-7 de Pseudomonas aeruginosa. Esta es la primera descripción y caracterización completa de un plásmido proveniente de A. ruhlandii.

Comparative genomic analysis of two novel plasmids from Acidithiobacillus ferrivorans strain PQ33 / Análisis genómico comparativo de dos nuevos plásmidos de la cepa PQ33 de Acidithiobacillus ferrivorans

Abstract Acidithiobacillus ferrivorans is a psychrotolerant acidophile capable of growing and oxidizing ferrous and sulphide substrates at low temperatures. To date, six genomes of this organism have been characterized; however, evidence of a plasmid in this species has been reported only once, whereby there is no conclusive role of the plasmids in the species. Herein, two novel plasmids of A. ferrivorans PQ33 were molecularly characterized and compared at a genomic scale. The genomes of two plasmids (12 kbp and 10 kbp) from A. ferrivorans PQ33 (NZ_LVZL01000000) were sequenced and annotated. The plasmids, named pAfPQ33-1 (NZ_CP021414.1) and pAfPQ33-2 (NZ_CP021415.1), presented 9 CDS and 13 CDS, respectively. In silico analysis showed proteins involved in conjugation (TraD, MobA, Eep and XerD), toxin-antitoxin systems (HicA and HicB), replication (RepA and DNA binding protein), transcription regulation (CopG), chaperone DnaJ, and a virulence gene (vapD). Furthermore, the plasmids contain sequences similar to phosphate-selective porins O and P and a diguanylate cyclase-phosphodiesterase protein. The presence of these genes suggests the possibility of horizontal transfer, a regulatory system of plasmid maintenance, and adhesion to substrates for A. ferrivorans species and PQ33. This is the first report of plasmids in this strain.

Resumen Acidithiobacillus ferrivorans es un acidófilo psicrotolerante capaz de hacer crecer y oxidar sustratos ferrosos y sulfurosos a bajas temperaturas. Hasta la fecha se han caracterizado seis genomas de este organismo; sin embargo, la evidencia de un plásmido en esta especie ha sido informado solo una vez, por lo que no hay un rol concluyente de los plásmidos en la especie. Aquí, dos plásmidos novedosos de A. ferrivorans PQ33 se caracterizaron molecularmente y se compararon a escala genómica. Se secuenciaron y anotaron los genomas de dos plásmidos (12 kpb y 10 kpb) de A. ferrivorans PQ33 (NZ_LVZL01000000). Los plásmidos, denominados pAfPQ33-1 (NZ_CP021414.1) y pAfPQ33-2 (NZ_CP021415.1), presentaron 9 CDS y 13 CDS, respectivamente. El análisis in silico mostró proteínas involucradas en la conjugación (TraD, MobA, Eep y XerD), sistemas de toxina-antitoxina (HicA y HicB), replicación (RepA y proteína de unión al ADN), regulación de la transcripción (CopG), chaperona DnaJ y un gen de virulencia (vapD). Además, los plásmidos contienen secuencias similares a las porinas selectivas de fosfato O y P y una proteína diguanilato ciclasa-fosfodiesterasa. La presencia de estos genes sugiere la posibilidad de transferencia horizontal, un sistema regulador de mantenimiento de plásmidos y adhesión a sustratos para especies de A. ferrivorans y PQ33. Este es el primer informe de plásmidos en esta cepa.

Full characterization of an IncR plasmid harboring qnrSI recovered from a VIM-11-producing Pseudomonas aeruginosa

Abstract Metallo-p-lactamases (MBL) producing Pseudomonas aeruginosa isolates have been well characterized. Quinolones are commonly used in the treatment of carbapenem-resistant P. aeruginosa infections; however, data about PMQR in this species are scarce. The objective of this study was to report the simultaneous presence of qnrS and blaV-M-n in P. aeruginosa, and to characterize the qnrS-harboring plasmid. Thirty-eight carbapenem-resistant P. aeruginosa isolates were recovered from a hospital in Buenos Aires during 2012. Screening forMBL was assessed by the double disk synergy test using EDTA and carbapenem discs. Plasmid DNA extraction was performed by a method using phenol-chloroform. PCR followed by sequencing was carried out to determine each MBL and PMQR allele. PCR-BseGI-RFLP was performed to detect aac-(6')-Ib-cr. The gyrA-QRDR was sequenced in those PMQR-harboring isolates. Plasmid incompatibility groups and addiction systems were characterized by PCR. The PMQR-carrying plasmid was sequenced using Illumina technology, annotated using RAST and manually curated. Eleven/38 isolates were VIM producers (blaVIM-2 and blaVIM-11) while 1/38 harbored blaIMP-13. One isolate harbored blaVIM-11 and the PMQR qnrSI; however, both markers were located in different plasmids. The qnrSí-harboring plasmid (pP6qnrS1) was 117 945 bp in size, presented 154 CDS and corresponded to the IncR group. In addition to qnrSI, it harbored several aminoglycoside resis-tance markers. Although pP6qnrS1 was non-conjugative, it presented an oriT which made it possible for this plasmid to be transferable. This is the first report on P. aeruginosa carrying both blaVIM-11 and qnrSI, plus the first detection of an IncR plasmid in Argentina.

Resumen Las quinolonas son comúnmente utilizadas en el tratamiento de las infecciones producidas por Pseudomonas aeruginosa resistentes a carbapenems (PARC); aun así, la información sobre la resistencia a quinolonas mediada por plásmidos (PMQR) en esta especie es escasa. El objetivo de este trabajo fue reportar la presencia simultánea de los genes qnrS y blaVIM-11 en PARC y caracterizar el plásmido portador de qnrS. Durante 2012 se recuperaron 38 PARC en un hospital de Buenos Aires. El tamizaje para detectar producción de metalo-beta-lactamasas (MBL) se llevó a cabo mediante sinergia de doble disco utilizando EDTA y carbapenems. El ADN plasmídico fue extraído utilizando fenolcloroformo. Para determinar los alelos de los genes implicados en la síntesis de MBL y de PMQR, se llevó a cabo PCR-secuenciación. Para la detección de aac-(6')-Ib-cr se realizó PCR-BseGI-RFLP. En aquellos aislamientos portadores de PMQR se secuenció el gen gyrA. Los grupos de incompatibilidad y sistemas de adicción fueron caracterizados por PCR. El plásmido portador de PMQR fue secuenciado completamente y curado manualmente. De 38 aislamientos, 11 fueron productores de VIM (blaVIM-2 y blaVIM-11), mientras que uno contenía blaIMP-13. Si bien un aislamiento fue portador de blaVIM-11 y de qnrSI, dichos marcadores se encontraban en distintos plásmidos. El plásmido portador de qnrSI (pP6qnrS1) presentó un tamaño de 117.945 pby 154 secuencias codificantes (CDS); este correspondió al grupo de incompatibilidad IncR. Además de qnrSI, el plásmido portaba diversos marcadores de resistencia a aminoglucósidos. Aun cuando pP6qnrS1 no resultó conjugativo, presentó un oriT, de modo que posiblemente sea transferible. Este es el primer informe acerca de PARC portadora de blaVIM-11 y de qnrSI en simultáneo, además, es la primera descripción de un plásmido IncR en Argentina.

Frecuencia de Chlamydia trachomatis en mujeres de edad fértil al usar PCR en tiempo real en el Servicio de Laboratorio del Hospital Carlos Andrade Marín / Recurrence of Chlamydia Trachomatis in women of childbearing age when using CRP in real time in the Laboratory Department of Carlos Andrade Marin Hospital

Introducción: Chlamydia trachomatis es una bacteria patógena comúnmente reportada como causante de infecciones del tracto urogenital. Materiales y métodos: Mediante este estudio se determinó la frecuencia de infección por C. trachomatis utilizando PCR en tiempo real en mujeres de edad fértil (18 ­ 45) que acudieron al laboratorio del Hospital Carlos Andrade Marín. Para el estudio se colectaron 200 muestras de orina y se identificó el patógeno utilizando un kit comercial que identificó el plásmido críptico y al gen ompA presentes en la bacteria. Resultados: Se detectaron 3 muestras positivas que correspondieron al 1.5% de frecuencia. Los casos positivos se encontraron dentro de grupo de edad de 25 a 26 años. Discusión: Los resultados obtenidos en la presente investigación son comparables con estudios similares realizados en Latinoamérica con grupos de bajo riesgo.

Introduction: Chlamydia trachomatis is a pathogenic bacterium commonly reported as cause of infections of the urogenital tract. Methods: This study determined the frequency of C. trachomatis infection using real-time PCR. Two hundred urine samples from women in reproductive age were analyzed (range: 18 ­ 45 years old), which have attended at Carlos Andrade Marín Hospital. In order to test the samples, a commercial kit that identifies the criptic plasmid and the ompA gene from C. trachomatis was used. Results: From the 200 samples, three were positive that corresponed to a frequency of 1.5%. All positive cases were found within the group of 25 and 26 years old. Discussion: The results obtained in this research are comparable with similar studies obtained in several Latin American countries in low risk population

Plásmido conjugativo portador de integrón clase 1 responsable de la resistencia a los antibióticos en aislados de vibrio cholerae O1 en Venezuela / Conjugative plasmid and a class 1integron responsible for the resistance to antibiotics in vibrio cholerae O1 isolates in Venezuela

Se han descrito aislados de Vibrio cholerae resistentes a una amplia variedad de antibióticos. En Venezuela, durante el brote de cólera ocurrido entre noviembre de 1998 y enero 2000 fueron reportados por primera vez aislados de V. cholerae O1 resistentes a ampicilina, trimetoprim-sulfametoxazole. Usando experimentos de conjugación se determinó la capacidad de transferir los determinantes de resistencia a ampicilina y trimetoprim-sulfametoxazole en 11 aislados. La visualización de plásmidos se realizó utilizando la digestión con nucleasa S1 y electroforesis en campo pulsante. La presencia de integrones de clase 1 fue establecida por PCR y se obtuvo la secuencia de la región variable del integrón. Los determinantes de resistencia fueron transferidos en un plásmido conjugativo de aproximadamente 170 kbp, común a todos los aislados. La resistencia a trimetoprim esta codificada en el gen dfra15, el cual se encuentra en un integrón clase 1 presente en el plásmido. En este estudio, se caracterizó la localización genética de los determinantes que codifican la resistencia a los antibióticos, y al conocer el mecanismo probable de dispersión de los determinantes de resistencia se podrán implementar medidas de control más adecuadas.

Vibrio cholerae has been reported to be resistant to a wide range of antibiotics. V. Cholerae O1 strains resistant to ampicillin, trimethoprim-sulfamethoxazole were isolated for the first time in Venezuela during a cholera outbreak that occurred between November 1998 and January 2000. Using conjugation experiments, the capacity of transfer of the resistance determinants in 11 strains resistant to ampicillin and trimethoprim-sulfamethoxazole was investigated. Plasmid analysis was done by S1 nuclease digestion and pulsed field gel electrophoresis. The presence of class 1 integrons was determined by PCR and the sequence of the gene harbored in the variable region of the integron was obtained. The antibiotic resistance determinants were transferred by a conjugative plasmid of approximately 170 kbp, common to all the isolates. Resistance to trimethoprim is encoded by the dfra15 gene that is harbored by a class 1 integron present in the plasmid. In this study, the genetic location of the determinants that code for resistance to antibiotics was characterized, and knowing the probable mechanism of dispersion of the determinants of resistance, control measures can be implemented most appropriate

Detección de Chlamydia trachomatis en muestras de exudado endocervical mediante una prueba de diagnóstico rápido y dos técnicas de reacción en cadena de la polimerasa / Detection of Chlamydia trachomatis in endocervical swab using rapid test and two reaction techniques polymerase chain

Introducción: Chlamydia trachomatis es el principal agente bacteriano que produce infecciones de transmisión sexual.Objetivo: detectar la presencia de C. trachomatis utilizando una prueba de diagnóstico rápido y compararla con la reacción en cadena de la polimerasa (RCP).Métodos: se procesaron 50 muestras de exudado endocervical, de mujeres sintomáticas del municipio 10 de Octubre. A las muestras se les aplicó la prueba Chlamy-check-1, un ensayo de RCP del gen del plásmido críptico y una RCP en tiempo real (RCP-TR) de la proteína mayor de la membrana externa (MOMP) de C. trachomatis, que fue utilizada como referencia. Se calculó, sensibilidad, especificidad, valor predictivo positivo (VPP) y negativo (VPN).Resultados: de las muestras estudiadas, 44 resultaron positivas por la prueba rápida, mientras que por la RCP del plásmido críptico solo 3 muestras (6 porciento) amplificaron. Al aplicar la RCP-TR, 4 muestras (8 porciento) se confirmaron como positivas, coincidiendo 3 por los tres métodos de diagnóstico. Al evaluar la prueba Chlamy-check-1 frente a la prueba de referencia se observó una sensibilidad de 100 porciento, mientras que la especificidad fue de 13 porciento, así como un VPP de 9,1 porciento y VPN de 100 porciento. Por el contrario, la RCP del plásmido críptico mostró una sensibilidad y especificidad de 75 y 100 porciento, respectivamente; un VPP de 100 porciento y VPN de 97,9 porciento.Conclusiones: se obtuvo diferencia entre los porcentajes de positividad detectados con la prueba rápida, y las técnicas de RCP. La baja especificidad de la prueba rápida indica la necesidad de realizar estudios de evaluación de este estuche diagnóstico.

Introduction: Chlamydia trachomatis is the leading bacterial agent that causes sexually transmitted infections.Objective: to detect the presence of C. trachomatis using a rapid test and compare it with the chain reaction (PCR).Methods: 50 endocervical exudates taken from symptomatic women were processed in Diez de October municipality. The samples were applied the Chlamy-check-1 test, a PCR assay of the cryptic plasmid gene and a real-time PCR (RT-PCR) of major outer membrane protein (MOMP) of C. trachomatis which was used as reference. Sensitivity, specificity, positive (PPV) and negative (NPV) predictive value were calculated.Results: 44 samples were positive by the rapid test, whereas only three samples (6 percent) amplified by cryptic plasmid PCR. Applying RT-PCR, 4 samples (8 percent) were confirmed as positive, 3 samples matched with three diagnostic methods. In assessing the Chlamy-check-1 versus the reference test, 100 percent of sensitivity was observed, while the specificity was 13 percent> Also PPV was 9.1percent and NPV was 100 percent. On the contrary, the cryptic plasmid PCR had 75 and 100 percent of sensitivity and specificity respectively, 100 percent PPV and 97.9 percent NPV.Conclusions: the difference was obtained between the percentages of positivity detected with both the rapid test, and CPR techniques. The low specificity of the rapid test indicates the need for further studies to evaluate this diagnostic kit.

Evaluación de la resistencia a agentes desinfectantes de bacterias aisladas de ambientes naturales / Evaluation of resistance to disinfectant agents of bacteria isolated from natural environments

Los antisépticos y desinfectantes son utilizados extensivamente para la prevención, vigilancia y control de las infecciones. Entre los más utilizados se encuentran los compuestos catiónicos de amonio cuaternario (QACs). El uso y abuso cotidiano de estos compuestos ha conllevado a la selección de cepas bacterianas resistentes. En este estudio, nos propusimos evaluar la resistencia a agentes desinfectantes en cepas bacterianas, multiresistentes a los antibióticos de uso frecuente, aisladas de ambientes naturales, y bacterias aisladas de pacientes hospitalizados. Se utilizó la prueba de suspensión cuantitativa para evaluar los niveles de resistencia, y ensayos de conjugación bacteriana para examinar la posible asociación de los determinantes de resistencia a moléculas plasmídicas transferibles. Los microorganismos gramnegativos, como Pseudomonas aeruginosa, resultaron ser los más resistentes. Las cepas ambientales presentaron niveles mayores de resistencia en comparación con las hospitalarias. Se obtuvieron transconjugantes con niveles de resistencia semejantes a las respectivas cepas donantes, indicando que estos determinantes de resistencia a desinfectantes están codificados en plásmidos, y cuyo análisis por patrones de restricción demostró que existen, al menos, dos moléculas plasmídicas diseminadas entre las cepas del mismo hábitat. Nuestros resultados representan un aporte que permitirá implementar medidas más exitosas para evitar la diseminación de estas bacterias resistentes.

Antiseptics and disinfectants are widely used for prevention, surveillance and control of infections. Among those most used are quaternary ammonium cationic compounds (QACs). The daily use and abuse of these compounds has resulted in the selection of resistant bacterial strains. In this study we decided to evaluate the resistance to disinfectant agents of bacterial strains multiresistant to frequently used antibiotics, both isolated from natural environments and isolated from hospital patients. The quantitative suspension test was used to evaluate resistance levels, and bacterial conjugation assays to examine the possible association of resistance determinants to transferable plasmid molecules. Gram negative microorganisms such as Pseudomonas aeruginosa appeared to be the most resistant. Environmental strains showed higher resistance levels as compared with hospital strains. We obtained transconjugants with resistance levels similar to those of the respective donor strain, indicating that these determinants of resistance to disinfectants are coded in plasmids; when analyzed by restriction patterns they showed that there were at least two plasmid molecules disseminated among the strains of the same habitat. Our results represent a contribution that will allow to implement more successful measures to avoid the dissemination of these resistant bacteria.

Búsqueda del plásmido de virulencia de Salmonella en aislamientos clínicos colombianos / Search of the Salmonella virulence plasmid in Colombian clinical isolates

Introducción: Salmonella es un bacilo Gram negativo, patógeno intracelular que invade células intestinales no fagocíticas y macrófagos en un proceso complejo que requiere múltiplesgenes. El plásmido de virulencia de Salmonella “spv” contiene el gen spvR cuya función es aumentarsu virulencia produciendo invasión sistémica en ratones.Métodos: Se buscó el gen spvR de Salmonella spp en aislamientos clínicos humanos provenientes de pacientes con sintomatología sistémica (fiebre tifoidea) y no sistémica (diarrea), con el fin de comparar la presencia del gen con la clínica del paciente. El gen spvR se buscó en 55 aislamientosde S. Typhi de pacientes con fiebre tifoidea, 20 de S. Enteritidis y 20 de S. Typhimurium, aislados de pacientes con diarrea. Se realizó PCR a partir de ADN genómico y plasmídico. Los productos sesecuenciaron y las secuencias obtenidas de material genómico y plasmídico se compararon utilizando análisis bioinformáticos Resultados: El 100 % de los aislamientos de S. Typhifueron negativos para spvR, mientras que 75 % de losaislamientos de S. Enteritidis y 40 % de S. Typhimurium,presentaron amplificación del gen spvR, tanto en material genómico como plasmídico. Se evidenció tambiénla presencia de secuencias plasmídicas homólogas al gen spvR en regiones cromosomales de los serotiposestudiados.Conclusiones: Los resultados muestran que la ausenciadel plásmido de virulencia de Salmonella no está relacionadacon la infección sistémica, pues no fue encontrado en S. Typhi productora de fiebre tifoidea. Se confirmótambién que existe material cromosomal homólogo al genspvR del plásmido de virulencia en el cromosoma de los serotipos S. Enteritidis y S. Typhimurium, pero no seencontró material similar en el cromosoma de S. Typhi.

Introduction: Salmonella is a Gram negative bacillus,intracellular pathogen that invades nonphagocytic intestinal cells and macrophages in a complex process that requires multiple genes.The salmonella virulence plasmid “spv” contains the spvR gene whose function is to increase its virulence producing systemic invasion in mice. Methods: We search for spvR gene in human clinicalisolates of Salmonella spp from patients with systemic infection (typhoid fever) and with nonsystemic infection (diarrheal), in order to comparethe presence of the gene to clinical outcome. spvR was searched in 55 clinical isolates of S. Typhi from typhoid fever patients, 20 of S. Enteritidisand 20 of S. Typhimurium isolates frompatients with diarrheal. PCR from chromosomal and plasmid DNA was performed. The PCR productswere sequenced and the sequences obtained from genomic and plasmid materials were compared using bioinformatics analysis.Results: 55 (100 %) isolates of S. Typhi were negativefor spvR. 15 (75 %) isolates of S. Enteritidis and 8 (40 %) of S. Typhimurium were positive forspvR both from genomic and plasmid material. These results show that clinical isolates of S.Typhi considered more virulent not showed spvR, and that diarrhea-producing serotypes S. Enteritidisand S. Typhimurium in 75 and 40 % respectively were positive for the gene, questioning the role of virulence of the gene in strains producing human infections. It also showed the presenceof plasmid gene sequences homologous to chromosomal regions in the studied serotypes.Conclusion: Results show that the absence of the plasmid of Salmonella’s virulence is not relatedwith the systemic outcome in the clinical isolates of Salmonella Typhi that were studied. There was also confirmed that exists chromosomal material homologous to the gene spvR virulenceplasmid in the chromosome of serotypes S. Enteritidis and S. Typhimurium but similar material wasn’t found in S. Typhi chromosome.

SHV-type extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) are encoded in related plasmids from enterobacteria clinical isolates from Mexico

OBJECTIVE: In this work we report the molecular characterization of beta-lactam antibiotics resistance conferred by genes contained in plasmids from enterobacteria producing extended-spectrum beta-lactamases (ESBL). MATERIAL AND METHODS: Fourteen enterobacterial clinical isolates selected from a group of strains obtained from seven different hospitals in Mexico during 1990-1992 and 1996-1998 were analyzed at the Bacterial Resistance Laboratory (National Institute Public Health, Cuernavaca). Molecular characterization included PFGE, IEF of beta-lactamases, bacterial conjugation, PCR amplification and DNA sequencing, plasmid extraction and restriction. RESULTS: Isolates were genetically unrelated. ESBL identified were SHV-2 (5/14) and SHV-5 (9/14) type. Cephalosporin-resistance was transferable in 9 of 14 (64 percent) clinical isolates with only one conjugative plasmid, DNA finger printing showed a similar band pattern in plasmids. CONCLUSIONS: The dissemination of cephalosporin resistance was due to related plasmids carrying the ESBL genes.

OBJETIVO: En este trabajo se reporta la caracterización molecular de la resistencia a antibiótico beta-lactámicos conferida por genes contenidos en plásmidos de enterobacterias productoras de beta-lactamasas de espectro extendido (BLEEs). MATERIAL Y MÉTODOS: Catorce aislamientos clínicos de enterobacterias fueron seleccionados por conveniencia de un banco de cepas obtenidas de siete diferentes hospitales de México durante los periodos 1990-1992 y 1996-1998 y fueron procesados en el Laboratorio de Resistencia Bacteriana (Instituto Nacional de Salud Pública, Cuernavaca). En la caracterización se empleó PFGE, IEF para beta-lactamasas, conjugación bacteriana, amplificación por PCR y secuenciación de DNA, extracción y restricción de plásmidos. RESULTADOS: Las 14 cepas fueron no relacionadas genéticamente. Se identificaron BLEEs tipo SHV-2 (5/14) y SHV-5 (9/14). La resistencia a cefalosporinas fue transferida por conjugación en 9 de 14 (64 por ciento) aislamientos clínicos mediante un plásmido que mostró un patrón de restricción similar entre ellos. CONCLUSIÓN: Se sugiere que la diseminación de la resistencia a cefalosporinas fue debida a plásmidos relacionados que contienen los genes que codifican BLEEs.

Biología molecular de los vectores adenovirales / Molecular biology of adenoviral vectors

La terapia con genes postula el uso terapéutico del DNA como una nueva alternativa de la biomedicina para el tratamiento de las enfermedades humanas. Todas las proteínas están codificadas en el DNA, y muchas enfermedades resultan de: a) la ausencia o expresión aberrante de uno o más genes; b) la ausencia de formas funcionales; c) alteraciones en su proceso de regulación, transporte o degradación. Por lo tanto, tales enfermedades pueden ser potencialmente tratadas, restableciendo la expresión de la proteína involucrada en las células afectadas. Sin embargo, para lograr una transferencia exitosa del material genético al sitio blanco y evitar la destrucción del DNA o del vehículo seleccionado antes de llegar al sitio de interés, se han desarrollado varios sistemas virales. Entre los virus más conocidos están: el virus del herpes simple, adenovirus tipo 5, virus adenoasociado y algunos retrovirus complejos (lentivirus). En este artículo se exponen las características biológicas, la manipulación genética y propiedades de los adenovirus, así como su empleo en la medicina actual como vectores para transferir genes y su potencial implicación en la terapia génica.

Gene therapy is based on the use of DNA as a therapeutic material as an alternative therapeutic tool for treatment of human diseases. All proteins are codified into the DNA and several diseases result from the absence or aberrant expression of one or related genes, absence of expression of functional proteins, and alterations for regulation process in transport and degradation mechanisms. In this regard, several diseases could be potentially treated through the expression of the normal form of the involved protein. However, the main objective is to achieve a successful genetic material delivery into the target site and avoid the destruction of DNA or the selected vehicle before arrival at the final destination. Several efficient viral gene transfer systems have been developed. Viral-mediated gene delivery for experimental models has been designed from herpes virus (HV), adenovirus (adenovirous), adeno-associated virus (AAV) and retroviruses (lentiviral vectors). In this review we will discuss the specific biological and cloning properties of adenoviral vectors as a gene transfer tool and potential medical implications for gene therapy.